✖


Jump to content

Список методов омики отдельных клеток

    Add links

    список из более чем 100 различных методов секвенирования одиночных клеток (омик). Опубликован [1] Подавляющее большинство методов сочетаются с технологиями секвенирования короткого считывания, хотя некоторые из них совместимы с секвенированием длинного считывания.

    Список

    [ редактировать ]
    Метод Ссылка Режим последовательности Ранняя оценка Поздняя оценка
    Метод Тан [2] Короткие чтения 2008 2009
    ЦиТОФ [3] Короткие чтения 2011 2012
    STRT-seq/C1 [4] Короткие чтения 2011 2012
    SMART-последовательность [5] Короткие чтения 2012 2013
    CEL-seq [6] Короткие чтения 2012 2013
    Кварц-Сек [7] Короткие чтения 2012 2013
    ПМА/СМА [8] Короткие чтения 2012 2013
    scBS-seq [9] Короткие чтения 2013 2014
    AbPair [10] Короткие чтения 2014 2014
    МАРС-сек. [11] Короткие чтения 2014 2015
    DR-сек. [12] Короткие чтения 2014 2015
    G&T-Seq [13] Короткие чтения 2014 2015
    СКТГ [14] Короткие чтения 2014 2015
    SIDR-сек. [15] Короткие чтения 2014 2015
    научно-ATAC-seq [16] Короткие чтения 2014 2015
    Привет-SCL [17] Короткие чтения 2015 2015
    СУПЕР-сек [18] Короткие чтения 2015 2015
    Drop-чип [19] Короткие чтения 2015 2015
    ЦитоСек [20] Короткие чтения 2015 2016
    inDrop [21] Короткие чтения 2015 2016
    sc-GEM [22] Короткие чтения 2015 2016
    scTrio-seq [23] Короткие чтения 2015 2016
    scM&T-seq [24] Короткие чтения 2015 2016
    ПЛЕЙР [25] Короткие чтения 2015 2016
    Геншафт-и-ал-2016 [26] Короткие чтения 2015 2016
    Дарманис и др. 2016 г. [27] Короткие чтения 2015 2016
    CRISP-сек. [28] Короткие чтения 2015 2016
    scGESTALT [29] Короткие чтения 2015 2016
    CEL-Seq2/C1 [30] Короткие чтения 2015 2016
    STRT-seq-2i [31] Короткие чтения 2016 2017
    РНКсек @ 10xгеномика [32] Короткие чтения 2016 2017
    РНКсек/экспрессия генов @ nanostringtech [33] Короткие чтения 2016 2017
    sc Направленная экспрессия генов @ Liquidigm [34] Короткие чтения 2016 2017
    scTCR Ваферген [35] Короткие чтения 2016 2017
    CROP-сек. [36] Короткие чтения 2016 2017
    SiC-seq [37] Короткие чтения 2016 2017
    mcSCRB-seq [38] Короткие чтения 2016 2017
    Патч-последовательность [39] Короткие чтения 2016 2017
    Гео-секвенирование [40] Короткие чтения 2016 2017
    scNOMe-seq [41] Короткие чтения 2016 2017
    scCOOL-seq [42] Короткие чтения 2016 2017
    Вырезать и запустить [43] Короткие чтения 2016 2017
    MATQ-seq [44] Короткие чтения 2016 2017
    Кварц-Seq2 [45] Короткие чтения 2017 2018
    Seq-Well [46] Короткие чтения 2017 2018
    DroNC-Seq [47] Короткие чтения 2017 2018
    научно-РНК-секвенирование [48] Короткие чтения 2017 2018
    scATAC @10xgenomics [49] Короткие чтения 2017 2018
    scVDJ @10xgenomics [50] Короткие чтения 2017 2018
    scNMT тройная омика [51] Короткие чтения 2017 2018
    SPLIT-seq Анализ Биологических наук [52] Короткие чтения 2017 2018
    CITE-Seq [53] Короткие чтения 2017 2018
    scMNase-seq [54] Короткие чтения 2017 2018
    Шалин и др. 2018 [55] Короткие чтения 2017 2018
    ЛИННЕЙ [56] Короткие чтения 2017 2018
    TracerSeq [57] Короткие чтения 2017 2018
    CellTag [58] Короткие чтения 2017 2018
    ScarTrace [59] Короткие чтения 2017 2018
    scRNA-Seq Доломит Био [60] Короткие чтения 2017 2018
    Трек-петля [61] Короткие чтения 2017 2018
    НАРУШЕНИЕ-АТАКА [62] Короткие чтения 2018 2019
    scМетилирование [63] Короткие чтения 2018 2019
    наука [64] Короткие чтения 2018 2019
    Мультиплексный капельный scRNAseq [65] Короткие чтения 2018 2019
    научная машина [66] Короткие чтения 2018 2019
    C1 CAGE одноклеточный [67] Короткие чтения 2018 2019
    sc спаренная микроРНК-мРНК [68] Короткие чтения 2018 2019
    scCAT-seq [69] Короткие чтения 2018 2019
    REAP-seq @fluidigm [70] Короткие чтения 2018 2019
    scCC [71] Короткие чтения 2018 2019
    yscRNA-SEQ [72] Короткие чтения 2018 2019
    TARGET-seq [73] Короткие чтения 2018 2019
    МУЛЬТИ-сек. [74] Короткие чтения 2018 2019
    snRNA-seq [75] Короткие чтения 2018 2019
    научно-РНК-seq3 [76] Короткие чтения 2018 2019
    BRIF-последовательность [77] Короткие чтения 2018 2019
    Drop-seq Доломит Био [60] Короткие чтения 2018 2019
    Слайд-последовательность [78] Короткие чтения 2018 2019
    ВЫРЕЗАТЬ&Тегировать [79] Короткие чтения 2018 2019
    Тегирование ячеек [80] Короткие чтения 2018 2019
    DART-Seq [81] Короткие чтения 2018 2019
    scDamID&T [82] Короткие чтения 2018 2019
    ACT-последовательность [83] Короткие чтения 2018 2019
    Научно-привет-C [84] Короткие чтения 2018 2019
    Слайд-последовательность [85] Короткие чтения 2018 2019
    Упрощенное удаление-seq [86] Короткие чтения 2018 2019
    scChIC-seq [87] Короткие чтения 2018 2019
    Дип-С [88] Короткие чтения 2018 2019
    КОБАТЧ [89] Короткие чтения 2018 2019
    Конвертировать-последовательность [90] Короткие чтения 2018 2019
    scATAC-seq на основе капель [91] Короткие чтения 2018 2019
    EXCITE-последовательность [92] Короткие чтения 2018 2019
    dsciATAC-seq [91] Короткие чтения 2018 2019
    CLEVER-последовательность [93] Короткие чтения 2018 2019
    scISOr-Seq [94] Короткие чтения 2018 2019
    МАРС-seq2.0 [95] Короткие чтения 2018 2019
    нано-ИМЯ [96] Длинное чтение 2018 2019
    MeSMLR-seq [97] Длинное чтение 2018 2019
    SMAC-последовательность [98] Длинное чтение 2018 2019
    MoonTag/SunTag [99] Короткие чтения 2018 2019
    SCoPE2 [100] Короткие чтения 2018 2019
    научная судьба [101] Короткие чтения 2018 2019
    μDamID [102] Короткие чтения 2018 2019
    Метил-HiC [103] Короткие чтения 2018 2019
    RAGE-последовательность [104] Длинное чтение 2018 2019
    Парный-Seq [105] Короткие чтения 2018 2019
    Тн5Прайм [106] Короткие чтения 2018 2019
    НаноПАРЕ [107] Короткие чтения 2018 2019
    BART-Seq [108] Короткие чтения 2018 2019
    scDam&T-seq [109] Короткие чтения 2018 2019
    itChIP-seq [110] Короткие чтения 2018 2019
    SNARE-seq [111] Короткие чтения 2018 2019
    ASTAR-последовательность [112] Короткие чтения 2018 2019
    научный-Плекс [113] Короткие чтения 2018 2019
    MIX-Seq [114] Короткие чтения 2018 2019
    микроСПЛИТ [115] Короткие чтения 2018 2019
    PAIso-seq [116] Короткие чтения 2018 2019
    FIN-Seq [117] Короткие чтения 2018 2019
    ВЕСЫ-сек. [118] Короткие чтения 2018 2019
    scifi-RNA-seq [119] Короткие чтения 2018 2019
    plexDIA [120] Короткие чтения 2021 2021
    МПХ [121] Короткие чтения 2023 2023

    Ссылки

    [ редактировать ]
    1. ^ "Single-Cell-Omics.v2.3.13 @albertvilella" . Гугл Документы . Проверено 01 января 2020 г.
    2. ^ Тан Ф., Барбачору С., Ван Ю., Нордман Э., Ли С., Сюй Н. и др. (май 2009 г.). «Анализ всего транскриптома мРНК-Seq одной клетки». Природные методы . 6 (5): 377–82. дои : 10.1038/nmeth.1315 . ПМИД   19349980 . S2CID   16570747 .
    3. ^ «Жидкая дигма | Достижения одноклеточных технологий» . www.fluidigm.com .
    4. ^ Хашимшони Т., Вагнер Ф., Шер Н., Янаи И. (сентябрь 2012 г.). «CEL-Seq: Seq одноклеточной РНК путем мультиплексной линейной амплификации» . Отчеты по ячейкам . 2 (3): 666–73. дои : 10.1016/j.celrep.2012.08.003 . ПМИД   22939981 .
    5. ^ Ислам С., Зейзель А., Йост С., Ла Манно Г., Заяк П., Каспер М. и др. (февраль 2014 г.). «Количественный секвенирование одноклеточной РНК с уникальными молекулярными идентификаторами». Природные методы . 11 (2): 163–6. дои : 10.1038/nmeth.2772 . ПМИД   24363023 . S2CID   6765530 .
    6. ^ Джайтин Д.А., Кенигсберг Э., Керен-Шауль Х., Элефант Н., Пол Ф., Зарецкий И. и др. (февраль 2014 г.). «Массовое параллельное секвенирование одноклеточной РНК для безмаркерного разложения тканей на типы клеток» . Наука . 343 (6172): 776–9. Бибкод : 2014Sci...343..776J . дои : 10.1126/science.1247651 . ПМЦ   4412462 . ПМИД   24531970 .
    7. ^ Сасагава Ю., Никайдо И., Хаяси Т., Данно Х., Уно К.Д., Имаи Т., Уэда Х.Р. (апрель 2013 г.). «Quartz-Seq: высоковоспроизводимый и чувствительный метод секвенирования одноклеточной РНК, выявляющий негенетическую гетерогенность экспрессии генов» . Геномная биология . 14 (4): С31. дои : 10.1186/gb-2013-14-4-r31 . ПМК   4054835 . ПМИД   23594475 .
    8. ^ Пан X, Дарретт Р.Э., Чжу Х., Танака Ю., Ли Ю., Цзы Х. и др. (январь 2013 г.). «Два метода полноразмерного секвенирования РНК для небольших количеств клеток и отдельных клеток» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 110 (2): 594–9. Бибкод : 2013PNAS..110..594P . дои : 10.1073/pnas.1217322109 . ПМЦ   3545756 . ПМИД   23267071 .
    9. ^ Смоллвуд С.А., Ли Х.Дж., Ангермюллер С., Крюгер Ф., Сааде Х., Пит Дж. и др. (август 2014 г.). «Одноклеточное полногеномное бисульфитное секвенирование для оценки эпигенетической гетерогенности» . Природные методы . 11 (8): 817–820. дои : 10.1038/nmeth.3035 . ПМК   4117646 . ПМИД   25042786 .
    10. ^ Бриггс А.В., Голдфлесс С.Дж., Тимберлейк С., Бельмонт Б.Дж., Клоузер С.Р., Коппштейн Д. и др. (5 мая 2017 г.). «Проникающий в опухоль иммунный репертуар, зафиксированный с помощью одноклеточного штрих-кодирования в эмульсии» . bioRxiv : 134841. doi : 10.1101/134841 .
    11. ^ Пичелли С., Бьорклунд О.К., Фаридани О.Р., Сагассер С., Винберг Г., Сандберг Р. (ноябрь 2013 г.). «Smart-seq2 для чувствительного полноразмерного профилирования транскриптома в отдельных клетках». Природные методы . 10 (11): 1096–8. дои : 10.1038/nmeth.2639 . ПМИД   24056875 . S2CID   6356570 .
    12. ^ Дей С.С., Кестер Л., Спанджаард Б., Биенко М., ван Ауденаарден А. (март 2015 г.). «Интегрированное секвенирование генома и транскриптома одной и той же клетки» . Природная биотехнология . 33 (3): 285–289. дои : 10.1038/nbt.3129 . ПМЦ   4374170 . ПМИД   25599178 .
    13. ^ Маколей И.С., Хаэрти В., Кумар П., Ли Й.И., Ху Т.Х., Тенг М.Дж. и др. (июнь 2015 г.). «G&T-seq: параллельное секвенирование одноклеточных геномов и транскриптомов» . Природные методы . 12 (6): 519–22. дои : 10.1038/nmeth.3370 . ПМИД   25915121 . S2CID   969246 .
    14. ^ Ли В., Колдер Р.Б., Мар Дж.К., Вейг Дж. (февраль 2015 г.). «Одноклеточная транскриптогеномика выявляет транскрипционное исключение аллелей, мутированных по ENU» . Мутационные исследования . 772 : 55–62. дои : 10.1016/j.mrfmmm.2015.01.002 . ПМЦ   4342853 . ПМИД   25733965 .
    15. ^ Хан К.Ю., Ким К.Т., Йонг Дж.Г., Сон Д.С., Ким Ю.Дж., Джо А. и др. (январь 2018 г.). «SIDR: одновременное выделение и параллельное секвенирование геномной ДНК и тотальной РНК из отдельных клеток» . Геномные исследования . 28 (1): 75–87. дои : 10.1101/гр.223263.117 . ПМК   5749184 . ПМИД   29208629 .
    16. ^ Кусанович Д.А., Даза Р., Адей А., Плинер Х.А., Кристиансен Л., Гундерсон К.Л. и др. (май 2015 г.). «Мультиплексное профилирование отдельных клеток доступности хроматина путем комбинаторного клеточного индексирования» . Наука . 348 (6237): 910–4. Бибкод : 2015Sci...348..910C . дои : 10.1126/science.aab1601 . ПМЦ   4836442 . ПМИД   25953818 .
    17. ^ Ротем А., Рам О., Шореш Н., Сперлинг Р.А., Шналль-Левин М., Чжан Х. и др. (1 января 2015 г.). «Высокопроизводительная маркировка одиночных клеток (Hi-SCL) для секвенирования РНК с использованием капельной микрофлюидики» . ПЛОС ОДИН . 10 (5): e0116328. Бибкод : 2015PLoSO..1016328R . дои : 10.1371/journal.pone.0116328 . ПМЦ   4441486 . ПМИД   26000628 .
    18. ^ Фань X, Чжан X, Ву X, Го Х, Ху Ю, Тан Ф, Хуан Ю (июль 2015 г.). «Одноклеточный анализ транскриптома RNA-seq линейных и кольцевых РНК в предимплантационных эмбрионах мышей» . Геномная биология . 16 (1): 148. дои : 10.1186/s13059-015-0706-1 . ПМЦ   4511241 . ПМИД   26201400 .
    19. ^ «Дроп-Чип» . pubs.broadinstitute.org .
    20. ^ Фан ХК, Фу ГК, Фодор СП (февраль 2015 г.). «Профилирование экспрессии. Комбинаторное мечение отдельных клеток для цитометрии экспрессии генов». Наука . 347 (6222): 1258367. doi : 10.1126/science.1258367 . ПМИД   25657253 . S2CID   5493175 .
    21. ^ Кляйн А.М., Мазутис Л., Акартуна И., Таллапрагада Н., Верес А., Ли В. и др. (май 2015 г.). «Капельное штрих-кодирование для транскриптомики отдельных клеток применительно к эмбриональным стволовым клеткам» . Клетка . 161 (5): 1187–1201. дои : 10.1016/j.cell.2015.04.044 . ПМЦ   4441768 . ПМИД   26000487 .
    22. ^ Чеоу Л.Ф., Куртуа Э.Т., Тан И., Вишванатан Р., Син К., Тан Р.З. и др. (октябрь 2016 г.). «Мультимодальное профилирование одной клетки выявляет клеточную эпигенетическую гетерогенность». Природные методы . 13 (10): 833–6. дои : 10.1038/nmeth.3961 . ПМИД   27525975 . S2CID   3531201 .
    23. ^ Хоу Ю, Го Х, Цао С, Ли Х, Ху Б, Чжу П и др. (март 2016 г.). «Секвенирование тройного омика одной клетки выявляет генетическую, эпигенетическую и транскриптомную гетерогенность в гепатоцеллюлярных карциномах» . Клеточные исследования . 26 (3): 304–19. дои : 10.1038/cr.2016.23 . ПМЦ   4783472 . ПМИД   26902283 .
    24. ^ Ангермюллер С., Кларк С.Дж., Ли Х.Дж., Маколей И.С., Тенг М.Дж., Ху Т.Х. и др. (март 2016 г.). «Параллельное секвенирование отдельных клеток связывает транскрипционную и эпигенетическую гетерогенность» . Природные методы . 13 (3): 229–232. дои : 10.1038/nmeth.3728 . ПМЦ   4770512 . ПМИД   26752769 .
    25. ^ Фрей А.П., Бава Ф.А., Цундер Э.Р., Се Э.В., Чен С.Ю., Нолан Г.П., Герардини П.Ф. (март 2016 г.). «Высокомультиплексное одновременное обнаружение РНК и белков в отдельных клетках» . Природные методы . 13 (3): 269–75. дои : 10.1038/nmeth.3742 . ПМЦ   4767631 . ПМИД   26808670 .
    26. ^ Геншафт А.С., Ли С., Галлант С.Дж., Дарманис С., Пракадан С.М., Циглер К.Г. и др. (сентябрь 2016 г.). «Мультиплексное целенаправленное профилирование одноклеточных протеомов и транскриптомов в одной реакции» . Геномная биология . 17 (1): 188. дои : 10.1186/s13059-016-1045-6 . ПМК   5027636 . ПМИД   27640647 .
    27. ^ Дарманис С., Слоан С.А., Крут Д., Миньярди М., Черникова С., Самхабаби П. и др. (октябрь 2017 г.). «Одноклеточная РНК-Seq-анализ инфильтрирующих неопластических клеток на мигрирующем фронте глиобластомы человека» . Отчеты по ячейкам . 21 (5): 1399–1410. дои : 10.1016/j.celrep.2017.10.030 . ПМЦ   5810554 . ПМИД   29091775 .
    28. ^ Джайтин Д.А., Вайнер А., Йофе И., Лара-Астиасо Д., Керен-Шауль Х., Дэвид Э. и др. (декабрь 2016 г.). «Рассечение иммунных цепей путем объединения скринингов, полученных с помощью CRISPR, с секвенированием одноклеточной РНК» . Клетка . 167 (7): 1883–1896.e15. дои : 10.1016/j.cell.2016.11.039 . ПМИД   27984734 .
    29. ^ Радж Б., Вагнер Д.Э., Маккенна А., Панди С., Кляйн А.М., Шендюр Дж. и др. (июнь 2018 г.). «Одновременное одноклеточное профилирование линий и типов клеток в мозге позвоночных» . Природная биотехнология . 36 (5): 442–450. дои : 10.1038/nbt.4103 . ПМЦ   5938111 . ПМИД   29608178 .
    30. ^ Хашимшони Т., Сендерович Н., Авиталь Г., Клохендлер А., де Леу Юв, Анави Л. и др. (апрель 2016 г.). «CEL-Seq2: чувствительный высокомультиплексированный одноклеточный РНК-Seq» . Геномная биология . 17 (1): 77. дои : 10.1186/s13059-016-0938-8 . ПМЦ   4848782 . ПМИД   27121950 .
    31. ^ Хохгернер Х., Лённерберг П., Ходж Р., Майкс Дж., Хескол А., Хабшле Х. и др. (ноябрь 2017 г.). «STRT-seq-2i: секвенирование 5'-одноклеточной и ядерной РНК с двойным индексом на адресуемой матрице микролунок» . Научные отчеты . 7 (1): 16327. Бибкод : 2017NatSR...716327H . дои : 10.1038/s41598-017-16546-4 . ПМК   5703850 . ПМИД   29180631 .
    32. ^ «Секвенирование одноклеточной РНК» . 10x геномный.
    33. ^ «Технология nCounter®» . Нанострунные технологии.
    34. ^ «Fluidigm | Расходные материалы | Одноклеточная экспрессия генов» . www.fluidigm.com .
    35. ^ Inc., WaferGen Bio-systems. «WaferGen представляет результаты секвенирования одноклеточных Т-клеточных рецепторов с использованием одноклеточной системы ICELL8 ™ на конференции по геномике одноклеточных клеток 2016 года» . www.prnewswire.com . {{cite web}}: |last= имеет общее имя ( справка )
    36. ^ Датлингер П., Рендейро А.Ф., Шмидл С., Краусгрубер Т., Тракслер П., Клугхаммер Дж. и др. (март 2017 г.). «Объединенный скрининг CRISPR со считыванием транскриптома одной клетки» . Природные методы . 14 (3): 297–301. дои : 10.1038/nmeth.4177 . ПМЦ   5334791 . ПМИД   28099430 .
    37. ^ Лан Ф., Демари Б., Ахмед Н., Абате А.Р. (июль 2017 г.). «Секвенирование одноклеточного генома со сверхвысокой производительностью с помощью микрофлюидного капельного штрих-кодирования» . Природная биотехнология . 35 (7): 640–646. дои : 10.1038/nbt.3880 . ПМК   5531050 . ПМИД   28553940 .
    38. ^ Баньоли Дж.В., Цигенхайн С., Янжич А., Ванге Л.Е., Вит Б., Парех С. и др. (18 октября 2017 г.). «mcSCRB-seq: чувствительное и мощное секвенирование одноклеточной РНК» . bioRxiv : 188367. doi : 10.1101/188367 .
    39. ^ Кэдвелл Ч.Р., Сандберг Р., Цзян Х, Толиас А.С. (июль 2017 г.). «Вопросы и ответы: использование Patch-seq для профилирования отдельных ячеек» . БМК Биология . 15 (1): 58. дои : 10.1186/s12915-017-0396-0 . ПМК   5499043 . ПМИД   28679385 .
    40. ^ Чен Дж, Суо С, Там П.П., Хан Дж.Дж., Пэн Г., Цзин Н. (март 2017 г.). «Пространственный транскриптомный анализ образцов замороженных тканей с помощью Geo-seq». Протоколы природы . 12 (3): 566–580. дои : 10.1038/нпрот.2017.003 . ПМИД   28207000 . S2CID   3879096 .
    41. ^ Потт С. (июнь 2017 г.). Рен Б. (ред.). «Одновременное измерение доступности хроматина, метилирования ДНК и фазировки нуклеосом в отдельных клетках» . электронная жизнь . 6 : е23203. doi : 10.7554/eLife.23203 . ПМК   5487215 . ПМИД   28653622 .
    42. ^ Го Ф, Ли Л, Ли Дж, Ву X, Ху Б, Чжу П и др. (август 2017 г.). «Одноклеточное мультиомное секвенирование ранних эмбрионов мыши и эмбриональных стволовых клеток» . Клеточные исследования . 27 (8): 967–988. дои : 10.1038/cr.2017.82 . ПМЦ   5539349 . ПМИД   28621329 .
    43. ^ Скин П.Дж., Хеникофф С. (январь 2017 г.). Рейнберг Д. (ред.). «Эффективная стратегия таргетной нуклеазы для картирования сайтов связывания ДНК с высоким разрешением» . электронная жизнь . 6 : е21856. дои : 10.7554/eLife.21856 . ПМК   5310842 . ПМИД   28079019 .
    44. ^ Шэн К., Цао В., Ню Ю, Дэн Ц, Цзун С. (март 2017 г.). «Эффективное обнаружение изменений в одноклеточных транскриптомах с использованием MATQ-seq». Природные методы . 14 (3): 267–270. дои : 10.1038/nmeth.4145 . ПМИД   28092691 . S2CID   582788 .
    45. ^ Сасагава Ю., Данно Х., Такада Х., Эбисава М., Танака К., Хаяши Т. и др. (март 2018 г.). «Quartz-Seq2: высокопроизводительный метод секвенирования одноклеточной РНК, который эффективно использует ограниченное считывание последовательности» . Геномная биология . 19 (1): 29. дои : 10.1186/s13059-018-1407-3 . ПМЦ   5845169 . ПМИД   29523163 .
    46. ^ Гиран Т.М., Уодсворт М.Х., Хьюз Т.К., Брайсон Б.Д., Батлер А., Сатия Р. и др. (апрель 2017 г.). «Seq-Well: портативное и недорогое секвенирование РНК отдельных клеток с высокой производительностью» . Природные методы . 14 (4): 395–398. дои : 10.1038/nmeth.4179 . hdl : 1721.1/113430 . ПМК   5376227 . ПМИД   28192419 .
    47. ^ Хабиб Н., Авраам-Давиди I, Басу А., Беркс Т., Шекхар К., Хофри М. и др. (октябрь 2017 г.). «Массивно параллельное секвенирование одноядерной РНК с DroNc-seq» . Природные методы . 14 (10): 955–958. дои : 10.1038/nmeth.4407 . ПМЦ   5623139 . ПМИД   28846088 .
    48. ^ Цао Дж., Пакер Дж.С., Рамани В., Кусанович Д.А., Хуинь С., Даза Р. и др. (август 2017 г.). «Комплексное одноклеточное транскрипционное профилирование многоклеточного организма» . Наука . 357 (6352): 661–667. Бибкод : 2017Sci...357..661C . дои : 10.1126/science.aam8940 . ПМЦ   5894354 . ПМИД   28818938 .
    49. ^ «Одноклеточный ATAC — 10-кратная геномика» .
    50. ^ «Профилирование одноклеточного иммунитета — 10-кратная геномика» .
    51. ^ Аргелагет Р., Мохаммед Х., Кларк С.Дж., Стапель Л.С., Крюгер С., Капурани К.А. и др. (13 января 2019 г.). «Мультиомное профилирование отдельных клеток выявляет иерархический эпигенетический ландшафт во время спецификации зародышевого листка млекопитающих» . bioRxiv : 519207. doi : 10.1101/519207 .
    52. ^ Розенберг А.Б., Роко С.М., Мускат Р.А., Кучина А., Образец П, Яо З и др. (апрель 2018 г.). «Одноклеточное профилирование развивающегося головного и спинного мозга мышей с помощью штрих-кодирования с разделенным пулом» . Наука . 360 (6385): 176–182. Бибкод : 2018Sci...360..176R . дои : 10.1126/science.aam8999 . ПМЦ   7643870 . ПМИД   29545511 .
    53. ^ Стоккиус М., Хафемейстер С., Стефенсон В., Хоук-Лумис Б., Чаттопадхай П.К., Свердлов Х. и др. (сентябрь 2017 г.). «Одновременное измерение эпитопа и транскриптома в отдельных клетках» . Природные методы . 14 (9): 865–868. дои : 10.1038/nmeth.4380 . ПМК   5669064 . ПМИД   28759029 .
    54. ^ Лай Б., Гао В., Цуй К., Се В., Тан Ц., Цзинь В. и др. (октябрь 2018 г.). «Принципы организации нуклеосом, выявленные с помощью секвенирования одноклеточных микрококковых нуклеаз» . Природа . 562 (7726): 281–285. Бибкод : 2018Natur.562..281L . дои : 10.1038/s41586-018-0567-3 . ПМЦ   8353605 . ПМИД   30258225 . S2CID   52841785 .
    55. ^ Нам А.С., Ким К.Т., Шалин Р., Иззо Ф., Анг С., Абу-Зейна Г. и др. (16 октября 2018 г.). «Высокопроизводительное капельное одноклеточное генотипирование транскриптомов (GoT) выявляет зависимость идентичности клеток от воздействия соматических мутаций» . bioRxiv : 444687. doi : 10.1101/444687 .
    56. ^ Спанджаард Б, Ху Б, Митич Н, Оливарес-Шове П, Янджуха С, Нинов Н, Юнкер Дж. П. (июнь 2018 г.). «Одновременное отслеживание происхождения и идентификация типов клеток с использованием генетических рубцов, индуцированных CRISPR-Cas9» . Природная биотехнология . 36 (5): 469–473. дои : 10.1038/nbt.4124 . ПМЦ   5942543 . ПМИД   29644996 .
    57. ^ Вагнер Д.Е., Вайнреб С., Коллинз З.М., Бриггс Дж.А., Мегасон С.Г., Кляйн А.М. (июнь 2018 г.). «Одноклеточное картирование ландшафтов экспрессии генов и их происхождения у эмбрионов рыбок данио» . Наука . 360 (6392): 981–987. Бибкод : 2018Sci...360..981W . дои : 10.1126/science.aar4362 . ПМК   6083445 . ПМИД   29700229 .
    58. ^ Го С, Конг В, Камимото К, Ривера-Гонсалес Г.К., Ян Х, Кирита Ю, Моррис С.А. (май 2019 г.). «Индексирование CellTag: мультиплексирование образцов на основе генетического штрих-кода для геномики отдельных клеток» . Геномная биология . 20 (1): 90. дои : 10.1186/s13059-019-1699-y . ПМК   6509836 . ПМИД   31072405 .
    59. ^ Алемани А., Флореску М., Барон К.С., Петерсон-Мадуро Дж., ван Ауденаарден А. (апрель 2018 г.). «Отслеживание клонов всего организма с использованием секвенирования отдельных клеток». Природа . 556 (7699): 108–112. Бибкод : 2018Natur.556..108A . дои : 10.1038/nature25969 . ПМИД   29590089 . S2CID   4633026 .
    60. ^ Jump up to: а б «Надя Инструмент» . Доломит Био .
    61. ^ Лай Б., Тан К., Цзинь В., Ху Г., Ванса Д., Цуй К. и др. (сентябрь 2018 г.). «Trac-петли измеряют структуру генома и доступность хроматина» . Природные методы . 15 (9): 741–747. дои : 10.1038/s41592-018-0107-y . ПМЦ   7212307 . ПМИД   30150754 .
    62. ^ Рубин А.Дж., Паркер К.Р., Сатпати А.Т., Ци Ю, Ву Б, Онг А.Дж. и др. (январь 2019 г.). «Совместный скрининг CRISPR одноклеточных клеток и эпигеномное профилирование выявляет причинно-следственные сети регуляции генов» . Клетка . 176 (1–2): 361–376.e17. дои : 10.1016/j.cell.2018.11.022 . ПМК   6329648 . ПМИД   30580963 .
    63. ^ Каремакер И.Д., Вермюлен М. (сентябрь 2018 г.). «Профилирование метилирования одноклеточной ДНК: технологии и биологические применения». Тенденции в биотехнологии . 36 (9): 952–965. дои : 10.1016/j.tibtech.2018.04.002 . hdl : 2066/200393 . ПМИД   29724495 . S2CID   19248693 .
    64. ^ де Вит Э (май 2017 г.). «Учет гетерогенности: одноклеточные структуры трехмерного генома». Структурная и молекулярная биология природы . 24 (5): 437–438. дои : 10.1038/nsmb.3404 . ПМИД   28471429 . S2CID   5132000 .
    65. ^ Кан Х.М., Субраманиам М., Тарг С., Нгуен М., Малискова Л., Маккарти Э. и др. (январь 2018 г.). «Мультиплексное капельное секвенирование одноклеточной РНК с использованием естественных генетических вариаций» . Природная биотехнология . 36 (1): 89–94. дои : 10.1038/nbt.4042 . ПМЦ   5784859 . ПМИД   29227470 .
    66. ^ Цао Дж., Кусанович Д.А., Рамани В., Агамирзаи Д., Плинер Х.А., Хилл А.Дж. и др. (сентябрь 2018 г.). «Совместное профилирование доступности хроматина и экспрессии генов в тысячах отдельных клеток» . Наука . 361 (6409): 1380–1385. Бибкод : 2018Sci...361.1380C . дои : 10.1126/science.aau0730 . ПМК   6571013 . ПМИД   30166440 .
    67. ^ Коуно Т., Муди Дж., Квон А.Т., Сибаяма Ю., Като С., Хуан Ю. и др. (январь 2019 г.). «C1 CAGE обнаруживает сайты начала транскрипции и активность энхансера с разрешением одной клетки» . Природные коммуникации . 10 (1): 360. Бибкод : 2019NatCo..10..360K . дои : 10.1038/s41467-018-08126-5 . ПМК   6341120 . ПМИД   30664627 .
    68. ^ Ван Н., Чжэн Дж., Чэнь З., Лю Ю., Дура Б., Квак М. и др. (январь 2019 г.). «Совместное секвенирование одноклеточной микроРНК-мРНК выявляет негенетическую гетерогенность и механизмы регуляции микроРНК» . Природные коммуникации . 10 (1): 95. Бибкод : 2019NatCo..10...95W . дои : 10.1038/s41467-018-07981-6 . ПМК   6327095 . PMID   30626865 .
    69. ^ Лю Л., Лю С., Кинтеро А., Ву Л., Юань Ю., Ван М. и др. (январь 2019 г.). «Деконволюция одноклеточных слоев мультиомики выявляет регуляторную гетерогенность» . Природные коммуникации . 10 (1): 470. Бибкод : 2019NatCo..10..470L . дои : 10.1038/s41467-018-08205-7 . ПМК   6349937 . ПМИД   30692544 .
    70. ^ Корпорация, Fluidigm (31 января 2019 г.). «Fluidigm представляет REAP-Seq для мультиомного анализа одиночных клеток на C1» . Информационный центр GlobeNewswire (пресс-релиз).
    71. ^ Муджил А., Уилкинсон М.Н., Чен Х., Хе Дж., Каммак А.Дж., Васек М.Дж. и др. (1 февраля 2019 г.). «Самоотчетные транспозоны позволяют одновременно считывать экспрессию генов и связывание факторов транскрипции в отдельных клетках» . биоRxiv . 182 (4): 992–1008.e21. дои : 10.1101/538553 . ПМК   7510185 . ПМИД   32710817 .
    72. ^ Надаль-Рибельс М., Ислам С., Вэй В., Латорре П., Нгуен М., де Надаль Э. и др. (апрель 2019 г.). «Чувствительный высокопроизводительный секвенирование одноклеточной РНК выявляет внутриклональные корреляции транскриптов в популяциях дрожжей» . Природная микробиология . 4 (4): 683–692. дои : 10.1038/s41564-018-0346-9 . ПМК   6433287 . ПМИД   30718850 .
    73. ^ Родригес-Мейра А., Бак Г., Кларк С.А., Повинелли Б.Дж., Алколеа В., Лука Е. и др. (март 2019 г.). «Раскрытие внутриопухолевой гетерогенности посредством высокочувствительного одноклеточного мутационного анализа и параллельного секвенирования РНК» . Молекулярная клетка . 73 (6): 1292–1305.e8. doi : 10.1016/j.molcel.2019.01.009 . ПМК   6436961 . ПМИД   30765193 .
    74. ^ Макгиннис К.С., Паттерсон Д.М., Винклер Дж., Конрад Д.Н., Хейн М.Ю., Шривастава В. и др. (июль 2019 г.). «MULTI-seq: мультиплексирование образцов для секвенирования одноклеточной РНК с использованием индексов, меченных липидами» . Природные методы . 16 (7): 619–626. дои : 10.1038/s41592-019-0433-8 . ПМК   6837808 . ПМИД   31209384 .
    75. ^ Гаубломм Дж.Т., Ли Б., Маккейб С., Кнехт А., Ян Ю., Дрохлянский Е. и др. (июль 2019 г.). «Мультиплексирование ядер с антителами со штрих-кодом для одноядерной геномики» . Природные коммуникации . 10 (1): 2907. Бибкод : 2019NatCo..10.2907G . дои : 10.1038/s41467-019-10756-2 . ПМК   6606589 . ПМИД   31266958 .
    76. ^ «Атлас РНК мыши» . oncoscape.v3.sttrcancer.org .
    77. ^ Ли Х, Чен Л, Чжан Ц, Сунь Ю, Ли Ц, Ян Дж (март 2019 г.). «BRIF-Seq: Секвенирование случайно интегрированных фрагментов, преобразованных в бисульфит, на уровне отдельных клеток» . Молекулярный завод . 12 (3): 438–446. дои : 10.1016/j.molp.2019.01.004 . ПМИД   30639749 .
    78. ^ Родрикес С.Г., Стикельс Р.Р., Гоева А., Мартин К.А., Мюррей Е., Вандербург С.Р. и др. (март 2019 г.). «Slide-seq: масштабируемая технология для измерения полногеномной экспрессии с высоким пространственным разрешением» . Наука . 363 (6434): 1463–1467. Бибкод : 2019Sci...363.1463R . дои : 10.1126/science.aaw1219 . ПМК   6927209 . ПМИД   30923225 .
    79. ^ Кая-Окур Х.С., Ву С.Дж., Кодомо К.А., Пледжер Э.С., Брайсон Т.Д., Хеникофф Дж.Г. и др. (апрель 2019 г.). «CUT&Tag для эффективного эпигеномного профилирования небольших образцов и отдельных клеток» . Природные коммуникации . 10 (1): 1930. Бибкод : 2019NatCo..10.1930K . дои : 10.1038/s41467-019-09982-5 . ПМК   6488672 . ПМИД   31036827 .
    80. ^ Бидди, Брент А. (7 марта 2019 г.). «Одноклеточное картирование происхождения и идентичности с помощью CellTagged» . Протоколы.io . doi : 10.17504/protocols.io.yxifxke .
    81. ^ Сайкиа М., Бёрнем П., Кешавджи С.Х., Ван М.Ф., Хэян М., Морал-Лопес П. и др. (январь 2019 г.). «Одновременное мультиплексное секвенирование ампликонов и профилирование транскриптома в отдельных клетках» . Природные методы . 16 (1): 59–62. дои : 10.1038/s41592-018-0259-9 . ПМК   6378878 . ПМИД   30559431 .
    82. ^ Ройерс К., Маркодимитраки СМ, ​​Ранг Ф.Дж., де Врис СС, Кьяластри А., де Лука К.Л. и др. (июль 2019 г.). «Одновременная количественная оценка контактов белок-ДНК и транскриптомов в отдельных клетках» . Природная биотехнология . 37 (7): 766–772. дои : 10.1038/s41587-019-0150-y . ПМК   6609448 . ПМИД   31209373 .
    83. ^ Картер Б., Ку В.Л., Кан Дж.И., Ху Дж., Перри Дж., Тан К., Чжао К. (август 2019 г.). «Картирование модификаций гистонов в клетках с небольшим количеством клеток и в одиночных клетках с использованием тагментации хроматина под контролем антител (ACT-seq)» . Природные коммуникации . 10 (1): 3747. Бибкод : 2019NatCo..10.3747C . дои : 10.1038/s41467-019-11559-1 . ПМК   6702168 . ПМИД   31431618 .
    84. ^ Рамани В., Дэн Х., Цю Р., Ли С., Дистече С.М., Нобл В.С. и др. (сентябрь 2019 г.). «Sci-Hi-C: одноклеточный метод Hi-C для картирования трехмерной организации генома в большом количестве отдельных клеток» . Методы . 170 : 61–68. дои : 10.1016/j.ymeth.2019.09.012 . ПМЦ   6949367 . ПМИД   31536770 .
    85. ^ Родрикес С.Г., Стикельс Р.Р., Гоева А., Мартин К.А., Мюррей Е., Вандербург С.Р. и др. (март 2019 г.). «Slide-seq: масштабируемая технология для измерения полногеномной экспрессии с высоким пространственным разрешением» . Наука . 363 (6434): 1463–1467. Бибкод : 2019Sci...363.1463R . дои : 10.1126/science.aaw1219 . ПМК   6927209 . ПМИД   30923225 .
    86. ^ Биочанин М., Буес Дж., Дайнезе Р., Амстад Э., Депланке Б. (апрель 2019 г.). «Упрощенный рабочий процесс Drop-seq с минимизацией потерь гранул с использованием микрофлюидного чипа для захвата и обработки гранул» . Лаборатория на чипе . 19 (9): 1610–1620. дои : 10.1039/C9LC00014C . ПМИД   30920557 .
    87. ^ Ку В.Л., Накамура К., Гао В., Цуй К., Ху Г., Тан К. и др. (апрель 2019 г.). «Секвенирование иммунорасщепления одноклеточного хроматина (scChIC-seq) для определения профиля модификации гистонов» . Природные методы . 16 (4): 323–325. дои : 10.1038/s41592-019-0361-7 . ПМЦ   7187538 . ПМИД   30923384 .
    88. ^ Тан Л., Син Д., Дейли Н., Се XS (апрель 2019 г.). «Трехмерные структуры генома отдельных сенсорных нейронов зрительной и обонятельной систем мышей». Структурная и молекулярная биология природы . 26 (4): 297–307. дои : 10.1038/s41594-019-0205-2 . ПМИД   30936528 . S2CID   89616808 .
    89. ^ Ван Ц, Сюн Х, Ай С, Юй Х, Лю Ю, Чжан Дж, Хэ А (октябрь 2019 г.). «CoBATCH для высокопроизводительного эпигеномного профилирования отдельных клеток» . Молекулярная клетка . 76 (1): 206–216.e7. doi : 10.1016/j.molcel.2019.07.015 . ПМИД   31471188 .
    90. ^ Лугинбюль Дж., Куно Т., Накано Р., Чатер Т.Э., Сивараман Д.М., Кишима М. и др. (5 апреля 2019 г.). «Декодирование разнообразия нейронов с помощью Convert-seq для отдельных клеток» . bioRxiv : 600239. doi : 10.1101/600239 .
    91. ^ Jump up to: а б Ларо К.А., Дуарте Ф.М., Чу Дж.Г., Карта В.К., Беркетт З.Д., Колуэй А.С. и др. (август 2019 г.). «Комбинаторное индексирование на основе капель для массовой доступности одноклеточного хроматина» . Природная биотехнология . 37 (8): 916–924. дои : 10.1038/s41587-019-0147-6 . ПМЦ   10299900 . ПМИД   31235917 . S2CID   195329871 .
    92. ^ Мимитоу Э.П., Ченг А., Монтальбано А., Хао С., Стоккиус М., Легут М. и др. (май 2019 г.). «Мультиплексное обнаружение белков, транскриптомов, клонотипов и изменений CRISPR в одиночных клетках» . Природные методы . 16 (5): 409–412. дои : 10.1038/s41592-019-0392-0 . ПМК   6557128 . ПМИД   31011186 .
    93. ^ Чжу С., Гао Ю., Пэн Дж., Тан Ф., И С. (1 января 2019 г.). «Одноклеточное секвенирование 5fC». Одноклеточные методы . Методы молекулярной биологии. Том. 1979. Клифтон, Нью-Джерси, стр. 251–267. дои : 10.1007/978-1-4939-9240-9_16 . ISBN  978-1-4939-9239-3 . ПМИД   31028643 . S2CID   135447312 . {{cite book}}: CS1 maint: отсутствует местоположение издателя ( ссылка )
    94. ^ Рассел А.Б., Эльшина Э., Ковальски-младший, Те Велтуис А.Дж., Блум Дж.Д. (июль 2019 г.). «Одноклеточное вирусное секвенирование инфекций гриппа, вызывающих врожденный иммунитет» . Журнал вирусологии . 93 (14). дои : 10.1128/JVI.00500-19 . ПМК   6600203 . ПМИД   31068418 .
    95. ^ Керен-Шауль Х., Кенигсберг Э., Джайтин Д.А., Дэвид Э., Пол Ф., Танай А., Амит И. (июнь 2019 г.). «MARS-seq2.0: экспериментальный и аналитический конвейер для индексированной сортировки в сочетании с секвенированием одноклеточной РНК». Протоколы природы . 14 (6): 1841–1862. дои : 10.1038/s41596-019-0164-4 . ПМИД   31101904 . S2CID   156055842 .
    96. ^ Ли И., Разаги Р., Гилпатрик Т., Молнар М., Садовски Н., Симпсон Дж.Т. и др. (2 февраля 2019 г.). «Одновременное профилирование доступности и метилирования хроматина на клеточных линиях человека с помощью секвенирования нанопор» . bioRxiv : 504993. doi : 10.1101/504993 .
    97. ^ Ван Ю, Ван А, Лю З, Турман А.Л., Пауэрс Л.С., Цзоу М. и др. (август 2019 г.). «Одномолекулярное длинное секвенирование раскрывает хроматиновую основу экспрессии генов» . Геномные исследования . 29 (8): 1329–1342. дои : 10.1101/гр.251116.119 . ПМЦ   6673713 . ПМИД   31201211 .
    98. ^ Шипони З., Маринов Г.К., Сваффер М.П., ​​Синотт-Армстронг Н.А., Скотхейм Дж.М., Кундадже А. и др. (22 декабря 2018 г.). «Дальнее одномолекулярное картирование доступности хроматина у эукариот» . биоRxiv . 17 (3): 319–327. дои : 10.1101/504662 . ПМЦ   7968351 . ПМИД   32042188 .
    99. ^ Боерсма С., Хуперкар Д., Верхаген Б.М., Зонневельд С., Гримм Дж.Б., Лавис Л.Д., Таненбаум М.Э. (июль 2019 г.). «Многоцветная визуализация одиночных молекул обнаруживает значительную гетерогенность в декодировании мРНК» . Клетка . 178 (2): 458–472.e19. дои : 10.1016/j.cell.2019.05.001 . ПМК   6630898 . ПМИД   31178119 .
    100. ^ Шпехт Х., Эммотт Э., Коллер Т., Славов Н. (9 июня 2019 г.). «Высокопроизводительная протеомика одиночных клеток позволяет количественно оценить появление гетерогенности макрофагов» . bioRxiv : 665307. doi : 10.1101/665307 .
    101. ^ Цао Дж., Чжоу В., Стимерс Ф., Трапнелл С., Шендюр Дж. (11 июня 2019 г.). «Характеристика временной динамики экспрессии генов в одиночных клетках с научной судьбой» . bioRxiv : 666081. doi : 10.1101/666081 .
    102. ^ Альтемос Н., Маслан А., Лай А., Уайт Дж.А., Стритс А.М. (18 июля 2019 г.). «μDamID: микрофлюидный подход для визуализации и секвенирования взаимодействий белок-ДНК в отдельных клетках» . bioRxiv : 706903. doi : 10.1101/706903 .
    103. ^ Ли Г, Лю Ю, Чжан Ю, Кубо Н, Ю М, Фанг Р и др. (октябрь 2019 г.). «Совместное профилирование метилирования ДНК и архитектуры хроматина в отдельных клетках» . Природные методы . 16 (10): 991–993. дои : 10.1038/s41592-019-0502-z . ПМК   6765429 . ПМИД   31384045 .
    104. ^ Сингх М., Аль-Эриани Г., Карсвелл С., Фергюсон Дж. М., Блэкберн Дж., Бартон К. и др. (июль 2019 г.). «Высокопроизводительное целевое секвенирование отдельных клеток с длинным считыванием раскрывает клональный и транскрипционный ландшафт лимфоцитов» . Природные коммуникации . 10 (1): 3120. Бибкод : 2019NatCo..10.3120S . дои : 10.1038/s41467-019-11049-4 . ПМЦ   6635368 . ПМИД   31311926 .
    105. ^ Чжу С., Ю М., Хуан Х., Джурик И., Абнуси А., Ху Р. и др. (ноябрь 2019 г.). «Сверхвысокопроизводительный метод одноклеточного совместного анализа открытого хроматина и транскриптома» . Структурная и молекулярная биология природы . 26 (11): 1063–1070. дои : 10.1038/s41594-019-0323-x . ПМК   7231560 . ПМИД   31695190 .
    106. ^ Коул С., Бирн А., Боден А.Е., Форсберг ЕС, Фоллмерс С. (июнь 2018 г.). «Tn5Prime, метод 5'-захвата на основе Tn5 для секвенирования одноклеточной РНК» . Исследования нуклеиновых кислот . 46 (10): е62. дои : 10.1093/nar/gky182 . ПМК   6007450 . ПМИД   29548006 .
    107. ^ Шон М.А., Келлнер М.Дж., Плотникова А., Хофманн Ф., Нодин, доктор медицинских наук (декабрь 2018 г.). «NanoPARE: параллельный анализ 5'-концов РНК от РНК с низким входом» . Геномные исследования . 28 (12): 1931–1942. дои : 10.1101/гр.239202.118 . ПМК   6280765 . ПМИД   30355603 .
    108. ^ Узбас Ф., Опперер Ф., Зонмезер С., Шапошников Д., Сасс С., Крендл С. и др. (август 2019 г.). «BART-Seq: экономичное массово распараллеленное целевое секвенирование для геномики, транскриптомики и анализа отдельных клеток» . Геномная биология . 20 (1): 155. дои : 10.1186/s13059-019-1748-6 . ПМК   6683345 . ПМИД   31387612 .
    109. ^ Ройерс К., Маркодимитраки СМ, ​​Ранг Ф.Дж., де Врис СС, Кьяластри А., де Лука К.Л. и др. (июль 2019 г.). «Одновременная количественная оценка контактов белок-ДНК и транскриптомов в отдельных клетках» . Природная биотехнология . 37 (7): 766–772. дои : 10.1038/s41587-019-0150-y . ПМК   6609448 . ПМИД   31209373 .
    110. ^ Ай С, Сюн Х, Ли CC, Луо Ю, Ши Ц, Лю Ю и др. (сентябрь 2019 г.). «Профилирование состояний хроматина с использованием одноклеточного itChIP-seq». Природная клеточная биология . 21 (9): 1164–1172. дои : 10.1038/s41556-019-0383-5 . ПМИД   31481796 . S2CID   201815293 .
    111. ^ Чен С., Лейк Б.Б., Чжан К. (декабрь 2019 г.). «Высокопроизводительное секвенирование транскриптома и доступности хроматина в одной клетке» . Природная биотехнология . 37 (12): 1452–1457. дои : 10.1038/s41587-019-0290-0 . ПМК   6893138 . ПМИД   31611697 .
    112. ^ Xing QR, Farran CE, Yi Y, Warrier T, Gautam P, Collins JJ и др. (4 ноября 2019 г.). «Параллельное бимодальное секвенирование отдельных клеток доступности транскриптома и хроматина» . биоRxiv . 30 (7): 1027–1039. дои : 10.1101/829960 . ПМЦ   7397874 . ПМИД   32699019 .
    113. ^ Шриватсан С.Р., Макфалин-Фигероа Дж.Л., Рамани В., Сондерс Л., Као Дж., Пакер Дж. и др. (декабрь 2019 г.). «Массовое мультиплексирование химической транскриптомики с разрешением одной клетки» . Наука . 367 (6473): 45–51. doi : 10.1126/science.aax6234 . ПМК   7289078 . ПМИД   31806696 .
    114. ^ МакФарланд Дж.М., Паолелла Б.Р., Уоррен А., Гейгер-Шуллер К., Шибу Т., Ротберг М. и др. (8 декабря 2019 г.). «Мультиплексное профилирование отдельных клеток транскрипционных ответов после возмущения для определения уязвимостей рака и терапевтического механизма действия» . bioRxiv : 868752. doi : 10.1101/868752 .
    115. ^ Кучина А., Бреттнер Л.М., Палеологу Л., Роко С.М., Розенберг А.Б., Кариньяно А. и др. (11 декабря 2019 г.). «Секвенирование микробной одноклеточной РНК методом штрих-кодирования с разделенным пулом» . bioRxiv : 869248. doi : 10.1101/869248 .
    116. ^ Лю Ю, Не Х, Лю Х, Лу Ф (ноябрь 2019 г.). «Секвенирование изоформ РНК, содержащее поли(А) (PAIso-seq), выявляет широко распространенные неаденозиновые остатки в хвостах поли(А) РНК» . Природные коммуникации . 10 (1): 5292. Бибкод : 2019NatCo..10.5292L . дои : 10.1038/s41467-019-13228-9 . ПМК   6876564 . ПМИД   31757970 .
    117. ^ Амамото Р., Зуккаро Э., Карри Н.К., Хурана С., Чен Х.Х., Чепко С.Л., Арлотта П. (ноябрь 2019 г.). «FIN-Seq: транскрипционное профилирование определенных типов клеток из замороженных архивных тканей центральной нервной системы человека» . Исследования нуклеиновых кислот . 48 (1): e4. дои : 10.1093/nar/gkz968 . ПМЦ   7145626 . ПМИД   31728515 .
    118. ^ Сетлифф И., Шиаколас А.Р., Пилевски К.А., Мурджи А.А., Мапенго Р.Э., Яновска К. и др. (декабрь 2019 г.). «Высокопроизводительное картирование последовательностей рецепторов B-клеток со специфичностью антигена» . Клетка . 179 (7): 1636–1646.e15. дои : 10.1016/j.cell.2019.11.003 . ПМК   7158953 . ПМИД   31787378 .
    119. ^ Датлингер П., Рендейру А.Ф., Боенке Т., Краусгрубер Т., Баррека Д., Бок К. (18 декабря 2019 г.). «Сверхвысокопроизводительное секвенирование одноклеточной РНК путем комбинаторного жидкостного индексирования» . bioRxiv : 2019.12.17.879304. дои : 10.1101/2019.12.17.879304 .
    120. ^ Деркс, Джейсон; Ледюк, Эндрю; Вальманн, Георг; Хаффман, Р. Грей; Уиллетс, Мэтью; Хан, Саад; Шпехт, Харрисон; Ральсер, Маркус; Демичев Вадим; Славов, Николай (14 июля 2022 г.). «Увеличение производительности чувствительной протеомики с помощью plexDIA» . Природная биотехнология . 41 (1): 50–59. дои : 10.1038/s41587-022-01389-w . ISSN   1546-1696 . ПМЦ   9839897 . ПМИД   35835881 .
    121. ^ Карлссон, Филип; Каллас, Томаш; Тиагараджан, Дивья; Карлссон, Макс; Швейцер, Мод; Фернандес Наварро, Хосе; Лейонанкер, Луиза; Джини, Сильвен; Петтерссон, Эрик; Ромберг-Кауэрт, Ян; Гонсалес Гранильо, Марсела; Бунц, Джессика; Дальберг, Йохан; Симонетти, Микеле; Сате, Праджакта; Бродин, Петтер; Мартинес Баррио, Альваро; Фредрикссон, Саймон (8 июня 2023 г.). «Молекулярная пикселизация: пространственная протеомика отдельных клеток путем секвенирования». биоRxiv . дои : 10.1101/2023.06.05.543770 . S2CID   259127075 .
    Retrieved from "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=List_of_single_cell_omics_methods&oldid=1224025864"
    Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
    Arc.Ask3.Ru
    Номер скриншота №: b11b317c51aeb1b2b4bda7ff93952ff9__1715793780
    URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/b1/f9/b11b317c51aeb1b2b4bda7ff93952ff9.html
    Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
    List of single cell omics methods - Wikipedia
    Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)