Джон Кларди
Джон Кларди | |
|---|---|
| Рожденный | |
| Национальность | Американский |
| Альма-матер | Йельский университет ( бакалавр ), Гарвардский университет ( доктор философии ) |
| Награды | Премия Эрнеста Гюнтера (1995) |
Джон Кларди (родился 16 мая 1943 года, Вашингтон, округ Колумбия , США) в настоящее время является Сянь Ву и Дейзи Йен Ву в Гарвардской медицинской школе. профессором биологической химии и молекулярной фармакологии [1] Его исследования сосредоточены на выделении и структурной характеристике натуральных продуктов, а в настоящее время он исследует роль биологически активных малых молекул в опосредовании симбиотических взаимодействий и заболеваний. [2]
Биография
[ редактировать ]Кларди выросла в Арлингтоне, штат Вирджиния , США, и была старшей из четырёх детей. Он учился в Йельском университете , где получил степень бакалавра в 1964 году и был избран в Фи Бета Каппа . Хотя его всегда увлекала биология, во время учебы в колледже он больше интересовался химией. Он проводил студенческие исследования в области органического синтеза под руководством Р. Стивена Берри с упором на бензин. [3] После окончания Йельского университета он перешёл в Гарвардский университет , где получил степень доктора философии. получил степень по химии в 1969 году. Затем он принял должность преподавателя на химическом факультете Университета штата Айова , где он был связан с лабораторией Эймса. В 1978 году он перешёл на химический факультет Корнеллского университета , где оставался до 2002 года, а затем перешёл на факультет биологической химии и молекулярной фармакологии Гарвардской медицинской школы. В 2004 году он защитил докторскую диссертацию. Программа по химической биологии со Стюартом Шрайбером и Грегом Вердином. [4] Он также создал и продолжает преподавать популярный курс под названием «Молекулы жизни» для студентов Гарварда, не специализирующихся в области естественных наук.
Работая над докторской диссертацией, Кларди познакомился со своей женой Андреа Флек, выпускницей Суортмор-колледжа и писательницей. Среди ее работ — детская книга, две книги о северной части штата Нью-Йорк и пьесы, которые шли по всей стране. У них двое сыновей.
Открытие натуральных продуктов
[ редактировать ]Ранние исследования Кларди были сосредоточены на выяснении структуры природных продуктов, главным образом, с помощью рентгеновской кристаллографии . В начале учебы в Университете штата Айова Кларди установил важное сотрудничество с Биллом Феникалом, Джоном Фолкнером и Полом Шойером. [5] что привело к выяснению структуры многочисленных морских натуральных продуктов, таких как противораковый агент бриостатин , [6] инсектицидное и противогрибковое средство джаспамид , диазонамид А и В , [7] и многие другие. Некоторые из его самых известных ранних работ были посвящены нейротоксинам, связанным с «красным приливом», что привело к определению трехмерных структур сакситоксина . [8] группы гониаутоксина и циклического полиэфира бреветоксина B. [9] После переезда в Корнеллский университет исследования Кларди расширились и включили в себя огромное разнообразие неморских организмов, включая, помимо прочего, грибы, Actinomycetota и C. elegans . Его многолетний интерес к эндофитным грибам привел к открытию селективно цитотоксичного хинона- торрейановой кислоты , структурно разнообразных гуанакастепенов , антимикотического агента криптоцина и многих других.
Недавно Кларди сосредоточился на симбиотических ассоциациях между бактериями и другими организмами как на богатых источниках новых малых молекул. [10] В сотрудничестве с Кэмероном Карри Кларди исследовал связи между актиномицетами и насекомыми, такими как южный сосновый жук, муравьи и термиты, что привело к открытию противогрибковых средств, включая дентигерумицин. [11] [12] и микангимицин. [13] [14] Изучение химического обмена в сложных экологических взаимодействиях остается центральным направлением лаборатории Clardy. [15]
Рентгеновская кристаллография взаимодействий малых молекул с белками
[ редактировать ]Кларки в сотрудничестве со Стюартом Шрайбером и его коллегами получил кристаллическую структуру комплексов FK506/ FKBP12 и рапамицина /FKBP12. [16] Вскоре после этого Шрайбер и Кларди приступили к определению структуры комплекса FK506/рапамицин/FRAP – новаторское исследование, которое выявило способность проницаемой для клеток небольшой молекулы облегчать димеризацию белка. [17] Vertex, начинающая фармацевтическая компания, была основана для разработки нетоксичной версии FK506. [18] В сотрудничестве с Уолтером Лилом Кларди и его коллеги получили рентгеновскую кристаллическую структуру летучего феромона насекомых бомбикола, чей связывающий партнер расположен на усиках самок тутового шелкопряда. [19] Помимо дальнейшего углубления понимания этого высокоспецифичного взаимодействия малых молекул с белком, это исследование ознаменовало первую трехмерную структуру белка, связывающего запах. [20]
Эдна
[ редактировать ]Кларди также известен своей работой по выявлению натуральных продуктов, производимых некультивируемыми бактериями, и ему приписывают, наряду с Джо Хандельсманом и Робертом М. Гудманом , новаторство в области метагеномики . Совместно с Шоном Брэйди он разработал метод, позволяющий вставлять ДНК непосредственно из ДНК окружающей среды (эДНК), такой как почва, в библиотеки космид, искать кластеры биосинтетических генов и идентифицировать продукты этих генов. [21] Используя этот метод, они выяснили структуру многих антибиотиков, ранее недоступных традиционными лабораторными методами, таких как натуральные продукты, полученные из длинноцепочечных N-ацилтирозинов. [22]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ «БКМП | Кафедра биологической химии и молекулярной фармакологии» . Bcmp.med.harvard.edu . Проверено 28 сентября 2013 г.
- ^ «Джон Кларди | Лаборатория Кларди» . Clardy.med.harvard.edu . Проверено 28 сентября 2013 г.
- ^ Berry, R. S., Clardy, J. & Schafer, M. E. Benzyne. J. Am. Chem. Soc. 86, 2738–2739 (1964)
- ^ «Химические биологи | Гарвардский журнал, март-апрель 2005 г.» . Harvardmagazine.com . Проверено 28 сентября 2013 г.
- ^ Информационный бюллетень Американского общества фармакогнозии. 1-3 (2004)
- ^ Петтит, GR и др. Выделение и структура бриостатина 1. J. Am. хим. Соц. 104, 6846–6848 (1982)
- ^ Линдквист Н., Феникал В., Ван Дуйн Г.Д. и Кларди Дж. Выделение и определение структуры диазонамидов A и B, необычных цитотоксических метаболитов морской асцидии Diazona chinensis. Дж. Ам. хим. Соц. 113, 2303–2304 (1991)
- ^ Шанц, EJ и др. Структура сакситоксина. Дж. Ам. хим. Соц. 97, 1238–1239 (1975)
- ^ Лин, Ю.-Ю. и др. Выделение и структура бреветоксина В из динофлагелляты «красного прилива» Ptychodiscus brevis (Gymnodinium breve). Дж. Ам. хим. Соц. 103, 6773–6775 (1981)
- ^ «О жуках и бактериях | Журнал Scientist» . Архивировано из оригинала 2 октября 2013 г. Проверено 25 августа 2014 г.
- ^ О, округ Колумбия, Поулсен, М., Карри, CR и Кларди, Дж. Дентигерумицин: бактериальный медиатор муравьино-грибкового симбиоза. Nat Chem Biol 5, 391–393 (2009).
- ^ Уилсон, Э. и Ярнелл, А. В сговоре: грибы, муравьи и бактерии. Новости химии и техники 87, 15 (2009)
- ^ Скотт, Джей Джей и др. Бактериальная защита от жука-гриба. Наука 322, 63 (2008)
- ^ Драл, C. Бактерии жуков обладают противогрибковым средством. Новости химии и техники 86, 47 (2008)
- ^ «Джон Кларди» . Академия.asm.org. Архивировано из оригинала 25 апреля 2013 г. Проверено 28 сентября 2013 г.
- ^ Ван Дуйн, Г.Д., Штандарт, РФ, Карплюс, Пенсильвания, Шрайбер. С.Л., Кларди Дж. Атомная структура FKBP-FK506, комплекса иммунофилин-иммунодепрессант. Наука 252, 839-842 (1991).
- ^ Чой Дж., Чен Дж., Шрайбер С.Л., Кларди Дж. Структура комплекса FKBP12-рапамицин, взаимодействующего со связывающим доменом FRAP человека. Наука 273, 239-242 (1996)
- ^ Молекула на миллиард долларов:В поисках идеального лекарства, Барри Верт, 1994 г.
- ^ Сандлер, Б.Х., Никонова, Л., Лил, В.С. и Кларди, Дж. Сексуальное влечение у тутового шелкопряда: структура комплекса феромон-связывающий белок-бомбикол. Химия и биология 7, 143–151 (2000)
- ^ Сандлер, Б.Х., Никонова, Л., Лил, В.С. и Кларди, Дж. Сексуальное влечение у тутового шелкопряда: структура комплекса феромон-связывающий белок-бомбикол. Химия и биология 7, 143–151 (2000)
- ^ Брэйди, С.Ф., Чао, СиДжей и Кларди, Дж. Новые семейства натуральных продуктов из кластера генов ДНК окружающей среды (эДНК). Дж. Ам. хим. Соц. 124, 9968–9969 (2002)
- ^ Брэди, С.Ф., Чао, С.Дж. и Кларди, Дж. Синтез N-ацилтирозина с длинной цепью из ДНК окружающей среды. Прил. Окружающая среда. Микробиол. 70, 6865–6870 (2004)
