ГигаБД
 | |
Тип сайта | Дисциплинарный репозиторий |
|---|---|
| Доступно в | Английский |
| Владелец | GigaScience / Китайский национальный банк генов |
| URL-адрес | гигабайты |
| Запущен | 2011 |
| Текущий статус | Активный |
Лицензия на контент | CC0 |
GigaDB (GigaScience DataBase) — дисциплинарный репозиторий , запущенный в 2011 году. [1] с целью обеспечения долгосрочного доступа к огромным многомерным наборам данных исследований в области наук о жизни и биомедицинских наук. Наборы данных разнообразны и включают геномные , транскриптомные данные и данные визуализации. Наборы данных курируются биокураторами GigaDB, которые работают в BGI и Китайском национальном банке генов .
Изначально GigaDB был задуман как вспомогательный архив для крупномасштабных исследовательских данных, представляемых в журналы данных GigaScience Press GigaScience и Gigabyte, основное внимание которых уделяется обеспечению воспроизводимости и возможности повторного использования биологических и биомедицинских исследований. Область применения GigaDB расширилась и теперь включает объекты вычислительных исследований, такие как синтетические данные, программное обеспечение и рабочие процессы. [2] В базе данных используются атрибуты и стандарты образцов, одобренные Консорциумом стандартизации геномики (GSC) , а также сотрудничая с GSC для обеспечения полноты и доступности данных. [3] Наборы данных, размещенные в GigaDB, определяются как группа файлов и метаданных, которые поддерживают конкретную статью или исследование. Каждому опубликованному набору данных GigaDB DataCite идентификатор цифрового объекта присваивается , а данные индексируются и доступны для обнаружения в NCBI Datamed и индексе цитирования данных Clarivate Analytics . GigaDB также сотрудничает с Repositive , чтобы повысить доступность их наборов данных о людях. [4]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Снеддон Т.П., Ли П., Эдмундс СК (июль 2012 г.). «GigaDB: анонс базы данных GigaScience» . ГигаСайенс . 1 (1): 11. дои : 10.1186/2047-217X-1-11 . ПМЦ 3626507 . ПМИД 23587345 .
- ^ Сяо С.З., Армит С., Эдмундс С., Гудман Л., Ли П., Тули М.А., Хантер С.И. (январь 2019 г.). «Повышение интерактивности и улучшение базы данных GigaScience, GigaDB» . База данных . 2019 : баз016. дои : 10.1093/база данных/baz016 . ПМК 6376146 . ПМИД 30753480 .
- ^ Армит С., Тули М.А., Хантер С.И. (июнь 2022 г.). «Десятилетие GigaScience: GigaDB и движение открытых данных» . ГигаСайенс . 11 . doi : 10.1093/gigascience/giac053 . ПМЦ 9197680 . ПМИД 35701374 .
- ^ «Repositive разрабатывает платформу для совместной работы с генными данными премиум-класса для исследователей лекарств» . biopharma-reporter.com . 2 февраля 2016 г. Проверено 1 июля 2019 г.
Внешние ссылки
[ редактировать ] | Эта статья о библиотеке незавершена . цифровой Вы можете помочь Википедии, расширив ее . |