Эписома

Эписома — это особый тип плазмиды , которая остается частью эукариотического генома без интеграции. Эписомы справляются с этим, реплицируясь вместе с остальной частью генома и впоследствии связываясь с метафазными хромосомами во время митоза. Эписомы не деградируют, в отличие от стандартных плазмид, и могут быть сконструированы таким образом, чтобы они не подвергались эпигенетическому молчанию внутри ядра эукариотической клетки. ^{[ 1 ]} Эписомы могут наблюдаться в природе при некоторых типах длительной инфекции аденоассоциированным вирусом или вирусом Эпштейна-Барра . В 2004 году было предложено использовать невирусные эписомы в генетической терапии для долгосрочного изменения экспрессии генов . ^{[ 2 ]}

По состоянию на 1999 год было известно множество последовательностей ДНК (дезоксирибонуклеиновой кислоты), которые позволяют стандартной плазмиде сохраняться эписомально. Одним из примеров является последовательность S/MAR . ^{[ 3 ]}

Продолжительность эписомальной ретенции весьма варьирует между различными генетическими конструкциями, и существует множество известных особенностей последовательности эписомы, которые влияют на продолжительность и стабильность генетической экспрессии переносимого трансгена. Среди этих особенностей — количество сайтов CpG , которые способствуют эпигенетическому молчанию трансгена, переносимого эписомой. ^{[ 4 ]}

Механизм эписомальной ретенции

Механизм эписомальной ретенции в случае эписом S/MAR, как правило, все еще неясен. По состоянию на 1985 год в случае латентной инфекции вируса Эпштейна-Барра эписомы, по-видимому, были связаны с ядерными белками клетки-хозяина через набор вирусных белков. ^{[ 5 ]}

Эписомы у прокариот

Эписомы у прокариот представляют собой особые последовательности, которые могут делиться либо отдельно от прокариотической хромосомы, либо интегрироваться в нее. ^{[ 6 ]}

Ссылки

^ Ван Краененбрук, Кэтлин; Ванхонакер, Питер; Хэгеман, Гай (сентябрь 2000 г.). «Эписомальные векторы для экспрессии генов в клетках млекопитающих: Эписомальные векторы для экспрессии эукариотических генов» . Европейский журнал биохимии . 267 (18): 5665–5678. дои : 10.1046/j.1432-1327.2000.01645.x . ПМИД 10971576 .
^ Конезе М., Ауриш К., Асенциони Ф. (декабрь 2004 г.). «Прогресс и перспективы генной терапии: эписомально поддерживаемые самовоспроизводящиеся системы». Генная терапия . 11 (24): 1735–1741. дои : 10.1038/sj.gt.3302362 . ПМИД 15385951 . S2CID 34565556 .
^ Пехачек С., Фетцер С., Байкер А., Боде Дж., Липпс Х.Дж. (январь 1999 г.). «Вектор, основанный на источнике репликации SV40 и хромосомных S/MAR, эписомально реплицируется в клетках CHO» . Исследования нуклеиновых кислот . 27 (2): 426–428. дои : 10.1093/нар/27.2.426 . ПМК 148196 . ПМИД 9862961 .
^ Хаасе Р., Аргирос О., Вонг С.П., Харботтл Р.П., Липпс Х.Дж., Огрис М. и др. (март 2010 г.). «pEPito: значительно улучшенный невирусный эписомальный вектор экспрессии для клеток млекопитающих» . БМК Биотехнология . 10 (1): 20. дои : 10.1186/1472-6750-10-20 . ПМЦ 2847955 . ПМИД 20230618 .
^ Роулинз Д.Р., Милман Дж., Хейворд С.Д., Хейворд Г.С. (октябрь 1985 г.). «Последовательность-специфическое связывание ДНК ядерного антигена вируса Эпштейна-Барр (EBNA-1) с кластерными сайтами в области поддержания плазмиды». Клетка . 42 (3): 859–868. дои : 10.1016/0092-8674(85)90282-X . ПМИД 2996781 . S2CID 9342392 .
^ Кэмпбелл, Аллан (1974), Кинг, Роберт К. (редактор), «Эписомы» , «Бактерии, бактериофаги и грибы: Том 1 » , Бостон, Массачусетс: Springer US, стр. 295–307, doi : 10.1007/978- 1-4899-1710-2_18 , ISBN 978-1-4899-1710-2 , получено 25 июня 2022 г.

[1] Ван Краененбрук, Кэтлин; Ванхонакер, Питер; Хэгеман, Гай (сентябрь 2000 г.). «Эписомальные векторы для экспрессии генов в клетках млекопитающих: Эписомальные векторы для экспрессии эукариотических генов» . Европейский журнал биохимии . 267 (18): 5665–5678. дои : 10.1046/j.1432-1327.2000.01645.x . ПМИД 10971576 .

[2] Конезе М., Ауриш К., Асенциони Ф. (декабрь 2004 г.). «Прогресс и перспективы генной терапии: эписомально поддерживаемые самовоспроизводящиеся системы». Генная терапия . 11 (24): 1735–1741. дои : 10.1038/sj.gt.3302362 . ПМИД 15385951 . S2CID 34565556 .

[3] Пехачек С., Фетцер С., Байкер А., Боде Дж., Липпс Х.Дж. (январь 1999 г.). «Вектор, основанный на источнике репликации SV40 и хромосомных S/MAR, эписомально реплицируется в клетках CHO» . Исследования нуклеиновых кислот . 27 (2): 426–428. дои : 10.1093/нар/27.2.426 . ПМК 148196 . ПМИД 9862961 .

[4] Хаасе Р., Аргирос О., Вонг С.П., Харботтл Р.П., Липпс Х.Дж., Огрис М. и др. (март 2010 г.). «pEPito: значительно улучшенный невирусный эписомальный вектор экспрессии для клеток млекопитающих» . БМК Биотехнология . 10 (1): 20. дои : 10.1186/1472-6750-10-20 . ПМЦ 2847955 . ПМИД 20230618 .

[5] Роулинз Д.Р., Милман Дж., Хейворд С.Д., Хейворд Г.С. (октябрь 1985 г.). «Последовательность-специфическое связывание ДНК ядерного антигена вируса Эпштейна-Барр (EBNA-1) с кластерными сайтами в области поддержания плазмиды». Клетка . 42 (3): 859–868. дои : 10.1016/0092-8674(85)90282-X . ПМИД 2996781 . S2CID 9342392 .

[6] Кэмпбелл, Аллан (1974), Кинг, Роберт К. (редактор), «Эписомы» , «Бактерии, бактериофаги и грибы: Том 1 » , Бостон, Массачусетс: Springer US, стр. 295–307, doi : 10.1007/978- 1-4899-1710-2_18 , ISBN 978-1-4899-1710-2 , получено 25 июня 2022 г.

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]