Тихоокеанские биологические науки

Pacific Biosciences of California, Inc.
Тип компании	Общественный
Торгуется как	Nasdaq : PACB ; Компонент Рассела 2000 ;
Промышленность	Биотехнология
Основан	2004 г .; 20 лет назад
Штаб-квартира	Менло-Парк, Калифорния , Соединенные Штаты
Ключевые люди	Кристиан Генри ( генеральный директор и президент ) ; Джон Ф. Миллиган ( председатель правления ) ;
Доход	долларов США 200,5 млн (2023 г.)
Чистая прибыль	−306,7 млн долларов США (2023 г.)
Всего активов	1,75 миллиарда долларов США (2023 г.)
Количество сотрудников	796 (декабрь 2023 г.)
Веб-сайт	упаковка .с
	Сноски/ссылки ; PacBio Q4 2023 results

37 ° 28'43 "N 122 ° 09'03" W / 37,4787 ° N 122,1507 ° W / 37,4787; -122,1507 ( штаб )

Pacific Biosciences of California, Inc. (также известная как PacBio) — американская биотехнологическая компания , основанная в 2004 году, которая разрабатывает и производит системы для секвенирования генов и некоторые новые биологические наблюдения в реальном времени. ^{[ 2 ]}^{[ 3 ]}^{[ не удалось пройти проверку ]} PacBio имеет две основные платформы секвенирования: секвенирование одиночных молекул в реальном времени (SMRT), основанное на свойствах волноводов с нулевой модой, и химическое секвенирование путем связывания (SBB), в котором используются нативные нуклеотиды и включение без рубцов для связывания и удлинения ДНК . ^{[ 4 ]}^{[ 5 ]}

История

Компания была основана на основе исследований, проведенных в Корнельском университете , в которых обработка полупроводников и фотоника сочетались с исследованиями в области биотехнологий. ^{[ 2 ]} трое аспирантов лаборатории профессоров Уотта У. Уэбба — Йонаса Корлаха — и Гарольда Крейгхеда Первыми сотрудниками стали — Стива Тёрнера и Матье Фоке.

Он начался под названием Nanofluidics, Inc. Компания привлекла около 400 000 000 долларов США в шести раундах преимущественно венчурного финансирования , что сделало ее одним из самых капитализированных стартапов в 2010 году, что привело к их публичному размещению акций в октябре того же года. ^{[ 6 ]} Ключевые инвесторы включали Mohr Davidow Ventures, Kleiner, Perkins, Caufield & Byers , Alloy Ventures и Wellcome Trust . ^{[ 2 ]}

Первый коммерческий продукт компании, PacBio RS, был продан ограниченному кругу клиентов в 2010 году и был коммерчески выпущен в начале 2011 года. ^{[ 7 ]}^{[ 8 ]} Последующая версия секвенатора под названием PacBio RS II была выпущена в апреле 2013 года. ^{[ 9 ]}

Лидерство

В 2004 году генеральным директором стал постоянный предприниматель Kleiner Perkins Хью Мартин. 6 января 2012 года член правления Михаэль Хункапиллер, доктор философии, вступил в должность генерального директора. ^{[ 10 ]} Хункапиллер ушел в отставку в сентябре 2020 года, и его заменил председатель правления Кристиан Генри. ^{[ 11 ]} Генри был бывшим исполнительным вице-президентом и коммерческим директором Illumina, прежде чем присоединиться к совету директоров PacBio в июле 2018 года. ^{[ 12 ]}

Illumina: попытка приобретения

1 ноября 2018 года компания Illumina, Inc. согласилась приобрести PacBio за 1,2 миллиарда долларов США наличными. Ожидалось, что сделка будет закрыта в четвертом квартале 2019 года. ^{[ 13 ]} В декабре 2019 года Федеральная торговая комиссия подала иск о блокировании сделки. ^{[ 14 ]}^{[ 15 ]} Сделка была прекращена после объявления от 2 января 2020 года. Illumina также согласилась выплатить Pacific Biosciences комиссию за расторжение сделки в размере 98 миллионов долларов США плюс ранее согласованные выплаты за продление сделки в размере 22 миллионов долларов США в феврале и 6 миллионов долларов США в марте 2020 года. ^{[ 16 ]}

Технология секвенирования

Инструменты секвенирования

Первый научный прибор компании под названием PacBio RS был выпущен для ограниченного круга клиентов в конце 2010 года, а полноценный коммерческий выпуск состоялся в начале 2011 года. ^{[ 17 ]}^{[ 8 ]} Поставщик секвенирования GATC Biotech был выбран Pacific Biosciences в качестве первого европейского поставщика услуг в конце 2010 года. ^{[ 18 ]} Новая версия секвенатора была выпущена в апреле 2013 года. Она обеспечивала более длительное считывание последовательностей и более высокую пропускную способность, чем исходный инструмент RS. ^{[ 9 ]} Официально инструмент RS будет поддерживаться до конца 2021 года. ^{[ 19 ]} В сентябре 2015 года компания выпустила новый инструмент для секвенирования Sequel System с увеличенной производительностью секвенирования при меньшем размере и более низкой цене по сравнению с PacBio RS II. ^{[ 20 ]} Впоследствии, в октябре 2022 года, PacBio запустила новую систему секвенирования, которая может секвенировать 1300 геномов человека в год по сравнению с 86 в год на предыдущих машинах для секвенирования PacBio. ^{[ 21 ]}

Реагенты и ячейки SMRT

Чтобы использовать любой из инструментов, клиентам необходимо также приобрести пакеты реагентов для подготовки и секвенирования ДНК, а также небольшие расходные материалы, называемые «ячейками SMRT». Ячейки ранних форм секвенатора имеют площадь чуть меньше одного квадратного сантиметра и содержат десятки тысяч волноводов нулевой моды . ^{[ 4 ]} тогда как более новые системы имеют более высокую плотность клеток и содержат 25 миллионов волноводов нулевой моды (ZMWG), что позволяет быстрее секвенировать ДНК. ^{[ 22 ]}^{[ 21 ]}^{[ 23 ]}

Программное обеспечение и приложения

Их продукт биоинформатики вторичного анализа для RS, названный «Анализ SMRT», имел открытый исходный код . ^{[ 24 ]} Для системы Sequel программное обеспечение вторичного анализа было реорганизовано в приложение «SMRT Link». В 2013 году компания выпустила новые биоинформационные инструменты для автоматизированной сборки генома (HGAP) и отделки (Quiver). ^{[ 25 ]}^{[ 26 ]}^{[ 27 ]}

Внешние ссылки

Ссылки

^ «Тихоокеанская форма биологических наук 8-K» . Комиссия по ценным бумагам и биржам США . 15 февраля 2024 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с Bloomberg.com https://www.bloomberg.com/businessweek/globalbiz/content/dec2009/gb2009123_706120.htm . {{cite web}}: Отсутствует или пусто |title= ( помощь ) ^{[ постоянная мертвая ссылка ]}
^ Бракманн, Сюзанна (5 апреля 2010 г.). «Рибосома в действии» . Природа . 464 (7291): 987–988. дои : 10.1038/464987a . ПМИД 20393548 . S2CID 1742990 .
^ Jump up to: ^а ^б Роудс, Энтони; Ау, Кин Фай (1 октября 2015 г.). «Секвенирование PacBio и его применение» . Геномика, протеомика и биоинформатика . 13 (5): 278–289. дои : 10.1016/j.gpb.2015.08.002 . ISSN 1672-0229 . ПМЦ 4678779 . ПМИД 26542840 .
^ Эйзенштейн, Майкл (1 января 2023 г.). «Illumina сталкивается с конкурентами в области короткометражного чтения» . Природная биотехнология . 41 (1): 3–5. дои : 10.1038/s41587-022-01632-4 . ISSN 1546-1696 . ПМИД 36653497 . S2CID 255971472 . Проверено 8 марта 2023 г.
^ Остин, Коллин Дебейз и Скотт (9 марта 2010 г.). «Оценка перспективных молодых фирм» . Wall Street Journal – через www.wsj.com.
^ «PacBio раскрывает характеристики бета-системы для RS; сообщает, что коммерческий выпуск ожидается в первой половине 2011 года» . ГеномВеб . 7 декабря 2010 г.
^ Jump up to: ^а ^б «PacBio поставляет первые две коммерческие системы; количество заказов выросло до 44» . ГеномВеб . 3 мая 2011 г.
^ Jump up to: ^а ^б «Новые продукты: RS II от PacBio; запонки» . ГеномВеб . 16 апреля 2013 г.
^ «Майкл Ханкапиллер ушёл, Хью Мартин ушёл с поста генерального директора Pacific Biosciences» . 6 января 2012 года . Проверено 10 августа 2020 г.
^ «Pacific Biosciences назначает Кристиана Генри президентом и генеральным директором» . 7 августа 2020 г. . Проверено 10 августа 2020 г.
^ «Люди в новостях: Кристиан Генри, Майк Хункапиллер, Карен Тай Ко, Майкл Вунацос и другие» . 6 марта 2020 г. . Проверено 10 августа 2020 г.
^ Фарр, Кристина (1 ноября 2018 г.). «Гигант по секвенированию ДНК Illumina только что купила конкурента Pac Bio за 1,2 миллиарда долларов — и вот почему» . CNBC. Архивировано из оригинала 14 июля 2019 года.
^ Мэтью, Герпер (17 декабря 2019 г.). «FTC пытается заблокировать приобретение PacBio компанией Illumina, занимающейся секвенированием ДНК» . Новости СТАТ . Проверено 31 марта 2021 г.
^ «FTC оспаривает предложение Illumina о приобретении PacBio» . Федеральная торговая комиссия . 17 декабря 2019 года . Проверено 31 марта 2021 г.
^ «Illumina отказывается от сделки стоимостью 1,2 миллиарда долларов по покупке конкурирующей компании Pacific Biosciences» . CNBC. 2 января 2020 г. Архивировано из оригинала 3 января 2020 г. . Проверено 3 января 2020 г.
^ «PacBio называет первых 10 клиентов на одномолекулярный секвенатор стоимостью 695 000 долларов; первые поставки намечены на второй квартал» . ГеномВеб . 23 февраля 2010 г.
^ «GATC Biotech станет первым европейским поставщиком услуг для PacBio RS» . ГеномВеб . 21 сентября 2010 г.
^ «PacBio планирует дальнейшие обновления, RSII будет закрыт в 2021 году» . ГеномВеб . 3 августа 2018 г.
^ http://www.pacb.com/blog/introducing-the-sequel-system-the-scalable-platform-for-smrt-sequencing/ ^{[ самостоятельный источник ]}
^ Jump up to: ^а ^б Хейл, Конор. «PacBio представляет свой первый секвенатор ДНК с коротким считыванием, а также модернизацию системы с длинным считыванием» . Жестокие биотехнологии . Проверено 7 марта 2023 г.
^ Левен, MJ; Корлах, Дж.; Тернер, SW; Фоке, М.; Крейгхед, Х.Г.; Уэбб, WW (31 января 2003 г.). «Нулевомодовые волноводы для анализа одиночных молекул при высоких концентрациях» . Наука . 299 (5607): 682–686. Бибкод : 2003Sci...299..682L . дои : 10.1126/science.1079700 . ISSN 0036-8075 . ПМИД 12560545 . S2CID 6060239 .
^ Лемье, Джулианна (1 декабря 2022 г.). «PacBio стремится вытеснить конкуренцию в переполненном пространстве секвенирования» . ОБЩ Биотехнология . 1 (6): 476–478. doi : 10.1089/genbio.2022.29066.jle . ISSN 2768-1572 . S2CID 255024364 . Проверено 8 марта 2023 г.
↑ Pacific Biosciences (23 февраля 2015 г.) «Анализ» ^{[ самостоятельный источник ]}
^ «Новые продукты: SMRT-анализ PacBio 1.4» . ГеномВеб . 29 января 2013 г.
^ «Завершение геномов с помощью HGAP» . 6 мая 2013 г.
^ Чин, Чэнь-Шань; Александр, Дэвид Х.; Маркс, Патрик; Кламмер, Аарон А.; Дрейк, Джеймс; Хайнер, Шерил; Клам, Алисия; Коупленд, Алекс; Хаддлстон, Джон; Эйхлер, Эван Э.; Тернер, Стивен В.; Корлах, Йонас (5 июня 2013 г.). «Негибридные готовые сборки микробного генома на основе давно считанных данных секвенирования SMRT» . Природные методы . 10 (6): 563–569. дои : 10.1038/nmeth.2474 . ПМИД 23644548 . S2CID 205421576 .

[10K-1] «Тихоокеанская форма биологических наук 8-K» . Комиссия по ценным бумагам и биржам США . 15 февраля 2024 г.

[businessweek.com-2] Jump up to: ^а ^б ^с Bloomberg.com https://www.bloomberg.com/businessweek/globalbiz/content/dec2009/gb2009123_706120.htm . {{cite web}}: Отсутствует или пусто |title= ( помощь ) ^{[ постоянная мертвая ссылка ]}

[brakmann2010-3] Бракманн, Сюзанна (5 апреля 2010 г.). «Рибосома в действии» . Природа . 464 (7291): 987–988. дои : 10.1038/464987a . ПМИД 20393548 . S2CID 1742990 .

[Rhoads-4] Jump up to: ^а ^б Роудс, Энтони; Ау, Кин Фай (1 октября 2015 г.). «Секвенирование PacBio и его применение» . Геномика, протеомика и биоинформатика . 13 (5): 278–289. дои : 10.1016/j.gpb.2015.08.002 . ISSN 1672-0229 . ПМЦ 4678779 . ПМИД 26542840 .

[5] Эйзенштейн, Майкл (1 января 2023 г.). «Illumina сталкивается с конкурентами в области короткометражного чтения» . Природная биотехнология . 41 (1): 3–5. дои : 10.1038/s41587-022-01632-4 . ISSN 1546-1696 . ПМИД 36653497 . S2CID 255971472 . Проверено 8 марта 2023 г.

[6] Остин, Коллин Дебейз и Скотт (9 марта 2010 г.). «Оценка перспективных молодых фирм» . Wall Street Journal – через www.wsj.com.

[genomeweb2010-7] «PacBio раскрывает характеристики бета-системы для RS; сообщает, что коммерческий выпуск ожидается в первой половине 2011 года» . ГеномВеб . 7 декабря 2010 г.

[genomeweb.com-8] Jump up to: ^а ^б «PacBio поставляет первые две коммерческие системы; количество заказов выросло до 44» . ГеномВеб . 3 мая 2011 г.

[ReferenceA-9] Jump up to: ^а ^б «Новые продукты: RS II от PacBio; запонки» . ГеномВеб . 16 апреля 2013 г.

[10] «Майкл Ханкапиллер ушёл, Хью Мартин ушёл с поста генерального директора Pacific Biosciences» . 6 января 2012 года . Проверено 10 августа 2020 г.

[11] «Pacific Biosciences назначает Кристиана Генри президентом и генеральным директором» . 7 августа 2020 г. . Проверено 10 августа 2020 г.

[12] «Люди в новостях: Кристиан Генри, Майк Хункапиллер, Карен Тай Ко, Майкл Вунацос и другие» . 6 марта 2020 г. . Проверено 10 августа 2020 г.

[purchase_cnbc-13] Фарр, Кристина (1 ноября 2018 г.). «Гигант по секвенированию ДНК Illumina только что купила конкурента Pac Bio за 1,2 миллиарда долларов — и вот почему» . CNBC. Архивировано из оригинала 14 июля 2019 года.

[14] Мэтью, Герпер (17 декабря 2019 г.). «FTC пытается заблокировать приобретение PacBio компанией Illumina, занимающейся секвенированием ДНК» . Новости СТАТ . Проверено 31 марта 2021 г.

[15] «FTC оспаривает предложение Illumina о приобретении PacBio» . Федеральная торговая комиссия . 17 декабря 2019 года . Проверено 31 марта 2021 г.

[16] «Illumina отказывается от сделки стоимостью 1,2 миллиарда долларов по покупке конкурирующей компании Pacific Biosciences» . CNBC. 2 января 2020 г. Архивировано из оригинала 3 января 2020 г. . Проверено 3 января 2020 г.

[17] «PacBio называет первых 10 клиентов на одномолекулярный секвенатор стоимостью 695 000 долларов; первые поставки намечены на второй квартал» . ГеномВеб . 23 февраля 2010 г.

[18] «GATC Biotech станет первым европейским поставщиком услуг для PacBio RS» . ГеномВеб . 21 сентября 2010 г.

[19] «PacBio планирует дальнейшие обновления, RSII будет закрыт в 2021 году» . ГеномВеб . 3 августа 2018 г.

[20] ttp://www.pacb.com/blog/introducing-the-sequel-system-the-scalable-platform-for-smrt-sequencing/ ^{[ самостоятельный источник ]}

[fiercebiotech.com-21] Jump up to: ^а ^б Хейл, Конор. «PacBio представляет свой первый секвенатор ДНК с коротким считыванием, а также модернизацию системы с длинным считыванием» . Жестокие биотехнологии . Проверено 7 марта 2023 г.

[22] Левен, MJ; Корлах, Дж.; Тернер, SW; Фоке, М.; Крейгхед, Х.Г.; Уэбб, WW (31 января 2003 г.). «Нулевомодовые волноводы для анализа одиночных молекул при высоких концентрациях» . Наука . 299 (5607): 682–686. Бибкод : 2003Sci...299..682L . дои : 10.1126/science.1079700 . ISSN 0036-8075 . ПМИД 12560545 . S2CID 6060239 .

[23] Лемье, Джулианна (1 декабря 2022 г.). «PacBio стремится вытеснить конкуренцию в переполненном пространстве секвенирования» . ОБЩ Биотехнология . 1 (6): 476–478. doi : 10.1089/genbio.2022.29066.jle . ISSN 2768-1572 . S2CID 255024364 . Проверено 8 марта 2023 г.

[24] Pacific Biosciences (23 февраля 2015 г.) «Анализ» ^{[ самостоятельный источник ]}

[25] «Новые продукты: SMRT-анализ PacBio 1.4» . ГеномВеб . 29 января 2013 г.

[26] «Завершение геномов с помощью HGAP» . 6 мая 2013 г.

[27] Чин, Чэнь-Шань; Александр, Дэвид Х.; Маркс, Патрик; Кламмер, Аарон А.; Дрейк, Джеймс; Хайнер, Шерил; Клам, Алисия; Коупленд, Алекс; Хаддлстон, Джон; Эйхлер, Эван Э.; Тернер, Стивен В.; Корлах, Йонас (5 июня 2013 г.). «Негибридные готовые сборки микробного генома на основе давно считанных данных секвенирования SMRT» . Природные методы . 10 (6): 563–569. дои : 10.1038/nmeth.2474 . ПМИД 23644548 . S2CID 205421576 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

[ 15 ]

[ 16 ]

[ 17 ]

[ 18 ]

[ 19 ]

[ 20 ]

[ 21 ]

[ 22 ]

[ 23 ]

[ 24 ]

[ 25 ]

[ 26 ]

[ 27 ]

Базы данных авторитетного контроля
Международный	ЯВЛЯЮТСЯ
Национальный	Соединенные Штаты