Лила Кари

Лила Кари
Лила Кари
Гражданство	Румынский; Канадский
Альма-матер	Университет Бухареста , Университет Турку
Известный	Биокомпьютеры, ДНК-вычисления
	Научная карьера
Поля	Информатика
Научные консультанты	Арто Саломаа
Веб-сайт	https://cs.uwaterloo.ca/~lila/

Лила Кари (урожденная Сантеан ) — румынский и канадский ученый-компьютерщик , профессор Школы компьютерных наук Дэвида Р. Черитона при Университете Ватерлоо , Канада.

Биография

Профессор Кари получила степень магистра в Бухарестском университете в 1987 году, учась там у Георге Пауна , а затем переехала в Университет Турку в Финляндии для учебы в аспирантуре, получив степень доктора философии. в 1991 году под руководством Арто Саломаа . ^[1]^[2] В 1993 году она приехала в Университет Западного Онтарио в качестве приглашенного профессора, а к 1996 году была принята туда на постоянную должность преподавателя. ^[2]^[3] В 2017 году она приняла должность профессора информатики и кафедры университетских исследований Университета Ватерлоо .

Исследовать

Дипломная работа Кари была посвящена теории формального языка . В середине 1990-х годов, вдохновленная статьей Леонарда Адлемана в журнале Science , она переключила свои интересы на вычисления ДНК . ^[4] В своих исследованиях вместе с Лорой Ландвебер она инициировала и исследовала изучение вычислительной мощности обработки ДНК у инфузорий . ^[5] используя свой опыт, чтобы показать, что операции ДНК, выполняемые в результате генетической рекомбинации в этих организмах, являются полными по Тьюрингу . ^[3] В десятилетие 2000-х годов ее исследования были сосредоточены на изучении теоретических вопросов, касающихся биомолекул ДНК, таких как недетерминизм и неразрешимость при самосборке. ^[6]. С начала 2010-х годов она сосредоточилась на изучении геномных сигнатур не требующих выравнивания и методов информатики биоразнообразия, . В ее методах используются различные теоретические концепции, такие как «Хаос-игра: представление геномных последовательностей ДНК», а также вычислительные инструменты, включая контролируемое и неконтролируемое машинное обучение, для идентификации и классификации организмов разных видов. ^[7]^[8]. Ярким применением ее работы является изучение геномных сигнатур микробных экстремофилов , где она обнаружила доказательства того, что, помимо таксономической информации, в геномных сигнатурах может также присутствовать информация об окружающей среде. ^[9].

Награды и почести

В 1991 году Кари получил награду за докторскую диссертацию Рольфа Неванлинны за лучшую финскую докторскую диссертацию по математике. ^[10]^[11]С 2002 по 2011 год она занимала кафедру исследований в области биокомпьютеров в Канаде. ^[12]

Ссылки

^ Лила Кари в проекте «Математическая генеалогия»
^ Jump up to: Перейти обратно: ^а ^б «Биография» , Журнал Universal Computer Science , заархивировано из оригинала 22 июля 2020 г.
^ Jump up to: Перейти обратно: ^а ^б «Исследователь в области биокомпьютеров награжден премией Бака» , Western News , Университет Западного Онтарио , 21 марта 2002 г.
^ «Карьера в нанобиотехнологии: глазами математика» , Science Careers , 2 февраля 2001 г., заархивировано из оригинала 21 августа 2011 г.
^ Ландвебер, Лаура; Кари, Лила (1999), «Эволюция клеточных вычислений: природное решение вычислительной проблемы», Biosystems , 52 (1–3): 3–13, CiteSeerX 10.1.1.297.3259 , doi : 10.1016/s0303-2647( 99)00027-1 , PMID 10636025 .
^ Адлеман, Леонард; Кари, Яркко; Кари, Лила; Рейшус, Дастин; Сосик, Петр (2009), «Неразрешимость проблемы бесконечной ленты: последствия для вычислений методом самосборки», SIAM J. Comput. , 38 (6): 2356–2381, CiteSeerX 10.1.1.158.2098 , doi : 10.1137/080723971 .
^ Кари, Лила; Хилл, Кэтлин; Сайем, Абу; Карамичалис, Раллис; Брайанс, Натаниэль; Дэвис, Кейтлин; Даттани, Никеш (2015), «Картирование пространства геномных сигнатур», PLOS ONE , 10 (5): e0119815, arXiv : 1406.4105 , Bibcode : 2015PLoSO..1019815K , doi : 10.1371/journal.pone.0119815 , PMC 44 41465 , ПМИД 26000734 .
^ Карамичалис, Раллис; Кари, Лила; Константинидис, Ставрос; Копецки, Стеффен (2015), «Исследование меж- и внутригеномных вариаций графических геномных сигнатур», BMC Bioinformatics , 16 : 246, arXiv : 1503.00162 , Bibcode : 2015arXiv150300162K , doi : 10.1186/s12859-015-06 55-4 , ЧВК 4527362 , ПМИД 26249837 .
^ Ариас, П.М., Батлер, Дж., Рандхава, Г.С. и др. Окружающая среда и таксономия формируют геномную подпись прокариотических экстремофилов. Sci Rep 13, 16105 (2023). https://doi.org/10.1038/s41598-023-42518-y
^ «Награда за докторскую диссертацию Рольфа Неванлинны» . Архивировано из оригинала 23 июня 2007 года . Проверено 22 февраля 2012 г.
^ Хамалайнен, Анна-Лииза (декабрь 1992 г.), «Девушка, которая хочет всего» (PDF) , Кодин Кувалехти (на финском языке): 22–24.
^ «Канадские кафедры исследований: Лила Кари» . Архивировано из оригинала 8 мая 2014 года . Проверено 22 февраля 2012 г.

Внешние ссылки

Домашняя страница Университета Ватерлоо
Публикации Лилы Кари , проиндексированные Google Scholar

[1] Лила Кари в проекте «Математическая генеалогия»

[jucs-2] Jump up to: Перейти обратно: ^а ^б «Биография» , Журнал Universal Computer Science , заархивировано из оригинала 22 июля 2020 г.

[bucke-3] Jump up to: Перейти обратно: ^а ^б «Исследователь в области биокомпьютеров награжден премией Бака» , Western News , Университет Западного Онтарио , 21 марта 2002 г.

[sm1-4] «Карьера в нанобиотехнологии: глазами математика» , Science Careers , 2 февраля 2001 г., заархивировано из оригинала 21 августа 2011 г.

[5] Ландвебер, Лаура; Кари, Лила (1999), «Эволюция клеточных вычислений: природное решение вычислительной проблемы», Biosystems , 52 (1–3): 3–13, CiteSeerX 10.1.1.297.3259 , doi : 10.1016/s0303-2647( 99)00027-1 , PMID 10636025 .

[6] Адлеман, Леонард; Кари, Яркко; Кари, Лила; Рейшус, Дастин; Сосик, Петр (2009), «Неразрешимость проблемы бесконечной ленты: последствия для вычислений методом самосборки», SIAM J. Comput. , 38 (6): 2356–2381, CiteSeerX 10.1.1.158.2098 , doi : 10.1137/080723971 .

[7] Кари, Лила; Хилл, Кэтлин; Сайем, Абу; Карамичалис, Раллис; Брайанс, Натаниэль; Дэвис, Кейтлин; Даттани, Никеш (2015), «Картирование пространства геномных сигнатур», PLOS ONE , 10 (5): e0119815, arXiv : 1406.4105 , Bibcode : 2015PLoSO..1019815K , doi : 10.1371/journal.pone.0119815 , PMC 44 41465 , ПМИД 26000734 .

[8] Карамичалис, Раллис; Кари, Лила; Константинидис, Ставрос; Копецки, Стеффен (2015), «Исследование меж- и внутригеномных вариаций графических геномных сигнатур», BMC Bioinformatics , 16 : 246, arXiv : 1503.00162 , Bibcode : 2015arXiv150300162K , doi : 10.1186/s12859-015-06 55-4 , ЧВК 4527362 , ПМИД 26249837 .

[9] Ариас, П.М., Батлер, Дж., Рандхава, Г.С. и др. Окружающая среда и таксономия формируют геномную подпись прокариотических экстремофилов. Sci Rep 13, 16105 (2023). https://doi.org/10.1038/s41598-023-42518-y

[10] «Награда за докторскую диссертацию Рольфа Неванлинны» . Архивировано из оригинала 23 июня 2007 года . Проверено 22 февраля 2012 г.

[11] Хамалайнен, Анна-Лииза (декабрь 1992 г.), «Девушка, которая хочет всего» (PDF) , Кодин Кувалехти (на финском языке): 22–24.

[12] «Канадские кафедры исследований: Лила Кари» . Архивировано из оригинала 8 мая 2014 года . Проверено 22 февраля 2012 г.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

Базы данных авторитетного контроля
Международный	ЯВЛЯЮТСЯ ВИАФ
Национальный	Финляндия
академики	Ассоциация вычислительной техники ДБЛП Google Академика MathSciNet Проект математической генеалогии ОРЦИД zbMATH
Другой	ИдРеф