✖


Jump to content

Эйлин Ферлонг

Edit links

Эйлин Ферлонг
ФРС МАЭ
Рожденный
Эйлин Э.М. Ферлонг
Национальность ирландский
Альма-матер Университетский колледж Дублина (бакалавр, доктор философии)
Награды Член Европейской академии (2016).
Членство в ЕМБО (2013 г.)
Научная карьера
Поля Усилители
Топология хроматина
Эмбриональное развитие
Геномика одиночных клеток
Транскрипционные факторы [ 1 ]
Учреждения Европейская лаборатория молекулярной биологии
Стэнфордский университет
Диссертация Тканеспецифическая регуляция экспрессии генов с помощью факторов транскрипции Инь-Ян 1 и ядерного фактора 1   (1996).
Докторантура Финиан Мартин [ 2 ]
Веб-сайт Ферлонглаб .embl .из

Эйлин Э.М. Ферлонг, FRS MAE, ирландский молекулярный биолог, работающий в области транскрипции , биологии хроматина , биологии развития и геномики . [ 3 ] Она известна своей работой по пониманию того, как геном регулируется , в частности, как функционируют усилители развития , как они взаимодействуют в трехмерных топологиях хроматина и как они влияют на решения судьбы клеток во время эмбриогенеза . [ 1 ] [ 4 ] [ 5 ] Она возглавляет отдел биологии генома Европейской лаборатории молекулярной биологии (EMBL). Ферлонг был избран членом Европейской организации молекулярной биологии (EMBO) в 2013 году. [ 6 ] в Европейская академия 2016 году [ 7 ] и исследовательскому совету EMBO в 2018 году. [ 8 ]

Образование

[ редактировать ]

Эйлин Ферлонг получила степень бакалавра наук в Университетском колледже Дублина и докторскую степень в институте Конвея при UCD, изучая регуляцию транскрипции генов немедленного раннего ответа в лаборатории Финиана Мартина. [ 2 ]

Карьера и исследования

[ редактировать ]

После получения докторской степени Ферлонг работала научным сотрудником в Стэнфордском университете в Мэтью П. Скотта . лаборатории [ 9 ] разработка инструментов геномики для функционального анализа программ развития во время эмбриогенеза. Ферлонг открыла свою независимую лабораторию в EMBL в 2002 году. [ 10 ] и был назначен начальником отдела [ 11 ] в 2009 году. Ее исследования объединяют подходы геномики , генетики и вычислительной биологии для функционального анализа роли некодирующих цис-регуляторных элементов в регуляции экспрессии генов . [ 12 ] [ 13 ] В частности, использование спецификации мезодермы в различные зачатки мышц в качестве модельной системы. Исследования ее группы выявили ряд свойств энхансеров. [ 14 ] [ 15 ] [ 16 ] [ 17 ] и связь энхансер- промотор , включая заранее сформированные « петли » энхансер-промотор. [ 18 ] [ 19 ] и способность многих энхансеров функционировать даже при более крупных топологий хроматина , нарушении [ 20 ] [ 21 ] [ 22 ] в дополнение к механизмам, которые позволяют энхансерам противостоять эффектам генетических вариаций , включая коллективный факторов транскрипции , рекрутинг [ 23 ] [ 24 ] генетический эпистаз внутри энхансеров [ 25 ] и промоутеры, [ 26 ] и обширное резервирование, [ 27 ] которые вместе способствуют канализации паттернов развития. [ нужна ссылка ]

Работа Ферлонга получила признание за разработку и применение геномных подходов для понимания эмбрионального развития. [ 28 ] [ 29 ] включая разработку дрозофилы микрочипов , [ 30 ] [ 31 ] автоматический сортировщик трансгенных эмбрионов, [ 32 ] [ 33 ] Иммунопреципитация хроматина (ЧИП) у эмбрионов, [ 34 ] [ 35 ] [ 36 ] тканеспецифический [ 37 ] [ 38 ] [ 39 ] и одноклеточные подходы [ 40 ] - что в сочетании с генетическими манипуляциями позволило получить представление о программах развития во время эмбриогенеза в масштабе всего генома. [ 41 ] [ 42 ]

Ферлонг является членом редакционной коллегии научных журналов Developmental Cell . [ 43 ] Разработка , [ 44 ] Молекулярная системная биология , [ 45 ] Текущее мнение о развитии генетики , [ 46 ] Современное мнение в области клеточной биологии , [ 47 ] [ 48 ] член комиссии Европейского исследовательского совета (ERC) [ 49 ] [ 50 ] и организатор международных конференций « От функциональной геномики до системной биологии» , [ 51 ] Транскрипция EMBL и хроматин [ 52 ] совещании и основной докладчик на национальных и международных конференциях, включая «Интеллектуальные системы для молекулярной биологии » (ISMB). [ 53 ] [ 54 ] [ 55 ] [ 56 ] [ 57 ] [ 58 ] [ 59 ] [ чрезмерное цитирование ]

Награды и почести

[ редактировать ]

Ферлонг был избран членом Европейской организации молекулярной биологии (EMBO) в 2013 году. [ 6 ] и член Европейской академии (MAE) в 2016 году. [ 7 ] Ферлонг получил финансирование от ERC для продвинутых исследователей CisRegVar 2013–2018 гг. [ 60 ] и DeCRypT 2019–2023 гг. [ 61 ] В мае 2022 года она была избрана членом Королевского общества . [ 62 ]

Ссылки

[ редактировать ]
  1. ^ Jump up to: а б Публикации Эйлин Ферлонг , проиндексированные Google Scholar Отредактируйте это в Викиданных
  2. ^ Jump up to: а б Ферлонг, Эйлин EM (1996). Тканеспецифическая регуляция экспрессии генов с помощью факторов транскрипции Инь-Ян 1 и ядерного фактора 1 (кандидатская диссертация). OCLC   605563938 . ПроКвест   301522152 .
  3. ^ Эйлин Ферлонг Публикации из Europe PubMed Central
  4. ^ «Расшифровка нормативного кодекса» . ЭМБЛ . 4 ноября 2009 г.
  5. ^ Нимиц, Эмили (2014). «Синтетическое моделирование усилителей развития» . Природная генетика . 46 (2): 99. дои : 10.1038/ng.2888 . ISSN   1546-1718 . S2CID   38520086 .
  6. ^ Jump up to: а б «Найдите людей в сообществах EMBO» . People.embo.org .
  7. ^ Jump up to: а б «Европейская академия: Ферлонг Эйлин» . ae-info.org .
  8. ^ «Совет» . ЭМБО . 22 марта 2021 г.
  9. ^ Ферлонг, Эйлин EM; Профитт, Дэвид; Скотт, Мэтью П. (2001). «Автоматическая сортировка живых трансгенных эмбрионов». Природная биотехнология . 19 (2): 153–156. дои : 10.1038/84422 . ISSN   1087-0156 . ПМИД   11175730 . S2CID   14228050 .
  10. ^ «Furlong Group - Регуляция и топология генома во время эмбрионального развития - EMBL» . embl.de. ​
  11. ^ «Геномная биология» .
  12. ^ Ферлонг, EEM; Левин, М. (28 сентября 2018 г.). «Усилители развития и топология хромосом» . Наука . 361 (6409): 1341–1345. Бибкод : 2018Sci...361.1341F . дои : 10.1126/science.aau0320 . ПМК   6986801 . ПМИД   30262496 .
  13. ^ Шпиц, Ф; Ферлонг, Э.Э. (сентябрь 2012 г.). «Факторы транскрипции: от связывания энхансера к контролю развития». Обзоры природы. Генетика . 13 (9): 613–26. дои : 10.1038/nrg3207 . ПМИД   22868264 . S2CID   205485256 .
  14. ^ Зинзен, Р.П.; Жирардо, К; Ганьер, Дж; Браун, М; Ферлонг, Э.Э. (5 ноября 2009 г.). «Комбинаторное связывание предсказывает пространственно-временную цис-регуляторную активность». Природа . 462 (7269): 65–70. Бибкод : 2009Natur.462...65Z . дои : 10.1038/nature08531 . ПМИД   19890324 . S2CID   4320071 .
  15. ^ Он, Синь; Синха, Саураб (февраль 2010 г.). «ЧИПы и нормативные биты». Природная биотехнология . 28 (2): 142–143. дои : 10.1038/nbt0210-142 . ISSN   1546-1696 . ПМИД   20139950 . S2CID   30471127 .
  16. ^ Старк, Александр (1 января 2009 г.). «Изучение регуляторного кода транскрипции» . Молекулярная системная биология . 5 (1): 329. doi : 10.1038/msb.2009.88 . ISSN   1744-4292 . ПМЦ   2795480 . ПМИД   19920814 .
  17. ^ Ристер, Йенс; Десплан, Клод (2010). «Расшифровка регуляторного кода генома: множество языков ДНК» . Биоэссе . 32 (5): 381–384. doi : 10.1002/bies.200900197 . ISSN   1521-1878 . ПМК   3024831 . ПМИД   20394065 .
  18. ^ Гави-Хельм, Ю; Кляйн, ФА; Пакозди, Т; Сиглар, Л; Нордермеер, Д; Хубер, В; Ферлонг, EE (7 августа 2014 г.). «Петли энхансера кажутся стабильными во время развития и связаны с приостановленной полимеразой». Природа . 512 (7512): 96–100. Бибкод : 2014Natur.512...96G . дои : 10.1038/nature13417 . ПМИД   25043061 . S2CID   4464054 .
  19. ^ «Неожиданная стабильность и сложность взаимодействия энхансеров транскрипции» . физ.орг .
  20. ^ Гави-Хельм, Ю; Янковский, А; Мейерс, С; Виалес, РР; Корбель, Дж.О.; Ферлонг, EEM (август 2019 г.). «Сильно перестроенные хромосомы обнаруживают разрыв между топологией генома и экспрессией генов» . Природная генетика . 51 (8): 1272–1282. дои : 10.1038/s41588-019-0462-3 . ПМК   7116017 . ПМИД   31308546 .
  21. ^ Финн, Элизабет Х.; Мистели, Том (август 2019 г.). «Разрыв генома» . Природная генетика . 51 (8): 1205–1206. дои : 10.1038/s41588-019-0476-x . ISSN   1546-1718 . ПМЦ   7418859 . ПМИД   31332379 .
  22. ^ Кох, Линда (октябрь 2019 г.). «Опровержение принципов TAD» . Обзоры природы Генетика . 20 (10): 565. дои : 10.1038/s41576-019-0164-9 . ISSN   1471-0064 . ПМИД   31367009 . S2CID   199056689 .
  23. ^ Джунион, Дж; Спиваков М; Жирардо, К; Браун, М; Густавсон, Э.Х.; Бирни, Э; Ферлонг, EE (3 февраля 2012 г.). «Коллектив транскрипционных факторов определяет судьбу сердечных клеток и отражает историю происхождения» . Клетка . 148 (3): 473–86. дои : 10.1016/j.cell.2012.01.030 . ПМИД   22304916 . S2CID   7990140 .
  24. ^ Хуэйри, П; Жирардо, К; Сиглар, Л; Пэн, ПК; Густавсон, Э.Х.; Синха, С; Ферлонг, EE (9 августа 2017 г.). «Развязка эволюционных изменений в последовательности ДНК, занятости фактора транскрипции и активности энхансера» . электронная жизнь . 6 . doi : 10.7554/eLife.28440 . ПМК   5550276 . ПМИД   28792889 .
  25. ^ Каннаво, Э; Келлинг, Н; Харнетт, Д; Гарфилд, Д; Казале, ФП; Сиглар, Л; Густавсон, HE; Виалес, Р.Р.; Марко-Ферререс, Р.; Дегнер, Дж. Ф.; Чжао, Б; Стегл, О; Бирни, Э; Ферлонг, Э.Э. (19 января 2017 г.). «Генетические варианты, регулирующие уровни экспрессии и разнообразие изоформ во время эмбриогенеза». Природы . 541 (7637): 402–406. Бибкод : 2017Natur.541..402C . дои : 10.1038/nature20802 . ПМИД   28024300 . S2CID   205252947 .
  26. ^ Шор, ИП; Дегнер, Дж. Ф.; Харнетт, Д; Каннаво, Э; Казале, ФП; Шим, Х; Гарфилд, Д.А.; Бирни, Э; Стивенс, М; Стегл, О; Ферлонг, EE (апрель 2017 г.). «Форма промотора варьируется в зависимости от популяции и влияет на эволюцию промотора и шум экспрессии». Природная генетика . 49 (4): 550–558. дои : 10.1038/ng.3791 . hdl : 11336/65679 . ПМИД   28191888 . S2CID   3331476 .
  27. ^ Каннаво, Э; Хуэйри, П; Гарфилд, Д.А.; Гилехер, П; Зихнер, Т; Густавсон, Э.Х.; Сиглар, Л; Корбель, Дж.О.; Ферлонг, EE (11 января 2016 г.). «Усилители теней являются широко распространенными особенностями развивающихся регулятивных сетей» . Современная биология . 26 (1): 38–51. дои : 10.1016/j.cub.2015.11.034 . ПМЦ   4712172 . ПМИД   26687625 .
  28. ^ Макгуайр, Алабама; Габриэль, С; Тишкофф, С.А.; Вонкам, А; Чакраварти, А; Ферлонг, EEM; Трейтлейн, Б; Мейснер, А; Чанг, Хай; Лопес-Бигас, Н.; Сигал, Э; Ким, Дж.С. (октябрь 2020 г.). «Путь вперед в генетике и геномике » Обзоры природы. Генетика . 21 (10): 581–596. дои : 10.1038/ s41576-020-0272-6 ПМЦ   7444682 . ПМИД   32839576 .
  29. ^ Флинтофт, Луиза (февраль 2013 г.). «Предсказания в пространстве и времени». Обзоры природы Генетика . 14 (2): 78–79. дои : 10.1038/nrg3411 . ISSN   1471-0064 . ПМИД   23269464 . S2CID   41780530 .
  30. ^ Арбайтман, Миннесота; Ферлонг, EE; Имам, Ф; Джонсон, Э; Нуль, Британская Колумбия; Бейкер, бакалавр наук; Краснов, Массачусетс; Скотт, член парламента; Дэвис, RW; Уайт, КП (2002). «Экспрессия генов в течение жизненного цикла Drosophila melanogaster». Наука . 297 (5590): 2270–5. Бибкод : 2002Sci...297.2270A . дои : 10.1126/science.1072152 . ПМИД   12351791 . S2CID   15639586 .
  31. ^ Наука, Американская ассоциация содействия развитию (27 сентября 2002 г.). «Эта неделя науки: обзоры статей этой недели» . Наука . 297 (5590): 2165. doi : 10.1126/science.2002.297.5590.twis . ISSN   0036-8075 . S2CID   239597164 .
  32. ^ Ферлонг, EE; Профитт, Д; Скотт, член парламента (февраль 2001 г.). «Автоматическая сортировка живых трансгенных эмбрионов». Природная биотехнология . 19 (2): 153–6. дои : 10.1038/84422 . ПМИД   11175730 . S2CID   14228050 .
  33. ^ «Сортировщик биологических частиц» . Гугл Патенты . 21 марта 2001 г.
  34. ^ Сандманн, Т; Дженсен, LJ; Якобсен, Дж. С.; Каржинский, ММ; Эйхенлауб, член парламента; Борк, П; Ферлонг, Э.Э. (июнь 2006 г.). «Временная карта активности транскрипционных факторов: mef2 напрямую регулирует гены-мишени на всех стадиях развития мышц» . Развивающая клетка . 10 (6): 797–807. дои : 10.1016/j.devcel.2006.04.009 . ПМИД   16740481 .
  35. ^ Сандманн, Т; Жирардо, К; Бреме, М; Тонгпрасит, Ж; Столц, В; Ферлонг, Э.Э. (15 февраля 2007 г.). «Основная транскрипционная сеть для раннего развития мезодермы у Drosophila melanogaster» . Гены и развитие . 21 (4): 436–49. дои : 10.1101/gad.1509007 . ПМК   1804332 . ПМИД   17322403 .
  36. ^ Шкипер, Магдалена (апрель 2007 г.). «Урезание сетей развития» . Обзоры природы Генетика . 8 (4): 249. дои : 10.1038/nrg2077 . ISSN   1471-0064 . S2CID   38908110 .
  37. ^ Бонн, С; Зинзен, Р.П.; Жирардо, К; Густавсон, Э.Х.; Перес-Гонсалес, А; Деломм, Н.; Гави-Хельм, Ю; Вильчинский, Б; Ридделл, А; Ферлонг, Э.Э. (8 января 2012 г.). «Тканеспецифический анализ состояния хроматина определяет временные признаки активности энхансера во время эмбрионального развития». Природная генетика . 44 (2): 148–56. дои : 10.1038/ng.1064 . ПМИД   22231485 . S2CID   143727 .
  38. ^ Бонн, С; Зинзен, Р.П.; Перес-Гонсалес, А; Ридделл, А; Гэвин, AC; Ферлонг, EE (26 апреля 2012 г.). «Имунопреципитация типоспецифического хроматина из образцов многоклеточных комплексов с использованием BiTS-ChIP». Протоколы природы . 7 (5): 978–94. дои : 10.1038/nprot.2012.049 . ПМИД   22538849 . S2CID   20098167 .
  39. ^ Реддингтон, JP; Гарфилд, Д.А.; Сигалова О.М.; Карабачак Кальвиелло, А; Марко-Ферререс, Р.; Жирардо, К; Виалес, РР; Дегнер, Дж. Ф.; Олер, Ю; Ферлонг, EEM (7 декабря 2020 г.). «Использование энхансера и промотора с разрешением по происхождению во время эмбриогенеза» . Развивающая клетка . 55 (5): 648–664.e9. дои : 10.1016/j.devcel.2020.10.009 . ПМИД   33171098 . S2CID   226302320 .
  40. ^ Кусанович, Д.А.; Реддингтон, JP; Гарфилд, округ Колумбия; Даза, Р.М.; Агамирзае, Д; Марко-Ферререс, Р.; Плинер, HA; Кристиансен, Л; Цю, Х; Стимерс, Ф.Дж.; Трапнелл, К; Шендюр, Дж; Ферлонг, EEM (2018). «Цис-регуляторная динамика эмбрионального развития при разрешении отдельных клеток» . Природы . 555 (7697): 538–542. Бибкод : 2018Natur.555..538C . дои : 10.1038/nature25981 . ПМК   5866720 . ПМИД   29539636 .
  41. ^ Ферлонг, EE; Андерсен, ЕС; Нуль, Б; Уайт, КП; Скотт, член парламента (31 августа 2001 г.). «Закономерности экспрессии генов во время развития мезодермы дрозофилы» . Наука . 293 (5535): 1629–33. Бибкод : 2001Sci...293.1629F . дои : 10.1126/science.1062660 . ПМИД   11486054 . S2CID   13826608 .
  42. ^ Наука, Американская ассоциация содействия развитию (31 августа 2001 г.). «Эта неделя науки: научные журналы о исследованиях» . Наука . 293 (5535): 1553. doi : 10.1126/science.2001.293.5535.twis . ISSN   0036-8075 .
  43. ^ «Редакция: Ячейка развития» . ячейка.com .
  44. ^ «Редакция и совет | Развитие» . dev.biologies.org .
  45. ^ «Редакторы и совет | Молекулярная системная биология» . embopress.org .
  46. ^ «Современное мнение в редакционной коллегии генетики и развития» .
  47. ^ «Современное мнение в области клеточной биологии — журнал — Elsevier» .
  48. ^ «Современное мнение редакционной коллегии клеточной биологии» .
  49. ^ «Следователи ЦЭР – ЭМБЛ» . embl.de. ​
  50. ^ «Фьючерсы: регулирование генома - получатель гранта ERC Эйлин Ферлонг» . ЭМБЛ . 13 марта 2017 г.
  51. ^ «Конференция EMBL – от функциональной геномики к системной биологии –» .
  52. ^ «14-я конференция EMBL – Транскрипция и хроматин – Виртуально – Спикеры» .
  53. ^ «Эволюционная системная биология» . Добро пожаловать на курсы и конференции по связям с наукой .
  54. ^ «Конференция CSH Asia 2020: Системная биология регуляции генов и редактирования генома» . cshl.csh-asia.org .
  55. ^ «Флаер онлайн-симпозиума Симпозиум Минервы-Гентнера 2020» (PDF) .
  56. ^ «Докладчик - Клеточные симпозиумы: регуляция транскрипции» . cell-symposia.com .
  57. ^ «Эйлин Ферлонг» . iscb.org .
  58. ^ «Профессор EMBL Эйлин Ферлонг: доклад о регуляции генома» . ЮБК . 4 октября 2017 г.
  59. ^ Патология, НИИ молекулярной хирургии. «Эйлин Ферлонг прочтет лекцию Макса Бирнстила» . НИИ молекулярной патологии .
  60. ^ «ERC предоставляет CisRegVar» .
  61. ^ «ERC предоставляет DeCrypT» .
  62. ^ «Выдающиеся ученые избраны научными сотрудниками и иностранными членами Королевского общества» . Королевское общество . 10 мая 2022 г. Проверено 11 мая 2022 г.
Retrieved from "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Eileen_Furlong&oldid=1240093068"
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: dfd0dcd801d6f4b62876e469cdccab66__1723546740
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/df/66/dfd0dcd801d6f4b62876e469cdccab66.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
Eileen Furlong - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)