Рибопереключатель PreQ1-II
| рибопереключатель preQ1-II (прекеуозин) | |
|---|---|
 Прогнозируемая вторичная структура и консервативность последовательности preQ1-II | |
| Идентификаторы | |
| Символ | предварительный квартал 1-II |
| Альт. Символы | COG4708 |
| Рфам | RF01054 |
| Другие данные | |
| РНК Тип | Цис-рег ; рибопереключатель |
| Домен(ы) | Бактерии |
| ТАК | ТАК: 0005836 |
| PDB Структуры | ПДБе |
Рибопереключатели PreQ1-II образуют класс рибопереключателей , которые специфически связывают прекеуозин 1 (PreQ 1 ), предшественник модифицированного нуклеозида кевозина . [ 1 ] Они обнаружены у некоторых видов Streptococcus и Lactococcus и первоначально были идентифицированы как консервативная вторичная структура РНК, называемая «мотивом COG4708». [ 2 ] Все известные представители этого класса рибопереключателей, по-видимому, контролируют члены генов COG4708. Предполагается, что эти гены кодируют мембраносвязанные белки и являются переносчиками preQ 1 или родственного метаболита на основании их ассоциации с preQ 1 -связывающими рибопереключателями. [ 1 ] Рибопереключатели PreQ1-II не имеют очевидного сходства по последовательности или структуре с рибопереключателями preQ1-I , ранее открытым классом рибопереключателей, связывающих preQ1 . Таким образом, PreQ 1 присоединяется к S-аденозилметионину в качестве второго обнаруженного метаболита, который является лигандом более чем одного класса рибопереключателей.
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Перейти обратно: а б с Мейер М.М., Рот А., Червин С.М., Гарсия Г.А., Брейкер Р.Р. (2008). «Подтверждение второго природного класса аптамеров preQ1 у бактерий Streptococcaceae» . РНК . 14 (4): 685–695. дои : 10.1261/rna.937308 . ПМК 2271366 . ПМИД 18305186 .
- ^ Перейти обратно: а б Вайнберг З., Баррик Дж.Э., Яо З. и др. (2007). «Идентификация 22 структурированных РНК-кандидатов в бактериях с использованием конвейера сравнительной геномики CMfinder» . Нуклеиновые кислоты Рез . 35 (14): 4809–4819. дои : 10.1093/нар/gkm487 . ПМК 1950547 . ПМИД 17621584 .
Внешние ссылки
[ редактировать ] | Эта по молекулярной или клеточной биологии статья незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее . |