Дэвид В. Димер

Дэвид В. Димер
Дэвид В. Димер
Рожденный	21 апреля 1939 г. (85 лет) ; Санта-Моника, Калифорния
Национальность	Американский
Занятие	Биолог
Награды	Стипендиат Гуггенхайма , 1985 г.
Академическое образование
Образование	Университет Дьюка ( бакалавр наук , 1961 г.) ; Университет штата Огайо ( доктор философии , 1965 г.)
Альма-матер	Университет штата Огайо
Диссертация	Влияние ионов щелочноземельных металлов на монослои жирных кислот и фосфолипидов (1965).
Докторантура	Дэвид Корнуэлл
Академическая работа
Дисциплина	Биофизик
Учреждения	Калифорнийский университет, Санта-Крус
Известные идеи	секвенирование нанопор

Дэвид Уилсон Димер (родился 21 апреля 1939 г.) — американский биолог и профессор-исследователь биомолекулярной инженерии Калифорнийского университета в Санта-Крус . Димер внес значительный вклад в область мембранной биофизики. Его работа привела к новому методу секвенирования ДНК и более полному пониманию роли мембран в возникновении жизни .

В 1985 году он был награжден стипендией Гуггенхайма, которая поддерживала исследования в Австралийском национальном университете в Канберре по исследованию органических соединений в метеорите Мерчисон . С 2013 по 2014 год он занимал пост президента Международного общества изучения происхождения жизни. ^{[ нужна ссылка ]}

Ранний период жизни

Отец Димера, также Дэвид, работал в компании Douglas Aircraft в Санта-Монике, Калифорния , во время и после Второй мировой войны , в то время как его мать Зена заботилась о Димере и двух его братьях, Ричарде и Джоне. В 1952 году семья переехала в Огайо , где трое братьев посещали среднюю школу Вестервилля. В 1957 году Димер представил свое исследование самоорганизующихся простейших на конкурсе Westinghouse Science Talent Search и был среди 40 победителей, приглашенных в том же году в Вашингтон . Ему была присуждена полная стипендия в Университете Дьюка, где он получил степень бакалавра химии в 1961 году. ^[1]

Исследовать

Будучи молодым профессором Калифорнийского университета в Дэвисе, Димер продолжал работать с электронной микроскопией , впервые обнаружив частицы, связанные с функциональными ферментами АТФазы, в мембранах саркоплазматического ретикулума. ^[2] Проведя творческий отпуск в Англии, в Бристольском университете в 1971 году и вместе с Алеком Бэнгэмом в 1975 году, Димер заинтересовался липосомами . Беседы с Бэнгэмом вдохновили его на исследование роли мембран в происхождении жизни, и в 1985 году Димер продемонстрировал, что углеродистый метеорит Мерчисона содержит липидоподобные соединения, которые могут собираться в мембранные везикулы. ^[3] Димер описал значение процессов самосборки в своей книге « Первая жизнь» 2011 года . ^[4] В совместной работе с Марком Акесоном, в то время аспирантом, были разработаны два метода мониторинга проникновения протонов через ионные каналы, такие как грамицидин. ^[5] В 1989 году, возвращаясь с научной встречи в Орегоне, Димер предположил, что можно секвенировать отдельные молекулы ДНК, используя приложенное напряжение, чтобы протягивать их индивидуально через наноскопический канал. Последовательность ДНК можно было отличить по специфическому модулирующему влиянию четырех оснований на ионный ток через канал. В 1993 году он и Дэн Брэнтон начали исследовательское сотрудничество с Джоном Касьяновицем из НИСТ, чтобы изучить эту возможность с каналом гемолизина , а в 1996 году опубликовали первую статью, демонстрирующую, что секвенирование нанопор может быть осуществимо. ^[6] Джордж Черч из Гарварда независимо предложил аналогичную идею, и Черч, Брэнтон и Димер решили подать заявку на патент, которая была выдана в 1998 году. ^[7] Марк Акесон присоединился к исследовательским усилиям в 1997 году, а в 1999 году опубликовал статью, показывающую, что гемолизиновый канал, теперь называемый нанопорой , может различать пуриновые и пиримидиновые основания в отдельных молекулах РНК. ^[8] В 2007 году компания Oxford Nanopore Technologies (ONT) лицензировала патенты, описывающие эту технологию. ^[9] а в 2014 году выпустила устройство для секвенирования нанопор MinION для избранных исследователей. Первые публикации появились в 2015 году, в одной из которых MinION использовался для секвенирования ДНК E. coli с точностью 99,4% относительно установленного генома длиной 5,4 миллиона пар оснований. ^[10] Несмотря на прежний скептицизм, секвенирование нанопор теперь признано жизнеспособным методом секвенирования третьего поколения . ^[11]^[12]^[13]^[14]

Другие публикации

Димер также является соавтором научно-фантастического романа «Охота на FOXP5: загадочный геномный роман» (Springer, 2016) вместе с научным писателем Уоллесом Кауфманом. Через персонажей из американских университетов, казахстанской науки и политики авторы исследуют этическую сложность редактирования человеческих генов.

Ссылки

^ Димер, Д.В.; Брэнтон, Д. (1967). «Плоскости разрушения в мембранной системе модели двухслойного льда». Наука . 158 (3801): 655–657. Бибкод : 1967Sci...158..655D . дои : 10.1126/science.158.3801.655 . ПМИД 4860951 . S2CID 25432205 .
^ Димер, Д.В.; Баскин, Р.Дж. (1969). «Ультраструктура препаратов саркоплазматической сети» . Журнал клеточной биологии . 42 (1): 296–307. CiteSeerX 10.1.1.281.3389 . дои : 10.1083/jcb.42.1.296 . ПМК 2107567 . ПМИД 4182374 .
^ Димер, Д.В. (1985). «Граничные структуры образованы органическими соединениями углеродистого хондрита Мерчисона». Природа . 317 (6040): 792–794. Бибкод : 1985Natur.317..792D . дои : 10.1038/317792a0 . S2CID 4249097 .
^ Димер, Дэвид (2011). Первая жизнь: открытие связей между звездами, клетками и происхождение жизни . Беркли, Калифорния, США: Издательство Калифорнийского университета. ISBN 9780520274457 . OCLC 727950391 .
^ патент США 5795782 , Чёрч, Джордж; Димер, Дэвид В.; Брэнтон, Дэниел; Бальдарелли, Ричард; Касьянович, Джон, «Характеристика отдельных полимерных молекул на основе взаимодействий мономер-интерфейс», выпущено 18 августа 1998 г., поручено президенту и научным сотрудникам Гарвардского колледжа.
^ Акесон, М.; Димер, Д.В. (1991). «Протонная проводимость в водной проволоке грамицидина: модель протонной проводимости в АТФазе FoF1?» . Биофизический журнал . 60 (1): 101–109. дои : 10.1016/s0006-3495(91)82034-3 . ПМЦ 1260042 . ПМИД 1715764 .
^ Касьянович, Дж.; Брандин, Э.; Брэнтон, Д.; Димер, Д.В. (1996). «Характеристика отдельных полинуклеотидных молекул с использованием мембранного канала» (PDF) . Труды Национальной академии наук США . 93 (24): 13770–13773. Бибкод : 1996PNAS...9313770K . дои : 10.1073/pnas.93.24.13770 . ЧВК 19421 . ПМИД 8943010 .
^ Акесон, М.; Брэнтон, Д.; Касьянович, Джей-Джей; Брандин, Э.; Димер, Д.В. (1999). «Дискриминация в микросекундном масштабе времени между полицитидиловой кислотой, полиадениловой кислотой и полиуридиловой кислотой как гомополимерами или сегментами внутри отдельных молекул РНК» . Биофизический журнал . 77 (6): 3227–3233. Бибкод : 1999BpJ....77.3227A . дои : 10.1016/s0006-3495(99)77153-5 . ПМЦ 1300593 . ПМИД 10585944 .
^ «Оксфордская технология нанопор» . Проверено 17 декабря 2015 г.
^ Ломан, Нью-Джерси; Квик, Дж.; Симпсон, Джей Ти (2015). «Полный бактериальный геном, собранный de novo с использованием только данных секвенирования нанопор». Природные методы . 12 (8): 733–735. дои : 10.1038/nmeth.3444 . ПМИД 26076426 . S2CID 15053702 .
^ Регаладо, Антонио; Квик, Дж.; Симпсон, Джей Ти (17 сентября 2014 г.). «Радикально новый секвенатор ДНК наконец попадает в руки исследователей» . Обзор технологий Массачусетского технологического института . Проверено 26 марта 2019 г.
^ Хайден, Антонио; Квик, Дж.; Симпсон, Джей Ти (2015). «Маленький секвенатор ДНК впечатляет первых пользователей» . Природа . 521 (7550): 15–16. Бибкод : 2015Natur.521...15C . дои : 10.1038/521015а . ПМИД 25951262 .
^ Зон, Джерри; Квик, Дж.; Симпсон, Джей Ти (15 сентября 2015 г.). «Секвенирование нанопор: 20 лет спустя» . Zone in With Zon: тенденции в исследованиях нуклеиновых кислот . Проверено 26 марта 2019 г.
^ Крол, Аарон; Квик, Дж.; Симпсон, Джей Ти (22 декабря 2014 г.). «Секвенирование нанопор никуда не денется» . Мир БиоИТ . Проверено 26 марта 2019 г.

^[1]

^ Охота на FOXP5: загадочный геномный роман, Уоллес Кауфман и Дэвид Димер, Springer, 2016, ISBN 978-3-319-28960-1

[ref1-1] Димер, Д.В.; Брэнтон, Д. (1967). «Плоскости разрушения в мембранной системе модели двухслойного льда». Наука . 158 (3801): 655–657. Бибкод : 1967Sci...158..655D . дои : 10.1126/science.158.3801.655 . ПМИД 4860951 . S2CID 25432205 .

[ref2-2] Димер, Д.В.; Баскин, Р.Дж. (1969). «Ультраструктура препаратов саркоплазматической сети» . Журнал клеточной биологии . 42 (1): 296–307. CiteSeerX 10.1.1.281.3389 . дои : 10.1083/jcb.42.1.296 . ПМК 2107567 . ПМИД 4182374 .

[ref3-3] Димер, Д.В. (1985). «Граничные структуры образованы органическими соединениями углеродистого хондрита Мерчисона». Природа . 317 (6040): 792–794. Бибкод : 1985Natur.317..792D . дои : 10.1038/317792a0 . S2CID 4249097 .

[ref4-4] Димер, Дэвид (2011). Первая жизнь: открытие связей между звездами, клетками и происхождение жизни . Беркли, Калифорния, США: Издательство Калифорнийского университета. ISBN 9780520274457 . OCLC 727950391 .

[ref5-5] патент США 5795782 , Чёрч, Джордж; Димер, Дэвид В.; Брэнтон, Дэниел; Бальдарелли, Ричард; Касьянович, Джон, «Характеристика отдельных полимерных молекул на основе взаимодействий мономер-интерфейс», выпущено 18 августа 1998 г., поручено президенту и научным сотрудникам Гарвардского колледжа.

[ref6-6] Акесон, М.; Димер, Д.В. (1991). «Протонная проводимость в водной проволоке грамицидина: модель протонной проводимости в АТФазе FoF1?» . Биофизический журнал . 60 (1): 101–109. дои : 10.1016/s0006-3495(91)82034-3 . ПМЦ 1260042 . ПМИД 1715764 .

[ref7-7] Касьянович, Дж.; Брандин, Э.; Брэнтон, Д.; Димер, Д.В. (1996). «Характеристика отдельных полинуклеотидных молекул с использованием мембранного канала» (PDF) . Труды Национальной академии наук США . 93 (24): 13770–13773. Бибкод : 1996PNAS...9313770K . дои : 10.1073/pnas.93.24.13770 . ЧВК 19421 . ПМИД 8943010 .

[ref8-8] Акесон, М.; Брэнтон, Д.; Касьянович, Джей-Джей; Брандин, Э.; Димер, Д.В. (1999). «Дискриминация в микросекундном масштабе времени между полицитидиловой кислотой, полиадениловой кислотой и полиуридиловой кислотой как гомополимерами или сегментами внутри отдельных молекул РНК» . Биофизический журнал . 77 (6): 3227–3233. Бибкод : 1999BpJ....77.3227A . дои : 10.1016/s0006-3495(99)77153-5 . ПМЦ 1300593 . ПМИД 10585944 .

[ref9-9] «Оксфордская технология нанопор» . Проверено 17 декабря 2015 г.

[ref10-10] Ломан, Нью-Джерси; Квик, Дж.; Симпсон, Джей Ти (2015). «Полный бактериальный геном, собранный de novo с использованием только данных секвенирования нанопор». Природные методы . 12 (8): 733–735. дои : 10.1038/nmeth.3444 . ПМИД 26076426 . S2CID 15053702 .

[ref11-11] Регаладо, Антонио; Квик, Дж.; Симпсон, Джей Ти (17 сентября 2014 г.). «Радикально новый секвенатор ДНК наконец попадает в руки исследователей» . Обзор технологий Массачусетского технологического института . Проверено 26 марта 2019 г.

[ref12-12] Хайден, Антонио; Квик, Дж.; Симпсон, Джей Ти (2015). «Маленький секвенатор ДНК впечатляет первых пользователей» . Природа . 521 (7550): 15–16. Бибкод : 2015Natur.521...15C . дои : 10.1038/521015а . ПМИД 25951262 .

[ref13-13] Зон, Джерри; Квик, Дж.; Симпсон, Джей Ти (15 сентября 2015 г.). «Секвенирование нанопор: 20 лет спустя» . Zone in With Zon: тенденции в исследованиях нуклеиновых кислот . Проверено 26 марта 2019 г.

[ref14-14] Крол, Аарон; Квик, Дж.; Симпсон, Джей Ти (22 декабря 2014 г.). «Секвенирование нанопор никуда не денется» . Мир БиоИТ . Проверено 26 марта 2019 г.

[15] Охота на FOXP5: загадочный геномный роман, Уоллес Кауфман и Дэвид Димер, Springer, 2016, ISBN 978-3-319-28960-1

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[1]

Базы данных авторитетного контроля
Международный	ЯВЛЯЮТСЯ ВИАФ WorldCat
Национальный	Каталония Германия Израиль Бельгия Соединенные Штаты Чешская Республика Корея Нидерланды Польша
академики	ЦиНии Google Академика ОРЦИД
Другой	ИдРеф