Аманда М. Халс-Кемп

Аманда М. Халс-Кемп
Аманда М. Халс-Кемп
Альма-матер	Техасский университет A&M ;
	Академическая карьера
Учреждения	Служба сельскохозяйственных исследований (2016–) ;

Аманда М. Халс-Кемп — компьютерный биолог из сельского хозяйства США Министерства Службы сельскохозяйственных исследований . Она работает в исследовательском отделе геномики и биоинформатики и работает в кампусе Университета штата Северная Каролина в Роли, Северная Каролина .

Ранний период жизни

Аманда Халс-Кемп выросла в Харрисонбурге, штат Вирджиния . ^{[ 1 ]} В 2010 году она получила степень бакалавра наук в области биологии и биотехнологии животных в Университете Невады, Рино . ^{[ 1 ]}^{[ 2 ]} Халс-Кемп получила докторскую степень. в 2015 году окончила Техасского университета A&M , где ее научным руководителем был доктор Дэвид Стелли. междисциплинарную аспирантуру по генетике ^{[ 2 ]}^{[ 3 ]}^{[ 4 ]} В лаборатории Стелли она координировала разработку матрицы CottonSNP63K, первой в своем роде для хлопка. ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]} Массив CottonSNP63K уже использовался для более эффективной характеристики ресурсов зародышевой плазмы и идентификации экономически важных генов. ^{[ 1 ]} Она и доктор Стелли также сформировали Международный консорциум хлопковой щепы SNP. ^{[ 6 ]} Она закончила постдокторантуру в Центре биотехнологии семян Калифорнийского университета в Дэвисе , где сосредоточилась на биоинформатике, разработке ресурсов и интеграции инструментов геномики и биотехнологии для улучшения селекции овощей и других сельскохозяйственных культур. ^{[ 3 ]}^{[ 2 ]} В центре она помогала проводить генетический анализ перца, хлопка, помидоров, кофе и шпината. ^{[ 7 ]}

Карьера

Халс-Кемп работает компьютерным биологом на стыке геномики, биотехнологии и селекции сельскохозяйственных культур. ^{[ 3 ]} Она работает в сельского хозяйства США Министерства Службе сельскохозяйственных исследований в отделе исследований геномики и биоинформатики. ^{[ 3 ]} В настоящее время ее исследовательская деятельность связана с использованием биоинформатики для улучшения программ селекции ARS как у растений, так и у животных. ^{[ 3 ]} Она является доцентом Министерства сельского хозяйства США в Университете штата Северная Каролина на факультете растениеводства и почвоведения. ^{[ 8 ]} Она участвовала в проекте «Геном кофе», целью которого является секвенирование Coffea arabica и изучение межсортового разнообразия. ^{[ 9 ]} Она была частью команды, проводившей первое секвенирование генома C. arabica . ^{[ 10 ]}

Награды и публикации

Как доктор философии. студентка Техасского университета A&M, в 2014 году она получила Мемориальную премию Этель Эшворт-Цуцуи за исследования. ^{[ 11 ]} награда выдающегося аспиранта Техасского университета A&M, премия декана за выдающиеся достижения в области научных исследований, ^{[ 1 ]}^{[ 6 ]} и премия Б.Б. Сингха за диссертацию по растениеводству. ^{[ 12 ]}

Халс-Кемп является соавтором следующих публикаций:

«Эволюционный анализ дивергенции последовательностей и разнообразия дубликатов генов у Aspergillus fumigatus » в журнале «Эволюционная биоинформатика», 2012 г. ^{[ 13 ]}
«Изучение эволюции диплоидов и полиплоидов хлопка на основе повторного секвенирования всего генома» в журнале Genes, Genomes, Genetics, 2013. ^{[ 14 ]}
«Фазировка гаплотипов после совместной оценки рекомбинации и неравновесия по сцеплению в племенных популяциях» в журнале Animal Science and Biotechnology, 2013 г. ^{[ 15 ]}
«Секвенирование аллотетраплоидного хлопка ( Gossypium hirsutum L. acc. TM-1) обеспечивает ресурс для улучшения волокна» в журнале Nature Biotechnology, 2015 г. ^{[ 16 ]}
«Майнинг SNP на конце BAC-конца в аллотетраплоидном хлопке ( Gossypium ) с использованием данных повторного секвенирования, филогенетических выводов и перспектив генетического картирования» в журнале Genes, Genomes, Genetics, 2015 ^{[ 17 ]}
«Эволюция последовательности ДНК и редкая гомологичная конверсия у тетраплоидного хлопка» и исправление в генетике PLOS, 2016 г. ^{[ 18 ]}^{[ 19 ]}
«Анализ разнообразия зародышевой плазмы хлопка ( Gossypium hirsutum L. ) с использованием массива CottonSNP63K» в BMC Plant Biology, 2017 г. ^{[ 20 ]}
«Субгеномные физические структуры генома аллотетраплоидного горного хлопка (Gossypium hirsutum L.) и подход к созданию сборок полиплоидов эталонного уровня» в Scientific Reports, 2017 г. ^{[ 21 ]}
«Сравнительная транскриптомика и геномные закономерности несогласованности у Capsiceae (Solanaceae) » в журнале «Молекулярная филогенетика и эволюция», 2018 г. ^{[ 22 ]}
«Кормление кур-несушек высокоолеиновым арахисом улучшает цвет яичного желтка и содержание олеиновых жирных кислот в скорлупе яиц» в журнале Poultry Science , 2019 г. ^{[ 23 ]}
«Повышение устойчивости хлопка Upland к засухе, продуктивности и качества волокна: сравнительная оценка и генетическое исследование» в журнале «Молекулярная генетика и геномика» , 2020 г. ^{[ 24 ]}

Она была ведущим автором следующих публикаций:

«Генетические варианты способствуют изменчивости экспрессии генов у людей» в журнале Genetics, 2013 г. ^{[ 25 ]}
«Разработка и групповое картирование ген-ассоциированных межвидовых SNP для хлопка ( Gossypium hirsutum L.) усилий по интрогрессивной селекции » в BMC Genomics, 2014 г. ^{[ 26 ]}
«Разработка массива SNP 63K для хлопка и картирование высокой плотности внутривидовых и межвидовых популяций Gossypium spp» в журнале «Гены, геномы, генетика», 2015 г. ^{[ 27 ]}
«HapMap приводит к массиву Infinium SNP Capsicum annuum : новый инструмент для селекции перца» в журнале Horticultural Research, 2016 г. ^{[ 28 ]}
«Сборка эталонного качества генома Capsicum annuum размером 3,5 ГБ из единой библиотеки связанного чтения» в журнале Horticultural Research, 2018 г. ^{[ 29 ]}

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д Техасский университет A&M (сентябрь 2015 г.). «Техасский бюллетень по селекции растений A&M объявляет о получении Аманды Халс-Кемп докторской степени». (PDF) . ТЕХАССКИЙ БЮЛЛЕТЕНЬ ПО СЕЛЕКЦИИ РАСТЕНИЙ A&M . Проверено 14 февраля 2020 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с Каки Карл (01 декабря 2017 г.). «Знакомьтесь, Аманда Халс-Кемп» . Государственный университет Северной Каролины . Проверено 14 февраля 2020 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д ^и «Аманда Халс-Кемп» . ars.usda.gov . Проверено 14 февраля 2020 г.
^ Баутиста, Кэрол Варгас (8 ноября 2017 г.). «Бывшие студенты» . Генетика в Техасском университете A&M . Проверено 14 февраля 2020 г.
^ «Проект CottonSNP63K» . хлопокген.орг . Проверено 14 февраля 2020 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с Департамент почвоведения и растениеводства Техасского университета A&M (май 2015 г.). «Поздравления» (PDF) . ЭГГИ Повестка дня . Проверено 14 февраля 2020 г.
^ Центр биотехнологии семян Калифорнийского университета в Дэвисе (2017). «Годовой отчет Центра биотехнологии семян (Калифорнийский университет в Дэвисе)» (PDF) . Годовой отчет 2017 . Проверено 14 февраля 2020 г.
^ «Аманда Халс-Кемп» . Государственный университет Северной Каролины . Проверено 14 февраля 2020 г.
^ "Люди" . Coffeegenome.ucdavis.edu . Проверено 14 февраля 2020 г.
^ «Секвенирование генома кофе арабика: совпадает с зарождением индустрии спешиэлти кофе, выращенной в Калифорнии» . ScienceDaily . 13 января 2017 г. Проверено 14 февраля 2020 г.
^ Наука, Техасский университет A&M. «Научная деятельность | Техасский университет A&M | Колледж-Стейшн, Техас» . outreach.science.tamu.edu . Проверено 14 февраля 2020 г.
^ Бет Людекер (19 января 2016 г.). «Награды факультетов почвоведения и растениеводства 2015 г.» . Soilcrop.tamu.edu . Проверено 14 февраля 2020 г.
^ Ян, Энце; Халс, Аманда М.; Кай, Джеймс Дж. (2012). «Эволюционный анализ дивергенции последовательностей и разнообразия дубликатов генов у Aspergillus fumigatus» . Эволюционная биоинформатика . 8 : 623–44. дои : 10.4137/ebo.s10372 . ISSN 1176-9343 . ПМЦ 3510868 . ПМИД 23225993 .
^ Пейдж, Джастин Т.; Хьюнь, Марк Д.; Лихти, Зак С.; Групп, Кара; Стелли, Дэвид; Халс, Аманда М.; Ашрафи, Хамид; Дейнзе, Аллен Ван; Вендел, Джонатан Ф.; Удалл, Джошуа А. (01 октября 2013 г.). «Понимание эволюции диплоидов и полиплоидов хлопка на основе повторного секвенирования всего генома» . G3: Гены, геномы, генетика . 3 (10): 1809–1818. дои : 10.1534/g3.113.007229 . ISSN 2160-1836 . ПМЦ 3789805 . ПМИД 23979935 .
^ Гомес-Райя, Луис; Халс, Аманда М.; Тейн, Дэвид; Рау, Венди М. (6 августа 2013 г.). «Фазировка гаплотипов после совместной оценки рекомбинации и неравновесия по сцеплению в размножающихся популяциях» . Журнал зоотехники и биотехнологии . 4 (1): 30. дои : 10.1186/2049-1891-4-30 . ISSN 2049-1891 . ПМЦ 3765333 . ПМИД 23916349 .
^ Чжан, Тяньчжэнь; Ху, Ян; Цзян, Венкай; Фанг, Лей; Гуань, Сюэин; Чен, Цзедан; Чжан, Цзиньбо; Саски, Кристофер А.; Шеффлер, Брайан Э.; Стелли, Дэвид М.; Халс-Кемп, Аманда М. (2015). «Секвенирование аллотетраплоидного хлопка (Gossypium hirsutum L. acc. TM-1) дает возможность улучшить волокно» . Природная биотехнология . 33 (5): 531–537. дои : 10.1038/nbt.3207 . ISSN 1546-1696 . ПМИД 25893781 .
^ Халс-Кемп, Аманда М.; Ашрафи, Хамид; Стоффель, Кевин; Чжэн, Сютин; Саски, Кристофер А.; Шеффлер, Брайан Э.; Фанг, Дэвид Д.; Чен, З. Джеффри; Дейнзе, Аллен Ван; Стелли, Дэвид М. (01 июня 2015 г.). «Майнинг SNP на конце BAC-конца в аллотетраплоидном хлопке (Gossypium) с использованием данных повторного секвенирования, филогенетических выводов и перспектив генетического картирования» . G3: Гены, геномы, генетика . 5 (6): 1095–1105. дои : 10.1534/g3.115.017749 . ISSN 2160-1836 . ПМЦ 4478540 . ПМИД 25858960 .
^ Пейдж, Джастин Т.; Лихти, Зак С.; Александр, Рич Х.; Клемонс, Кимберли; Халс-Кемп, Аманда М.; Ашрафи, Хамид; Дейнзе, Аллен Ван; Стелли, Дэвид М.; Удалл, Джошуа А. (11 мая 2016 г.). «Эволюция последовательности ДНК и редкая гомологичная конверсия у тетраплоидного хлопка» . ПЛОС Генетика . 12 (5): e1006012. дои : 10.1371/journal.pgen.1006012 . ISSN 1553-7404 . ПМЦ 4864293 . ПМИД 27168520 .
^ Пейдж, Джастин Т.; Лихти, Зак С.; Александр, Рич Х.; Клемонс, Кимберли; Халс-Кемп, Аманда М.; Ашрафи, Хамид; Дейнзе, Аллен Ван; Стелли, Дэвид М.; Удалл, Джошуа А. (22 июля 2016 г.). «Коррекция: эволюция последовательности ДНК и редкая гомологичная конверсия у тетраплоидного хлопка» . ПЛОС Генетика . 12 (7): e1006206. дои : 10.1371/journal.pgen.1006206 . ISSN 1553-7404 . ПМЦ 4957745 . ПМИД 27447832 .
^ Хинце, Лори Л.; Халс-Кемп, Аманда М.; Уилсон, Иэн В.; Чжу, Цянь-Хао; Ллевеллин, Дэнни Дж.; Тейлор, Джен М.; Сприггс, Эндрю; Фанг, Дэвид Д.; Уллоа, Морис; Берк, Джон Дж.; Гибанд, Марк (3 февраля 2017 г.). «Анализ разнообразия зародышевой плазмы хлопка (Gossypium hirsutum L.) с использованием массива CottonSNP63K» . Биология растений BMC . 17 (1):37.doi 10.1186 : /s12870-017-0981-y . ISSN 1471-2229 . ПМК 5291959 . ПМИД 28158969 .
^ Саски, Кристофер А.; Шеффлер, Брайан Э.; Халс-Кемп, Аманда М.; Лю, Бо; Сун, Цинсинь; Андо, Ацуми; Стелли, Дэвид М.; Шеффлер, Джоди А.; Гримвуд, Джейн; Джонс, Дон С.; Петерсон, Дэниел Г. (10 ноября 2017 г.). «Субгеном закрепил физические структуры аллотетраплоидного генома горного хлопка (Gossypium hirsutum L.), а также подход к созданию эталонных сборок полиплоидов» . Научные отчеты . 7 (1): 15274. Бибкод : 2017NatSR...715274S . doi : 10.1038/s41598-017-14885-w . ISSN 2045-2322 . ПМЦ 5681701 . ПМИД 29127298 .
^ Спалинк, Дэниел; Стоффель, Кевин; Уолден, Женевьева К.; Халс-Кемп, Аманда М.; Хилл, Тереза А.; Ван Дейнзе, Аллен; Бос, Линн (2018). «Сравнительная транскриптомика и геномные закономерности несогласованности у Capsiceae (Solanaceae)» . Молекулярная филогенетика и эволюция . 126 : 293–302. Бибкод : 2018МолПЭ.126..293С . дои : 10.1016/j.ympev.2018.04.030 . ISSN 1055-7903 . ПМИД 29702214 . S2CID 13701098 .
^ Тумер, Ондулла Т.; Халс-Кемп, Аманда М.; Дин, Лиза Л.; Бойкин, Дебора Л.; Малейрос, Рамон; Андерсон, Кеннет Э. (2019). «Кормление кур-несушек арахисом с высоким содержанием олеина улучшает цвет яичного желтка и содержание олеиновых жирных кислот в скорлупе яиц» . Птицеводство . 98 (4): 1732–1748. дои : 10.3382/ps/pey531 . ISSN 1525-3171 . ПМИД 30535420 .
^ Уллоа, Маурисио; Де Сантьяго, Луис М.; Халс-Кемп, Аманда М.; Стелли, Дэвид М.; Берк, Джон Дж. (01 января 2020 г.). «Повышение устойчивости хлопка Upland к засухе, продуктивности и качества волокна: сравнительная оценка и генетическое исследование». Молекулярная генетика и геномика . 295 (1): 155–176. дои : 10.1007/s00438-019-01611-6 . ISSN 1617-4623 . ПМИД 31620883 . S2CID 204707151 .
^ Халс, Аманда М.; Кай, Джеймс Дж. (1 января 2013 г.). «Генетические варианты способствуют изменчивости экспрессии генов у людей» . Генетика . 193 (1): 95–108. дои : 10.1534/genetics.112.146779 . ISSN 0016-6731 . ПМЦ 3527258 . ПМИД 23150607 .
^ Халс-Кемп, Аманда М.; Ашрафи, Хамид; Чжэн, Сютин; Ван, Фэй; Хогенауэр, Кевин А.; Маэда, Андреа Б.В.; Ян, С. Сэмюэл; Стоффель, Кевин; Матвиенко Марта; Клемонс, Кимберли; Удалл, Джошуа А. (30 октября 2014 г.). «Разработка и групповое картирование ген-ассоциированных межвидовых SNP для усилий по интрогрессивной селекции хлопка (Gossypium hirsutum L.)» . БМК Геномика . 15 (1): 945. дои : 10.1186/1471-2164-15-945 . ISSN 1471-2164 . ПМК 4298081 . ПМИД 25359292 .
^ Халс-Кемп, Аманда М.; Лемм, Яна; Плиске, Йорг; Ашрафи, Хамид; Буйярапу, Рамеш; Фанг, Дэвид Д.; Фрелиховски, Джеймс; Гибанд, Марк; Хейга, Стив; Хинце, Лори Л.; Кочан, Келли Дж. (01 июня 2015 г.). «Разработка массива SNP 63K для хлопка и картирование высокой плотности внутривидовых и межвидовых популяций видов Gossypium» . G3: Гены, геномы, генетика . 5 (6): 1187–1209. дои : 10.1534/g3.115.018416 . ISSN 2160-1836 . ПМЦ 4478548 . ПМИД 25908569 .
^ Халс-Кемп, Аманда М.; Ашрафи, Хамид; Плиске, Йорг; Лемм, ешь; Стоффель, Кевин; Хилл, Тереза; Люерсен — Харту; Петиягода, Чарит Л.; Лоули, Синди Т.; Ганал, Мартин В.; Ван Дейнзе, Аллен (27 июля 2016 г.). «HapMap приводит к инфиниумному массиву Capsicum annuum SNP: новому инструменту для селекции перца» . Садоводческие исследования . 3 (1): 16036. Бибкод : 2016HorR.... 316036H дои : 10.1038/hortres.2016.36 . ISSN 2052-7276 . ПМЦ 4962762 . ПМИД 27602231 .
^ Халс-Кемп, Аманда М.; Махешвари, Шамони; Стоффель, Кевин; Хилл, Тереза А.; Яффе, Дэвид; Уильямс, Стивен Р.; Вайзенфельд, Нил; Рамакришнан, Шривидья; Кумар, Виджай; Шах, Прейас; Шац, Майкл К. (12 января 2018 г.). «Сборка эталонного качества генома Capsicum annuum объемом 3,5 ГБ из одной библиотеки связанного чтения» . Исследования в области садоводства . 5 (1): 4. Бибкод : 2018HorR....5....4H . дои : 10.1038/s41438-017-0011-0 . ISSN 2052-7276 . ПМЦ 5798813 . ПМИД 29423234 .

[:3-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д Техасский университет A&M (сентябрь 2015 г.). «Техасский бюллетень по селекции растений A&M объявляет о получении Аманды Халс-Кемп докторской степени». (PDF) . ТЕХАССКИЙ БЮЛЛЕТЕНЬ ПО СЕЛЕКЦИИ РАСТЕНИЙ A&M . Проверено 14 февраля 2020 г.

[:1-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с Каки Карл (01 декабря 2017 г.). «Знакомьтесь, Аманда Халс-Кемп» . Государственный университет Северной Каролины . Проверено 14 февраля 2020 г.

[:0-3] Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д ^и «Аманда Халс-Кемп» . ars.usda.gov . Проверено 14 февраля 2020 г.

[4] Баутиста, Кэрол Варгас (8 ноября 2017 г.). «Бывшие студенты» . Генетика в Техасском университете A&M . Проверено 14 февраля 2020 г.

[5] «Проект CottonSNP63K» . хлопокген.орг . Проверено 14 февраля 2020 г.

[:2-6] Перейти обратно: ^а ^б ^с Департамент почвоведения и растениеводства Техасского университета A&M (май 2015 г.). «Поздравления» (PDF) . ЭГГИ Повестка дня . Проверено 14 февраля 2020 г.

[7] Центр биотехнологии семян Калифорнийского университета в Дэвисе (2017). «Годовой отчет Центра биотехнологии семян (Калифорнийский университет в Дэвисе)» (PDF) . Годовой отчет 2017 . Проверено 14 февраля 2020 г.

[8] «Аманда Халс-Кемп» . Государственный университет Северной Каролины . Проверено 14 февраля 2020 г.

[9] "Люди" . Coffeegenome.ucdavis.edu . Проверено 14 февраля 2020 г.

[10] «Секвенирование генома кофе арабика: совпадает с зарождением индустрии спешиэлти кофе, выращенной в Калифорнии» . ScienceDaily . 13 января 2017 г. Проверено 14 февраля 2020 г.

[11] Наука, Техасский университет A&M. «Научная деятельность | Техасский университет A&M | Колледж-Стейшн, Техас» . outreach.science.tamu.edu . Проверено 14 февраля 2020 г.

[12] Бет Людекер (19 января 2016 г.). «Награды факультетов почвоведения и растениеводства 2015 г.» . Soilcrop.tamu.edu . Проверено 14 февраля 2020 г.

[13] Ян, Энце; Халс, Аманда М.; Кай, Джеймс Дж. (2012). «Эволюционный анализ дивергенции последовательностей и разнообразия дубликатов генов у Aspergillus fumigatus» . Эволюционная биоинформатика . 8 : 623–44. дои : 10.4137/ebo.s10372 . ISSN 1176-9343 . ПМЦ 3510868 . ПМИД 23225993 .

[14] Пейдж, Джастин Т.; Хьюнь, Марк Д.; Лихти, Зак С.; Групп, Кара; Стелли, Дэвид; Халс, Аманда М.; Ашрафи, Хамид; Дейнзе, Аллен Ван; Вендел, Джонатан Ф.; Удалл, Джошуа А. (01 октября 2013 г.). «Понимание эволюции диплоидов и полиплоидов хлопка на основе повторного секвенирования всего генома» . G3: Гены, геномы, генетика . 3 (10): 1809–1818. дои : 10.1534/g3.113.007229 . ISSN 2160-1836 . ПМЦ 3789805 . ПМИД 23979935 .

[15] Гомес-Райя, Луис; Халс, Аманда М.; Тейн, Дэвид; Рау, Венди М. (6 августа 2013 г.). «Фазировка гаплотипов после совместной оценки рекомбинации и неравновесия по сцеплению в размножающихся популяциях» . Журнал зоотехники и биотехнологии . 4 (1): 30. дои : 10.1186/2049-1891-4-30 . ISSN 2049-1891 . ПМЦ 3765333 . ПМИД 23916349 .

[16] Чжан, Тяньчжэнь; Ху, Ян; Цзян, Венкай; Фанг, Лей; Гуань, Сюэин; Чен, Цзедан; Чжан, Цзиньбо; Саски, Кристофер А.; Шеффлер, Брайан Э.; Стелли, Дэвид М.; Халс-Кемп, Аманда М. (2015). «Секвенирование аллотетраплоидного хлопка (Gossypium hirsutum L. acc. TM-1) дает возможность улучшить волокно» . Природная биотехнология . 33 (5): 531–537. дои : 10.1038/nbt.3207 . ISSN 1546-1696 . ПМИД 25893781 .

[17] Халс-Кемп, Аманда М.; Ашрафи, Хамид; Стоффель, Кевин; Чжэн, Сютин; Саски, Кристофер А.; Шеффлер, Брайан Э.; Фанг, Дэвид Д.; Чен, З. Джеффри; Дейнзе, Аллен Ван; Стелли, Дэвид М. (01 июня 2015 г.). «Майнинг SNP на конце BAC-конца в аллотетраплоидном хлопке (Gossypium) с использованием данных повторного секвенирования, филогенетических выводов и перспектив генетического картирования» . G3: Гены, геномы, генетика . 5 (6): 1095–1105. дои : 10.1534/g3.115.017749 . ISSN 2160-1836 . ПМЦ 4478540 . ПМИД 25858960 .

[18] Пейдж, Джастин Т.; Лихти, Зак С.; Александр, Рич Х.; Клемонс, Кимберли; Халс-Кемп, Аманда М.; Ашрафи, Хамид; Дейнзе, Аллен Ван; Стелли, Дэвид М.; Удалл, Джошуа А. (11 мая 2016 г.). «Эволюция последовательности ДНК и редкая гомологичная конверсия у тетраплоидного хлопка» . ПЛОС Генетика . 12 (5): e1006012. дои : 10.1371/journal.pgen.1006012 . ISSN 1553-7404 . ПМЦ 4864293 . ПМИД 27168520 .

[19] Пейдж, Джастин Т.; Лихти, Зак С.; Александр, Рич Х.; Клемонс, Кимберли; Халс-Кемп, Аманда М.; Ашрафи, Хамид; Дейнзе, Аллен Ван; Стелли, Дэвид М.; Удалл, Джошуа А. (22 июля 2016 г.). «Коррекция: эволюция последовательности ДНК и редкая гомологичная конверсия у тетраплоидного хлопка» . ПЛОС Генетика . 12 (7): e1006206. дои : 10.1371/journal.pgen.1006206 . ISSN 1553-7404 . ПМЦ 4957745 . ПМИД 27447832 .

[20] Хинце, Лори Л.; Халс-Кемп, Аманда М.; Уилсон, Иэн В.; Чжу, Цянь-Хао; Ллевеллин, Дэнни Дж.; Тейлор, Джен М.; Сприггс, Эндрю; Фанг, Дэвид Д.; Уллоа, Морис; Берк, Джон Дж.; Гибанд, Марк (3 февраля 2017 г.). «Анализ разнообразия зародышевой плазмы хлопка (Gossypium hirsutum L.) с использованием массива CottonSNP63K» . Биология растений BMC . 17 (1):37.doi 10.1186 : /s12870-017-0981-y . ISSN 1471-2229 . ПМК 5291959 . ПМИД 28158969 .

[21] Саски, Кристофер А.; Шеффлер, Брайан Э.; Халс-Кемп, Аманда М.; Лю, Бо; Сун, Цинсинь; Андо, Ацуми; Стелли, Дэвид М.; Шеффлер, Джоди А.; Гримвуд, Джейн; Джонс, Дон С.; Петерсон, Дэниел Г. (10 ноября 2017 г.). «Субгеном закрепил физические структуры аллотетраплоидного генома горного хлопка (Gossypium hirsutum L.), а также подход к созданию эталонных сборок полиплоидов» . Научные отчеты . 7 (1): 15274. Бибкод : 2017NatSR...715274S . doi : 10.1038/s41598-017-14885-w . ISSN 2045-2322 . ПМЦ 5681701 . ПМИД 29127298 .

[22] Спалинк, Дэниел; Стоффель, Кевин; Уолден, Женевьева К.; Халс-Кемп, Аманда М.; Хилл, Тереза А.; Ван Дейнзе, Аллен; Бос, Линн (2018). «Сравнительная транскриптомика и геномные закономерности несогласованности у Capsiceae (Solanaceae)» . Молекулярная филогенетика и эволюция . 126 : 293–302. Бибкод : 2018МолПЭ.126..293С . дои : 10.1016/j.ympev.2018.04.030 . ISSN 1055-7903 . ПМИД 29702214 . S2CID 13701098 .

[23] Тумер, Ондулла Т.; Халс-Кемп, Аманда М.; Дин, Лиза Л.; Бойкин, Дебора Л.; Малейрос, Рамон; Андерсон, Кеннет Э. (2019). «Кормление кур-несушек арахисом с высоким содержанием олеина улучшает цвет яичного желтка и содержание олеиновых жирных кислот в скорлупе яиц» . Птицеводство . 98 (4): 1732–1748. дои : 10.3382/ps/pey531 . ISSN 1525-3171 . ПМИД 30535420 .

[24] Уллоа, Маурисио; Де Сантьяго, Луис М.; Халс-Кемп, Аманда М.; Стелли, Дэвид М.; Берк, Джон Дж. (01 января 2020 г.). «Повышение устойчивости хлопка Upland к засухе, продуктивности и качества волокна: сравнительная оценка и генетическое исследование». Молекулярная генетика и геномика . 295 (1): 155–176. дои : 10.1007/s00438-019-01611-6 . ISSN 1617-4623 . ПМИД 31620883 . S2CID 204707151 .

[25] Халс, Аманда М.; Кай, Джеймс Дж. (1 января 2013 г.). «Генетические варианты способствуют изменчивости экспрессии генов у людей» . Генетика . 193 (1): 95–108. дои : 10.1534/genetics.112.146779 . ISSN 0016-6731 . ПМЦ 3527258 . ПМИД 23150607 .

[26] Халс-Кемп, Аманда М.; Ашрафи, Хамид; Чжэн, Сютин; Ван, Фэй; Хогенауэр, Кевин А.; Маэда, Андреа Б.В.; Ян, С. Сэмюэл; Стоффель, Кевин; Матвиенко Марта; Клемонс, Кимберли; Удалл, Джошуа А. (30 октября 2014 г.). «Разработка и групповое картирование ген-ассоциированных межвидовых SNP для усилий по интрогрессивной селекции хлопка (Gossypium hirsutum L.)» . БМК Геномика . 15 (1): 945. дои : 10.1186/1471-2164-15-945 . ISSN 1471-2164 . ПМК 4298081 . ПМИД 25359292 .

[27] Халс-Кемп, Аманда М.; Лемм, Яна; Плиске, Йорг; Ашрафи, Хамид; Буйярапу, Рамеш; Фанг, Дэвид Д.; Фрелиховски, Джеймс; Гибанд, Марк; Хейга, Стив; Хинце, Лори Л.; Кочан, Келли Дж. (01 июня 2015 г.). «Разработка массива SNP 63K для хлопка и картирование высокой плотности внутривидовых и межвидовых популяций видов Gossypium» . G3: Гены, геномы, генетика . 5 (6): 1187–1209. дои : 10.1534/g3.115.018416 . ISSN 2160-1836 . ПМЦ 4478548 . ПМИД 25908569 .

[28] Халс-Кемп, Аманда М.; Ашрафи, Хамид; Плиске, Йорг; Лемм, ешь; Стоффель, Кевин; Хилл, Тереза; Люерсен — Харту; Петиягода, Чарит Л.; Лоули, Синди Т.; Ганал, Мартин В.; Ван Дейнзе, Аллен (27 июля 2016 г.). «HapMap приводит к инфиниумному массиву Capsicum annuum SNP: новому инструменту для селекции перца» . Садоводческие исследования . 3 (1): 16036. Бибкод : 2016HorR.... 316036H дои : 10.1038/hortres.2016.36 . ISSN 2052-7276 . ПМЦ 4962762 . ПМИД 27602231 .

[29] Халс-Кемп, Аманда М.; Махешвари, Шамони; Стоффель, Кевин; Хилл, Тереза А.; Яффе, Дэвид; Уильямс, Стивен Р.; Вайзенфельд, Нил; Рамакришнан, Шривидья; Кумар, Виджай; Шах, Прейас; Шац, Майкл К. (12 января 2018 г.). «Сборка эталонного качества генома Capsicum annuum объемом 3,5 ГБ из одной библиотеки связанного чтения» . Исследования в области садоводства . 5 (1): 4. Бибкод : 2018HorR....5....4H . дои : 10.1038/s41438-017-0011-0 . ISSN 2052-7276 . ПМЦ 5798813 . ПМИД 29423234 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

[ 15 ]

[ 16 ]

[ 17 ]

[ 18 ]

[ 19 ]

[ 20 ]

[ 21 ]

[ 22 ]

[ 23 ]

[ 24 ]

[ 25 ]

[ 26 ]

[ 27 ]

[ 28 ]

[ 29 ]