Усилитель теней

Теневые энхансеры представляют собой группы из двух или более энхансеров , которые контролируют один и тот же ген- мишень и управляют перекрывающимися пространственно-временными паттернами экспрессии. ^{[ 1 ]}^{[ 2 ]}^{[ 3 ]} Усилители тени обнаружены у широкого спектра организмов, от насекомых до растений и млекопитающих , особенно в сочетании с генами развития . ^{[ 4 ]}^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]} Хотя отдельные энхансеры группы теневых энхансеров кажутся избыточными, было показано, что они имеют решающее значение для правильной экспрессии генов перед лицом как экологических, так и генетических пертурбаций. Такие возмущения могут усугубить колебания в работе регуляторов верхнего уровня. ^{[ 1 ]}^{[ 8 ]}^{[ 9 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б Уэймак, Рэйчел; Флетчер, Альваро; Энсизо, немецкий; Вундерлих, Зеба (17 августа 2020 г.). Витткопп, Патрисия Дж; Крокер, Джастин (ред.). «Теневые энхансеры могут подавлять шум входного фактора транскрипции посредством четкой регуляторной логики» . электронная жизнь . 9 : е59351. doi : 10.7554/eLife.59351 . ISSN 2050-084X . ПМЦ 7556877 . ПМИД 32804082 . В эту статью включен текст, доступный по лицензии CC BY 4.0 .
^ Хонг, Чжон Ву; Хендрикс, Дэвид А.; Левин, Майкл С. (5 сентября 2008 г.). «Усилители теней как источник эволюционной новизны» . Наука . 321 (5894): 1314. Бибкод : 2008Sci...321.1314H . дои : 10.1126/science.1160631 . ISSN 0036-8075 . ПМЦ 4257485 . ПМИД 18772429 .
^ Бароло, Скотт (2012). «Теневые усилители: часто задаваемые вопросы о распределенной цис-регуляторной информации и избыточности усилителей» . Биоэссе . 34 (2): 135–141. doi : 10.1002/bies.201100121 . ISSN 1521-1878 . ПМК 3517143 . ПМИД 22083793 .
^ Каннаво, Энрико; Хуэйри, Пьер; Гарфилд, Дэвид А.; Гилехер, Пол; Зихнер, Томас; Густафсон, Э. Хилари; Сиглар, Люсия; Корбель, Ян О.; Ферлонг, Эйлин Э.М. (январь 2016 г.). «Усилители теней являются широко распространенными особенностями развивающихся регулятивных сетей» . Современная биология . 26 (1): 38–51. дои : 10.1016/j.cub.2015.11.034 . ISSN 0960-9822 . ПМЦ 4712172 . ПМИД 26687625 .
^ Остервальдер, Марко; Бароцци, Ирос; Тиссьер, Вирджиния; Фукуда-Юдзава, Йоко; Мэннион, Брэндон Дж.; Афзал, Сара Ю.; Ли, Элизабет А.; Чжу, Ивэнь; Плайзер-Фрик, Ингрид; Пикл, Кэтрин С.; Като, Момоэ (февраль 2018 г.). «Избыточность энхансеров обеспечивает фенотипическую устойчивость в развитии млекопитающих» . Природа . 554 (7691): 239–243. Бибкод : 2018Natur.554..239O . дои : 10.1038/nature25461 . ISSN 1476-4687 . ПМЦ 5808607 . ПМИД 29420474 .
^ Гарнетт, Аарон Т.; Сквер, Тайлер А.; Медейрос, Дэниел М. (15 ноября 2012 г.). «Сигналы BMP, Wnt и FGF интегрируются посредством эволюционно консервативных энхансеров для достижения устойчивой экспрессии генов Pax3 и Zic на границе нервной пластинки рыбки данио» . Разработка . 139 (22): 4220–4231. дои : 10.1242/dev.081497 . ISSN 0950-1991 . ПМК 4074300 . ПМИД 23034628 .
^ Бомблис, Кирстен; Дагенайс, Николь; Вайгель, Детлеф (1 декабря 1999 г.). «Избыточные энхансеры опосредуют репрессию транскрипции AGAMOUS с помощью APETALA2» . Биология развития . 216 (1): 260–264. дои : 10.1006/dbio.1999.9504 . ISSN 0012-1606 . PMID 10588876 .
^ Чунг, Дэвид; Ма, Джун (октябрь 2015 г.). «Исследование влияния температуры на молекулярные события в системе развития» . Научные отчеты . 5 (1): 13124. Бибкод : 2015NatSR...513124C . дои : 10.1038/srep13124 . ISSN 2045-2322 . ПМЦ 4541335 . ПМИД 26286011 .
^ Чен, Цзюнь; Нольте, Виола; Шлёттерер, Кристиан (26 февраля 2015 г.). Гибсон, Грег (ред.). «Температурный стресс опосредует деканализацию и доминирование экспрессии генов у Drosophila melanogaster» . ПЛОС Генетика . 11 (2): e1004883. дои : 10.1371/journal.pgen.1004883 . ISSN 1553-7404 . ПМЦ 4342254 . ПМИД 25719753 .

Эта о генетике статья незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[Waymack-1] Jump up to: ^а ^б Уэймак, Рэйчел; Флетчер, Альваро; Энсизо, немецкий; Вундерлих, Зеба (17 августа 2020 г.). Витткопп, Патрисия Дж; Крокер, Джастин (ред.). «Теневые энхансеры могут подавлять шум входного фактора транскрипции посредством четкой регуляторной логики» . электронная жизнь . 9 : е59351. doi : 10.7554/eLife.59351 . ISSN 2050-084X . ПМЦ 7556877 . ПМИД 32804082 . В эту статью включен текст, доступный по лицензии CC BY 4.0 .

[2] Хонг, Чжон Ву; Хендрикс, Дэвид А.; Левин, Майкл С. (5 сентября 2008 г.). «Усилители теней как источник эволюционной новизны» . Наука . 321 (5894): 1314. Бибкод : 2008Sci...321.1314H . дои : 10.1126/science.1160631 . ISSN 0036-8075 . ПМЦ 4257485 . ПМИД 18772429 .

[3] Бароло, Скотт (2012). «Теневые усилители: часто задаваемые вопросы о распределенной цис-регуляторной информации и избыточности усилителей» . Биоэссе . 34 (2): 135–141. doi : 10.1002/bies.201100121 . ISSN 1521-1878 . ПМК 3517143 . ПМИД 22083793 .

[4] Каннаво, Энрико; Хуэйри, Пьер; Гарфилд, Дэвид А.; Гилехер, Пол; Зихнер, Томас; Густафсон, Э. Хилари; Сиглар, Люсия; Корбель, Ян О.; Ферлонг, Эйлин Э.М. (январь 2016 г.). «Усилители теней являются широко распространенными особенностями развивающихся регулятивных сетей» . Современная биология . 26 (1): 38–51. дои : 10.1016/j.cub.2015.11.034 . ISSN 0960-9822 . ПМЦ 4712172 . ПМИД 26687625 .

[5] Остервальдер, Марко; Бароцци, Ирос; Тиссьер, Вирджиния; Фукуда-Юдзава, Йоко; Мэннион, Брэндон Дж.; Афзал, Сара Ю.; Ли, Элизабет А.; Чжу, Ивэнь; Плайзер-Фрик, Ингрид; Пикл, Кэтрин С.; Като, Момоэ (февраль 2018 г.). «Избыточность энхансеров обеспечивает фенотипическую устойчивость в развитии млекопитающих» . Природа . 554 (7691): 239–243. Бибкод : 2018Natur.554..239O . дои : 10.1038/nature25461 . ISSN 1476-4687 . ПМЦ 5808607 . ПМИД 29420474 .

[6] Гарнетт, Аарон Т.; Сквер, Тайлер А.; Медейрос, Дэниел М. (15 ноября 2012 г.). «Сигналы BMP, Wnt и FGF интегрируются посредством эволюционно консервативных энхансеров для достижения устойчивой экспрессии генов Pax3 и Zic на границе нервной пластинки рыбки данио» . Разработка . 139 (22): 4220–4231. дои : 10.1242/dev.081497 . ISSN 0950-1991 . ПМК 4074300 . ПМИД 23034628 .

[7] Бомблис, Кирстен; Дагенайс, Николь; Вайгель, Детлеф (1 декабря 1999 г.). «Избыточные энхансеры опосредуют репрессию транскрипции AGAMOUS с помощью APETALA2» . Биология развития . 216 (1): 260–264. дои : 10.1006/dbio.1999.9504 . ISSN 0012-1606 . PMID 10588876 .

[8] Чунг, Дэвид; Ма, Джун (октябрь 2015 г.). «Исследование влияния температуры на молекулярные события в системе развития» . Научные отчеты . 5 (1): 13124. Бибкод : 2015NatSR...513124C . дои : 10.1038/srep13124 . ISSN 2045-2322 . ПМЦ 4541335 . ПМИД 26286011 .

[9] Чен, Цзюнь; Нольте, Виола; Шлёттерер, Кристиан (26 февраля 2015 г.). Гибсон, Грег (ред.). «Температурный стресс опосредует деканализацию и доминирование экспрессии генов у Drosophila melanogaster» . ПЛОС Генетика . 11 (2): e1004883. дои : 10.1371/journal.pgen.1004883 . ISSN 1553-7404 . ПМЦ 4342254 . ПМИД 25719753 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]