Acidithrix Ferrooxidans

Acidithrix Ferrooxidans
Научная классификация
Домен:	Бактерии
Филум:	Actinomycetota
Сорт:	Acidimicrobiia
Заказ:	Acidimicrobiales
Семья:	неопределенность
Род:	"Acidithrix" ; Кей и соавт. 2013
Разновидность:	А. Ферроиданы
Биномиальное название
	Acidithrix Ferrooxidans ; Кей и соавт. 2013
Тип напряжения
	DSM 28176 ; JCM 19728 ; Py-F3

Acidithrix Ferrooxidans ( A. ferrooxidans ) представляют собой гетеротрофическую , ацидофильную и грамположительную бактерию из рода Acidithrix . Тип штамм этого вида, A. ferrooxidans Py-F3, был выделен из кислого потока, истощающего из медного рудника в Уэльсе . ^{[ 1 ]}^{[ 3 ]}^{[ 4 ]} Этот вид растет в различных кислых средах, таких как потоки, шахты или геотермальные участки. ^{[ 1 ]} Шахтные озера с ростом роста с редокклинатом с железом железа в качестве донора электронов. ^{[ 1 ]}^{[ 5 ]} « A. ferrooxidans » быстро растет в макроскопическом стримере, вызывая большую плотность клеток, чем другие микробы, образующие стример. ^{[ 6 ]} Было предложено использование в биореакторах для исправления отходов шахты из -за плотности клеток и быстрого окисления окисления железа в кистном дренаже шахты. ^{[ 6 ]} Производство экзополисахаридов во время метаболизма субстрата металлов, такого как окисление железа, помогает предотвратить инкрустацию клеток минералами. ^{[ 5 ]}

Изоляты/секвенирование

Isolate Py-F3

Тип штамм Py-F3 был выделен из кислых, богатых металлом вод шахты в Северном Уэльсе. ^{[ 5 ]} PY-3 может выращивать различные метаболизмы для потенциальных субстратов роста, ^{[ 4 ]} и может расти в диапазоне температур от 10 до 30 ° C и рН от 1,5–4,4. ^{[ 4 ]} Штамм Py-F3 кодирует несколько ферментов для углеродной фиксации, включая Rubisco, но его активность углеродной фиксации не была изучена. ^{[ 4 ]} Гены, кодирующие белки для метаболических путей, использующих серы, азот и железо, были обнаружены в геноме. ^{[ 4 ]} Источником серы является сульфат, и он может использовать аминокислоты в качестве источника азота. Это уникальное требование изолята PY-F3, оставляя его неспособностью расти в среде, если не добавляются сложные субстраты. ^{[ 4 ]} Для рН -гомеостаза гены уреазы могут помочь выживанию из -за кодирования протонной насосной активности. ^{[ 4 ]} Поглощение мочевины задокументировано в PY-F3 и позволяет внутриклеточно производству мочевины, а не вносит ее в клетку. ^{[ 4 ]} Пептидогликан этого организма содержит мезо - диаминопимелевую кислоту , с основными цепями жирной кислоты и дыхательным хиноном. ^{[ 4 ]}

Изолят C25

Изолят C25 был извлечен из формирования железа в частиц в зоне экзаничинного листа, богатой пелагическим железом, в рамках озера шахты. ^{[ 5 ]} Этот изолят может как окислять Fe (II), так и уменьшать Fe (III) в микроотабельных условиях и было предположительно способствовать образованию твердых частиц в пелагической среде. ^{[ 5 ]} Рост не произошел при pH ниже, чем у PY-F3 (pH) 2, в то время как C25 обладал более высокой толерантностью к рН. ^{[ 5 ]} Наблюдение о том, что C25 может как окислять, так и уменьшение железа, дает представление о том, как микробы цикличны как железо, так и органический углерод в кислых условиях. ^{[ 5 ]} Быстрая скорость окисления железа приводит к регенерации железа железа в окружающей среде при pH всего 1,5. ^{[ 7 ]}^{[ 6 ]} По сравнению с PY-F3 C25 не кодировал для рибулозы, но будущие исследования должны быть проведены для окончательного ответа. ^{[ 5 ]}

Применение к биоремедиации

Штаммы растут с использованием метаболизма железа на триптическом соевом бульоне/агаре (TSA/TSB) при низком pH, где бактериальные колонии образуются с осадками железа. ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]} Лабораторные условия 25 ° C аэробно позволили окисление железа происходить в стерилизованной среде озера. ^{[ 5 ]} Исследователи признали потенциал использования « A. ferrooxidans » для биореактора посредством роста/приверженности на твердых поверхностях. ^{[ 6 ]} Железные шахты делают превосходное состояние растущего и аналогию для биореактора из -за подобных поверхностей. ^{[ 6 ]} Использование бактерий может способствовать удалению растворимого железа из железистой воды, а продукция железа (III) способствует растворению сульфидных минералов. ^{[ 6 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} ^и Джонс, RM; Джонсон, DB (2014). « Acidithrix Ferrooxidans Gen. Nov., Sp. Nov.; Нитевидной и обязательно гетеротрофной, ацидофильный член актинобактерий , который катализирует диссимилирующую оксидо-восстановление железа» . Исследования в области микробиологии . 166 (2): 111–20. doi : 10.1016/j.resmic.2015.01.003 . PMID 25638020 .
^ Euzéby JP, parte ac. " Acidithrix Ferrooxidans " . Список прокариотических имен с стоянием в номенклатуре (LPSN) . Получено 10 мая 2022 года .
^ Паркер, Чарльз Томас; Гаррити, Джордж М. (2015). Паркер, Чарльз Томас; Гаррити, Джордж М (ред.). «НОМЕНКЛАТУРА Аннотация для Acidithrix Ferrooxidans Jones and Johnson 2015». Название Afforlife Abstracts . doi : 10.1601/nm.27541 (неактивный 2024-04-17). {{cite journal}}: CS1 Maint: doi неактивен с апреля 2024 года ( ссылка )
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} ^и ^фон ^глин ^час ^я Эйзен, Себастьян; Poehlein, Anja; Джонсон, Д. Барри; Даниэль, Рольф; Шлёманн, Майкл; Мюлинг, Мартин (30 апреля 2015 г.). «Последовательность генома ацидофильного железо-окисляющего изолята изолята -ацитиррооксиданов Py-F3, предлагаемый штамм типа нового актинобактериального рода Acidithrix » . Объявления генома . 3 (2): E00382-15. doi : 10.1128/genomea.00382-15 . PMC 4417699 . PMID 25931603 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} ^и ^фон ^глин ^час ^я ^Дж Джиро Ф. Мори; Доставка Лу; Мэтью Хандель; Kai Uwe Totsche; Томас Р. Нейу; Vasilile Vlad Iancu; Николар Тарчеа; Юрген Попп; Кристиан Кюсель (2016-01-01). «Образование Schwrtmannite в клеточных соединениях с помощью новой поданной формируемой Fe (II)-оксидизирующего изолята, аффилированного с новым родом Aciditthrix » Микробиология 162 (1): 62–7 Doi : 10.1099/ mic.0.0 ISSN 1350-0 26506965PMID
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} ^и ^фон ^глин Джонс, Роуз М.; Джонсон, Д. Барри (2016-07-15). «Железная кинетика и эволюция микробных популяций в низко-г-м, железо-окисляющих биореакторов» . Экологическая наука и технология . 50 (15): 8239–8245. Bibcode : 2016enst ... 50.8239j . doi : 10.1021/acs.est.6b02141 . ISSN 0013-936X . PMID 27377871 .
^ Ху, Данью; Ча, Гухонг; Гао, Бейл (2018). «Филогеномный и молекулярный анализ на основе класса Acidimicrobiia » . Границы в микробиологии . 9 : 987. DOI : 10.3389/fmicb.2018.00987 . ISSN 1664-302X . PMC 5962788 . PMID 29867887 .

[:0-1] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} ^и Джонс, RM; Джонсон, DB (2014). « Acidithrix Ferrooxidans Gen. Nov., Sp. Nov.; Нитевидной и обязательно гетеротрофной, ацидофильный член актинобактерий , который катализирует диссимилирующую оксидо-восстановление железа» . Исследования в области микробиологии . 166 (2): 111–20. doi : 10.1016/j.resmic.2015.01.003 . PMID 25638020 .

[LPSN-2] Euzéby JP, parte ac. " Acidithrix Ferrooxidans " . Список прокариотических имен с стоянием в номенклатуре (LPSN) . Получено 10 мая 2022 года .

[3] Паркер, Чарльз Томас; Гаррити, Джордж М. (2015). Паркер, Чарльз Томас; Гаррити, Джордж М (ред.). «НОМЕНКЛАТУРА Аннотация для Acidithrix Ferrooxidans Jones and Johnson 2015». Название Afforlife Abstracts . doi : 10.1601/nm.27541 (неактивный 2024-04-17). {{cite journal}}: CS1 Maint: doi неактивен с апреля 2024 года ( ссылка )

[:1-4] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} ^и ^фон ^глин ^час ^я Эйзен, Себастьян; Poehlein, Anja; Джонсон, Д. Барри; Даниэль, Рольф; Шлёманн, Майкл; Мюлинг, Мартин (30 апреля 2015 г.). «Последовательность генома ацидофильного железо-окисляющего изолята изолята -ацитиррооксиданов Py-F3, предлагаемый штамм типа нового актинобактериального рода Acidithrix » . Объявления генома . 3 (2): E00382-15. doi : 10.1128/genomea.00382-15 . PMC 4417699 . PMID 25931603 .

[:2-5] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} ^и ^фон ^глин ^час ^я ^Дж Джиро Ф. Мори; Доставка Лу; Мэтью Хандель; Kai Uwe Totsche; Томас Р. Нейу; Vasilile Vlad Iancu; Николар Тарчеа; Юрген Попп; Кристиан Кюсель (2016-01-01). «Образование Schwrtmannite в клеточных соединениях с помощью новой поданной формируемой Fe (II)-оксидизирующего изолята, аффилированного с новым родом Aciditthrix » Микробиология 162 (1): 62–7 Doi : 10.1099/ mic.0.0 ISSN 1350-0 26506965PMID

[:3-6] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} ^и ^фон ^глин Джонс, Роуз М.; Джонсон, Д. Барри (2016-07-15). «Железная кинетика и эволюция микробных популяций в низко-г-м, железо-окисляющих биореакторов» . Экологическая наука и технология . 50 (15): 8239–8245. Bibcode : 2016enst ... 50.8239j . doi : 10.1021/acs.est.6b02141 . ISSN 0013-936X . PMID 27377871 .

[7] Ху, Данью; Ча, Гухонг; Гао, Бейл (2018). «Филогеномный и молекулярный анализ на основе класса Acidimicrobiia » . Границы в микробиологии . 9 : 987. DOI : 10.3389/fmicb.2018.00987 . ISSN 1664-302X . PMC 5962788 . PMID 29867887 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]