Мирный священник

Мирный священник
Научная классификация
Домен:	Эукариоты
Королевство:	животное
Тип:	Нематоды
Сорт:	Хромадория
Заказ:	Рабдитида
Семья:	Диплогастериды
Род:	Пристионх
Разновидность:	П. тихоокеанский
Биномиальное имя
	Мирный священник ; Соммер, Карта, Ким и Штернберг, 1996 г.

Pristionchus pacificus — вид свободноживущих нематод (круглых червей) семейства Diplogastridae . Этот вид был установлен как модельный организм -спутник Caenorhabditis elegans , с которым он имел общего предка 200–300 миллионов лет назад. Геном P. pacificus полностью секвенирован. ^{[ 1 ]} что в сочетании с другими инструментами генетического анализа делает этот вид удобной моделью в лаборатории, особенно для исследований биологии развития .

Диморфизм рта

Как и другие виды Pristionchus и многие другие свободноживущие нематоды, P. pacificus демонстрирует полифенизм в ротовом аппарате, который позволяет отдельным нематодам специализироваться на различных источниках пищи, что сделало этот вид примером фенотипической пластичности . ^{[ 2 ]} Полифенизм имеет две формы (морфы). Наиболее распространенным типом, по крайней мере среди лабораторных штаммов дикого типа , является «эвристоматозная» морфа, которая может питаться как бактериями, так и другими видами нематод. С другой стороны, «стеностоматозная» морфа специализирована на питании исключительно бактериями. ^{[ 3 ]}

Дифференциация в ту или иную морфу зависит от сочетания условий среды и стохастичности . Основные морфологические различия можно увидеть в ротовом аппарате. Эвристоматозная морфа имеет второстепенный зуб и более широкую ротовую полость. ^{[ 3 ]}^{[ 4 ]} Вторичный зуб позволяет эвристоматозной морфе питаться другими нематодами. ^{[ 4 ]} Две пищевые морфы, которые позволяют нематодам быстро реагировать на изменение окружающей среды, определяются гормональным и генетическим каскадом во время личиночного развития. ^{[ 5 ]}

Самопризнание

Поскольку это хищный вид, который питается родственными видами, вполне вероятно, что существует селективное давление, направленное на самораспознавание , то есть признание сородичей. P. pacificus не питается сородичами и поэтому должен быть способен отличать их от других видов нематод. Самораспознавание не зависит от ресничек , в отличие от распознавания добычи. ^{[ 3 ]}

Геномика

Геном Pristionchus pacificus был секвенирован в 2005 и 2006 годах. ^{[ 6 ]} Анализ P. pacificus предоставил экологическую информацию об этом организме. Установлено, что геном P. pacificus крупнее, чем у широко изученной нематоды C. elegans . ^{[ 7 ]} и было предсказано, что геном P. pacificus содержит более 26 000 генов, кодирующих белки. ^{[ 6 ]}

Экология

Установлено, что нематоды Pristionchus живут в некроменической ассоциации с жуками-скарабеями . ^{[ 8 ]}^{[ 9 ]} «После смерти жука нематода продолжает развиваться и питаться микробами, растущими внутри мертвого жука. Совокупность бактерий, грибов и нематод работает рука об руку, разлагая труп жука». ^{[ 10 ]} Таким образом, пристионх — всеядное животное , которое может использовать в качестве источников пищи бактерии, простейшие и грибы, которые растут на тушах жуков-скарабеев.

Ссылки

^ Дитерих С., Клифтон С.В., Шустер Л.Н., Чинвалла А., Делехонти К., Динкелакер И., Фултон Л., Фултон Р., Годфри Дж., Минкс П., Митрева М., Розелер В., Тиан Х., Витте Х., Ян С.П., Уилсон Р.К., Соммер Р.Дж. (2008). « Геном Pristionchus pacificus дает уникальный взгляд на образ жизни и паразитизм нематод» . Природная генетика . 40 (10): 1193–1198. дои : 10.1038/ng.227 . ПМЦ 3816844 . ПМИД 18806794 .
^ Серобян В., Рэгсдейл Э.Дж., Соммер Р.Дж. (2014). «Адаптационное значение хищной формы рта у диморфной нематоды» . Труды Лондонского королевского общества Б. 281 (1791): 20141334. doi : 10.1098/rspb.2014.1334 . ПМЦ 4132687 . ПМИД 25080344 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с Морено, Эдуардо; Лайтфут, Джеймс В.; Ленуцци, Маша; Зоммер, Ральф Дж. (2019). «Реснички обеспечивают пластичность развития и необходимы для эффективного обнаружения добычи у хищных нематод» . Труды Королевского общества B: Биологические науки . 286 (1912): 20191089. doi : 10.1098/rspb.2019.1089 . ПМК 6790756 . PMID 31575374 .
^ Jump up to: ^а ^б Лайтфут, Джеймс В.; Вилецки, Мартин; Окумура, Мисако; Соммер, Ральф Дж. (2016). «Анализ хищнического пищевого поведения пристионхов и других нематод» . Журнал визуализированных экспериментов (115): 54404. doi : 10.3791/54404 . ПМК 5091989 . ПМИД 27684744 .
^ Рэгсдейл, Э.Дж.; Мюллер, MR; Рёдельспергер, К; Соммер, Р.Дж. (2013). «Переключение развития, связанное с эволюцией пластичности, действует через сульфатазу» . Клетка . 155 (4): 922–933. дои : 10.1016/j.cell.2013.09.054 . ПМИД 24209628 .
^ Jump up to: ^а ^б Борхерт, Н; Дитрих, К; Круг, К; и др. (2010). «Протеогеномика Pristionchus pacificus выявляет отчетливую структуру протеома моделей нематод» . Геномные исследования . 20 (6): 837–846. дои : 10.1101/гр.103119.109 . ПМЦ 2877580 . ПМИД 20237107 .
^ Соммер Дж., Ральф, Макгогран, Анджела и др. (2013) Нематода Pristionchus pacificus как модельная система для интегративных исследований в эволюционной биологии, Molecular Ecology 22, 2380–2393
^ Херрманн М., Майер В.Е., Зоммер Р.Дж. (2006). «Нематоды рода Pristionchus тесно связаны с жуками-скарабеями и колорадским жуком в Западной Европе». Зоология . 109 (2): 96–108. дои : 10.1016/j.zool.2006.03.001 . ПМИД 16616467 .
^ Веллер, Андреас; и др. (21 января 2010 г.). «Количественная оценка фауны нематод, присутствующей на навозных жуках Geotrupes, выявляет богатые видами сообщества с гетерогенным распространением». Журнал паразитологии . 96 (3): 525–531. дои : 10.1645/GE-2319.1 .
^ Д.Л., Риддл (23 апреля 1981 г.). «Взаимодействие генов при формировании дауер-личинок нематод». Природа . 290 (5808): 668–671. дои : 10.1038/290668a0 . ПМИД 7219552 .

Внешние ссылки

Просмотрите сборку генома priPac1 в браузере генома UCSC .

[1] Дитерих С., Клифтон С.В., Шустер Л.Н., Чинвалла А., Делехонти К., Динкелакер И., Фултон Л., Фултон Р., Годфри Дж., Минкс П., Митрева М., Розелер В., Тиан Х., Витте Х., Ян С.П., Уилсон Р.К., Соммер Р.Дж. (2008). « Геном Pristionchus pacificus дает уникальный взгляд на образ жизни и паразитизм нематод» . Природная генетика . 40 (10): 1193–1198. дои : 10.1038/ng.227 . ПМЦ 3816844 . ПМИД 18806794 .

[2] Серобян В., Рэгсдейл Э.Дж., Соммер Р.Дж. (2014). «Адаптационное значение хищной формы рта у диморфной нематоды» . Труды Лондонского королевского общества Б. 281 (1791): 20141334. doi : 10.1098/rspb.2014.1334 . ПМЦ 4132687 . ПМИД 25080344 .

[Moreno_2019-3] Jump up to: ^а ^б ^с Морено, Эдуардо; Лайтфут, Джеймс В.; Ленуцци, Маша; Зоммер, Ральф Дж. (2019). «Реснички обеспечивают пластичность развития и необходимы для эффективного обнаружения добычи у хищных нематод» . Труды Королевского общества B: Биологические науки . 286 (1912): 20191089. doi : 10.1098/rspb.2019.1089 . ПМК 6790756 . PMID 31575374 .

[Lightfoot_2016-4] Jump up to: ^а ^б Лайтфут, Джеймс В.; Вилецки, Мартин; Окумура, Мисако; Соммер, Ральф Дж. (2016). «Анализ хищнического пищевого поведения пристионхов и других нематод» . Журнал визуализированных экспериментов (115): 54404. doi : 10.3791/54404 . ПМК 5091989 . ПМИД 27684744 .

[Ragsdale2013-5] Рэгсдейл, Э.Дж.; Мюллер, MR; Рёдельспергер, К; Соммер, Р.Дж. (2013). «Переключение развития, связанное с эволюцией пластичности, действует через сульфатазу» . Клетка . 155 (4): 922–933. дои : 10.1016/j.cell.2013.09.054 . ПМИД 24209628 .

[Proteogenomics_of_Pristionchus_paci-6] Jump up to: ^а ^б Борхерт, Н; Дитрих, К; Круг, К; и др. (2010). «Протеогеномика Pristionchus pacificus выявляет отчетливую структуру протеома моделей нематод» . Геномные исследования . 20 (6): 837–846. дои : 10.1101/гр.103119.109 . ПМЦ 2877580 . ПМИД 20237107 .

[7] Соммер Дж., Ральф, Макгогран, Анджела и др. (2013) Нематода Pristionchus pacificus как модельная система для интегративных исследований в эволюционной биологии, Molecular Ecology 22, 2380–2393

[herrmann2006z-8] Херрманн М., Майер В.Е., Зоммер Р.Дж. (2006). «Нематоды рода Pristionchus тесно связаны с жуками-скарабеями и колорадским жуком в Западной Европе». Зоология . 109 (2): 96–108. дои : 10.1016/j.zool.2006.03.001 . ПМИД 16616467 .

[9] Веллер, Андреас; и др. (21 января 2010 г.). «Количественная оценка фауны нематод, присутствующей на навозных жуках Geotrupes, выявляет богатые видами сообщества с гетерогенным распространением». Журнал паразитологии . 96 (3): 525–531. дои : 10.1645/GE-2319.1 .

[10] Д.Л., Риддл (23 апреля 1981 г.). «Взаимодействие генов при формировании дауер-личинок нематод». Природа . 290 (5808): 668–671. дои : 10.1038/290668a0 . ПМИД 7219552 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]