База данных Мительмана по хромосомным аберрациям и слияниям генов при раке
База данных Мительмана по хромосомным аберрациям и слияниям генов при раке — это база данных с бесплатным доступом, посвященная хромосомам, генам и раку. Впервые он был опубликован в 1983 году как книга под названием «Каталог хромосомных аберраций при раке» в Журнале цитогенетики и клеточной генетики, содержащая 3844 случая. [1] Последующие издания Каталога были опубликованы в 1985 г. (5345 ящиков), [2] 1988 год (9069 случаев), [3] 1991 год (14 141 случай), [4] 1994 г.(22 076 случаев), [5] и 1998 год (30 541 случай). [6] В 2000 году она стала онлайн-базой данных с открытым доступом, размещенной NCI (Национальным институтом рака).
Информация в базе данных Мительмана о хромосомных аберрациях и слияниях генов при раке связывает цитогенетические изменения и их геномные последствия, в частности слияния генов , с характеристиками опухоли , основываясь либо на отдельных случаях, либо на ассоциациях. Все данные были вручную отобраны из литературы Феликсом Мительманом в сотрудничестве с Бертилом Йоханссоном и Фредриком Мертенсом.
«Золотая жила цитогенетических данных, связанных с раком» (Центр биомедицинской информатики, Национальный институт рака, 2023 г.)
«Принимая во внимание весь прогресс, достигнутый в цитогенетике рака, без базы данных Мительмана все было бы гораздо медленнее». [7]
База данных Mitelman поддерживается NCI (Национальным институтом рака), Шведским онкологическим обществом и Шведским фондом детского рака. База данных обновляется ежеквартально в январе, апреле, июле и октябре.
База данных доступна в режиме онлайн ( https://mitelmandatabase.isb-cgc.org ) для поиска, связанного с цитогенетикой случаев , слиянием генов , клиническими ассоциациями, структурными или численными повторяющимися аберрациями и ссылками.
База данных в последний раз обновлялась 15 июля 2024 г.: общее количество случаев = 77 850, общее количество уникальных слияний генов = 34 009 и общее количество задействованных генов = 14 065. [8]
См. также
[ редактировать ]- Атлас генетики и цитогенетики в онкологии и гематологии
- База данных рака COSMIC
- Проект базы данных генома Ensembl
- Введите Джина
- ГенБанк
- Джин Вики
- Комитет по генной номенклатуре HUGO
- Международное агентство по исследованию рака
- Международная классификация онкологических заболеваний
- Онлайн-менделевское наследование у человека
- Браузер генома UCSC
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Мительман, Феликс (1983). «Каталог хромосомных аберраций при раке» . Цитогенетические и геномные исследования . 36 (1–2): 1–3. дои : 10.1159/000131930 . ПМИД 6627995 .
- ^ Мительман, Феликс (1985). Каталог хромосомных аберраций при раке (2-е изд.). Нью-Йорк: Лисс. п. 707. ИСБН 0-8451-2405-6 .
- ^ Мительман, Феликс (1988). Каталог хромосомных аберраций при раке (3-е изд.). Нью-Йорк: Лисс. п. 1146. ИСБН 0-8451-4248-8 .
- ^ Мительман, Феликс (1991). Каталог хромосомных аберраций при раке (4-е изд.). Нью-Йорк: Вили-Лисс. п. 1986. ISBN 0-471-56087-1 .
- ^ Мительман, Феликс (1994). Каталог хромосомных аберраций при раке (5-е изд.). Нью-Йорк: Вили-Лисс. п. 4252. ИСБН 0-471-11183-Х .
- ^ Мительман, Феликс (1998). Каталог хромосомных аберраций при раке '98 (6-е изд.). Нью-Йорк: Вили-Лисс. ISBN 0-471-17603-6 .
- ^ «Ресурсы по цитогеномике рака» .
- ^ «База данных Мительман: О проекте» . База данных Мительмана: Хромосомные аберрации и слияния генов при раке . Проверено 27 апреля 2023 г.