Jump to content

Ортороовирус плавательный бассейн

Ортороовирус плавательный бассейн
Анализ PRV-1 с использованием просвечивающей электронной микроскопии (масштабная стержня 100 нм).
Классификация вирусов Измените эту классификацию
(не вмешательство): Вирус
Область : Рибовирия
Королевство: Orthornavirae
Филум: Дублировать
Сорт: Reventoviricetes
Заказ: Reovirals
Семья: Sedoreoviridae
Род: Ортооровирус
Разновидность:
Ортороовирус плавательный бассейн

Писциновый ортооровирус ( PRV ) - это вид рода ортореовируса , который заражает исключительно рыбу, PRV был впервые обнаружен в 2010 году у фермерского атлантического лосося, демонстрирующего воспаление сердца и скелетных мышц (HSMI) и обнаружено, что при более высокой концентрации у рыб с различными рассеяниями. [ 1 ] Эти заболевания включают HSMI, синдром дженендиции, пролиферативный синдром затемнения и синдром включения эритроцитарного тела. [ 1 ] [ 2 ] [ 3 ] [ 4 ] Считается, что PRV в основном влияет на аквакультурированные и марикультурные запасы рыб, и недавние исследования были сосредоточены на восприимчивости дикого запаса. Однако, является ли PRV вирулентным по отношению к HSMI, остается темой дебатов. [ 5 ] PRV был в глазах общественности в основном из -за потенциальной связи с фермерским атлантическим лосося, демонстрирующим HSMI. [ 1 ] Общественное беспокойство было выявлено в отношении возможности того, что фермы с открытым океаном, передаваемые PRV в популяции диких лосося и являются фактором в снижении населения. [ 6 ] PRV не был подтвержден как патогенный в запасах дикого лосося.

Классификация

[ редактировать ]

Филогенетический анализ каждого сегмента генома PRV первоначально размещал PRV в семействе Reoviridae , подсемейство Spinareovirinae , на основе последовательности и структурного сходства с известными реовирусами . [ 1 ] родов После обнаружения анализ филогенетических последовательностей показал, что PRV был в равной степени связан с вирусами в ортороовирусе и акваревирусе . [ 1 ] В результате было высказано предположение, что PRV развивался отдельно от общего предка, связанного как с ортороовирусом , так и с акваревирусом в подсемействе Spinareovirinae .

В настоящее время PRV официально классифицируется как ортооровирус. [ 7 ] Размещение в род ортореовируса утверждается по следующим причинам:

  • Более высокая точность последовательности в гомологичных последовательностях [ 8 ]
  • Те же числа сегментов, 10, по сравнению с 11 в акваревирусе .
  • Недостаток малого трансмембранного белка, связанного с фузогеном, белок, который почти универсален в акваревирусе . [ 9 ] Это также означает, что ортореовирусы не вызывают образования синциты среди инфицированных клеток.
  • Наличие белка прикрепления вируса волокна [ 10 ]
  • Процент нуклеозида GC 47%, который попадает в диапазон ортореовирусов (44-48%), а не в диапазон акваревирусов (52-60%). [ 10 ]

Противоположные аргументы в пользу размещения в ортооровирусе ,

  • Единственным другим нефузогенным вирусом ортореовирусов является ортооровирус млекопитающих (MRV), только с хозяевами млекопитающих.
  • Многие акваревирусы заражают рыбу, в то время как PRV является единственным известным ортореовирусом, который заражает рыбу. [ 11 ] [ 12 ]
  • Последовательности S1 и S4 в PRV не имеют известных гомологов ни на один из родов [ 1 ]
  • Почти все ортооровирусы и акваревирусы являются биистроринами для их вирусного прикрепления белка, а PRV - моноцистроронность. [ 13 ] [ 10 ]
  • PRV демонстрирует 5 'терминальных последовательностей на своих сегментах, которые не соответствуют ни одному роду. [ 1 ]
  • Были обнаружены виды акваревируса как нефузогенный, включая GCRV104 и GCRVGD108. [ 14 ]
  • Внешний белок зажима PRV обнаружен на бицистронном сегменте S1, первой из любого известного ортореовируса или акваревируса, чтобы кодировать этот белок в полицистронном сегменте. [ 9 ]

Геном и структура

[ редактировать ]

Писциновый ортореовирус имеет сегментированный геном дцРНК , состоящий из 10 отдельных линейных сегментов, совокупно измеряя около 23 600BP. [ 1 ] [ 10 ] Он имеет содержание GC 47%. Каждый сегмент имеет консервативные терминальные последовательности. 3 'конечная последовательность (UCAUC-3') такая же, как ортореовирус и акваревирус . 5-'конечная последовательность (5'-Gauaaa/u) уникальна для PRV. [ 1 ] [ 11 ] Эти сегменты называются L1-3 (Long), M1-3 (Medium) и S1-4 (короткий), основанный на длине и сравнении с гомологичными сегментами в ортооровирусе и акваревирусе . L1 самый длинный на 3916BP и S4 самый короткий на 1040BP. [ 1 ] [ 10 ] [ 8 ]

Одиннадцать белков подтверждаются как кодируемые. [ 10 ] S1 демонстрирует бицистроничность с 2 перекрывающимися открытыми рамами считывания, в то время как оставшиеся белки либо подтверждаются как моноцистроронные, либо считались биистроринами без каких -либо дополнительных доказательств. [ 8 ] [ 9 ] [ 10 ] Белки, которые кодирует каждый сегмент, следующие, используя стандартизированную систему именования в родах реовируса: [ 10 ] [ 13 ]

  • L1 -λ3 - оболочный белок (внутренний капсидный белок)
  • L2 -λ2 - башня белка, гуанилтрансфераза и метилтранфераза, экструзия генома. [ 10 ]
  • L3 -λ1 - RDRP
  • M1 -мк2 - NTPASE
  • М2 -мниее - внешний капсидный белок
  • M3 -мкнс - неизвестная функция, предоставленная для помощи в образовании вирусной фабрики. [ 15 ]
  • S1 -σ3 - белок внешнего зажима (капсидный белок) и P13 - цитотоксический неструктурный белок [ 16 ]
  • S2 -σ2 - белок зажима основного зажима
  • S3 -σns - неизвестная функция, Неструктурная.
  • S4 -σ1 - белок привязанности вируса [ 10 ]

Подразделения

[ редактировать ]
Дендограмма сегментных последовательностей сегмента M2 для различных генотипов PRV и субгенотипов.

Ортоовирус Piscine был сгруппирован в множество различных генотипов на основе разнообразия последовательностей. Хотя было предложено несколько способов подразделения PRV, [ 3 ] Система чаще всего используется в литературных подразделениях PRV в генотипы I и II, которые дополнительно разделены на IA и IB, и IIA и IIB, соответственно. [ 17 ] [ 2 ] [ 18 ] [ 19 ] Эти подразделения и подразделения основаны на разнообразии последовательностей в сегменте S1. [ 18 ] [ 8 ]

Генотип I (PRV-1) [ 8 ]

[ редактировать ]

Этот субнотип PRV встречается в основном в фермерском атлантическом лососе в Норвегии, Чили и Канаде. Это было связано с популяциями, демонстрирующими HSMI. Он был обнаружен в сельскохозяйственном лососе Чинук в Канаде с синдромом желтухи, а также на сельскохозяйственной радужной форели и кохо, демонстрирующих симптомы HSMI в Чили и Канаде. [ 20 ]

Одинокий
[ редактировать ]

Этот субнотип PRV обнаружен в основном в фермерских атлантических и кохо -лосось в Норвегии и Чили, дополнительно обнаруживается в сельскохозяйственной радужной форели в Чили. [ 4 ] Он присутствовал во многих лососе с HSMI. Это также было обнаружено в популяциях Coho, демонстрирующих синдром дженендии.

Генотип II был впервые обнаружен при сравнении последовательностей S1 среди фермерских атлантических лосося в Чили, а также с помощью анализа M2 и целого генома. [ 21 ] [ 17 ] Несмотря на то, что они находятся в пределах одного генотипа, субнотипы IIA и IIB демонстрируют гораздо более высокое меж последовательность, чем IA и IB.

PRV-3 был связан с патологическими поражениями сердца в радужной форели. [ 22 ] [ 17 ] Он также был найден в лососе, коричневой форели и радужной форели, демонстрирующих HSMI по всей северной Европе и Чили. [ 19 ] Это также было обнаружено в дикой коричневой форели с синдромом пролиферативного затемнения в Центральной Европе. [ 16 ] Сравнение с PRV-2 показывает сходство 80,1% и 90,5% для нуклеотидов и аминокислот соответственно. [ 23 ] Сравнение с PRV-1 показало 72,9% сходство в нуклеотидной последовательности и 80,0% сходства аминокислот.

PVR-2 был обнаружен только в фермерском лососе в Японии, демонстрирующем синдром тела эритроцитарного включения (EIBS). [ 2 ] До сих пор только один геном PRV-2 был секвенирован, что снижает уверенность в филогенетических размещениях. [ 9 ] Сравнение с PRV-1 показало сходство 73,4% и 80,3% в нуклеотидной последовательности и аминокислотной последовательности соответственно. [ 23 ]

Структура

[ редактировать ]
Электрограмма изображение PRV с меченными белками иммуноглолда в черных стрелках. Слева: белок вирусного прикрепления (σ1) на внешнем капсиде. Справа: белок внешнего зажима (σ3) на внешнем капсиде.

Как член рода ортооровируса , вирионная форма PRV представляет собой неразвитый икосаэдрический капсид с двумя слоями, внешним и ядром. Диаметр общего вириона, охватывающего внешний слой, составляет приблизительно 70 нм, при этом внутренний сердечный слой составляет около 39 нм в диаметре. [ 24 ]

Внутренний слой состоит из белка оболочки, λ3, а также белка внутреннего зажима σ2, который, как считается, играет роль в структурной стабилизации икосаэдрона. [ 25 ] Считается, что внешний слой играет стабилизирующую роль для внутреннего капсида и состоит из μ1 (внешний капсидный белок), а также σ3 (белок внешнего зажима). Кроме того, внешний слой имеет волокнистые белки (σ1), которые опосредуют вирусное прикрепление и попадают в хозяин.

PRV представляет собой башенную реовирус, демонстрирующий белок башни (λ2) на пятикратных осях его внутреннего капсидного икосаэдрона. [ 10 ] [ 26 ] Гомологичные белки для L2 в MRV и ARV обладают активностью гуанилтрансферазы и метилтрансферазы. Хотя это и не полностью консервативно, активные области (λ2) демонстрируют верность для последовательностей MRV и ARV, предполагая, что λ2 является белком башни, и он играет аналогичную роль в 5 -дюймовом покрытии транскрибированной вирусной мРНК.

Открытие

[ редактировать ]

PRV был впервые идентифицирован в 2010 году с помощью подходов с высокой пропускной способностью секвенирования ДНК и биоинформатики, которые определяли, что вирус присутствовал в марикультурном атлантическом лососе, затронутом воспалением сердца и скелетных мышц (HSMI), и, хотя было рекомендовано контроль PRV, причинно -следственная связь между между PRV и HSMI не были продемонстрированы в то время. [ 1 ]

В 2012 году несколько видов диких рыб у побережья Норвегии дали положительный результат на PRV, что указывает на то, что PRV присутствует в диких популяциях, однако большинство испытаний образцов дали отрицательные результаты, указывающие на низкую распространенность PRV у норвежского побережья. [ 27 ]

Были показаны предположение, что PRV 1A был представлен на западном побережье Северной Америки из северного атлантического источника. PRV 1A был введен в Чили из северной части Тихого океана и северной атлантической источников. [ 21 ]

Распределение

[ редактировать ]
Горная форель, которая проверяла положительный результат на PRV в озере Культус, Британская Колумбия, Канада.

Было обнаружено, что PRV имеет почти во всем мире с различными исследованиями, обнаруживающими присутствие PRV в рыболовстве в Атлантике у побережья Великобритании, Ирландии и Норвегии, а также на Атлантическом и Тихоокеанском побережье у севера и юга Америка. PRV был обнаружен у тихоокеанских видов и диких рыб на севере до Аляски, и на юге, как Чили. [ 8 ] [ 21 ] [ 28 ]

PRV-1 встречается реже в диком лососе, чем в фермерском лососе, и хотя дикая морская форель имеет тенденцию проявлять инфекцию PRV-3, то же самое нельзя сказать для популяций дикого атлантического лосося. [ 21 ]

Взаимодействие с хозяином

[ редактировать ]

Динамика инфекции

[ редактировать ]

Кинетика инфекции PRV была идентифицирована в трех отдельных этапах:

  1. Раннее вход хоста, начальная репликация без распознавания хозяина и системное распространение вируса происходит в клетках крови.
    • Этот этап определяет общий курс и общую тяжесть инфекции на ранней фазе репликации MRV. [ 21 ] Чтобы инициировать инфекцию, все три генотипа PRV нацелены на эритроциты хозяина. Однако вирусные включения в эритроциты и системное распознавание вируса клетками -хозяева не было обнаружено, что в течение этого периода не наблюдается, что демонстрирует, что вирус проливается в окружающую среду с низкой степенью и что в репликации есть возможное отставание или Первоначально происходит инфекция различных типов клеток. [ 29 ]
  2. Пиковая системная репликация, нагрузка, зависящее от распознавания хозяина и образование цитоплазматического вирусного включения [ 30 ] затем происходит.
    • На этом этапе системные крови РНК PRV встречаются на самом высоком уровне. [ 31 ] Значительное избавление вируса также происходит на этом этапе, что показано предыдущими проблемами сожительства. [ 32 ] Обеспечивалось, что образованные цитоплазматические вирусные включения, характерные для ортооровирусного рода, аналогичны тем, которые развиваются во время реовирусной инфекции млекопитающих распространенных клеточных линий. [ 29 ]
  3. Происходит долгосрочная персистенция с высокой нагрузкой с ограниченной репликацией, с потенциалом незначительного воспаления сердца.
    • Продолжительность этой стойкости варьируется в зависимости от генотипа хозяина и/или PRV. Прямое не происходит системного распознавания PRV, и вирусные включения в эритроциты исчезают. Умеренное количество инфекционного PRV все еще присутствует в цитоплазме инфицированных эритроцитов на этой поздней инфекционной стадии, однако он находится в уменьшенном или нерепликативном состоянии. Выделение вируса минимально и может полностью остановиться со временем. [ 29 ] [ 21 ] [ 32 ]
    • Воспаление сердца может происходить на ранних этапах этой фазы сразу после пиковой вирусной нагрузки или во время пика инфекции. В зависимости от многих факторов, это воспаление может продолжаться в течение нескольких месяцев, но может исчезнуть, даже если инфекции PRV все еще остаются. [ 21 ]

Есть осложнения при определении возможных результатов инфекции PRV. Было показано, что каждый генотип приводит к заболеванию кровообращения; Тем не менее, инфекции PRV с высокой нагрузкой также произошли в необработанных лосося и форели. [ 21 ]

Гистопатологический анализ PRV (красный) в норвежской ферме Атлантического лосося ткани сердца (синий): а) лосось, демонстрирующий воспаление сердца и скелетных мышц (HSMI) C) здоровый лосось.

В то время как норвежские штаммы PRV привели к вспышкам HSMI, неясно, развивается ли HSMI в результате инфекции североамериканскими штаммами PRV в качестве различных лосося и форели имеет обнаруживаемые инфекции PRV, несмотря на явное отсутствие HSMI. [ 24 ] [ 33 ]

Исследования в Норвегии показали, что инъекция ткани из рыбы, демонстрирующая HSMI в здоровую рыбу, приводит к HSMI, но эта причинно -следственная связь, по -видимому, сложнее продемонстрировать с помощью вариантов PRV, найденных у западного побережья Канады. [ 34 ] До сих пор только атлантический лосось в Норвегии имел доказанную причинность, в то время как корреляция с заболеванием была обнаружена в других случаях, но причинно -следственная связь еще не доказала. [ 33 ] Дикий лосось из Британской Колумбии, такой как Coho, Chinook и Sockeee, подвержены инфекции PRV и демонстрируют сходные вирусные нагрузки на фермерский атлантический лосось, но не сообщалось, что не наблюдают симптомы HSMI. [ 35 ]

Профилактика заболевания

[ редактировать ]

HSMI является одним из наиболее значительных заболеваний в аквакультуре атлантического лосося в Норвегии. В усилиях по смягчению этого заболевания были предприняты попытки разработать вакцины, которые нацелены на PRV-1 с использованием деактивированных вирусных частиц, и ДНК, которая кодирует белки с последовательностями, полученными из PRV; Ни одно лечение не предотвратило инфекцию PRV, но эффекты HSMI были уменьшены с помощью обоих методов лечения. Различные диетические составы были опробованы в попытках снизить тяжесть HSMI, и были предприняты некоторые усилия, чтобы выбрать для рыб с генетическими вариантами, которые обеспечивают устойчивость. [ 21 ]

Одним из методов профилактики заболеваний может быть дезинфекция поверхности рыбных яиц до введения на ферму, поскольку удаление PRV из ограниченной системы после этого факта требует строгой дезинфекции, предоставление системе оставаться свободным от хозяев и тщательного регулярного тестирования. [ 21 ]

Распространенность в аквакультуре

[ редактировать ]

Было обнаружено, что PRV наиболее распространен в Европе, а в Америке с относительно небольшим количеством сообщений в Азии. Распространенность PRV сильно варьируется в зависимости от региона и видов хозяев. Наблюдение за PRV происходит наиболее значительно в Северной Америке и Норвегии [ 21 ]

Европа:

PRV-1 присутствовал в норвежском атлантическом лососе, фермерском фармишке с 1988 года; В остальной Европе предполагается, что PRV является обычным явлением, но в некоторых странах сообщения остаются ограниченными. Исландия сообщила, что обнаружила высокую распространенность PRV-1 в своем атлантическом лососе. В 2018 году PRV-3 был зарегистрирован на фермах Brown Trout и Rainbow Frout в Дании и Германии. [ 21 ]

Северная Америка:

PRV, по -видимому, демонстрирует высокую инфекционность в Северной Америке, причем одна инфицированная рыба часто приводит к инфекции ферм целых рыб. PRV-1, как правило, изначально обнаруживается после возвращения фермерского лосося от морской воды. Вполне вероятно, что PRV-1 присутствовал в Северной Америке на протяжении десятилетий или, возможно, дольше. [ 21 ]

Южная Америка:

В Чили, фермерский атлантический лосось, показывает высокий уровень инфекции PRV-1, в то время как популяции диких рыб показывают низкие показатели инфекции. Радужная форель показывает высокие показатели инфекции с помощью PRV-1. [ 21 ]

Азия:

В Азии PRV-2 был обнаружен только в Японии, и он был связан с синдромом тела эритроцитарного включения (EIBS) в лососее для фермы. [ 21 ]

Хост диапазон

[ редактировать ]

PRV был обнаружен в ряде аквакультурных/диких видов хозяев, таких как: [ 33 ]

  1. ^ Jump up to: а беременный в дюймовый и фон глин час я Дж k Palacios G, Lovoll M, Tengs T, Hornig M, Hutchison S, Hui J, et al. (Июль 2010). «Сердце и скелетные мышцы воспаление фермерского лосося связано с инфекцией новым реовирусом» . Plos один . 5 (7): E11487. doi : 10.1371/journal.pone.0011487 . PMC   2901333 . PMID   20634888 .
  2. ^ Jump up to: а беременный в Такано Т., Навата А., Сакай Т., Мацуяма Т., Ито Т., Курита Дж. И др. (2016-10-27). «Секвенирование полного генома и подтверждение причинного агента синдрома тела эритроцитарного включения в лосось-кохо идентифицирует новый тип ортоовируса писцины» . Plos один . 11 (10): E0165424. doi : 10.1371/journal.pone.0165424 . PMC   5082797 . PMID   27788206 .
  3. ^ Jump up to: а беременный Garseth Ah, Ekrem T, Biering E (2013-12-11). «Филогенетические доказательства рассеяния на расстоянии и передачи реовируса писцинового (PRV) между фермерским и диким атлантическим лосося» . Plos один . 8 (12): E82202. doi : 10.1371/journal.pone.0082202 . PMC   3859594 . PMID   24349221 .
  4. ^ Jump up to: а беременный Cartagena J, Jiménez C, Spencer E (ноябрь 2020). «Обнаружение писциновых ортооровирусов (PRV-1B и PRV-3A) в фермерском лососе с синдромом джондице из Чили». Аквакультура . 528 : 735480. DOI : 10.1016/j.aquaculture.2020.735480 . ISSN   0044-8486 . S2CID   219465755 .
  5. ^ Zhang Y, Polinski MP, Morrison PR, Brauner CJ, Farrell AP, Garver KA (2019). «Реовирусные инфекции с высокой нагрузкой не подразумевают физиологические нарушения у лосося» . Границы в физиологии . 10 : 114. doi : 10.3389/fphys.2019.00114 . PMC   6425399 . PMID   30930782 .
  6. ^ Noakes DJ, Beamish RJ, Kent ML (март 2000 г.). «При упадке лосося Тихого океана и спекулятивных связях с фермерством лосося в Британской Колумбии». Аквакультура . 183 (3–4): 363–386. doi : 10.1016/s0044-8486 (99) 00294-x . ISSN   0044-8486 .
  7. ^ "ICTV" . talk.ictvonline.org . Получено 2021-03-16 .
  8. ^ Jump up to: а беременный в дюймовый и фон Kibenge MJ, Iwamoto T, Wang Y, Morton A, Godoy MG, Kibenge FS (июль 2013 г.). «Анализ всего генома реовируса писцина (PRV) показывает PRV представляет собой новый род в семейных Reoviridae и его сегменте генома S1 Group его в два отдельных субгенотипа» . Virology Journal . 10 (1): 230. doi : 10.1186/1743-422x-10-230 . PMC   3711887 . PMID   23844948 .
  9. ^ Jump up to: а беременный в дюймовый Key T, Read J, Nibert ML, Duncan R (май 2013). «Ревирус писцина кодирует цитотоксичный, нефузогенный, интегральный мембранный белок и ранее не признанные вирионевые белки с наружным капсидом» . Журнал общей вирусологии . 94 (Pt 5): 1039–1050. doi : 10.1099/vir.0.048637-0 . PMID   23343626 .
  10. ^ Jump up to: а беременный в дюймовый и фон глин час я Дж k Markussen T, Dahle MK, Tengs T, Løvoll M, Finstad øw, Wiik-Nielsen CR, et al. (2013-07-29). «Анализ последовательности генома ортореовируса писцина (PRV), связанный с воспалением сердца и скелетных мышц (HSMI) у атлантического лосося (Salmo Salar)» . Plos один . 8 (7): E70075. doi : 10.1371/journal.pone.0070075 . PMC   3726481 . PMID   23922911 .
  11. ^ Jump up to: а беременный Attoui H, Fang Q, Jafar FM, Cantaloube JF, Biagini P, De Micco P, De Micco X (август 2002 г.). "Общее эволюционное происхождение акваревирусов и ортореовирусов, выявленных при геноктеризации золотого реовируса, реовируса карпа, полосатого окуня и реовируса Golden IDE (род акваревирус (род акваревирус Reoviridae) » . Журнал общей вирусологии 83 (Pt 8): 1941–1 Doi : 10.1099/ 0022-1317-83-8-1  12124458PMID
  12. ^ Дункан Р (август 1999). «Обширная дивергенция последовательности и филогенетические отношения между фузогенными и нефузогенными ортореовирусами: видовое предложение» . Вирусология . 260 (2): 316–28. doi : 10.1006/viro.1999.9832 . PMID   10417266 .
  13. ^ Jump up to: а беременный Ян Х, родитель КН, Гудман Р.П., Тан Дж., Шоу Дж, Ниберт М.Л. и др. (Август 2011 г.). «Вирионная структура реовируса бабуна, фузогенный ортореовирус, которому не хватает адгезионного волокна» . Журнал вирусологии . 85 (15): 7483–95. doi : 10.1128/jvi.00729-11 . PMC   3147939 . PMID   21593159 .
  14. ^ Nibert ML, Duncan R (2013-07-04). «Биоинформатика недавних аква- и ортооровирусных изолятов от рыбы: эволюционная прирост или потеря быстрых и волоконных белков и таксономических последствий» . Plos один . 8 (7): E68607. doi : 10.1371/journal.pone.0068607 . PMC   3701659 . PMID   23861926 .
  15. ^ Haatveit HM, Nyman IB, Markussen T, Wessel Ø, Dahle Mk, Rimstad E (январь 2016 г.). «Неструктурный белок мкн писцинового ортореовируса (PRV) образует вирусные фабричные структуры» . Ветеринарное исследование . 47 (1): 5. doi : 10.1186/s13567-015-0302-0 . PMC   4705589 . PMID   26743679 .
  16. ^ Jump up to: а беременный Kuehn R, Stoeckle BC, Young M, Popp L, Taeubert JE, Pfaffl MW, Geist J (2018-10-22). «Идентификация патогена, связанного с реовирусом, при пролиферативном потемневом синдроме (PDS), зараженной коричневой форелью (Salmo Trutta Fario) с использованием трубопровода обнаружения технологии следующего поколения» . Plos один . 13 (10): E0206164. doi : 10.1371/journal.pone.0206164 . PMC   6197672 . PMID   30346982 .
  17. ^ Jump up to: а беременный в Годой М., Медина Д.А., Суарес Р., Валенсуэла С., Ромеро Дж., Кибенге М. и др. (Январь 2021 г.). «Обширный филогенетический анализ геномных последовательностей ортороовируса писцинового ортоовируса показывает надежность классификации субгенотипов» . Патогены . 10 (1): 41. doi : 10.3390/pathogens10010041 . PMC   7825714 . PMID   33430212 .
  18. ^ Jump up to: а беременный в Doy MG, Kibengee MJ, Wang Y, Suarez R, Leiva C, Vallejos F, Kibengge FS (июнь 2016 г.). «Первое описание клинического представления инфекций ортоороовируса писцинового ортоовируса в лососевой аквакультуре в чили и идентификации второго генотипа (генотип II) PRV » Virology Journal 13 (1): 98. doi : 10.1186/s12985-016-0554- Y PMC   4906990  27296722PMID
  19. ^ Jump up to: а беременный Kibenge FS (февраль 2019 г.). «Новые вирусы в аквакультуре». Текущее мнение о вирусологии . Новые вирусы: внутривидовая передача • Вирусная иммунология. 34 : 97–103. doi : 10.1016/j.coviro.2018.12.008 . PMID   30711892 . S2CID   73415392 .
  20. ^ Di Cicco E, Ferguson HW, Kaukinen KH, Schulze AD, Li S, Tabata A, et al. (2018-10-01). «Тот же штамм писцинового ортореовируса (PRV-1) участвует в разработке различных, но связанных, адреса и тихоокеанского лосося в Британской Колумбии » Грани 3 (1): 599–6 Arxiv : 1805.01530 Doi : 10.1139/Facets- 2018-0 ISSN   2371-1
  21. ^ Jump up to: а беременный в дюймовый и фон глин час я Дж k л м не а Полинский М.П., ​​Вендрамин Н., Куэнка А., Гарвер Ка (ноябрь 2020 г.). «Писциновый ортооровирус: биология и распространение в фермерских и диких рыбах» . Журнал рыбных заболеваний . 43 (11): 1331–1352. doi : 10.1111/jfd.13228 . PMID   32935367 .
  22. ^ Vendramin N, Kanniimuthu D, Olsen AB, Cuenca A, Teige LH, Wesel O, et al. (Февраль 2019 г.). ) "Писциновый оргореовирусный подтип 3 (PRV-3) вызывает воспаление сердца в радужной форели (Ncorhynchus mykiss Ветеринарное исследование 50 (1): 14. : 10.1186 /s13567-019-0632-4 doi  6380033PMC  30777130PMID
  23. ^ Jump up to: а беременный Dhamotharan K, Vendramin N, Markussen T, Wessel Ø, Cuenca A, Nyman IB, et al. (Апрель 2018). «Молекулярная и антигенная характеристика писцинового ортореовируса (PRV) из радужной форели (Oncorhynchus mykiss)» . Вирусы . 10 (4): 170. doi : 10.3390/v10040170 . PMC   5923464 . PMID   29614838 .
  24. ^ Jump up to: а беременный Wessel Ø, Braaen S, Alarcon M, Haatveit H, Roos N, Markussen T, et al. (2017-08-25). «Инфекция очищенным писциновым ортореовирусом демонстрирует причинно -следственную связь с воспалением сердца и скелетных мышц у атлантического лосося» . Plos один . 12 (8): E0183781. doi : 10.1371/journal.pone.0183781 . PMC   5571969 . PMID   28841684 .
  25. ^ Zhou ZH, Zhang H, Jakana J, Lu Xy, Zhang JQ (июнь 2003 г.). «Структура вируса цитоплазматического многополиэдроза при 8 a с помощью электронной кривомикроскопии: структурная основа стабильности капсида и регуляции обработки мРНК» . Структура 11 (6): 651–63. doi : 10.1016/s0969-2126 (03) 00091-1 . PMID   12791254 .
  26. ^ Miyazaki N, Uehara-Icchiki T, Xing L, Bergman L, Higashiura A, Nagagaga A, et al. (Ноябрь 2008 г.). «Структурная эволюция Reoviridae, выявленная Oryzavirus в приобретении второй капсидной оболочки » Журнал вирусологии 82 (22): 11344–5 Doi : 10.1128/ jvi.02375-0 PMC   2573255 PMID   18787002
  27. ^ Wiik-Nielsen CR, Løvoll M, Sandlund N, Faller R, Wiik-Nielsen J, Bang Jensen B (январь 2012 г.). «Первое обнаружение реовируса Piscine (PRV) у видов морских рыб» . Болезни водных организмов . 97 (3): 255–8. doi : 10.3354/dao02425 . HDL : 11250/108999 . PMID   22422096 .
  28. ^ Siah A, Morrison DB, Fringuelli E, Savage P, Richmond Z, Johns R, et al. (2015-11-04). «Реовирус писцина: геномный и молекулярный филогенетический анализ из выращиваемых и диких лососевых, собранных на побережье Канады/США» . Plos один . 10 (11): E0141475. doi : 10.1371/journal.pone.0141475 . PMC   4633109 . PMID   26536673 .
  29. ^ Jump up to: а беременный в Полинский депутат, Марти Г.Д., Сниман Х.Н., Гарвер К.А. (март 2019 г.). «Писциновый ортореовирус демонстрирует высокую инфекционность, но низкую вирулентность в атлантическом лососе в Тихоокеанском регионе» . Научные отчеты . 9 (1): 3297. DOI : 10.1038/S41598-019-40025-7 . PMC   6416343 . PMID   30867461 .
  30. ^ Wessel Ø, Olsen CM, Rimstad E, Dahle Mk (март 2015 г.). «Писциновый ортооровирус (PRV) повторяет в атлантическом лососе (Salmo Salar L.) эритроциты ex vivo» . Ветеринарное исследование . 46 (1): 26. doi : 10.1186/s13567-015-0154-7 . PMC   4350956 . PMID   25888832 .
  31. ^ Haatveit HM, Wessel Ø, Markussen T, Lund M, Thiede B, Nyman IB, et al. (Март 2017). «Вирусная кинетика писциновой ортооровирусной инфекции в атлантических клетках крови лосося» . Вирусы . 9 (3): 49. doi : 10.3390/v9030049 . PMC   5371804 . PMID   28335455 .
  32. ^ Jump up to: а беременный Гарвер К.А., Джонсон С.К., Полински М.П., ​​Брэдшоу Дж.С., Марти Г.Д., Сниман Х.Н. и др. (Январь 2016). «Писциновый ортооровирус из Западной Северной Америки передается атлантическому лосося и лосося в социальных сетях, но не может вызвать воспаление сердца и скелетных мышц» . Plos один . 11 (1): E0146229. doi : 10.1371/journal.pone.0146229 . PMC   4701501 . PMID   26730591 .
  33. ^ Jump up to: а беременный в Правительство Канады, рыболовство и океаны, Канада (2018-04-03). «Писциновый ортооровирус (PRV) и воспаление сердца и скелетных мышц (HSMI)» . www.dfo-mpo.gc.ca . Получено 2021-03-13 .
  34. ^ Гарвер, Кайл А.; Джонсон, Стюарт С.; Полинский, Марк П.; Брэдшоу, Джулия С.; Марти, Гэри Д.; Snyman, Heindrich N.; Моррисон, Дайан Б.; Ричард, Джон (2016-01-05). «Писциновый ортооровирус из Западной Северной Америки передается атлантическому лосося и лосося в социальных сетях, но не может вызвать воспаление сердца и скелетных мышц» . Plos один . 11 (1): E0146229. doi : 10.1371/journal.pone.0146229 . ISSN   1932-6203 . PMC   4701501 . PMID   26730591 .
  35. ^ Purcell, Mk; Powers, RL; Evered, J; Kerwin, J; Мейерс, Тр; Стюарт, б; Уинтон, младший (февраль 2018 г.). «Молекулярное тестирование взрослого тихоокеанского лосося и форели (Oncorhynchus spp.) Для нескольких РНК -вирусов демонстрирует широкое распространение писцинового ортооровируса на Аляске и Вашингтоне» . Журнал рыбных заболеваний . 41 (2): 347–355. doi : 10.1111/jfd.12740 .
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: b4b85853c262f558d59b58690257341a__1704346380
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/b4/1a/b4b85853c262f558d59b58690257341a.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
Piscine orthoreovirus - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)