Участок входа в внутреннюю рибосому пикорнавируса (IRES)
Участок входа в внутреннюю рибосому пикорнавируса (IRES) | |
---|---|
![]() Прогнозируемая вторичная структура и сохранение последовательности IRES_PICORNA | |
Идентификаторы | |
Символ | Ires_picorna |
RFAM | RF00229 |
Другие данные | |
РНК тип | Cis-reg ; IRES |
Домен (ы) | Вирусы |
ИДТИ | Go: 0043022 |
ТАК | SO: 0000243 |
PDB Структуры | PDBE |
Эта семья представляет пикорнавируса элемент внутреннего участка вступления в внутренний рибосоме (IRES), присутствующий в их 5 -'нетранслируемом регионе. [ 1 ] Эти элементы были обнаружены в пикорнавирусах. [ 2 ] Они представляют собой последовательности РНК цис-действия, которые принимают различные трехмерные структуры, рекрутируют механизм трансляции и часто работают в связи со специфическими РНК-связывающими белками. [ 2 ] Элементы IRES позволяют CAP и конечно-независимый трансляция мРНК . в клетке-хозяине Было обнаружено, что La Autoantigen (LA) необходим для трансляции Coxsackievirus B3 (CVB3), опосредованного IRES, и было высказано предположение, что LA может потребоваться для эффективной трансляции вирусной РНК в поджелудочной железе . [ 3 ] [ 4 ] Основываясь на их вторичной структуре, Picornavirus Ires сгруппированы в четыре основных типа. Тип I включает в себя энтеро и риновирус и II типа, кардио- и афтовирус, среди прочих. Тип III используется для названия гепатита А IRES. [ 2 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Фернандес-Мирагалл, Ольга; Пятый, Соня Лопес де; Мартинес-Салас, Энкарнасион (февраль 2009 г.). «Повторная структура РНК для активности картины, независимо от элементов». Исследовательский вирус . 139 (2): 172–182. Doi : 10.1016/j.virusres . PMID 18692097 .
- ^ Jump up to: а беременный в Мартинес-Салас, Энкарнацион; Франциско-Элалля, Росарио; Фернандес-Чаморро, Хавьер; Лозано, Глория; Диас-Тольдано, Роза (август 2015 г.). «ПИКОРНАВИРУС, НЕ ЭЛЕМЕНТЫ: РНК -структура и взаимодействие белка -хозяина». Исследовательский вирус . 206 : 62–73. Doi : 10.1016/j.virusres.2015.01.012 . HDL : 10261/140186 . PMID 25617758 .
- ^ Ray PS, Das S (октябрь 2002 г.). «La Autoantigen необходим для внутренней опосредованной на участке рибосомы трансляции RNA Coxsackievirus B3» . Исследование нуклеиновых кислот . 30 (20): 4500–4508. doi : 10.1093/nar/gkf583 . PMC 137146 . PMID 12384597 .
- ^ Лю З., Карти С.М., Чеунг П., Бохунек Л., Уилсон Дж., Макманус Б.М., Ян Д. (декабрь 1999 г.). «Структурный и функциональный анализ 5 'нетранслируемой области РНК Coxsackievirus B3: исследования трансляционных и инфекционных исследований in vivo у мутантов полноразмерных» . Вирусология . 265 (2): 206–217. doi : 10.1006/viro.1999.0048 . PMID 10600593 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]- http://rfam.xfam.org/family/rf00229 Входной сайт Внутреннего рибосомы пикорнавируса (IRES)
- Страница для пикорнавируса внутреннего сайта входа в рибосому (IRES) на RFAM