Гэри Б. Фогель
Гэри Брайс Фогель (1968 г.р.) — американский биолог и ученый-компьютерщик. Он является генеральным директором Natural Selection, Inc. [1] Он наиболее известен своими приложениями вычислительного интеллекта и машинного обучения в биоинформатике, вычислительной биологии и промышленной оптимизации.
Образование и исследования
[ редактировать ]Фогель родился и вырос в Ла-Хойе, Калифорния , окончил среднюю школу Ла-Хойи . Он получил степень бакалавра биологии со специализацией в области наук о Земле в Калифорнийском университете в Санта-Крус в 1991 году и степень доктора философии. получил степень бакалавра биологии в Калифорнийском университете в Лос-Анджелесе в 1998 году. Фогель опубликовал более 150 рецензируемых публикаций на конференциях и в журналах. [2] 2 отредактированные книги, [3] [4] и 11 патентов. Будучи генеральным директором Natural Selection, Inc., его исследования сосредоточены на применении вычислительного интеллекта, машинного обучения и прогнозной аналитики в областях, не ограничивающихся: вирусной эволюцией , [5] [6] [7] [8] клеточная дифференциация , [9] [10] [11] открытие лекарств , [12] [13] [14] структура РНК , [15] [16] цис-регуляторные элементы , [17] [18] рак , [19] и эволюционная теория игр [20] [21] [22] а также разработка эволюционных алгоритмов и других подходов. [23] [24] [25] [26] [27]
Услуга
[ редактировать ]В период с 2008 по 2018 год Гэри Фогель был главным редактором журнала Elsevier BioSystems . [28] Ранее он работал заместителем редактора журналов IEEE Transactions on Artificial Intelligence, журнала IEEE Computational Intelligence Magazine (2005–2010), IEEE Transactions on Evolutionary Computation (2001–2013), IEEE Transactions on Emerging Topics in Computational Intelligence (2016–2018), IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics (2004–2008), Международный журнал исследований и приложений биоинформатики (2004–2007), Международный журнал интеллектуального анализа данных и биоинформатики (2005–2007), в качестве редактора-консультанта журнала Computational. Интеллект в биоинформатике (2006–2007 гг.), а также член редакционного совета журналов «Экологическая информатика» (2005–2009 гг.) и BMC Big Data Analytics (2015–2020 гг.).
В рамках Общества вычислительной разведки IEEE Фогель основал Технический комитет по биоинформатике и биоинженерии и учредил серию конференций IEEE «Вычислительный интеллект в биоинформатике и вычислительной биологии», председательствуя на первых двух собраниях в 2004 и 2005 годах в Сан-Диего. [29] Он работал в административном комитете Общества вычислительной разведки IEEE (2004–2009, 2014–2022). [30] и занимал должность вице-президента по конференциям IEEE CIS (2010–2013, 2019).
Обучение
[ редактировать ]Гэри Фогель также работает адъюнкт-преподавателем в Государственном университете Сан-Диего на факультете аэрокосмической техники. [31] а также в Центре компьютерных исследований. [32] Он написал четыре книги [33] [34] [35] [36] и многочисленные статьи по истории ранней авиации, посвященные безмоторным полетам. Он является ассоциированным научным сотрудником Американского института аэронавтики и астронавтики. [37] и работает в Историческом комитете AIAA. [38]
Награды
[ редактировать ]- 2023 — Премия за выдающийся вклад в аэрокосмическое образование, секция AIAA в Сан-Диего.
- 2022 г. - избран членом Азиатско-Тихоокеанской ассоциации искусственного интеллекта.
- 2019 – 100 лучших лидеров в области искусственного интеллекта в области открытия лекарств и передового здравоохранения по версии Deep Knowledge Analytics [39]
- 2019 - Премия за выдающийся вклад в аэрокосмическое образование, секция AIAA в Сан-Диего
- 2016 - Премия за заслуги перед обществом IEEE Computational Intelligence Society. [40]
- 2016 — Премия сообщества за выдающийся вклад, секция AIAA в Сан-Диего. [41]
- 2015 - Премия за выдающееся улучшение имиджа аэрокосмической профессии, секция AIAA в Сан-Диего
- 2012 - Медаль за выдающиеся достижения, отделение Sigma Xi в Сан-Диего.
- 2012 г. – научный сотрудник Института инженеров электротехники и электроники. [42] за вклад в вычислительный интеллект и его применение в биологии, химии и медицине .
Авиамоделирование
[ редактировать ]Гэри Фогель установил национальные и мировые рекорды среди моделей самолетов. [43] Он помог создать программу национального модельного авиационного наследия. [44] для Академии модельного воздухоплавания . Он является лидером, директором конкурса и избранным членом Академии моделей аэронавтики.
Ссылки
[ редактировать ]- ^ «Корпоративный менеджмент» .
- ^ «Гэри Фогель» .
- ^ Фогель, Гэри Б.; Корн, Дэвид В. (2003). Эволюционные вычисления в биоинформатике . ISBN 1558607978 .
- ^ Вычислительный интеллект в биоинформатике . 2010. АСИН B0017T76EG .
- ^ Ламерс, Сюзанна Л.; Фогель, Гэри Б.; Нолан, Дэвид Дж.; Барбье, Эндрю Э.; Роуз, Ребекка; Певица Элиз Дж.; Гонсалес-Перес, Мария Пас; МакГрат, Майкл С. (июнь 2019 г.). «Новые закономерности вариабельных доменов gp120 ВИЧ-1 в анатомических тканях в отсутствие вирусной нагрузки в плазме» . Исследования СПИДа и ретровирусы человека . 35 (6): 588–596. дои : 10.1089/aid.2018.0267 . ПМК 6588100 . ПМИД 30793919 .
- ^ Ламерс, Сюзанна Л.; Фогель, Гэри Б.; Лю, Енох С.; Барбье, Эндрю Э.; Родригес, Кристофер В.; Певица Элиз Дж.; Нолан, Дэвид Дж.; Роуз, Ребекка; МакГрат, Майкл С. (2018). «Мозгоспецифичный ВИЧ-Nef выявлен у многих пациентов с неврологическими заболеваниями» . Журнал нейровирусологии . 24 (1): 1–15. дои : 10.1007/s13365-017-0586-0 . ПМЦ 5792318 . ПМИД 29063512 .
- ^ Магуайр, Аланна; Фогель, Гэри Б; Кендрик, Саманта Л.; Лю, Енох С; Виснер, Ли; Рамсауэр, Коллин; Глинсманн-Гибсон, Бетти; Ламерс, Сюзанна Л; МакГрат, Майкл С.; Римша, Лиза М. (07 декабря 2017 г.). «Статус вируса иммунодефицита человека (ВИЧ) стимулирует диффузную крупноклеточную В-клеточную лимфому через онкогенные сигнальные пути» . Кровь . 130 (Дополнение 1): 5128. doi : 10.1182/blood.V130.Suppl_1.5128.5128 . S2CID 251171043 .
- ^ Ламерс, Сюзанна Л.; Роуз, Ребекка; Майджи, Екатерина; Агсалда-Гарсия, Мелисса; Нолан, Дэвид Дж.; Фогель, Гэри Б.; Салеми, Марко; Гарсия, Дебра Л.; Браччи, Пейдж; Йонг, Уильям; Комминс, Дебора; Сказал, Джонатан; Ханлоу, Негар; Хинкин, Чарльз Х.; Суэйрас, Мигель Вальдес; Матисен, Гленн; Донован, Сюзанна; Ширамидзу, Брюс; Стоддарт, Шерил А.; МакГрат, Майкл С.; Певица, Элиз Дж. (15 октября 2016 г.). «ДНК ВИЧ часто присутствует в патологических тканях, оцениваемых при аутопсии пациентов, получающих комбинированную антиретровирусную терапию, с неопределяемой вирусной нагрузкой» . Журнал вирусологии . 90 (20): 8968–8983. дои : 10.1128/JVI.00674-16 . ПМК 5044815 . ПМИД 27466426 .
- ^ Фогель, Гэри Б.; Кай, Зоя С.; Заргар, Сахар; Хинтон, Эндрю; Джонс, Дж. Адам; Вонг, Огаста С.; Фичичи, Севан Г.; Лопес, Ана Д.; Кинг, Чарльз К. (декабрь 2015 г.). «Динамика микроРНК во время дифференцировки эмбриональных стволовых клеток человека в энтодерму поджелудочной железы». Джин . 574 (2): 359–370. дои : 10.1016/j.gene.2015.08.027 . ПМИД 26297998 .
- ^ Хинтон, Эндрю; Хантер, Шон Э.; Африканова, Ивка; Джонс, Дж. Адам; Лопес, Ана Д.; Фогель, Гэри Б.; Хайек, Альберто; Кинг, Чарльз К. (сентябрь 2014 г.). «Анализ секвенирования РНК эмбриональных стволовых клеток человека и дефинитивной эндодермы выявляет дифференциально экспрессируемые микроРНК и новые изомиР с различными мишенями: анализ секвенирования РНК эмбриональных стволовых клеток человека» . Стволовые клетки . 32 (9): 2360–2372. дои : 10.1002/stem.1739 . ПМИД 24805944 . S2CID 9725569 .
- ^ Хинтон, Эндрю; Хантер, Шон; Рейес, Глория; Фогель, Гэри Б.; Кинг, Чарльз К. (2012). «От плюрипотентности к островкам». Достижения в генетике, том 79 . Том. 79. стр. 1–34. дои : 10.1016/B978-0-12-394395-8.00001-3 . ISBN 978-0-12-394395-8 . ПМИД 22989764 .
- ^ Хехт, Дэвид; Фогель, Гэри Б. (2012). «Моделирование эволюции лекарственной устойчивости малярии» . Журнал компьютерного молекулярного дизайна . 26 (12): 1343–1353. Бибкод : 2012JCAMD..26.1343H . дои : 10.1007/s10822-012-9618-2 . ПМЦ 3535480 . ПМИД 23179493 .
- ^ Хехт, Дэвид; Тран, Джонатан; Фогель, Гэри Б. (октябрь 2011 г.). «Структурно-ориентированный анализ эволюции дигидрофолатредуктазы». Молекулярная филогенетика и эволюция . 61 (1): 212–230. Бибкод : 2011MolPE..61..212H . дои : 10.1016/j.ympev.2011.06.005 . ПМИД 21704717 .
- ^ Хехт, Дэвид; Фогель, Гэри Б. (27 апреля 2009 г.). «Новый подход In Silico к открытию лекарств с помощью вычислительного интеллекта». Журнал химической информации и моделирования . 49 (4): 1105–1121. дои : 10.1021/ci9000647 . ПМИД 19348414 .
- ^ Ламерс, Сюзанна Л.; Фогель, Гэри Б.; МакГрат, Майкл С. (2010). «Эволюция ВИЧ-миР-H1 в ходе патогенеза ВИЧ» . Биосистемы . 101 (2): 88–96. Бибкод : 2010BiSys.101...88L . doi : 10.1016/j.biosystems.2010.05.001 . ПМК 3478900 . ПМИД 20546828 .
- ^ Фогель, Великобритания (декабрь 2002 г.). «Открытие структурных элементов РНК с помощью эволюционных вычислений» . Исследования нуклеиновых кислот . 30 (23): 5310–5317. дои : 10.1093/нар/gkf653 . ПМК 137967 . ПМИД 12466557 .
- ^ Фогель, Великобритания (16 июля 2004 г.). «Открытие мотивов последовательности, связанных с совместной экспрессией генов с использованием эволюционных вычислений» . Исследования нуклеиновых кислот . 32 (13): 3826–3835. дои : 10.1093/nar/gkh713 . ПМК 506801 . ПМИД 15266008 .
- ^ Фогель, Гэри Б.; Уикс, Дана Г.; Варга, Габор; Доу, Эрнст Р.; Крэйвен, Эндрю М.; Харлоу, Гарри Б.; Су, Эрик В.; Ония, Джуд Э.; Су, Чен (август 2005 г.). «Статистический анализ базы данных ТРАНСФАК». Биосистемы . 81 (2): 137–154. Бибкод : 2005BiSys..81..137F . doi : 10.1016/j.biosystems.2005.03.003 . ПМИД 15941617 .
- ^ Корнфорт, Эндрю Н.; Фогель, Гэри; Карбонелл, Дениша; Диллман, Роберт О. (1 августа 2015 г.). «Реферат 4845: Микроматричный анализ линий аутологичных опухолевых клеток меланомы, используемых в качестве источника опухолеассоциированных антигенов в исследовании фазы II индивидуальной иммунотерапии дендритными клетками у пациентов с метастатической меланомой». Исследования рака . 75 (15_Supplement): 4845. doi : 10.1158/1538-7445.AM2015-4845 .
- ^ Фогель, Дэвид Б; Фогель, Гэри Б; Эндрюс, Питер С. (ноябрь 1997 г.). «О неустойчивости эволюционно устойчивых стратегий». Биосистемы . 44 (2): 135–152. Бибкод : 1997BiSys..44..135F . дои : 10.1016/S0303-2647(97)00050-6 . ПМИД 9429748 .
- ^ Фогель, Гэри Б.; Эндрюс, Питер С.; Фогель, Дэвид Б. (июнь 1998 г.). «О неустойчивости эволюционно стабильных стратегий в малых популяциях». Экологическое моделирование . 109 (3): 283–294. Бибкод : 1998EcMod.109..283F . дои : 10.1016/S0304-3800(98)00068-4 .
- ^ Фогель, Гэри Б.; Фогель, Дэвид Б. (апрель 2011 г.). «Моделирование естественного отбора как механизма отбраковки конечных популяций с помощью игры ястреб-голубь». Биосистемы . 104 (1): 57–62. Бибкод : 2011BiSys.104...57F . doi : 10.1016/j.biosystems.2011.01.002 . ПМИД 21219966 .
- ^ Фогель, Дэвид Б; Фогель, Гэри Б; Окура, Казухиро (июль 2001 г.). «Многовекторная самоадаптация в эволюционных алгоритмах». Биосистемы . 61 (2–3): 155–162. Бибкод : 2001BiSys..61..155F . дои : 10.1016/S0303-2647(01)00167-8 . ПМИД 11716975 .
- ^ Фогель, Великобритания; Гринвуд, Джорджия; Челлапилла, К. (2000). «Эволюционные вычисления с вымиранием: эксперименты и анализ». Материалы Конгресса 2000 г. по эволюционным вычислениям. CEC00 (Кат. номер 00TH8512) . Том. 2. С. 1415–1420. дои : 10.1109/CEC.2000.870818 . ISBN 0-7803-6375-2 . S2CID 14051394 .
- ^ Эшлок, Дэниел; Кршич, Никола; Фогель, Гэри Б. (2013). «Функции анализа разведки и эксплуатации». Конгресс IEEE 2013 по эволюционным вычислениям . стр. 2020–2027 гг. дои : 10.1109/CEC.2013.6557807 . ISBN 978-1-4799-0454-9 . S2CID 12294772 .
- ^ Кринк, Т.; Филипич, Б.; Фогель, Великобритания (2004). «Зашумленные задачи оптимизации - особая проблема дифференциальной эволюции?». Материалы Конгресса по эволюционным вычислениям 2004 г. (каталожный номер IEEE 04TH8753) . стр. 332–339. дои : 10.1109/CEC.2004.1330876 . ISBN 0-7803-8515-2 . S2CID 6842873 .
- ^ Фогель, Гэри Б.; Фогель, Дэвид Б. (январь 1995 г.). «Непрерывное эволюционное программирование: анализ и эксперименты». Кибернетика и системы . 26 (1): 79–90. дои : 10.1080/01969729508927488 .
- ^ «Биосистемы» .
- ^ «Доктор Гэри Фогель возглавляет первый симпозиум IEEE 2004 года по вычислительному интеллекту» . Архивировано из оригинала 20 декабря 2016 г.
- ^ «ADCOM-Административный комитет — Общество вычислительной разведки IEEE» . Архивировано из оригинала 22 августа 2019 года.
- ^ «Преподаватели, преподаватели и сотрудники» .
- ^ «CSRC::Управление» .
- ^ Фогель, Гэри (июль 2021 г.). Sky Rider: Парк Ван Тассель и рост воздухоплавания на Западе . ISBN 978-0826362827 .
- ^ Фогель, Гэри (июль 2000 г.). Ветер и крылья: история полета в Сан-Диего . ISBN 0967033950 .
- ^ В поисках полета: Джон Дж. Монтгомери и зарождение авиации на Западе . 17 октября 2012 г. ASIN B009W1J8M4 .
- ^ Фогель, Гэри Б. (7 апреля 2014 г.). Планерный порт Торри Пайнс . ISBN 978-1531676087 .
- ^ «Сотрудники AIAA» (PDF) . АААА. Январь 2022 г.
- ^ "О нас" .
- ^ «100 лучших лидеров ИИ в области открытия лекарств и передового здравоохранения» (PDF) . dkaGlobal . Аналитика глубоких знаний.
- ^ Йен, Гэри Г. (2016). «Награды IEEE CIS Awards 2016 [Общественные обзоры]». Журнал IEEE Computational Intelligence . 11 : 4–7. дои : 10.1109/MCI.2015.2502123 .
- ^ «Страница без названия» (PDF) .
- ^ «Высокий парень, 2012 г.» (PDF) . Справочник участников IEEE . [ мертвая ссылка ]
- ^ «Рекорды авиамоделирования и космомоделирования» . Август 2017.
- ^ «Академия воздухоплавания» .