Фрагмент ограничения
Эта статья нуждается в дополнительных цитатах для проверки . ( январь 2020 г. ) |
Фрагмент рестрикции представляет собой фрагмент ДНК , образующийся в результате разрезания цепи ДНК ферментом рестрикции (эндонуклеазой рестрикции), процесс, называемый рестрикцией. [1] Каждый фермент рестрикции обладает высокой специфичностью: он распознает определенную короткую последовательность ДНК или сайт рестрикции и разрезает обе цепи ДНК в определенных точках этого сайта. Большинство сайтов рестрикции являются палиндромными (последовательность нуклеотидов одинакова на обеих цепях при чтении в направлении от 5’ к 3’ каждой цепи) и имеют длину от четырех до восьми нуклеотидов . Многие разрезы выполняются одним ферментом рестрикции из-за случайного повторения этих последовательностей в длинной молекуле ДНК, в результате чего образуется набор рестрикционных фрагментов. Определенная молекула ДНК всегда будет давать один и тот же набор рестрикционных фрагментов при воздействии одного и того же фермента рестрикции. Рестрикционные фрагменты можно анализировать с использованием таких методов, как гель-электрофорез , или использовать в технологии рекомбинантной ДНК . [2]

Приложения
[ редактировать ]В технологии рекомбинантной ДНК используются специфические эндонуклеазы рестрикции, которые изолируют конкретный ген и расщепляют сахарофосфатные остовы в разных точках (сохраняя симметрию), так что двухцепочечные рестрикционные фрагменты имеют одноцепочечные концы. Эти короткие отростки, называемые липкими концами , могут образовывать пары оснований , связанные водородными связями , с комплементарными липкими концами на любой другой ДНК, разрезанной тем же ферментом (например, на бактериальной плазмиде).
При электрофорезе в агарозном геле рестрикционные фрагменты дают структуру полос, характерную для исходной молекулы ДНК и используемого фермента рестрикции, например, относительно небольшие молекулы ДНК вирусов и плазмид можно идентифицировать просто по структуре их рестрикционных фрагментов. Если нуклеотидные различия двух разных аллелей возникают в сайте рестрикции определенного фермента рестрикции, расщепление сегментов ДНК людей с разными аллелями этого конкретного гена с помощью этого фермента приведет к образованию разных фрагментов, каждый из которых будет давать разные рисунки полос в геле. электрофорез.
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Робертс, Р.Дж. (2005). «Как ферменты рестрикции стали рабочими лошадками молекулярной биологии» . Труды Национальной академии наук . 102 (17): 5905–5908. Бибкод : 2005PNAS..102.5905R . дои : 10.1073/pnas.0500923102 . ПМЦ 1087929 . ПМИД 15840723 .
- ^ Кэмпбелл, Нил А .; Джейн Б. Рис (2005). Биология (Седьмое изд.). Бенджамин Камминс. ISBN 0-8053-7171-0 .