Авайс Хан (генетик растений)

Авайс Хан
Авайс Хан
Рожденный	1977 (46–47 лет) ; Палландри , Азад Джамму и Кашмир , Пакистан
Альма-матер	Университет Георга-Августа, Геттинген , Германия ; Швейцарский федеральный технологический институт (ETH) , Цюрих , Швейцария
Известный	Генетика растений , ; Геномика растений , ; Улучшение урожая , ; Генетика и геномика яблок
	Научная карьера
Поля	Сельское хозяйство
Учреждения	Международный центр картофеля (CIP) ; Корнелльский университет

Авайс Хан (1977 г.р.) — пакистано-американский генетик растений и доцент Колледжа сельского хозяйства и наук о жизни Корнельского университета . ^[1]^[2]

Его исследования сосредоточены на генетике устойчивости яблок к болезням . ^[1] улучшение урожая, устойчивое сельское хозяйство и продовольственная безопасность. ^[2] До того, как занять эту должность, он возглавлял глобальную исследовательскую программу по генетике адаптации и устойчивости к абиотическому стрессу картофеля и сладкого картофеля в Международном центре картофеля (CIP) , Лима , Перу. ^[3]^[4]^.

Биография [ править ]

Хан родился в маленькой деревне под названием Талиан в Палландри , Азад Кашмир (часть спорного региона Джамму и Кашмир, находящаяся под управлением Пакистана), и имел скромное финансовое положение. Его начальное образование он получил в «школе таат», где ученики сидели на джутовой циновке (таат) на земле, а он также помогал своим родителям выращивать урожай и разводить скот. ^[2]

Он получил докторскую степень в Швейцарском федеральном технологическом институте (ETH) , Цюрих , Швейцария , по бактериальному ожогу яблок Великобритания , и степень магистра в Университете Георга-Августа , Геттинген , Германия , с дальнейшим исследовательским опытом в Йоркском университете , , и в университете Иллинойс, Урбана-Шампейн , США. ^[1]^[2]

Он публиковался в нескольких влиятельных научных журналах, включая Science , Nature Genetics и Genome Research . ^[5] Его исследования о быстром упадке яблонь , бактериальном ожоге , генетике и геномике яблок также освещались в популярных журналах, включая Science Magazine , The Economist , New York Times и Forbes . ^[6]^[7]^[8]^[2] В 2022 году доктор Хан совместно возглавил исследование и завершил сборку последовательности генома Honeycrisp яблок в масштабе хромосом . ^[9]^[10]

Избранные публикации [ править ]

Тегтмайер Р., Помпили В., Сингх Дж., Микелетти Д., Сильва Дж.К., Малной М., Хан М.А. 2020. Картирование генов-кандидатов идентифицирует геномные вариации генов восприимчивости к бактериальному ожогу HIPM и DIPM в зародышевой плазме Malus . Научные отчеты, 10, 16317.
Папп Д., Гао Л., Тапа Р., Олмстед Д., Хан М.А. 2020. Восприимчивость яблони к парше в разнообразной коллекции зародышевой плазмы Malus определяет потенциальные источники устойчивости для селекции яблони. CABI Сельское хозяйство и биологические науки, в печати .
Тапа Р., Чжан К., Снавели Н., Белонги С., Хан М.А. 2020. Набор данных «Патология растений 2020» позволяет классифицировать лиственные заболевания яблок. Приложения в науках о растениях, 8 (9), e11390.
Сингх Дж., Кобб-Смит Д., Хиггинс Э., Хан М.А. 2020. Сравнительная оценка иммуноанализа латерального потока, LAMP и количественной ПЦР для диагностики бактериального ожога в яблоневых садах. Журнал патологии растений, дои : 10.1007/s42161-020-00644-w .
Ю М., Сингх Дж., Хан М.А., Сундин Г.В., Чжао Ю. 2020. Полная последовательность генома возбудителя бактериального ожога штамма Erwinia amylovora Ea1189. Молекулярные растительно-микробные взаимодействия, два : 10.1094/MPMI-06-20-0158-A .
Перейра Г, Геменет Д, Моллинари М, Олуколу Б, Вуд Дж, Диас Ф, Москера В, Грюнеберг В, Хан М.А., Бьюэлл Р, Йенчо С, Зенг ЗБ. 2020. Множественное картирование QTL у автополиплоидов: подход модели со случайным эффектом с применением в популяции полнородных сибсов гексаплоидного сладкого картофеля. Генетика, 215 (3), 579–595.
Ян Х.В., Ю М., Лю Дж., Хан М.А., Чжао Ю. 2020. Характеристика генов, участвующих в биосинтезе предшественников (p)ppGpp у Erwinia amylovora . Журнал патологии растений, два : 10.1007/s42161-020-00583-6 .
[ PubMed ] Папп Д., Сингх Дж., Гадури Д., Хан М.А. 2020. Новые североамериканские изоляты Venturia inaequalis способны преодолеть устойчивость Malus floribunda 821 к парше яблони. Plant Болезнь, 104(3), 649-655.
Сингх Дж., Фабрицио Дж., Десну Э., Перейра Силва Дж., Буш В., Хан М.А. 2020. Особенности корневой системы влияют на раннюю восприимчивость яблони к бактериальному ожогу ( Malus×domestica ). Биология растений BMC, 19 (1), 1-14.
Моллинари М., Олуколу Б., Перейра Г., Хан М.А., Геменет Д., Йенчо С. и Зенг З.Б. 2019. Раскрытие гексаплоидного наследования сладкого картофеля с помощью сверхплотного мультилокусного картирования. G3: Гены|Геномы|Генетика, 10 (1), 281–292.
Сингх Дж. и Хан М.А. 2019. Отличительные закономерности естественного отбора определяют структуру субпопуляций возбудителя бактериального ожога Erwinia amylovora . Научные отчеты, 9 (1), 1–13.
Геменет Д, Перейра Г, Бёк Д, Вуд Дж, Моллинари М, Олуколу Б, Диас Ф, Москера В, Ссали Р, Дэвид М, Китави М, Бургос Г, Зум Фельде Т, Гислен М, Кэри Е, Суонкарт Дж, Коин Л., Фей З., Гамильтон Дж., Яда Б., Йенчо С., Зенг З.Б., Мванга Р., Хан М.А., Грюнеберг В., Бьюэлл Р. 2019. Локусы количественных признаков и анализ дифференциальной экспрессии генов раскрывают генетическую основу отрицательно ассоциированного β-каротина. и содержание крахмала в гексаплоидном батате [ Ipomoea batatas (L.) Lam.]. Теоретическая и прикладная генетика, 133, 23-36.
Ли Х, Сингх Дж, Цинь М, Ли Х, Чжан Х, Чжан М, Хан М.А., Чжан С., Ву Дж. 2019. Разработка интегрированного массива генотипирования SNP из 200 тыс. и его применение для генетического картирования, улучшения сборки генома и GWAS в груше. (Пирус) . Журнал биотехнологии растений, 17 (8), 1582–1594.
Перейра Силва К.Дж., Сингх Дж., Беднарек Р., Фей З., Хан М.А. 2019. Дифференциальные регуляторные реакции генов на бактериальный ожог у двух сортов яблони ( Malus × Domestica ). Исследования в области садоводства, 6 (1), 35.
Сингх Дж., Перейра Силва К.Дж., Фукс М. и Хан М.А. 2019. Потенциальная роль погоды, почвенных и растительных микробных сообществ в быстром упадке яблонь. ПлоСОНЕ, 14 (3), дои : 10.1371/journal.pone.0213293 .
Ву С, Лау К.Х., Цао Q, Гамильтон Дж.П., Сунь Х., Чжоу С., Эзерман Л., Геменет Д.С., Олуколу Б.А., Ван Х., Крисован Е., Годден Г., Цзяо С., Ван Х., Китави Н., Манрике-Карпинтеро Н., Вайланкур Б, Вигерт-Ринингер К, Ян Х, Бао К, Шафф Дж, Кройце Дж, Грюнеберг В, Хан М.А., Гислен М, Ма Д, Цзян Дж, Мванга Р, Либенс-Мак Дж, Коин Л, Йенчо С, Бьюэлл Р., Фей З. 2018. Последовательности генома двух диплоидных диких родственников культивируемого сладкого картофеля обнаруживают цели для генетического улучшения. Природные коммуникации, 9(1), 4580.
Лау К.Х., дель Росарио Эррера М., Крисован Э., Ву С., Фей З., Хан М.А., Бьюэлл Ч.Р., Геменет, округ Колумбия. 2018. Транскриптомный анализ сладкого картофеля в условиях стресса обезвоживания идентифицирует гены-кандидаты устойчивости к засухе. Завод Директ, 2 (10), два : 10.1002/pld3.92 .
Чжоу С, Дуарте Т, Сильвестр Р, Россель Г, Мванга РО, Хан М.А., Джордж А.В., Фей З., Йенчо Г.К., Эллис Д., Коин Л.Дж. 2018. Анализ популяционной структуры восточноафриканских сортов сладкого картофеля на основе гибридной сборки геномов хлоропластов. Открытое исследование Гейтса, 5 (2).
Виллордон А., Грегори Дж.С., Лабонте Д., Хан М.А., Селварадж М. 2018. Изменение длины корней батата Bayou Belle и Beauregard в ответ на экспериментальный дефицит фосфора и обработку уплотненных слоев. HortScience, 53 (10), 1534–1540.
Ву Дж, Ван Ю, Сюй Дж, Корбан СС, Фей З, Тао С, Мин Р, Тай С, Хан М.А., Почтальон Дж. Д., Гу С. 2018. Диверсификация и независимое одомашнивание азиатских и европейских груш. Геномная биология, 19 (1), 77.
Десну Э, Норелли Дж. Л., Олдвинкл Х.С., Вишневский М.Е., Эванс К.М., Малной М., Хан М.А. 2018. Идентификация новых штаммоспецифичных и зависящих от окружающей среды второстепенных QTL, связанных с устойчивостью яблок к бактериальному ожогу. Репортер по молекулярной биологии растений, 36 (2), 247–256.
Бай Дж., Мао Дж., Ян Х., Хан М.А., Фань А., Лю С., Чжан Дж., Ван Д., Гао Х. и Чжан Дж. 2017. Гены протеинкиназы 2, не связанной с ферментом 1 сахарозы ( SnRK 2), могут опосредовать Стрессовые реакции картофеля ( Solanum tuberosum L.). БМК Генетикс, 18 (1), 41.
Рамирес Д.А., Яктайо В., Ренс Л.Р., Роландо Х.Л., Паласиос С., Де Мендибуру Ф., Марес В., Барреда С., Лоайса Х., Монневё П., Зотарелли Л., Хан М.А., Кирос Р. 2016. Определение биологических порогов, связанных с состоянием воды в растениях. для мониторинга эффектов ограничения воды: Устьичная проводимость и восстановление фотосинтеза как ключевые показатели картофеля. Управление водными ресурсами в сельском хозяйстве, 177, 369–378.
Саравиа Д, Фарфан Э, Гутьеррес Р, Мендибуру Ф, Шафляйтнер Р, Боньербале М, Хан М.А. 2016. Урожайность и физиологическая реакция картофеля указывают на различные стратегии борьбы с стрессом от засухи и внесения азотных удобрений. Американский журнал исследований картофеля, 93 (3), 288–295.
Линдквист Кройце Х., Хан М.А., Салас Э., Мейалаган С., Томсон С., Гомес Р., Боньербале М. 2015. Изменение формы клубня и глубины глазка у диплоидного семейства андского картофеля. БМЦ Генетика, 16 (1), 57.
Хан М.А., Олсен К.М., Соверо В., Кушад М.М., Корбан СС. 2014. Качество плодов могло сыграть решающую роль в одомашнивании яблока. Геном растения, 7 (3), doi : 10.3835/plantgenomes2014.04.0018 .
Поттс С.М., Хан М.А., Хан Ю, Кушад ММ, Корбан СС. 2014. Идентификация локусов количественных признаков (QTL) для показателей качества фруктов в яблоках. Репортер по молекулярной биологии растений, 32 (1), 109–116.
Хан М.А., Чжао Ю.Ф., Корбан С.С. 2013. Идентификация генетических локусов, связанных с устойчивостью к бактериальному ожогу у Malus, посредством комбинированного использования QTL и картирования ассоциаций. Физиология Плантарум, 148 (3), 344–53.
Ву Дж, Ван З, Ши З, Чжан С, Мин Р, З Шилин, Хан М.А., Тао С., Корбан С.С., Ван Х, Чен Н.Дж., Нисио Т, Сюй Икс, Конг Л, Ци К, Хуан Икс, Ван Юй , Чжао X, У Дж, Дэн С, Гоу С, Чжоу В, Инь Х, Цинь Г, Ша Ю, Тао Ю, Чэнь Х, Ян Ю, Сун Ю, Чжан Д, Ван Дж, Ли Л, Дай М, Гу C, Ван И, Ши Д, Ван Икс, Чжан Х, Цзэн Л, Чжэн Д, Ван С, Чен М, Ван Г, Се Л, Соверо В, Ша С, Хуан В, Чжан С, Чжан М, Сунь Дж, Сюй Л, Ли Ю, Лю Икс, Ли Кью, Шен Дж, Ван Дж, Полл Р.Э., Беннетцен Дж.Л., Ван Дж., Чжан С. 2012. Геном груши ( Pyrus bretschneideri Rehd.), 23 (2). , 396-408.
Хан М.А., Хан Ю, Чжао Ю.Ф., Троджио М., Корбан СС. 2012. Согласованная генетическая карта нескольких популяций показывает непостоянный порядок маркеров среди карт, вероятно, связанный со структурными изменениями в геноме яблока. ПлоСОНЕ, 7 (11), дои : 10.1371/journal.pone.0047864 .
Чэнь Цзюнь, Хан М.А., Цю В.М., Ли Дж., Чжоу Х., Чжан Ц., Го В., Чжу Т., Пэн Дж., Сан Ф., Ли С., Корбан С.С., Хан Ю. 2012. Диверсификация генов, кодирующих синтазу связанного с гранулами крахмала. (GBSS) у однодольных и двудольных отмечен множественными событиями полногеномной дупликации. ПлоСОНЕ, 7 (1), дои : 10.1371/journal.pone.0030088 .
Хан М.А., Хан Й, Корбан С.С. 2012. Высокопроизводительный анализ генотипирования SNP яблок с использованием платформы GoldenGateTM. ГЕН (Эльзевир), 494, 196–201.
Поттс С.М., Хан Ю., Хан М.А., Кушад М.М., Рейберн А.Л. и Корбан С.С. 2011. Генетическое разнообразие и характеристика основной коллекции зародышевой плазмы Malus с использованием простых повторов последовательностей (SSR). Репортер по молекулярной биологии растений, 30 (4), 827-837.
Хан Ю, Чжэн Д., Вимолмангкан С., Хан М.А., Бивер Дж.Э., Корбан СС. 2011. Интеграция физических и генетических карт яблока подтверждает полногеномные и сегментные дупликации в геноме яблока. Журнал экспериментальной ботаники, 62 (14), 5117-5130.
Грэм И.А., Бессер К., Блюмер С., Браниган К.А., Чеховский Т., Элиас Л., Гутерман И., Харви Д., Исаак П.Г., Хан М.А., Ларсон Т.Р., Ли Ю., Оуэнс С., Поусон Т., Пенфилд Т., Рэй А.М., Рэтбоун Д.А. , Росс Дж., Смоллвуд М.Ф., Сегура В., Таунсенд Т., Вьяс Д., Винзер Т. и Боулз Д. 2010. Генетическая карта Artemisia annua L. идентифицирует множественные локусы, влияющие на выработку противомалярийного препарата артемизинина, Science, 327, 328-331. .
Ле Ру П.М., Хан М.А., Даффи Б., Патокки А., Брогджини Г.А.Л. и Гесслер К. 2010. Количественное картирование локусов признаков устойчивости к бактериальному ожогу у сортов яблони «Флорина» и «NovaEasygro». Геном, 53, 710–722.
Хан М.А., Дюрел С.Э., Даффи Б., Друэ Д., Келлерхалс М., Гесслер С. и Патокки А. 2008. Идентификация и проверка QTL, связанных с устойчивостью к бактериальному ожогу у Malus , и их применимость в селекции с помощью маркеров. Двенадцатый (12-й) симпозиум EUCARPIA по селекции и генетике фруктов. Acta Horticultural (ISHS), 814, 753-758.
Хан М.А., Дюрел С.Э., Даффи Б., Друэ Д., Келлерхалс М., Гесслер С. и Патокки А. 2007. Разработка молекулярных маркеров, связанных с 7-м основным QTL группы сцепления Fiesta, для устойчивости к бактериальному ожогу и их применение для селекции с помощью маркеров. . Геном, 50, 568–577.
Хан М.А., Даффи Б., Гесслер С. и Патокки А. 2006. QTL-картирование устойчивости яблони к бактериальному ожогу. Молекулярная селекция, 17, 299–306.

Источник: ^[5]

Источники [ править ]

Ссылки

^ Jump up to: Перейти обратно: ^а ^б ^с «Авайс Хан» . КАЛС . 13 октября 2022 г. Проверено 20 февраля 2023 г.
^ Jump up to: Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д ^и Уайт, Эндрю. «Миссия этого исследователя — помочь фермерам найти более выносливое яблоко» . Форбс . Проверено 20 февраля 2023 г.
^ админ (6 июля 2015 г.). «CIP сотрудничает со штатом Северная Каролина и другими участниками финансируемых Фондом Гейтса усилий по ускорению улучшения OFSP» . Международный Картофельный Центр . Проверено 20 февраля 2023 г.
^ админ (17 июня 2016 г.). «ИССЛЕДОВАНИЯ ЗАСУХОУСТОЙЧИВОГО КАРТОФЕЛЯ В СРЕДСТВЕ CIP СООТВЕТСТВУЮТ С СОБЛЮДЕНИЯМИ ООН ПО ОПУСТЫНИВАНИЮ» . Международный Картофельный Центр . Проверено 20 февраля 2023 г.
^ Jump up to: Перейти обратно: ^а ^б «Авайс Хан» . ученый.google.com . Проверено 20 февраля 2023 г.
^ «Что-то быстро убивает молодые яблони в садах Северной Америки. Ученые в тупике» . www.science.org . Проверено 20 февраля 2023 г.
^ «Молодые яблони гибнут, и никто не понимает, почему» . Экономист . ISSN 0013-0613 . Проверено 20 февраля 2023 г.
^ Роббинс, Джим (2 декабря 2019 г.). «Огонь распространяется на север, угрожая яблоневым садам» . Нью-Йорк Таймс . ISSN 0362-4331 . Проверено 20 февраля 2023 г.
^ «Геном Honeycrisp поможет ученым выводить более качественные яблоки» . КАЛС . 13 октября 2022 г. Проверено 20 февраля 2023 г.
^ «Ученые Корнелла создают более сильное яблоко» . Рочестер Первый . 19 октября 2022 г. Проверено 20 февраля 2023 г.

[:0-1] Jump up to: Перейти обратно: ^а ^б ^с «Авайс Хан» . КАЛС . 13 октября 2022 г. Проверено 20 февраля 2023 г.

[:1-2] Jump up to: Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д ^и Уайт, Эндрю. «Миссия этого исследователя — помочь фермерам найти более выносливое яблоко» . Форбс . Проверено 20 февраля 2023 г.

[3] админ (6 июля 2015 г.). «CIP сотрудничает со штатом Северная Каролина и другими участниками финансируемых Фондом Гейтса усилий по ускорению улучшения OFSP» . Международный Картофельный Центр . Проверено 20 февраля 2023 г.

[4] админ (17 июня 2016 г.). «ИССЛЕДОВАНИЯ ЗАСУХОУСТОЙЧИВОГО КАРТОФЕЛЯ В СРЕДСТВЕ CIP СООТВЕТСТВУЮТ С СОБЛЮДЕНИЯМИ ООН ПО ОПУСТЫНИВАНИЮ» . Международный Картофельный Центр . Проверено 20 февраля 2023 г.

[:2-5] Jump up to: Перейти обратно: ^а ^б «Авайс Хан» . ученый.google.com . Проверено 20 февраля 2023 г.

[6] «Что-то быстро убивает молодые яблони в садах Северной Америки. Ученые в тупике» . www.science.org . Проверено 20 февраля 2023 г.

[7] «Молодые яблони гибнут, и никто не понимает, почему» . Экономист . ISSN 0013-0613 . Проверено 20 февраля 2023 г.

[8] Роббинс, Джим (2 декабря 2019 г.). «Огонь распространяется на север, угрожая яблоневым садам» . Нью-Йорк Таймс . ISSN 0362-4331 . Проверено 20 февраля 2023 г.

[9] «Геном Honeycrisp поможет ученым выводить более качественные яблоки» . КАЛС . 13 октября 2022 г. Проверено 20 февраля 2023 г.

[10] «Ученые Корнелла создают более сильное яблоко» . Рочестер Первый . 19 октября 2022 г. Проверено 20 февраля 2023 г.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]