Миколицибактерия
| Миколицибактерия | |
|---|---|
Научная классификация 
| |
| Домен: | Бактерии |
| Тип: | Актиномицетота |
| Сорт: | Актиномицетия |
| Заказ: | Микобактерии |
| Семья: | Микобактерии |
| Род: | Миколицибактерия Гупта и др. 2018 год [ 1 ] |
| Типовой вид | |
| Миколицибактерия фортуитум (да Коста Крус, 1938) Гупта и др. 2018 год
| |
| Разновидность | |
|
См. текст. | |
Mycolicibacterium — род грамположительных палочковидных бактерий семейства Mycobacteriaceae из порядка Mycobacteriales . [ 1 ]
Члены Mycolicibacterium были отделены от более крупного рода Mycobacterium в 2018 году Gupta et al. на основе данных различных филогенетических деревьев, построенных на основе консервативных последовательностей генома, сравнительного геномного анализа и средних значений идентичности аминокислот. [ 1 ] Помимо этого рода, в исследовании было предложено разделить Mycobacterium на пять отдельных родов, что встретило некоторое сопротивление со стороны некоторых представителей научного сообщества. Устойчивость была основана на том, что Mycobacterium содержит некоторые клинически значимые виды, и изменение названия может вызвать путаницу среди врачей и других исследователей. [ 2 ]
В 2020 году Ямада и др. проанализировали фундаментальные морфологические свойства новых родов, включая диаметр клеток, длину клеток, периметр клеток, округлость клеток и соотношение сторон, и определили, что между пятью родами существуют значительные различия, что подтверждает новое деление. [ 3 ]
Название Mycolicibacterium происходит от латинского acidum mycolicum (переводится как миколевая кислота) и латинского существительного бактерия от греческого существительного «бактерии» (переводится как маленькая палочка). Вместе это название относится к роду миколевой кислоты, содержащему палочковидные бактерии. [ 1 ]
Биохимические характеристики и молекулярные подписи [ 1 ]
[ редактировать ]Mycolicibacterium — это род быстрорастущих бактерий, которым для образования колоний требуется менее семи дней. Члены также нехромогенны (не производят пигмент) и дают положительный результат в трехдневном тесте на активность арилсульфатазы , нитратредуктазу и усвоение железа. Большинство видов являются сапрофитами и способны перерабатывать разлагающиеся органические вещества в питательные вещества. Хотя представители этого рода не считаются патогенными, сообщалось, что некоторые виды вызывают инфекции и заболевания. Размер генома Mycolicibacterium составляет 3,95–8,0 Мб, а содержание G+C составляет 65,4–70,3 мол.% .
Четыре консервативные сигнатурные индели (CSI) были идентифицированы посредством геномного анализа как уникально присутствующие в этом роде в следующих белках: регуляторе транскрипции семейства LacI, циклазе , CDP-диацилглицерин-глицерин-3-фосфат-3-фосфатидилтрансферазе и CDP-диацилглицерин-серин O- фосфатидилтрансфераза . [ 1 ] Эти CSI служат надежным молекулярным средством отличия представителей этой Mycolicibacterium от других родов семейства Mycobacteriaceae и всех других бактерий. Кроме того, для этого рода было идентифицировано 10 уникальных консервативных сигнатурных белков (CSP).
Разновидность
[ редактировать ]| Филогения миколицибактерий [ 1 ] [ а ] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Примечания
|
Миколицибактерии включают следующие виды: [ 4 ]
- « М. acapulense » Gupta et al. 2018 год
- M. agri (Tsukamura 1981) Gupta et al. 2018 год
- M. aichiense (Цукамура, 1981 г.) Гупта и др. 2018 г.
- M. alvei (Ausina et al. 1992) Gupta et al. 2018 год
- M. Anyangense (Ким и др., 2015) Gupta et al. 2018 год
- M. arabiense (Zhang et al. 2013) Gupta et al. 2018 год
- M. arcueilense (Konjek et al. 2016) Gupta et al. 2018 год
- M. aromaticivorans (Hennessee et al. 2009) Gupta et al. 2018 год
- M. aubagnense (Adékambi et al. 2006) Gupta et al. 2018 год
- М. золото (Цукамура, 1966) Gupta et al. 2018 год
- M. austroafricanum (Tsukamura et al. 1983) Gupta et al. 2018 год
- M. bacteremicum (Brown-Elliott et al. 2012) Gupta et al. 2018 год
- M. baixianningiae Cheng и др. 2021 г.
- M. boenickei (Schinsky et al. 2004) Gupta et al. 2018 год
- M. brisbanense (Schinsky et al. 2004) Gupta et al. 2018 год
- M. brumae (Luquin et al. 1993) Gupta et al. 2018 год
- M. canariasense (Хименес и др., 2004 г.) Gupta et al. 2018 год
- M. celeriflavum (Shahraki et al. 2015) Gupta et al. 2018 год
- M. chitae (Tsukamura 1967) Gupta et al. 2018
- M. chromophenolicum (Apajalahti et al. 1986) Gupta et al. 2018 год
- М. chubuense (Цукамура, 1981 г.) Гупта и др. 2018 г.
- M. Conceptionense (Adékambi et al. 2006) Gupta et al. 2018 год
- M. confluentis (Kirschner et al. 1992) Gupta et al. 2018 год
- M. Cosmeticum (Кукси и др., 2004 г.) Gupta et al. 2018 год
- M. crocinum (Hennessee et al. 2009) Gupta et al. 2018 год
- M. diernhoferi (Tsukamura et al. 1983) Gupta et al. 2018 год
- M. doricum (Tortoli et al. 2001) Gupta et al. 2018 год
- M. duvalii (Стэнфорд и Ганторп, 1971) Gupta et al. 2018 год
- M. Elephantis (Shojaei et al. 2000) Gupta et al. 2018 год
- М. Fallax (Леви-Фребо и др., 1983) Gupta et al. 2018 год
- M.farcinogenes (Chamoiseau 1973) Gupta et al. 2018 год
- M. flavescens (Bojalil et al. 1962) Gupta et al. 2018 год
- M. fluoranthenivorans (Hormisch et al. 2006) Gupta et al. 2018 год
- M. fortuitum (да Коста Круз, 1938) Gupta et al. 2018 год
- M. frederiksbergense (Willumsen et al., 2001) Gupta et al. 2018 год
- M. gadium (Casal and Calero 1974) Gupta et al. 2018 год
- M. gilvum (Стэнфорд и Ганторп, 1971) Gupta et al. 2018 год
- « M.goodii » (Brown et al. 1999) Gupta et al. 2018 год
- « М. gossypii » Huang et al. 2021 год
- M. hassiacum (Шредер и др., 1997) Gupta et al. 2018 год
- M. helvum (Тран и Даль, 2016) Gupta et al. 2018 год
- M. hippocampi (Balcázar et al. 2014) Gupta et al. 2018 год
- M. hodleri (Kleespies et al. 1996) Gupta et al. 2018 год
- M. holsaticum (Richter et al. 2002) Gupta et al. 2018 год
- M. houstonense (Schinsky et al. 2004) Gupta et al. 2018 год
- M. insubricum (Tortoli et al. 2009) Gupta et al. 2018 год
- M. iranicum (Shojaei et al. 2013) Gupta et al. 2018 год
- « М. комании » (Гцебе и др. 2018) Гупта и др. 2018 год
- M. komossense (Казда и Мюллер, 1979) Gupta et al. 2018 год
- M.litorale (Zhang et al., 2012) Gupta et al. 2018 год
- M. latzerense (Gomila et al. 2008) Gupta et al. 2018 год
- M. lutetiense (Konjek et al. 2016) Gupta et al. 2018 год
- M. madagascariense (Kazda et al. 1992) Gupta et al. 2018 год
- M. mageritense (Domenech et al. 1997) Gupta et al. 2018 год
- M. Malmesburyense (Gcebe et al. 2017) Gupta et al. 2018 год
- М. mengxianglii Cheng и др. 2021 г.
- M. monacense (Reischl et al. 2006) Gupta et al. 2018 год
- « M. montmartrense » (Конжек и др., 2016) Gupta et al. 2018 год
- M. moriokaense (Tsukamura et al. 1986) Gupta et al. 2018 год
- M. mucoogenicum (Springer et al. 1995) Gupta et al. 2018 год
- M. murale (Vuorio et al. 1999) Gupta et al. 2018 год
- M. neoaurum (Tsukamura 1972) Gupta et al. 2018 год
- M. nevorleansense (Schinsky et al. 2004) Gupta et al. 2018 год
- M. nivoides Dahl et al. 2021 год
- M. novocastrense (Shojaei et al. 1997) Gupta et al. 2018 год
- М. obuense (Цукамура и Мизуно, 1981 г.) Гупта и др. 2018 г.
- M. oryzae (Рамапрасад и др., 2016) Gupta et al. 2018 год
- M. pallens (Hennessee et al. 2009) Gupta et al. 2018 год
- M. parafortuitum (Tsukamura 1966) Gupta et al. 2018 год
- M. peregrinum (Кусуноки и Эзаки, 1992) Gupta et al. 2018 год
- M. phlei (Lehmann and Neumann 1899) Gupta et al. 2018 год
- M. phocaicum (Adékambi et al. 2006) Gupta et al. 2018 год
- M. porcinum (Tsukamura et al. 1983) Gupta et al. 2018 год
- M. poriferae (Padgitt and Moshier 1987) Gupta et al. 2018 год
- M. psychrotolerans (Trujillo et al., 2004) Gupta et al. 2018 год
- М. порошок (Tsukamura et al. 1983) Gupta et al. 2018 год
- M.pyrenivorans (Derz et al. 2004) Gupta et al. 2018 год
- M. rhodesiae (Tsukamura 1981) Gupta et al. 2018 год
- M. rufum (Hennessee et al. 2009) Gupta et al. 2018 год
- M. rutilum (Hennessee et al., 2009) Gupta et al. 2018 год
- M. sarraceniae (Тран и Даль, 2016) Gupta et al. 2018 год
- M. sediminis (Чжан и др., 2013) Gupta et al. 2018 год
- M. senegalense (Chamoiseau 1973) Gupta et al. 2018 год
- M. septicum (Schinsky et al. 2000) Gupta et al. 2018 год
- M. setense (Lamy et al. 2008) Gupta et al. 2018 год
- M. smegmatis (Trevisan 1889) Gupta et al. 2018 год
- M. sphagni (Kazda 1980) Gupta et al. 2018 год
- M. stellerae Nouioui et al. 2019 год
- М. терморезистентный (Tsukamura 1966) Gupta et al. 2018 год
- М. токайенсе (Цукамура, 1981 г.) Гупта и др., 2018 г.
- M. tusciae (Tortoli et al. 1999) Gupta et al. 2018 год
- M. vaccae (Bönicke and Juhasz 1964) Gupta et al. 2018 год
- « М. винилхлоридум » Cortes-Albayay et al. 2021 год
- М. рана (van Ingen et al. 2009) Gupta et al. 2018 год
- М. wolinskyi (Brown et al. 1999) Gupta et al. 2018 год
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б с д и ж г Гупта, Рэдхи С.; Ло, Брайан; Сын, Джин (13 февраля 2018 г.). «Филогеномика и сравнительные геномные исследования убедительно подтверждают разделение рода Mycobacterium на расширенный род Mycobacterium и четыре новых рода» . Границы микробиологии . 9:67 . дои : 10.3389/fmicb.2018.00067 . ISSN 1664-302X . ПМЦ 5819568 . ПМИД 29497402 .
- ^ Тортоли, Энрико; Браун-Эллиотт, Барбара А.; Чалмерс, Джеймс Д.; Чирилло, Даниэла М.; Дейли, Чарльз Л.; Эмлер, Стефан; Флото, Р. Андрес; Гарсия, Мария Дж.; Хофслот, Воутер; Ко, Вон-Юнг; Ланге, Кристоф (01 июля 2019 г.). «То же мясо, другой соус: не обращайте внимания на новые названия микобактерий» . Европейский респираторный журнал . 54 (1). дои : 10.1183/13993003.00795-2019 . ISSN 0903-1936 . ПМИД 31296783 . S2CID 195893005 .
- ^ Ямада, Хироюки; Чикамацу, Кинуё; Аоно, Акио; Мурата, Казуёси; Миядзаки, Наоюки; Каяма, Йоко; Бхатт, Апурва; Фудзивара, Нагатоши; Маэда, Синдзи; Митарай, Сатоши (2020). «Фундаментальная морфология клеток, исследованная с помощью Cryo-TEM, видов новых пяти родов, надежно коррелирует с новой классификацией семейства Mycobacteriaceae » . Границы микробиологии . 11 : 562395. дои : 10.3389/fmicb.2020.562395 . ISSN 1664-302X . ПМК 7701246 . ПМИД 33304323 .
- ^ Эузеби Ж.П., Парте AC. « Миколицибактерии » . Список названий прокариот, имеющих номенклатуру (LPSN) . Проверено 25 июня 2022 г.