Институт биоинформатики, Бангалор
| Тип | Автономная некоммерческая исследовательская организация |
|---|---|
| Учредил | 2002 |
| Директор | Доктор Ахилеш Пандей (основатель и директор) Доктор Рави Сирдешмух (заместитель директора) |
| Расположение | , , |
| Кампус | Городской |
| Псевдоним | ИОБ или ИОБ |
| Веб-сайт | www |
Институт биоинформатики , часто называемый IOB , является индийской некоммерческой академической исследовательской организацией, базирующейся в Бангалоре , Индия. Он занимается исследованиями в области биоинформатики , мультиомики , системной биологии и неврологических расстройств . [ 1 ] В 2002 году институт был основан The Genomics Research Trust и Университетом Джонса Хопкинса в Балтиморе , штат Мэриленд . [ 2 ] Эта организация признана «Организацией научных и промышленных исследований» (SIRO) Департамента научных и промышленных исследований правительства Индии . [ 3 ] Известный протеомик Ахилеш Панди , профессор кафедры лабораторной медицины и патологии Центра индивидуализированной медицины клиники Мэйо в Рочестере , Миннесота , США, является основателем и нынешним директором IOB, а выдающийся протеомист Рави Сирдешмух , президент-основатель «Протеомного общества Индия» является нынешним заместителем директора IOB.
Базы данных, разработанные IOB
[ редактировать ]- Справочная база данных по белкам человека (в сотрудничестве с лабораторией Панди, Университет Джонса Хопкинса ) [ 4 ] [ 5 ]
- Протеинпедия человека [ 6 ] [ 7 ] [ 8 ] [ 9 ]
- NetPath [ 10 ] [ 11 ]
- База данных исследований рака в Индии
- Карта протеома человека
- База данных протеомов плазмы
- База данных рака поджелудочной железы
- Ресурс азиатских первичных иммунодефицитных заболеваний
Финансирующие агентства
[ редактировать ]IOB получает гранты и финансирование от различных национальных и международных финансовых агентств. [ 12 ]
Национальные финансирующие агентства
[ редактировать ]- Совет научных и промышленных исследований
- Комиссия по университетским грантам (Индия)
- Индийский совет медицинских исследований
- Кафедра биотехнологии
- Департамент науки и технологий (Индия)
Международные финансовые агентства
[ редактировать ]Другие
[ редактировать ]Принадлежность
[ редактировать ]IOB является филиалом Академии высшего образования Манипала (MAHE) для присуждения степени доктора философии. градусов. [ 3 ]
Достижения и мировое признание
[ редактировать ]IOB — первый исследовательский институт в мире, которому удалось расшифровать почти полную белковую карту человека. В мае 2014 года журнал Nature опубликовал книгу, поместив на обложку это достижение IOB под заголовком «Протеом человека». [ 13 ] [ 14 ] 17 февраля 2016 г. (DST) правительства Индии опубликовал Департамент науки и технологий статью «Исследовательский ландшафт Индии: результаты, сотрудничество и сравнительная эффективность - библиометрические исследования», в которую вошли два отчета. Первый отчет под названием «Результаты исследований и сотрудничество в Индии (2005–2014 годы): библиометрическое исследование» был составлен Thomson Reuters , а второй отчет под названием «Международная сравнительная эффективность исследовательской базы Индии (2009–2014 годы)» был опубликован независимо составлено Elsevier . По данным Thomson Reuters, статья « Справочная база данных по белкам человека », опубликованная в 2009 году, заняла второе место среди 10 лучших публикаций индийского происхождения в области биологии и биохимии, а «Проект карты человеческого протеома», представленный на обложка журнала Nature в 2014 году была процитирована более 400 раз за короткий период времени и заняла шестое место. [ 15 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ «Институт биоинформатики» .
- ^ Рохатги, Риту (22 апреля 2003 г.). «Разгадка жизни» . Времена Индии .
- ^ Jump up to: а б «Институт биоинформатики» .
- ^ Пери С. и др. (2003). «Разработка справочной базы данных по белкам человека как исходной платформы для подхода к системной биологии человека» . Геномные исследования . 13 (10): 2363–71. дои : 10.1101/гр.1680803 . ПМК 403728 . ПМИД 14525934 .
- ^ Ганди ТКБ; и др. (март 2006 г.). «Анализ интерактома белка человека и сравнение с наборами данных о взаимодействии дрожжей, червей и мух». Природная генетика . 38 (3): 285–293. дои : 10.1038/ng1747 . ПМИД 16501559 . S2CID 1446423 .
- ^ Кандасами и др. Human Proteinpedia: единый ресурс для исследований в области протеомики. Исследования нуклеиновых кислот. Предварительный доступ опубликован 23 октября 2008 г., DOI 10.1093/nar/gkn701.
- ^ Мативанан и др. Human Proteinpedia позволяет обмениваться данными о человеческом белке. Нат Биотехнология. 2008 февраль;26:164-7
- ^ Мишра и др. Справочная база данных по белкам человека — обновление 2006 г. Нуклеиновые кислоты Рез. 34 января 2006 г. (проблема с базой данных): D411-4
- ^ Пери и др. Разработка справочной базы данных по белкам человека как исходной платформы для подхода к системной биологии человека. Геном Рез. Октябрь 2003 г.; 13: 2363-71.
- ^ Кандасами, Кумаран; Мохан, Суджата; Раджу, Раджеш; Киртикумар, Шивакумар; Кумар, Гантасала С. Самир; Венугопал, Абхилаш К; Теликичерла, Дипти; Наварро, Дэниел Дж; Мативанан, Суреш (2010). «NetPath: общедоступный ресурс тщательно подобранных путей передачи сигналов» . Геномная биология . 11 (1): Р3. дои : 10.1186/gb-2010-11-1-r3 . ПМЦ 2847715 . ПМИД 20067622 .
- ^ Кандасами, К.; Киртикумар, С.; Раджу, Р.; Кешава Прасад, Т.С.; Рамачандра, ЮЛ; Мохан, С.; Панди, А. (2009). «PathBuilder — программное обеспечение с открытым исходным кодом для аннотирования и разработки ресурсов путей» . Биоинформатика . 25 (21): 2860–2. doi : 10.1093/биоинформатика/btp453 . ПМЦ 2781757 . ПМИД 19628504 .
- ^ «Институт биоинформатики (Финансирование)» .
- ^ «Природа (том 509, выпуск 7502, 29 мая 2014 г.)» .
- ^ «Освещение NDTV на карте протеома человека» .
- ^ «Результаты исследований и сотрудничество в Индии (2005–2014 гг.): Библиометрическое исследование (Фаза II)» (PDF) . Томсон Рейтер. 2017.