Белки группы триторакса
Белки группы Trithorax ( TrxG ) представляют собой гетерогенную совокупность белков, основное действие которых заключается в поддержании экспрессии генов . Их можно разделить на три общих класса в зависимости от молекулярной функции:
- гистон -модифицирующие белки TrxG
- , ремоделирующие хроматин белки TrxG
- ДНК-связывающие белки TrxG,
плюс другие белки TrxG, не отнесенные к первым трем классам. [1]
Открытие
[ редактировать ]Один из основателей белков TrxG, триторакс (trx), был открыт примерно в 1978 году Филиппом Ингэмом в рамках его докторской диссертации, когда он был аспирантом в лаборатории Дж. Р. С. Уиттла в Университете Сассекса . [2] Гистон-лизин N -метилтрансфераза 2А является человеческим гомологом trx. [2]
| Имя | Символ(ы) |
|---|---|
| отсутствуют, маленькие или гомеозисные диски 1 | ясень1 |
| отсутствуют, маленькие или гомеозисные диски 2 | ясень2 |
| Брахма | брм |
| Брама-ассоциированный белок 55 кДа | Бап55 |
| Брама-ассоциированный белок 60 кДа | Бап60 |
| Уходите | Уходите |
| домино | дом |
| Усилитель биторакса | Е(бх) |
| усилитель желтого цвета 3 | SAYP или e(y)3 |
| веко | огонь или оса |
| женская стерильность (1) гомеозис | фс(1)ч |
| граппа | gpp |
| Имитация SWI | Это того стоит |
| кисмет | маленький |
| маленькие воображаемые диски | крышка |
| лола лайк | ржу не могу |
| модификатор ЦРТ 4 | mod(mdg4), E(var)3-93D или doom |
| Мойра | нежный |
| Фактор ремоделирования нуклеосомы-38кД | Нурф38 |
| триторакс | ТРХ |
| Триторакс как | Трл |
| Повсеместно транскрибируемый тетратрикопептидный повтор, Х-хромосома | UTX |
| вертанди | и т. д. |
| интерес | С |
В таблице приведены имена членов Drosophila TrxG. Гомологи у других видов могут иметь разные названия.
Функция
[ редактировать ]Белки группы Trithorax обычно функционируют в больших комплексах, образующихся с другими белками. Комплексы, образуемые белками TrxG, делятся на две группы: гистон-модифицирующие комплексы и АТФ -зависимые комплексы ремоделирования хроматина. Основная функция белков TrxG, наряду с белками группы поликомб (PcG), заключается в регуляции экспрессии генов. В то время как белки PcG обычно связаны с подавлением генов , белки TrxG чаще всего связаны с активацией генов . Комплекс триторакс активирует транскрипцию генов, индуцируя триметилирование лизина 4 гистона H3 ( H3K4me3 ) в определенных участках хроматина, распознаваемых комплексом. [1] Домен Ash1 участвует в метилировании H3K36. Комплекс Trithorax также взаимодействует с CBP (связывающим белком CREB), который представляет собой ацетилтрансферазу и ацетилирует H3K27 . [3] Активация этого гена усиливается ацетилированием гистона H4 . Действия белков TrxG часто описываются как «антагонистические» по отношению к функциям белков PcG. [4] Помимо регуляции генов, данные свидетельствуют о том, что белки TrxG также участвуют в других процессах, включая апоптоз , рак и реакции на стресс. [5] [6] [7]
Роль в развитии
[ редактировать ]Во время развития белки TrxG поддерживают активацию необходимых генов, особенно генов Hox , после истощения материнских факторов. [8] Это достигается за счет сохранения эпигенетических меток, в частности H3K4me3, установленных материнскими факторами. [9] Белки TrxG также участвуют в инактивации Х-хромосомы , которая происходит во время раннего эмбриогенеза . [10] По состоянию на 2011 год [update] неясно, необходима ли активность TrxG в каждой клетке на протяжении всего развития организма или только на определенных стадиях в определенных типах клеток. [11]
См. также
[ редактировать ]- Хистоме
- Гистон ацетилтрансфераза
- Гистоновые деацетилазы
- Гистон метилтрансфераза
- Ферменты, модифицирующие гистоны
- нуклеосома
- Путь PRMT4
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б Шюттенгрубер Б., Шурут Д., Верворт М., Леблан Б., Кавалли Г. (февраль 2007 г.). «Регуляция генома белками полисот и триторакса» . Клетка . 128 (4): 735–45. дои : 10.1016/j.cell.2007.02.009 . ПМИД 17320510 .
- ^ Jump up to: а б Ингхэм П.В. (1998). «Триторакс и регуляция экспрессии гомеотических генов у дрозофилы: историческая перспектива». Межд. Дж. Дев. Биол . 42 (3): 423–9. ПМИД 9654027 .
- ^ Гейслер, Сара Дж.; Паро, Ренато (01 сентября 2015 г.). «Группово-зависимое регулирование Триторакса и Поликомба: история противоположных действий» . Разработка . 142 (17): 2876–2887. дои : 10.1242/dev.120030 . hdl : 20.500.11850/104579 . ISSN 0950-1991 . ПМИД 26329598 .
- ^ Гримо С., Негре Н., Кавалли Г. (2006). «От генетики к эпигенетике: рассказ о генах группы Поликомб и группы триторакс». Хромосомный рез . 14 (4): 363–75. дои : 10.1007/s10577-006-1069-y . ПМИД 16821133 . S2CID 19504262 .
- ^ Тьяги С., герр В. (октябрь 2009 г.). «E2F1 опосредует повреждение ДНК и апоптоз через HCF-1 и семейство гистоновых метилтрансфераз MLL» . ЭМБО Дж . 28 (20): 3185–95. дои : 10.1038/emboj.2009.258 . ПМК 2771094 . ПМИД 19763085 .
- ^ Зиболд А.П., Банерджи Р., Тай Ф., Кисс Д.Л., Московиц Дж., Харт П.Дж. (январь 2010 г.). «Репрессивный комплекс Polycomb 2 и триторакс модулируют продолжительность жизни и устойчивость дрозофилы к стрессу» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 107 (1): 169–74. Бибкод : 2010PNAS..107..169S . дои : 10.1073/pnas.0907739107 . ПМК 2806727 . ПМИД 20018689 .
- ^ Багчи А., Папазоглу С., Ву Ю., Капурсо Д., Бродт М., Фрэнсис Д., Бредель М., Фогель Х., Миллс А.А. (февраль 2007 г.). «CHD5 является супрессором опухоли на уровне 1p36 человека» . Клетка . 128 (3): 459–75. дои : 10.1016/j.cell.2006.11.052 . ПМИД 17289567 .
- ^ Брок Х.В., Фишер К.Л. (март 2005 г.). «Поддержание паттернов экспрессии генов» . Дев. Дин . 232 (3): 633–55. дои : 10.1002/dvdy.20298 . ПМИД 15704101 .
- ^ Сошникова Н (август 2011 г.). «Динамика активности Polycomb и Trithorax в процессе развития». Исследование врожденных дефектов. Часть A: Клиническая и молекулярная тератология . 91 (8): 781–7. дои : 10.1002/bdra.20774 . ПМИД 21290568 .
- ^ Пуллирш Д., Хертель Р., Кисимото Х., Лееб М., Штайнер Г., Вутц А. (март 2010 г.). «Белки группы Trithorax Ash2l и Saf-A рекрутируются на неактивную Х-хромосому в начале стабильной инактивации Х» . Разработка . 137 (6): 935–43. дои : 10.1242/dev.035956 . ПМЦ 2834461 . ПМИД 20150277 .
- ^ Шюттенгрубер Б., Мартинес А.М., Иовино Н., Кавалли Г. (декабрь 2011 г.). «Белки группы Trithorax: включение генов и поддержание их активности». Нат. Преподобный мол. Клеточная Биол . 12 (12): 799–814. дои : 10.1038/nrm3230 . hdl : 21.11116/0000-0006-0774-0 . ПМИД 22108599 . S2CID 19992445 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]- Страница Polycomb и Trithorax лаборатории Cavalli в IGH (Institut de Génétique Humaine). Эта страница содержит полезную информацию о белках Polycomb и trithorax в форме введения, ссылки на опубликованные обзоры, список белков Polycomb и trithorax, иллюстрацию Power Point. слайды и ссылка на браузер генома, показывающие распределение этих белков по всему геному у Drosophila melanogaster.
- Интерактивная муха - Общество биологии развития