Центрифугирование с плавучей плотностью

Центрифугирование с плавучей плотностью (также изопикническое центрифугирование или центрифугирование с равновесным градиентом плотности ) использует концепцию плавучести для разделения молекул в растворе по разнице их плотности.

Выполнение

Исторически хлорида цезия часто использовался раствор (CsCl), но чаще всего используются градиенты плотности сахарозы или перколла . Для этого применения требуется раствор с высокой плотностью и при этом относительно низкой вязкостью, и CsCl подходит для него из-за его высокой растворимости в воде, высокой плотности из-за большой массы Cs, а также низкой вязкости и высокой стабильности растворов CsCl. ^[1]

Образец помещается поверх раствора, а затем трубка вращается с очень высокой скоростью в течение длительного времени, иногда нескольких дней. Молекулы CsCl плотно упаковываются ко дну, поэтому образуется непрерывный градиент слоев различной плотности (и концентрации CsCl). Поскольку исходный раствор имел примерно одинаковую плотность, они переходят на уровень, на котором их плотность и плотность CsCl совпадают, до чего они образуют резкую отчетливую полосу.

Разделение изотопов

Этот метод очень резко разделяет молекулы, причем настолько острый, что позволяет даже отделять друг от друга разные молекулярные изотопы. ^[2]

разделение ДНК

Плавучая плотность большей части ДНК составляет 1,7 г/см. ³^[3] что равно плотности 6М раствора CsCl. ^{[ нужна ссылка ]} Плавучая плотность ДНК меняется в зависимости от содержания в ней GC . Термин « сателлитная ДНК » относится к небольшим полосам повторяющихся последовательностей ДНК с различным составом оснований, плавающим выше (богатая A+T) или ниже (богатая G+C) ДНК основного компонента.

См. также

Ссылки

^ Берт, Ричард О. (4 декабря 2000 г.). «Цезий и соединения цезия» . Энциклопедия химической технологии Кирка-Отмера . дои : 10.1002/0471238961.0305190902211820.a01 .
^ Дюмон, Марк Г.; Мюррелл, Дж. Колин (июнь 2005 г.). «Зондирование стабильными изотопами — связь микробной идентичности с функцией» . Обзоры природы Микробиология . 3 (6): 499–504. дои : 10.1038/nrmicro1162 . ISSN 1740-1534 . ПМИД 15886694 . S2CID 24051877 .
^ Арриги, Фрэнсис Э.; Мандель, Мэнли; Бергендал, Джанет; Сюй, TC (июнь 1970 г.). «Плавущая плотность ДНК млекопитающих». Биохимическая генетика . 4 (3): 367–376. дои : 10.1007/BF00485753 . ПМИД 4991030 .

Дальнейшее чтение

Шильдкраут, Карл Л.; Мармур, Юлиус; Доти, Пол (1962). «Определение основного состава дезоксирибонуклеиновой кислоты по ее плавучей плотности в CsCl». Журнал молекулярной биологии . 4 (6): 430–443. дои : 10.1016/S0022-2836(62)80100-4 . ISSN 0022-2836 . ПМИД 14498379 .
Джеймс Грин (25 июня 1998 г.). Принципы и методологии рекомбинантной ДНК . ЦРК Пресс. стр. 278–. ISBN 978-0-8247-9989-2 .

Эта статья об химии незавершена . аналитической Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[1] Берт, Ричард О. (4 декабря 2000 г.). «Цезий и соединения цезия» . Энциклопедия химической технологии Кирка-Отмера . дои : 10.1002/0471238961.0305190902211820.a01 .

[2] Дюмон, Марк Г.; Мюррелл, Дж. Колин (июнь 2005 г.). «Зондирование стабильными изотопами — связь микробной идентичности с функцией» . Обзоры природы Микробиология . 3 (6): 499–504. дои : 10.1038/nrmicro1162 . ISSN 1740-1534 . ПМИД 15886694 . S2CID 24051877 .

[3] Арриги, Фрэнсис Э.; Мандель, Мэнли; Бергендал, Джанет; Сюй, TC (июнь 1970 г.). «Плавущая плотность ДНК млекопитающих». Биохимическая генетика . 4 (3): 367–376. дои : 10.1007/BF00485753 . ПМИД 4991030 .

[1]

[2]

[3]