Дэвид Фелл (биохимик)
Дэвид Фелл | |
---|---|
Рожденный | 16 декабря 1947 г. |
Национальность | Британский |
Альма-матер | Оксфордский университет |
Известный | анализ метаболического контроля , элементарные режимы , анализ баланса потоков |
Научная карьера | |
Поля | системная биология , сетевая биология , генетика |
Учреждения | Оксфордский университет Брукса |
Диссертация | (1974) |
Докторантура | Артур Пикок |
Докторанты | Герберт М. Сауро |
Дэвид А. Фелл — британский биохимик и профессор системной биологии в Оксфордском университете Брукса . [ 1 ] Опубликовал более 200 публикаций, [ 2 ] включая учебник « Понимание контроля метаболизма» [ 3 ] в 1996 году.
Ранние работы
[ редактировать ]Фелл исследовал физическую биохимию пируваткиназы дрожжей . [ 4 ] Он получил должность преподавателя в Оксфордском политехническом институте. [ 1 ] Его ранние работы в Оксфордском политехническом институте были посвящены гемоглобину, где он разработал более точные методы мониторинга насыщения кислородом. [ 5 ] и расщепление 2,3-бисфосфоглицерата под действием Fe(III)-гемоглобина . [ 6 ] В это же время он также работал над первыми исследованиями по моделированию, связанными с функционированием циклических нуклеотид-фосфодиэстераз с высоким и низким по Km регуляции аденозин-3',5'-циклического монофосфата (цАМФ). [ 7 ]
Более поздняя карьера
[ редактировать ]С начала 1980-х годов Дэвид Фелл переключил свои исследования на системную биологию и был одним из первых системных биологов в Великобритании, с публикациями 1979 года. [ 8 ] далее. Другим известным системным биологом того времени был Хенрик Качер из Эдинбургского университета . Учитывая, что его ранние работы имели значительную математическую и вычислительную составляющую, он был идеально расположен для рассмотрения более количественного подхода к изучению свойств сотовых сетей. Именно на этом фоне он обратился к относительно новой области, называемой анализом метаболического контроля, как к средству понимания принципов метаболической регуляции. До разработки анализа метаболического контроля понимание метаболизма основывалось на качественных аргументах, которые приводили к некоторым неверным выводам (шаги, ограничивающие скорость). Большая часть исследований Фелла в течение следующих 20 лет была сосредоточена на расширении и применении анализа метаболического контроля к обмену веществ. Кульминацией этой работы стала публикация его учебника « Понимание контроля над обменом веществ» . [ 3 ] В 1986 году он вместе со своим аспирантом Рэнкином Смоллом опубликовал одну из первых моделей баланса потоков, в которой они использовали линейное программирование для изучения эффективности преобразования глюкозы в жир. [ 9 ] Он также был одним из первых исследователей, применивших метод Гиллеспи для стохастического моделирования в клеточной биологии. [ 10 ] метод, который сейчас обычно используется в системной биологии. В конце 1990-х годов его исследования начали больше смещаться в сторону стехиометрического анализа с особым упором на элементарные моды. [ 11 ] и анализ более крупных сетей, например, участвующих в фотосинтезе. [ 12 ] и полногеномные модели различных организмов, включая одну из первых масштабных моделей генома Arabidopsis . [ 13 ]
Публикации
[ редактировать ]Помимо его учебника, который процитировали 1464 раза (сентябрь 2018 г.), в десятку его лучших публикаций входят: [ 14 ] две публикации, посвященные эволюционному возрасту метаболизма с использованием анализа маленького мира , определение пути с точки зрения элементарных способов , три обзора по анализу метаболического контроля, включая повторную публикацию. [ 15 ] плодотворной работы «Контроль потока» , Кассера и Бернса [ 16 ] две исследовательские статьи по анализу метаболического контроля , одна из самых ранних статей по использованию анализа баланса потоков , одна из самых ранних статей, описывающая модель пути MAPK в передаче сигналов EGF, а также самая ранняя статья, описывающая весь геном. масштабная модель растения арабидопсис .
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б «Профессор Дэвид Фелл — профессор системной биологии» . Оксфордский университет Брукса .
- ^ «Дэвид Фелл — цитаты из Google Scholar» . ученый.google.no . Проверено 31 августа 2020 г.
- ^ Jump up to: а б Фелл, Дэвид (1997). Понимание контроля обмена веществ . Портленд Пресс. ISBN 9781855780477 . OCLC 553392040 .
- ^ Фелл, Дэвид А.; Лиддл, Питер Ф.; Пикок, Артур Р.; Двек, Раймонд А. (1974). «Получение и свойства пируваткиназы дрожжей» . Биохимический журнал . 139 (3): 665–675. дои : 10.1042/bj1390665 . ISSN 0264-6021 . ПМЦ 1166331 . ПМИД 4369339 .
- ^ Фелл, Дэвид (1978). «Автоматизированный смесительный аппарат для определения диссоциации гемоглобина-кислорода». Журнал физиологии . 2823 : 3П–4П. дои : 10.1113/jphysicalol.1978.sp012483 . ПМИД 31462 . S2CID 222217462 .
- ^ Эль-Яссин, ДИ; Фелл, Д.А.; Ллойд, BB; Фишер, РБ (1979). «Расщепление 2,3-бис(фосфо) -D -глицерата Fe(III)-гемоглобином» . Биохимический журнал . 177 (1): 373–375. дои : 10.1042/bj1770373 . ISSN 0264-6021 . ПМЦ 1186379 . ПМИД 426777 .
- ^ Фелл, Дэвид А. (1980). «Теоретический анализ функционирования циклических нуклеотид-фосфодиэстераз с высоким и низким K m в регуляции концентрации аденозин-3',5'-циклического монофосфата в клетках животных». Журнал теоретической биологии . 84 (2): 361–385. дои : 10.1016/s0022-5193(80)80011-7 . ISSN 0022-5193 . ПМИД 6251314 .
- ^ Фелл, Д.А.; Сауро, HM (1986). «Метаболический контроль и его анализ: дополнительные взаимосвязи между эластичностью и коэффициентами контроля» . Европейский журнал биохимии . 148 (3): 555–5616. дои : 10.1111/j.1432-1033.1985.tb08876.x . ISSN 0014-2956 . ПМИД 3996393 .
- ^ Фелл, Д.А.; Смолл, младший (1986). «Синтез жира в жировой ткани. Исследование стехиометрических ограничений» . Биохимический журнал . 238 (3): 781–786. дои : 10.1042/bj2380781 . ISSN 0264-6021 . ПМК 1147204 . ПМИД 3800960 .
- ^ Мониш-Баррето, П.; Фелл, Д.А. (1996), «Моделирование свободнорадикальных реакций дикислорода: их значение в инициировании перекисного окисления липидов», Биомедицина и физика жизни , Vieweg+Teubner Verlag, стр. 137–144, doi : 10.1007/978-3-322 -85017-1_12 , ISBN 9783322850195
- ^ Шустер, С.; Хильгетаг, К.; Шустер, Р. (1996), «Определение элементарных режимов функционирования в биохимических реакционных сетях в устойчивом состоянии», Биомедицина и физика жизни , Vieweg+Teubner Verlag, стр. 101–114, номер документа : 10.1007/978-3-322-85017 -1_9 , ISBN 9783322850195
- ^ Пулман, Марк Г.; Фелл, Дэвид А.; Рейнс, Кристин А. (2003). «Анализ элементарных режимов фотосинтатного обмена в строме хлоропластов» . Европейский журнал биохимии . 270 (3): 430–439. дои : 10.1046/j.1432-1033.2003.03390.x . ISSN 0014-2956 . ПМИД 12542693 .
- ^ Пулман, Миннесота; Миге, Л.; Свитлав, Эл-Джей; Фелл, Д.А. (2009). в масштабе генома «Метаболическая модель арабидопсиса и некоторые ее свойства» . Физиология растений . 151 (3): 1570–1581. дои : 10.1104/стр.109.141267 . ISSN 0032-0889 . ПМК 2773075 . ПМИД 19755544 .
- ^ «Дэвид Фелл — цитаты из Google Scholar» . ученый.google.no . Проверено 25 сентября 2018 г.
- ^ Качер, Х; Бернс, Дж.А.; Фелл, Д.А. (1995). «Контроль потока». Труды Биохимического общества . 23 (2): 341–366. дои : 10.1042/bst0230341 . ПМИД 7672373 .
- ^ Качер, Х; Бернс, Дж. А. (1973). «Контроль потока». Симпозиумы Общества экспериментальной биологии . 27 : 65–104.