IMES-1 Мотив РНК
Мотив РНК IMES -1 представляет собой консервативную РНК- структуру, которая была идентифицирована в морских экологических последовательностях двумя исследованиями, основанными на метагеномике и биоинформатике , первом анализе данных MetatranScriptome (РНК) [ 2 ] и второй с использованием данных метагенома ( ДНК ). [ 1 ] Эти РНК присутствуют в экологических последовательностях , и, как известно, не присутствуют в каких -либо культивируемых видах . Однако виды, которые используют эти РНК, наиболее тесно связаны с известными альфапротеобактериями и гаммапротеобактериями . [ 2 ] IMES-1 РНК составляют значительную часть транскриптов морской РНК [ 2 ] и исключительно распространены в том, что в пять раз больше RNA IMES-1 были обнаружены, чем рибосомы [ 1 ] в РНК, отобранных из Тихого океана . [ 2 ] [ 3 ] Только два бактериальных РНК известны ( 6S РНК и переносит РНК ), чтобы более сильно транскрибируются, чем рибосомы. IMES-1 РНК также были обнаружены в изобилии в Блок-Айленд-Саунд в Атлантическом океане .
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а беременный в Weinberg Z, Perreault J, Meyer MM, Breaker RR (декабрь 2009 г.). «Исключительные структурированные некодирующие РНК, выявленные с помощью анализа бактериальных метагеномов» . Природа . 462 (7273): 656–659. Bibcode : 2009natur.462..656W . doi : 10.1038/nature08586 . PMC 4140389 . PMID 19956260 .
- ^ Jump up to: а беременный в дюймовый Shi Y, Tyson GW, Delong EF (май 2009 г.). «Metatranscriptomics выявляет уникальные микробные небольшие РНК в толще воды океана». Природа . 459 (7244): 266–269. Bibcode : 2009natur.459..266s . doi : 10.1038/nature08055 . PMID 19444216 . S2CID 4340144 .
- ^ Frias-Lopez J, Shi Y, Tyson GW, et al. (Март 2008 г.). «Экспрессия генов микробного сообщества в поверхностных водах океана» . Прокурор Нат. Академический Наука США . 105 (10): 3805–3810. doi : 10.1073/pnas.0708897105 . PMC 2268829 . PMID 18316740 .