подавление компьютерной графики
Подавление CG — это термин, обозначающий явление, при котором динуклеотиды CG очень редко встречаются в большинстве частей геномов позвоночных .
Во взрослых соматических тканях остатки цитозина могут быть метилированы , и это происходит почти исключительно в симметричном контексте CpG. [ 1 ] Метилированные остатки C самопроизвольно дезаминируются с образованием остатков T; следовательно, динуклеотиды CpG постоянно мутируют в динуклеотиды TpG, что приводит к недостаточной представленности динуклеотидов CpG в геноме человека (они встречаются только с 21% ожидаемой частоты). [ 2 ] (С другой стороны, спонтанное дезаминирование неметилированных остатков C приводит к образованию остатков U — мутации, которая быстро распознается и восстанавливается клеткой).
У человека и мыши CG являются наименее частыми динуклеотидами , составляя менее 1% всех динуклеотидов. GC являются вторыми по частоте, составляя более 4% всех динуклеотидов, поэтому CG встречаются более чем в четыре раза реже, чем все другие динуклеотиды.
См. также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Лоу Дж., Якобсен С.Е. (2010). «Установление, поддержание и изменение закономерностей метилирования ДНК у растений и животных» . Нат. Преподобный Жене . 11 (3): 204–220. дои : 10.1038/nrg2719 . ПМК 3034103 . ПМИД 20142834 .
- ^ Международный консорциум по секвенированию генома человека; и др. (февраль 2001 г.). «Первичное секвенирование и анализ генома человека» (PDF) . Природа . 409 (6822): 860–921. дои : 10.1038/35057062 . ПМИД 11237011 .