Рибопереключатель PreQ1-III

Консенсусная вторичная структура рибопереключателей PreQ ₁ -III, основанная на более ранних данных, чем ранее опубликованное описание. ^{[ 1 ]} Структурное значение парного взаимодействия, получившего название «псевдоузел или альтернативный стебель», в настоящее время неизвестно. Стебель P1 необычайно богат нуклеотидами A и U, что подтверждается экспериментальными данными.

Рибопереключатели PreQ1-III представляют собой класс рибопереключателей , которые связывают прекеуозин ₁ (PreQ ₁ ), предшественник модифицированного нуклеозида кевозина . ^{[ 1 ]} Рибопереключатели PreQ ₁ -III представляют собой третий класс обнаруженных рибопереключателей, которые воспринимают этот лиганд и структурно отличаются от рибопереключателей preQ ₁ -I и preQ ₁ -II . Большинство секвенированных примеров рибопереключателей preQ ₁ -III получено из некультивируемых образцов метагенома , но несколько примеров в культивируемых организмах присутствуют в штаммах, которые известны или предположительно являются Faecalibacterium prausnitzii , разновидностью грамположительных клостридий . Известные примеры рибопереключателей preQ ₁ -III находятся выше генов queT , которые, как ожидается, кодируют транспортеры производного кевозина. Два других известных класса рибопереключателей preQ ₁ также обычно обнаруживаются выше генов queT .

Структура рибопереключателя preQ1-III с атомным разрешением была решена с помощью рентгеновской кристаллографии. ^{[ 2 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б МакКаун П.Дж., Лян Дж.Дж., Вайнберг З., Брейкер Р.Р. (2014). «Структурное, функциональное и таксономическое разнообразие трех классов рибопереключателей PreQ1» . хим. Биол . 21 (7): 880–889. doi : 10.1016/j.chembiol.2014.05.015 . ПМЦ 4145258 . ПМИД 25036777 .
^ Либерман Дж.А., Суддала К.С., Айтенфису А., Чан Д., Белашов И.А., Салим М., Мэтьюз Д.Х., Спитале Р.К., Уолтер Н.Г., Ведекинд Дж.Е. (2015). «Структурный анализ рибопереключателя preQ1 класса III выявил аптамер, удаленный от сайта связывания рибосомы, регулируемого быстрой динамикой» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 112 (27): E3485–3494. дои : 10.1073/pnas.1503955112 . ПМК 4500280 . ПМИД 26106162 .

Эта по молекулярной или клеточной биологии статья незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[McCown2014-1] Jump up to: ^а ^б МакКаун П.Дж., Лян Дж.Дж., Вайнберг З., Брейкер Р.Р. (2014). «Структурное, функциональное и таксономическое разнообразие трех классов рибопереключателей PreQ1» . хим. Биол . 21 (7): 880–889. doi : 10.1016/j.chembiol.2014.05.015 . ПМЦ 4145258 . ПМИД 25036777 .

[2] Либерман Дж.А., Суддала К.С., Айтенфису А., Чан Д., Белашов И.А., Салим М., Мэтьюз Д.Х., Спитале Р.К., Уолтер Н.Г., Ведекинд Дж.Е. (2015). «Структурный анализ рибопереключателя preQ1 класса III выявил аптамер, удаленный от сайта связывания рибосомы, регулируемого быстрой динамикой» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 112 (27): E3485–3494. дои : 10.1073/pnas.1503955112 . ПМК 4500280 . ПМИД 26106162 .

[ 1 ]

[ 2 ]