Ро использовать сайт
Сайт использования Rho , также известный под аббревиатурой rut , представляет собой последовательность РНК в бактериях, расположенную выше терминаторной области, которая служит сайтом связывания для белка, известного как фактор rho . Эта последовательность необходима для rho-зависимой терминации транскрипции ДНК у бактерий. Общей чертой участка гона является обилие цитозина и малое количество остатков гуанина , хотя эти последовательности широко варьируют в разных генах и имеют небольшую гомологию. [ 1 ]
Для прогнозирования таких сайтов было разработано несколько алгоритмов. [ 2 ] [ 3 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Гены Левина X. Левин, Бенджамин., Кребс, Джоселин Э., Килпатрик, Стивен Т., Гольдштейн, Эллиот С., Левин, Бенджамин. (10-е изд.). Садбери, Массачусетс: Джонс и Бартлетт. 2011. ISBN 9780763766320 . OCLC 456641931 .
{{cite book}}
: CS1 maint: другие ( ссылка ) - ^ Ди Сальво, Марко; Пуччо, Симона; Пеано, Клелия; Лакур, Стефан; Алифано, Пьетро (7 марта 2019 г.). «RhoTermPredict: алгоритм прогнозирования Rho-зависимых терминаторов транскрипции на основе баз данных Escherichia coli, Bacillus subtilis и Salmonella enterica» . БМК Биоинформатика . 20 (1): 117. дои : 10.1186/s12859-019-2704-x . ПМК 6407284 . ПМИД 30845912 .
- ^ Надирас, Седрик; Эвено, Эрик; Шварц, Энни; Фигероа-Босси, Нара; Будвиллен, Марк (19 сентября 2018 г.). «Модель многомерного прогнозирования Rho-зависимой терминации транскрипции» . Исследования нуклеиновых кислот . 46 (16): 8245–8260. дои : 10.1093/nar/gky563 . ПМК 6144790 . ПМИД 29931073 .