Инпараноидальный

Инпараноид — это алгоритм , который находит ортологичные гены и паралогичные гены, возникшие — скорее всего, в результате дупликации — после некоторого события видообразования . Такие гены, кодирующие белок , называются входными паралогами , в отличие от внешних паралогов (которые возникли до разделения видов). ^{[ 1 ]}

Инпараноид (с разной заглавной буквой) может относиться к программе, использующей алгоритм INPARANOID, или к производной базе данных ортологичных кластеров генов. ^{[ 2 ]}

См. также

Ссылки

^ Ремм, Майдо; Кристиан Э.В. Шторм; Эрик Л.Л. Зоннхаммер (2001). «Автоматическая кластеризация ортологов и паралогов на основе попарных сравнений видов». Журнал молекулярной биологии . 314 (5): 1041–1052. CiteSeerX 10.1.1.328.6724 . дои : 10.1006/jmbi.2000.5197 . ПМИД 11743721 .
^ О'Брайен, КП; Ремм, М.; Зоннхаммер, ELL (2005). «Инпараноид: обширная база данных ортологов эукариот» . Исследования нуклеиновых кислот . 33 (Проблема с базой данных): D476–80. дои : 10.1093/nar/gki107 . ПМК 540061 . ПМИД 15608241 .

Внешние ссылки

InParanoid

Эта статья, посвященная биоинформатике, незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[Remm2001-1] Ремм, Майдо; Кристиан Э.В. Шторм; Эрик Л.Л. Зоннхаммер (2001). «Автоматическая кластеризация ортологов и паралогов на основе попарных сравнений видов». Журнал молекулярной биологии . 314 (5): 1041–1052. CiteSeerX 10.1.1.328.6724 . дои : 10.1006/jmbi.2000.5197 . ПМИД 11743721 .

[O'Brien2005-2] О'Брайен, КП; Ремм, М.; Зоннхаммер, ELL (2005). «Инпараноид: обширная база данных ортологов эукариот» . Исследования нуклеиновых кислот . 33 (Проблема с базой данных): D476–80. дои : 10.1093/nar/gki107 . ПМК 540061 . ПМИД 15608241 .

[ 1 ]

[ 2 ]