CSRA белок
CSRA | |||
---|---|---|---|
![]() CSRA Димер из Escherichia coli . [ 1 ] | |||
Идентификаторы | |||
Символ | CSRA | ||
Pfam | PF02599 | ||
InterPro | IPR003751 | ||
|
Регулятор хранения углерода A ( CSRA ) является РНК -связывающим белком . Гомологи CSRA встречаются у большинства видов бактерий, у псевдомонадов их называют репрессором вторичных метаболитов ( RSMA и RSME ). [ 2 ] Белки CSRA, как правило, связываются с последовательности Shine-Dalgarno Messenger RNAS и либо ингибируют трансляцию, либо облегчают распад мРНК. [ 3 ]
CSRA оказывает регуляторное влияние на биосинтез гликогена и катаболизм, гликолиз , [ 3 ] Биопленка Формирование [ 4 ] и чувствительность кворума . [ 5 ]
Взаимодействия
[ редактировать ]
Белок CSRA связывается с мотивом РНК -петли ствола . Способность белка ингибировать трансляцию связанных мРНК может противостоять экспрессии SRNAS, таких как CSRB , CSRC , RSMZ , RSMY и RSMX, которые содержат несколько копий мотива РНК. Эти RNAS Seckest CSRA, которая позволяет переводить ранее ингибированных связанных мРНК. Исследование, исследующее специфическое связывание CSRA в транскриптоме сальмонеллы , выявило 467 сайтов связывания. [ 6 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Gutiérrez, P; Li, y; Осборн, MJ; Pomerantseva, E; Лю, Q; Gehring, K (май 2005). «Структура раствора регулятора хранения углерода CSRA из Escherichia coli» . Журнал бактериологии . 187 (10): 3496–501. doi : 10.1128/jb.187.10.3496-3501.2005 . PMC 1112004 . PMID 15866937 .
- ^ Timmermans, J; Ван Мелдерен, L (сентябрь 2010 г.). «Посттранскрипционная глобальная регуляция CSRA в бактериях» . Клеточные и молекулярные науки о жизни . 67 (17): 2897–908. doi : 10.1007/s00018-010-0381-z . PMC 11115721 . PMID 20446015 . S2CID 23366724 .
- ^ Jump up to: а беременный Лю, мой; GUI, G; Вэй, б; Престон JF, 3 -й; Окфорд, L; Yüksel, U; Giedroc, DP; Ромео, Т (11 июля 1997 г.). «Молекула РНК CSRB связывается с глобальным регуляторным белком CSRA и противодействует его активности в Escherichia coli» . Журнал биологической химии . 272 (28): 17502–10. doi : 10.1074/jbc.272.28.17502 . PMID 9211896 .
{{cite journal}}
: CS1 Maint: числовые имена: список авторов ( ссылка ) - ^ Джексон, DW; Suzuki, K; Окфорд, L; Seagecka, JW; Харт, я; Ромео, Т (январь 2002 г.). «Формирование биопленки и рассеивание под влиянием глобального регулятора CSRA Escherichia coli» . Журнал бактериологии . 184 (1): 290–301. doi : 10.1128/jb.184.1.290-301.2002 . PMC 134780 . PMID 11741870 .
- ^ Sonnleitner, E; Ромео, а; Bläsi, U (апрель 2012 г.). «Небольшие регуляторные РНК в Pseudomonas aeruginosa» . РНК -биология . 9 (4): 364–71. doi : 10.4161/rna.19231 . PMID 22336763 .
- ^ Holmqvist E, Wright PR, Li L, Bischler T, Barquist L, Reinhardt R, Backofen R, Vogel J (2016). «Глобальные паттерны распознавания РНК посттранскрипционных регуляторов HFQ и CSRA, выявленные с помощью ультрафиолетового сшивания in vivo» . Embo j . 35 (9): 991–1011. doi : 10.15252/embj.201593360 . PMC 5207318 . PMID 27044921 .