Микобактерииды
| Микобактерииды | |
|---|---|
Научная классификация 
| |
| Домен: | Бактерии |
| Тип: | Актиномицетота |
| Сорт: | Актиномицетия |
| Заказ: | Микобактерии |
| Семья: | Микобактерии |
| Род: | Микобактерииды Гупта и др. 2018 год [ 1 ] |
| Типовой вид | |
| Микобактериоидный абсцесс (Мур и Фрерихс, 1953) Гупта и др. 2018 год
| |
| Разновидность [ 2 ] | |
| |
| Синонимы [ 3 ] | |
| |
Mycobacteroides — род грамположительных палочковидных бактерий семейства Mycobacteriaceae из порядка Mycobacteriales . [ 1 ]
Члены Mycobacteroides были отделены от более крупного рода Mycobacterium в 2018 году Gupta et al. на основе данных различных филогенетических деревьев, построенных на основе консервативных последовательностей генома, сравнительного геномного анализа и средних значений идентичности аминокислот. [ 1 ] Помимо этого рода, в исследовании было предложено разделить Mycobacterium на пять отдельных родов, что встретило некоторое сопротивление со стороны некоторых представителей научного сообщества. Устойчивость была основана на том, что Mycobacterium содержит некоторые клинически значимые виды, и изменение названия может вызвать путаницу среди врачей и других исследователей. [ 4 ]
В 2020 году Ямада и др. проанализировали фундаментальные морфологические свойства новых родов, включая диаметр клеток, длину клеток, периметр клеток, округлость клеток и соотношение сторон, и определили, что между пятью родами существуют значительные различия, что подтверждает новое деление. [ 5 ]
Название Mycobacteroides происходит от латинского существительного Mycobacterium (относящегося к роду бактерий) и латинского суффикса «-oides » (переводится как «похожий»). Вместе название относится к роду, напоминающему Mycobacterium . [ 1 ]
Биохимические характеристики и молекулярные подписи
[ редактировать ]Члены Mycobacteroides — это быстрорастущие бактерии, образующие колонии менее чем за семь дней. Некоторые характеристики этого рода включают: отрицательный результат на нитратредуктазу, поглощение железа и демонстрацию устойчивости к полимиксину B. Оптимальная температура содержания составляет 30 ° C, хотя рост может происходить и при 35 ° C. Участники также демонстрируют положительный результат трехдневного теста на арилсульфатазу. Размер генома видов Mycobacteroides составляет от 4,5 до 5,6 Мб, а содержание G+C в них составляет от 63,9 до 64,8 мол.%. Некоторые виды являются патогенными и могут вызывать инфекции легких, кожи и мягких тканей. Кроме того, некоторые виды устойчивы к нескольким противомикробным препаратам.
27 консервативных сигнатурных инделей (CSI) были идентифицированы как уникально присутствующие в этом роде в таких белках, как: DEAD/DEAH-бокс-хеликаза , переносчик анионов , мембранный белок , никотинат-нуклеотид-аденилилтрансфераза , эфир-лиаза КоА, урацил-фосфорибозилтрансфераза , L-гистидин N( альфа)-метилтрансфераза, белок, содержащий домен DUF58, Субъединица G НАДН-хинон-оксидоредуктазы , АТФ-зависимая геликаза, тРНК (цитидин(34)-2'- O )-метилтрансфераза , глутамин-фруктозо-6-фосфат трансаминаза (изомеризация) , склонная к ошибкам ДНК-полимераза и 2-амино- 4-гидрокси-6-гидроксиметилдигидроптеридиндифосфокиназа . [ 1 ] Эти молекулярные сигнатуры были идентифицированы посредством анализа последовательностей генома видов Mycobacteroides и обеспечивают надежный молекулярный метод для отличия этого рода от теоретически других родов семейства Mycobacteriaceae и всех других бактерий. было идентифицировано 24 уникальных консервативных сигнатурных белка (CSP) Кроме того, для этого рода . [ 1 ]
Полногеномное секвенирование — лучший способ отличить представителей этого рода друг от друга. [ 6 ]
Филогения
[ редактировать ]Филогения Mycobacteroides основана на полногеномном анализе. [ 1 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б с д и ж г Гупта, Рэдхи С.; Ло, Брайан; Сын, Джин (13 февраля 2018 г.). «Филогеномика и сравнительные геномные исследования убедительно подтверждают разделение рода Mycobacterium на расширенный род Mycobacterium и четыре новых рода» . Границы микробиологии . 9:67 . дои : 10.3389/fmicb.2018.00067 . ISSN 1664-302X . ПМЦ 5819568 . ПМИД 29497402 .
- ^ Эузеби Ж.П., Парте AC. « Микобактериоиды » . Список названий прокариот, имеющих номенклатуру (LPSN) . Проверено 25 июня 2022 г.
- ^ Ричардсон, ET; Самсон, Д.; Банаи, Н. (май 2009 г.). «Быстрая идентификация микобактерий туберкулеза и нетуберкулезных микобактерий с помощью мультиплексной ПЦР в реальном времени» . Дж. Клин. Микробиол . 47 (5): 1497–502. дои : 10.1128/JCM.01868-08 . ПМК 2681835 . ПМИД 19297596 .
- ^ Тортоли, Энрико; Браун-Эллиотт, Барбара А.; Чалмерс, Джеймс Д.; Чирилло, Даниэла М.; Дейли, Чарльз Л.; Эмлер, Стефан; Флото, Р. Андрес; Гарсия, Мария Дж.; Хофслот, Воутер; Ко, Вон-Юнг; Ланге, Кристоф (01 июля 2019 г.). «То же мясо, другой соус: не обращайте внимания на новые названия микобактерий» . Европейский респираторный журнал . 54 (1). дои : 10.1183/13993003.00795-2019 . ISSN 0903-1936 . ПМИД 31296783 . S2CID 195893005 .
- ^ Ямада, Хироюки; Чикамацу, Кинуё; Аоно, Акио; Мурата, Казуёси; Миядзаки, Наоюки; Каяма, Йоко; Бхатт, Апурва; Фудзивара, Нагатоши; Маэда, Синдзи; Митарай, Сатоши (2020). «Фундаментальная морфология клеток, исследованная с помощью Cryo-TEM, видов новых пяти родов, надежно коррелирует с новой классификацией семейства Mycobacteriaceae » . Границы микробиологии . 11 : 562395. дои : 10.3389/fmicb.2020.562395 . ISSN 1664-302X . ПМК 7701246 . ПМИД 33304323 .
- ^ Ногейра CL, де Алмейда LGP, Менендес MC, Гарсия MJ, Диджампьетри Л.А., Чимара Е, Кнокарт М., Паломино Х.К., Портаэлс Ф., Мартин А., Вандамм П., Леан СК. (2017). «Характеристика штаммов, подобных Mycobacterium chelonae, с помощью сравнительной геномики» . Передний микробиол . 8 : 789. дои : 10.3389/fmicb.2017.00789 . ПМК 5420552 . ПМИД 28533767 .