Герберт М. Сауро
Герберт М. Сауро | |
|---|---|
| Рожденный | июль 1960 г. (64 года) Дайфед, Уэльс |
| Национальность | Британия, США |
| Альма-матер |
|
| Известный | анализ метаболического контроля , метаболическая регуляция, SBML |
| Научная карьера | |
| Поля | Биохимия , Биоинженерия , системная биология |
| Учреждения | |
| Диссертация | Контрольный анализ и моделирование метаболизма (1986) |
| Научные консультанты | Дэвид Фелл |
Герберт М. Сауро (родился 19 июля 1960 г.) — валлийский биохимик, работающий в области анализа метаболического контроля и системной биологии .
Раннее и образование
[ редактировать ]Сауро вырос в деревне Лланголман в Пембрукшире и посещал валлийскую общеобразовательную школу Ysgol y Preseli . [ 1 ]
После получения степени бакалавра наук. степень бакалавра биохимии и микробиологии в Университете Кента Кентербери и степень магистра наук. Получив степень бакалавра биологических вычислений в Йоркском университете , Сауро перешёл в Оксфордский университет Брукса, чтобы получить докторскую степень. (1986) под руководством Дэвида Фелла за диссертацию под названием «Контрольный анализ и моделирование метаболизма» , работу, которая привела к нескольким публикациям, в том числе к той, в которой были описаны новые взаимосвязи между эластичностью и коэффициентами контроля. [ 2 ] Впоследствии он получил степень преподавателя в Аберистуитском университете .
Исследовать
[ редактировать ]Сауро проводил постдокторские исследования в Эдинбургском университете совместно с Хенриком Качером , когда он работал над нестационарными системами. [ 3 ] и фермент-ферментные взаимодействия. [ 4 ] [ 5 ]
Студент Оксфордского университета Брукс Сауро написал программу SCAMP для моделирования метаболических систем. [ 6 ] позже развит как Жарнак [ 7 ] и включен в его систему системной биологии . [ 8 ]
Вместе с Хамидом Болури, Эндрю Финни и Майклом Хукой он был членом команды разработчиков по созданию SBML (языка системной биологии разметки). [ 9 ] который оказал большое влияние на эту тему. [ 10 ]
В 2018 году исследовательская группа Сауро опубликовала Tellurium, среду моделирования на основе Python с приложениями в системном анализе и синтетической биологии. [ 11 ]
Книги
[ редактировать ]Сауро — автор книг по анализу метаболического контроля. [ 12 ] кинетика ферментов, [ 13 ] и преобразования Лапласа. [ 14 ]
Карьера
[ редактировать ]Через несколько лет, сначала в Калифорнийском технологическом институте (2000–2005), затем в Институте аспирантуры Кека в Клермонте , Калифорния (2004–2007), Сауро в 2007 году перешёл в Вашингтонский университет в качестве доцента кафедры биоинженерии. [ 15 ] [ 16 ] В 2013 году он получил награду Инженерного колледжа Вашингтонского университета, премию Сообщества новаторов, «Инноватор факультета: преподавание и обучение». [ 17 ]
В настоящее время он является директором Центра воспроизводимого биомедицинского моделирования НИЗ. [ 18 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ ОРЦИД 0000-0002-3659-6817
- ^ Фелл, Д.А.; Сауро, HM (1985). «Метаболический контроль и его анализ: дополнительные взаимосвязи между эластичностью и коэффициентами контроля» . Евро. Дж. Биохим . 148 (3): 555–561. дои : 10.1111/j.1432-1033.1985.tb08876.x . ПМИД 3996393 .
- ^ Асеренца, Л; Сауро, HM; Качер, Х (1989). «Контрольный анализ нестационарных метаболических систем». Дж. Теория. Биол . 137 (4): 423–444. Бибкод : 1989JThBi.137..423A . дои : 10.1016/S0022-5193(89)80038-4 . ПМИД 2626059 .
- ^ Качер, Х; Сауро, HM; Асеренца, Л. (1990). «Фермент-ферментные взаимодействия и контрольный анализ. 1. Случай неаддитивности – мономер-олигомерные ассоциации» . Евро. Дж. Биохим . 187 (3): 481–491. дои : 10.1111/j.1432-1033.1990.tb15329.x . ПМИД 2406132 .
- ^ Сауро, HM; Качер, Х (1990). «Фермент-ферментные взаимодействия и контрольный анализ. 2. Случай несамостоятельности – гетерологичное объединение» . Евро. Дж. Биохим . 187 (3): 493–500. дои : 10.1111/j.1432-1033.1990.tb15330.x . ПМИД 2406133 .
- ^ Сауро, HM (1993). «SCAMP: универсальный симулятор и программы анализа метаболического контроля». Вычислить. Прил. Биосци . 9 (4): 441–450. дои : 10.1093/биоинформатика/9.4.441 . ПМИД 8402211 .
- ^ Сауро, HM (2000). «Жарнак: система интерактивного метаболического анализа». В Хофмейре, Ж.-ХС; Ровер, Дж. М.; Снуп, Дж. Л. (ред.). Анимация карты сотовой связи . Издательство Стелленбосского университета. стр. 221–228. ISBN 0-7972-0776-7 .
- ^ Веллок, К; Чикармане, В.; Сауро, HM (2005). «Интерфейс SBW-MATLAB». Биоинформатика . 21 (6): 823–824. doi : 10.1093/биоинформатика/bti110 . ПМИД 15531613 .
- ^ Хука, М.; Финни, А.; Сауро, HM; Болури, Х.; Дойл, Дж. К.; Китано, Х.; Аркин, AP; Борнштейн, Би Джей; Брей, Д; Корниш-Боуден, А.; Куэльяр, А.А.; Дронов С.; Жиль, Эд; Гинкель, М; Гор, В.; Горянин, И.И.; Хедли, штат Вашингтон; Ходжман, Калифорния; Хофмейр, Ж.-Х. Хантер, Пи Джей; Джути, Н.С.; Касбергер, JL; Кремлинг, А.; Куммер, У.; Ле Новер, Н.; Лоу, LM; Пайк, Д.; Мендес, П.; Минч, Э.; Мьёлснесс, Эд; Накаяма, Ю.; Нельсон, MR; Нильсен, ПФ; Сакурада, Т.; Шафф, JC; Шапиро, Бельгия; Симидзу, ТС; Спенс, HD; Стеллинг, Дж.; Такахаши, К.; Томита, М.; Вагнер, Дж.; Ван, Дж. (2003). «Язык разметки системной биологии (SBML): среда для представления и обмена моделями биохимических сетей» . Биоинформатика . 19 (4): 524–531. CiteSeerX 10.1.1.562.1085 . doi : 10.1093/биоинформатика/btg015 . ПМИД 12611808 .
- ^ Более 2000 цитирований по состоянию на начало 2023 года.
- ^ Чой, Кири; Медли, Дж. Кайл; Кениг, Матиас; Чулок, Кейлин; Смит, Люциан; Гу, Стэнли; Сауро, Герберт М. (июль 2018 г.). «Теллурий: расширяемая среда моделирования на основе Python для систем и синтетической биологии» . БиоСистемы . 171 : 74–79. doi : 10.1016/j.biosystems.2018.07.006 . ISSN 1872-8324 . ПМК 6108935 . ПМИД 30053414 .
- ^ Сауро, Ее Величество (2018). Системная биология: введение в анализ метаболического контроля (2-е изд.). Амброзиус. ISBN 978-0982477366 .
- ^ Сауро, HM (2023). Кинетика ферментов в системной биологии (2-е изд.). Издательство Амброзиус. ISBN 978-0982477335 .
- ^ Сауро, Ее Величество (2021 г.). Маленькая книга преобразований Лапласа . Издательство Амброзиус. ISBN 978-1732548619 .
- ^ https://depts.washington.edu/bpsd/people/faculty/sauro/
- ^ «Герберт М Сауро» . Исследовательские ворота . 14 марта 2023 г. Проверено 14 марта 2023 г.
- ^ «Предыдущие лауреаты премии» . Инженерный колледж UW . 25 июня 2009 года . Проверено 15 марта 2023 г.
- ^ «Центр воспроизводимого биомедицинского моделирования» . Центр воспроизводимого биомедицинского моделирования .
