Боковая цепь
Ветвь
Боковая цепь
Кулон-цепочка
Олигомерное ответвление или полимерное макромолекулярной . цепиПримечания
- Олигомерную ветвь можно назвать короткоцепочечной ветвью .
- Полимерную ветвь можно назвать длинноцепочечной ветвью . [1]
В органической химии и биохимии боковая цепь — это химическая группа , которая прикреплена к основной части молекулы, называемой «основной цепью» или основной цепью . Боковая цепь представляет собой углеводородный разветвляющийся элемент молекулы, который присоединен к более крупной углеводородной цепи. Это один из факторов, определяющих свойства и реакционную способность молекулы. [2] Боковая цепь также известна как подвесная цепь , но боковая группа (боковая группа) имеет другое определение.
Конвенции
[ редактировать ]Заполнитель R часто используется в качестве общего заполнителя для боковых цепей алкильных (насыщенных углеводородных) групп на диаграммах химической структуры . Для обозначения других неуглеродных групп на структурных диаграммах X , Y или Z. часто используются
История
[ редактировать ]Символ R был введен французским химиком 19-го века Шарлем Фредериком Герхардом , который выступал за его принятие на том основании, что он будет широко узнаваемым и понятным, учитывая его соответствие на нескольких европейских языках начальной букве «корня» или «остатка»: Французский racine («корень») и résidu («остаток»), соответствующие английские переводы этих терминов, а также радикал (сам производный от латинского radix ниже), латинского radix («корень») и residuum («остаток») и немецкого языка. Остальное («остаток», а в контексте химии как «остаток», так и «радикал»). [3]
Использование
[ редактировать ]Органическая химия
[ редактировать ]В науке о полимерах боковая цепь олигомерного или полимерного ответвления простирается от основной цепи полимера. Боковые цепи оказывают заметное влияние на свойства полимера, главным образом на его кристалличность и плотность . Олигомерную ветвь можно назвать короткоцепочечной ветвью, а полимерную ветвь можно назвать длинноцепочечной ветвью. Боковые группы отличаются от боковых цепей; они не являются ни олигомерными, ни полимерными. [4]
Биохимия
[ редактировать ]В белках , которые состоят из аминокислотных остатков, боковые цепи присоединены к альфа- атомам углерода амидного остова . Боковая цепь, связанная с альфа-углеродом, специфична для каждой аминокислоты и отвечает за определение заряда и полярности аминокислоты. Боковые цепи аминокислот также отвечают за многие взаимодействия, которые приводят к правильному сворачиванию и функционированию белка . [5] Аминокислоты с одинаковой полярностью обычно притягиваются друг к другу, тогда как неполярные и полярные боковые цепи обычно отталкиваются. Неполярные/полярные взаимодействия все еще могут играть важную роль в стабилизации вторичной структуры из-за относительно большого их количества, происходящего по всему белку. [6] Пространственные положения атомов боковой цепи можно предсказать на основе геометрии основной цепи белка с использованием вычислительных инструментов для реконструкции боковой цепи. [7]
См. также
[ редактировать ]- Алкил
- Магистральная цепь
- Ветвление (химия полимеров)
- Функциональная группа
- Во время группы
- Остаток (химия)
- заместитель
- Зависимая от магистрали библиотека ротамеров
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Дженкинс, AD; Краточвил, П.; Степто, РФТ; Сутер, Вашингтон (1996). «Глоссарий основных терминов в науке о полимерах (Рекомендации ИЮПАК, 1996 г.)» (PDF) . Чистая и прикладная химия . 68 (12): 2287–2311. дои : 10.1351/pac199668122287 . S2CID 98774337 .
- ^ Уэйд, LG (2010). Органическая химия, 7-е издание . Река Аппер-Сэддл, Нью-Джерси: Пирсон Прентис Холл. стр. 70–78. ISBN 978-0-321-59231-6 .
- ^ Дженсен ВБ , Журнал химического образования 87 , 360 (2010)
- ^ Химия, Международный союз теоретической и прикладной химии. Сборник химической терминологии ИЮПАК . ИЮПАК. дои : 10.1351/goldbook.B00720 .
{{cite book}}:|website=игнорируется ( помогите ) - ^ Воэт, Дональд; Воэт, Джудит; Пратт, Шарлотта (2013). Основы биохимии: жизнь на молекулярном уровне (Четвертое изд.). John Wiley & Sons, Inc. Хобокен, Нью-Джерси: ISBN 9781118129180 .
- ^ Эндрю, компакт-диск; Пенель, С.; Джонс, Греция; Дойг, Эй Джей (1 декабря 2001 г.). «Стабилизация неполярных/полярных взаимодействий боковой цепи в альфа-спирали». Белки . 45 (4): 449–455. дои : 10.1002/прот.1161 . ISSN 0887-3585 . ПМИД 11746692 . S2CID 25739520 .
- ^ Бадачевска-Давид, Александра Е.; Колинский, Анджей; Кмичик, Себастьян (26 декабря 2019 г.). «Вычислительная реконструкция атомистических белковых структур по крупнозернистым моделям» . Журнал вычислительной и структурной биотехнологии . 18 : 162–176. дои : 10.1016/j.csbj.2019.12.007 . ISSN 2001-0370 . ПМК 6961067 . ПМИД 31969975 .