Юнипепт

Оригинальный автор(ы)	Гентский университет
Разработчик(и)	Барт Месуэр
Первоначальный выпуск	3 февраля 2011 г .; 13 лет назад
Стабильная версия	4.1.1 / 21 января 2019 г .; 5 лет назад
Репозиторий	github .с /Юнипепт /Юнипепт ;
Написано в	Руби , JavaScript
Тип	Биоинформатика , Визуализация данных
Лицензия	МОЯ лицензия
Веб-сайт	юнипепт .агент .быть

Unipept — это исследовательский инструмент с открытым исходным кодом для биоразнообразия анализа метапротеомных образцов. Он также содержит инструмент для выбора пептидов для использования в качестве биомаркера и инструмент для сравнения генома организмов на основе содержания в них белка. ^[2]^[3] Программное обеспечение разработано в Гентском университете .

Unipept состоит из веб-приложения и автономного инструмента командной строки. Веб-приложение использует интерактивную визуализацию данных для изучения наборов данных. Инструмент командной строки содержит те же функции, но предназначен для использования в конвейерах автоматизированной обработки данных. ^[4]

Ссылки

^ «Релизы Юнипепта» . Гитхаб . Проверено 14 апреля 2019 г.
^ Месуэре, Барт; Девриз, Барт; Дебизер, Грит; Аэртс, Мартен; Вандам, Питер; Давиндт, Питер (2012). «Юнипепт: анализ биоразнообразия образцов метапротеома на основе триптических пептидов». Журнал исследований протеома . 11 (12): 5773–80. дои : 10.1021/pr300576s . ISSN 1535-3893 . ПМИД 23153116 .
^ Месуэре, Барт; Дебизер, Грит; Аэртс, Мартен; Девриз, Барт; Вандам, Питер; Давиндт, Питер (2015). «Пайплайн метапротеомного анализа Unipept». Протеомика . 15 (8): 1437–1442. дои : 10.1002/pmic.201400361 . ISSN 1615-9853 . ПМИД 25477242 . S2CID 43820480 .
^ «Документация Unipept CLI» . Проверено 24 августа 2015 г.

Внешние ссылки

Эта научная статья о программном обеспечении незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

Эта статья, посвященная биоинформатике, незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[1] «Релизы Юнипепта» . Гитхаб . Проверено 14 апреля 2019 г.

[MesuereDevreese2012-2] Месуэре, Барт; Девриз, Барт; Дебизер, Грит; Аэртс, Мартен; Вандам, Питер; Давиндт, Питер (2012). «Юнипепт: анализ биоразнообразия образцов метапротеома на основе триптических пептидов». Журнал исследований протеома . 11 (12): 5773–80. дои : 10.1021/pr300576s . ISSN 1535-3893 . ПМИД 23153116 .

[MesuereDebyser2015-3] Месуэре, Барт; Дебизер, Грит; Аэртс, Мартен; Девриз, Барт; Вандам, Питер; Давиндт, Питер (2015). «Пайплайн метапротеомного анализа Unipept». Протеомика . 15 (8): 1437–1442. дои : 10.1002/pmic.201400361 . ISSN 1615-9853 . ПМИД 25477242 . S2CID 43820480 .

[4] «Документация Unipept CLI» . Проверено 24 августа 2015 г.

[1]

[2]

[3]

[4]