Захват экзона

Захват экзонов — это метод молекулярной биологии, позволяющий идентифицировать потенциальные экзоны во фрагменте эукариот ДНК с неизвестной структурой интрон - экзон . Это делается для того, чтобы определить, является ли фрагмент частью экспрессируемого гена .

Геномный фрагмент встраивают в интрон « вектора сплайсинга », состоящего из известной последовательности ДНК экзон-интрон-экзон, а затем вектор встраивают в эукариотическую клетку. Если фрагмент не содержит экзонов (т.е. состоит исключительно из интронной ДНК), он будет сращен вместе с исходным интроном вектора. С другой стороны, если экзоны присутствуют, они будут частью зрелой мРНК после транскрипции (со всем удалением интронного материала). Присутствие «захваченных экзонов» можно обнаружить по увеличению размера мРНК или с помощью RT-PCR для амплификации интересующей ДНК.

Этот метод в значительной степени был вытеснен подходом секвенирования кДНК , полученной из мРНК , а затем использования инструментов биоинформатики, таких как NCBI, для сервер BLAST определения источника последовательности, тем самым определяя соответствующие сайты сплайсинга экзонов и интронов.