Дэвид Бартель

Дэвид П. Бартель
Дэвид П. Бартель
Национальность	Американский
Альма-матер	Гошен - колледж Гарвардского университета
Известный	микроРНК
Награды	Главный научный приз Фонда Луи Д. (2005 г.) ; Премия НАН в области молекулярной биологии (2005 г.)
	Научная карьера
Поля	Биохимия , Молекулярная биология
Учреждения	Институт Уайтхеда , Массачусетский технологический институт
Диссертация	Распознавание и катализ РНК: I. Новые рибозимы из случайных последовательностей; II. Взаимодействие ВИЧ-ревизии и RRE (1993 г.)
Докторантура	Джек Шостак

Дэвид П. Бартель — американский молекулярный биолог, наиболее известный своими работами над микроРНК . Бартель — Массачусетского технологического профессор биологии института , член Института Уайтхеда и исследователь Медицинского института Говарда Хьюза (HHMI).

Биография

Бартель получил бакалавра степень биологии в колледже Гошен в 1982 году и степень доктора философии. Степень по вирусологии Гарвардского университета в 1993 году под руководством Джека В. Шостака . ^[1]

Находясь в лаборатории Шостака, Бартель выделил первые рибозимы непосредственно из случайной последовательности, используя эволюцию in vitro (среди них лигаза класса I). ^[2] После того, как он стал независимым в Институте Уайтхеда, он развил этот рибозим, чтобы он функционировал как РНК-зависимая РНК-полимераза и расширял праймеры на внешние матрицы РНК, подкрепляя теорию «мира РНК». ^[3]^[4]

Позже Бартель переключил свои исследования на биологию микроРНК и, в частности, на понимание их регуляторных функций. ^[5] МикроРНК представляют собой короткие фрагменты РНК длиной около 22 нуклеотидов, которые ослабляют экспрессию генов за счет подавления информационных РНК (мРНК). Его лаборатория была одной из трёх, обнаруживших, что у животных имеется множество таких малых регуляторных РНК. ^[6]^[7]^[8] и он был первым, кто описал микроРНК в растениях. ^[9]^[10] Работая с микроРНК, он разработал методологию, позволяющую прогнозировать их регуляторные цели, и создал веб-инструмент TargetScan , который делает эти прогнозы доступными для исследовательского сообщества. ^[11]^[12]^[13]^[14]^[15] Его исследования также показали, что большинство мРНК человека регулируются микроРНК и что микроРНК преимущественно действуют, снижая уровни своих мРНК-мишеней. ^[13]^[16]

Бартель также обнаружил несколько других типов регуляторных РНК, в том числе гетерохроматические миРНК, которые заставляют замолчать ДНК вместо РНК. ^[17] Кроме того, Бартель исследует роль длинных некодирующих РНК (днРНК) и то, как нетранслируемые области и хвосты мРНК рекрутируют и опосредуют регуляторные явления. ^[5]

Бартель является основателем и научным консультантом Alnylam Pharmaceuticals, компании, основанной в 2002 году с целью продвижения «терапии РНКи (РНК-интерференции) как нового класса инновационных лекарств». ^[18]

В 2006 году Бартель занял второе место по версии Thomson Reuters в рейтинге цитируемости в области молекулярной биологии/генетики.Он получил несколько наград и был избран членом Национальной академии наук в 2011 году. ^[19]

Ссылки

^ «Дэвид П. Бартель '82» . Гошенский бюллетень . 2007 . Проверено 8 марта 2014 г.
^ Наука . 10 сентября 1993 г.; 261 (5127): 1411-8. « Выделение новых рибозимов из большого пула случайных последовательностей ». Бартель Д.П., Шостак Дж.В.
^ Тенденции клеточной биологии. 1999 декабрь;9(12):M9-M13. « Построение мира РНК ». Бартель Д.П., Унрау П.Дж.
^ Джонстон, Западная Келли; Унрау, П.Дж.; Лоуренс, MS; Гласнер, Мэн; Бартель, ДП (18 мая 2001 г.). «РНК-катализируемая полимеризация РНК: точное и общее расширение праймера с помощью матрицы РНК». Наука . 292 (5520): 1319–25. Бибкод : 2001Sci...292.1319J . CiteSeerX 10.1.1.70.5439 . дои : 10.1126/science.1060786 . ПМИД 11358999 . S2CID 14174984 .
^ Jump up to: ^а ^б «Дэвид Бартель» . ХХМИ . Проверено 7 октября 2016 г.
^ «Наука». 26 октября 2001 г.; 294 (5543): 853-8. «Идентификация новых генов, кодирующих малые экспрессируемые РНК». Лагос-Кинтана М1, Раухут Р, Лендекель В, Тушль Т.
^ «Наука». 26 октября 2001 г.; 294 (5543): 858-62. « Богатый класс крошечных РНК, которые, возможно, играют регуляторную роль в Caenorhabditis elegans ». Лау NC1, Лим Л.П., Вайнштейн Э.Г., Бартель Д.П.
^ «Наука». 26 октября 2001 г.; 294 (5543): 862-4. « Обширный класс малых РНК у Caenorhabditis elegans . Lee RC1, Ambros V.
^ "Гены Дев." 1 июля 2002 г.; 16 (13): 1616-26. « МикроРНК в растениях ». Рейнхарт BJ1, Вайнштейн Э.Г., Роудс М.В., Бартель Б., Бартель Д.П.
^ «Клетка». 2002, 23 августа; 110(4): 513-20.« Прогнозирование мишеней микроРНК растений ». Роудс MW1, Рейнхарт Б.Дж., Лим Л.П., Бердж CB, Бартель Б., Бартель Д.П.
^ «Клетка». 14 января 2005 г.; 120 (1): 15–20. « Консервативные пары семян, часто окруженные аденозинами, указывают на то, что тысячи человеческих генов являются мишенями микроРНК ». Льюис Б.П., Бердж С.Б., Бартель Д.П.
^ "Мол Клетка". 2007, 6 июля; 27(1): 91-105. « Специфичность воздействия микроРНК у млекопитающих: детерминанты, выходящие за рамки спаривания семян ». Гримсон А1, Фарх К.К., Джонстон В.К., Гаррет-Энгеле П., Лим Л.П., Бартель Д.П.
^ Jump up to: ^а ^б «Геном Рез». Январь 2009 г.;19(1):92-105. « Большинство мРНК млекопитающих являются консервативными мишенями микроРНК ». Фридман RC1, Фарх К.К., Бердж CB, Бартель DP.
^ Агарвал, Викрам; Белл, Джордж В.; Нам, Джин-Ву; Бартель, Дэвид П. (12 августа 2015 г.). «Прогнозирование эффективных целевых участков микроРНК в мРНК млекопитающих» . электронная жизнь . 4 : e05005. doi : 10.7554/eLife.05005 . ISSN 2050-084X . ПМЦ 4532895 . ПМИД 26267216 .
^ Агарвал, В.; Субтельный, АО; Тиру, П; Улицкий, И; Бартель, ДП (4 октября 2018 г.). «Прогнозирование эффективности нацеливания микроРНК на дрозофилу» . Геномная биология . 19 (1): 152. дои : 10.1186/s13059-018-1504-3 . ПМК 6172730 . ПМИД 30286781 .
^ Го, Х; Инголия, Северная Каролина; Вайсман, Дж. С.; Бартель, ДП (12 августа 2010 г.). «МикроРНК млекопитающих преимущественно снижают уровни целевой мРНК» . Природа . 466 (7308): 835–40. Бибкод : 2010Natur.466..835G . дои : 10.1038/nature09267 . ПМЦ 2990499 . ПМИД 20703300 .
^ Рейнхарт, Би Джей; Бартель, ДП (13 сентября 2002 г.). «Маленькие РНК соответствуют центромерным гетерохроматическим повторам». Наука . 297 (5588): 1831. doi : 10.1126/science.1077183 . ПМИД 12193644 . S2CID 42288846 .
^ «Научно-консультативный совет» . Alnylam.com . Проверено 5 октября 2016 г.
^ «Член Уайтхеда Дэвид Бартель избран в Национальную академию наук» . Проверено 25 января 2015 г.

Внешние ссылки

[1] «Дэвид П. Бартель '82» . Гошенский бюллетень . 2007 . Проверено 8 марта 2014 г.

[2] Наука . 10 сентября 1993 г.; 261 (5127): 1411-8. « Выделение новых рибозимов из большого пула случайных последовательностей ». Бартель Д.П., Шостак Дж.В.

[3] Тенденции клеточной биологии. 1999 декабрь;9(12):M9-M13. « Построение мира РНК ». Бартель Д.П., Унрау П.Дж.

[4] Джонстон, Западная Келли; Унрау, П.Дж.; Лоуренс, MS; Гласнер, Мэн; Бартель, ДП (18 мая 2001 г.). «РНК-катализируемая полимеризация РНК: точное и общее расширение праймера с помощью матрицы РНК». Наука . 292 (5520): 1319–25. Бибкод : 2001Sci...292.1319J . CiteSeerX 10.1.1.70.5439 . дои : 10.1126/science.1060786 . ПМИД 11358999 . S2CID 14174984 .

[HHMI_Bio-5] Jump up to: ^а ^б «Дэвид Бартель» . ХХМИ . Проверено 7 октября 2016 г.

[6] «Наука». 26 октября 2001 г.; 294 (5543): 853-8. «Идентификация новых генов, кодирующих малые экспрессируемые РНК». Лагос-Кинтана М1, Раухут Р, Лендекель В, Тушль Т.

[7] «Наука». 26 октября 2001 г.; 294 (5543): 858-62. « Богатый класс крошечных РНК, которые, возможно, играют регуляторную роль в Caenorhabditis elegans ». Лау NC1, Лим Л.П., Вайнштейн Э.Г., Бартель Д.П.

[8] «Наука». 26 октября 2001 г.; 294 (5543): 862-4. « Обширный класс малых РНК у Caenorhabditis elegans . Lee RC1, Ambros V.

[9] "Гены Дев." 1 июля 2002 г.; 16 (13): 1616-26. « МикроРНК в растениях ». Рейнхарт BJ1, Вайнштейн Э.Г., Роудс М.В., Бартель Б., Бартель Д.П.

[10] «Клетка». 2002, 23 августа; 110(4): 513-20.« Прогнозирование мишеней микроРНК растений ». Роудс MW1, Рейнхарт Б.Дж., Лим Л.П., Бердж CB, Бартель Б., Бартель Д.П.

[11] «Клетка». 14 января 2005 г.; 120 (1): 15–20. « Консервативные пары семян, часто окруженные аденозинами, указывают на то, что тысячи человеческих генов являются мишенями микроРНК ». Льюис Б.П., Бердж С.Б., Бартель Д.П.

[12] "Мол Клетка". 2007, 6 июля; 27(1): 91-105. « Специфичность воздействия микроРНК у млекопитающих: детерминанты, выходящие за рамки спаривания семян ». Гримсон А1, Фарх К.К., Джонстон В.К., Гаррет-Энгеле П., Лим Л.П., Бартель Д.П.

[:0-13] Jump up to: ^а ^б «Геном Рез». Январь 2009 г.;19(1):92-105. « Большинство мРНК млекопитающих являются консервативными мишенями микроРНК ». Фридман RC1, Фарх К.К., Бердж CB, Бартель DP.

[14] Агарвал, Викрам; Белл, Джордж В.; Нам, Джин-Ву; Бартель, Дэвид П. (12 августа 2015 г.). «Прогнозирование эффективных целевых участков микроРНК в мРНК млекопитающих» . электронная жизнь . 4 : e05005. doi : 10.7554/eLife.05005 . ISSN 2050-084X . ПМЦ 4532895 . ПМИД 26267216 .

[15] Агарвал, В.; Субтельный, АО; Тиру, П; Улицкий, И; Бартель, ДП (4 октября 2018 г.). «Прогнозирование эффективности нацеливания микроРНК на дрозофилу» . Геномная биология . 19 (1): 152. дои : 10.1186/s13059-018-1504-3 . ПМК 6172730 . ПМИД 30286781 .

[16] Го, Х; Инголия, Северная Каролина; Вайсман, Дж. С.; Бартель, ДП (12 августа 2010 г.). «МикроРНК млекопитающих преимущественно снижают уровни целевой мРНК» . Природа . 466 (7308): 835–40. Бибкод : 2010Natur.466..835G . дои : 10.1038/nature09267 . ПМЦ 2990499 . ПМИД 20703300 .

[17] Рейнхарт, Би Джей; Бартель, ДП (13 сентября 2002 г.). «Маленькие РНК соответствуют центромерным гетерохроматическим повторам». Наука . 297 (5588): 1831. doi : 10.1126/science.1077183 . ПМИД 12193644 . S2CID 42288846 .

[18] «Научно-консультативный совет» . Alnylam.com . Проверено 5 октября 2016 г.

[19] «Член Уайтхеда Дэвид Бартель избран в Национальную академию наук» . Проверено 25 января 2015 г.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]

[16]

[17]

[18]

[19]

Базы данных авторитетного контроля
Международный	ВИАФ
Национальный	Соединенные Штаты Польша
академики	ОРЦИД