Галококк

Галококк
Научная классификация
Домен:	Архея
Королевство:	Эвриархеота
Тип:	Эвриархеота
Сорт:	Галобактерии
Заказ:	Галобактерии
Семья:	Галококковые
Род:	Галококк ; Шуп 1935 г.
Типовой вид
	Галококк литоралис ; (Поульсен, 1879 г.) Шуп, 1935 г.
Разновидность
	Х. агариликус ; Х. домбровский ; Х. hamelinensis ; Х. морруа ; Х. циндаоненсис ; H. сахаролитический ; H. salifodinae ; Х. соленый ; Х. седимикола ; Х. тайланденсис ;

Halococcus (распространенная аббревиатура: Hcc. ) род Halococcaceae — .

Экология

Halococcus — это род крайне галофильных архей, а это означает, что для оптимального роста им требуется высокий уровень соли, иногда до 32% NaCl. Галофилы встречаются главным образом во внутренних водоемах с высокой соленостью, где их пигменты (из белка, называемого родопсинбелком), окрашивают осадки в яркие цвета. Родопсинпротеин и другие белки служат для защиты Halococcus от экстремальной солености окружающей среды. Поскольку они могут функционировать в условиях такого высокого содержания соли, Halococcus и подобные галофильные организмы используются в пищевой промышленности и даже в продуктах по уходу за кожей.

Halococcus встречается в средах с высоким содержанием соли, в основном во внутренних водоемах с соленой водой, но некоторые из них могут находиться в сильно засоленной почве или пищевых продуктах. Пигментированные белки у некоторых видов вызывают красноватый оттенок, встречающийся в некоторых районах Мертвого моря и Большого Соленого озера, особенно в конце вегетационного периода. При культивировании организмы лучше всего росли в условиях высокой солености. ^[2]

Структура генома

Геном нескольких видов галококков был секвенирован. ^[3] 16-я рДНК вида ^{[ который? ]} продемонстрировал свое место на филогенетическом дереве . Благодаря потенциальному долголетию организмов, Halococcus может быть хорошим кандидатом для изучения таксономического сходства с жизнью, обнаруженной в космическом пространстве.

Структура клетки и метаболизм

Виды Halococcus способны выживать в средах с высоким содержанием соли благодаря хлорным насосам, которые поддерживают осмотический баланс с соленостью среды обитания и, таким образом, предотвращают обезвоживание цитоплазмы.

Клетки представляют собой кокки длиной 0,6–1,5 микрометра со стенками из сульфатированного полисахарида. Клетки органотрофны, используют аминокислоты, органические кислоты или углеводы для получения энергии. В некоторых случаях они также способны фотосинтезировать.

Филогения

Принятая в настоящее время таксономия основана на Списке названий прокариот, имеющих номенклатуру (LPSN). ^[1] и Национальный центр биотехнологической информации (NCBI). ^[2]

на основе 16S рРНК ДП _06_2022 ^[4]^[5]^[6]

53 маркерных белка на основе GTDB 08-RS214 ^[7]^[8]^[9]

H. salifodinae Denner et al. 1994 г.

	H. agarolyticus Minegishi et al. 2015 год

	H. saccharolyticus Montero et al. 1990 год

	H. hamelinensis Goh et al. 2006 г.

	H. saltus Chen et al. 2018 год

H. sediminicola Yim et al. 2014 год

H. thailandensis Namwong et al. 2007 год

H. qingdaonensis Wang et al. 2007 год

	Х. домбровский Стэн-Лоттер и др. 2002 г.

	H. morrhuae (Фарлоу 1880) Кокур и Ходжкисс 1973

Х. агариликус

	H. сахаролитический

	H. salifodinae

	Х. hamelinensis

	Х. соленый

Х. седимикола

H. morrhuae [вкл. Halococcus домбровский ]

	Х. циндаоненсис

	Х. тайланденсис

См. также

Список родов архей

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б Ж. П. Эзеби. «Халококк» . Список названий прокариот, имеющих номенклатуру (LPSN) . Проверено 17 ноября 2021 г.
^ Jump up to: ^а ^б Сэйерс; и др. «Халококк» . База данных таксономии Национального центра биотехнологической информации (NCBI) . Проверено 5 июня 2022 г.
^ «Полные геномы: Halococcus» .
^ «ЛТП» . Проверено 10 мая 2023 г.
^ «Дерево LTP_all в формате Ньюика» . Проверено 10 мая 2023 г.
^ «Примечания к выпуску LTP_06_2022» (PDF) . Проверено 10 мая 2023 г.
^ «Выпуск GTDB 08-RS214» . База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.
^ "ar53_r214.sp_label" . База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.
^ «История таксонов» . База данных таксономии генома . Проверено 10 мая 2023 г.

Дальнейшее чтение

Научные журналы

Орен А., Вентоза А. (2000). «Подкомитет Международного комитета по систематической бактериологии по таксономии Halobacteriaceae. Протоколы заседаний, 16 августа 1999 г., Сидней, Австралия» . Межд. Дж. Сист. Эвол. Микробиол . 50 (3): 1405–1407. дои : 10.1099/00207713-50-3-1405 . ПМИД 10843089 .
Шуп, Г. (1935). «Halococcuslitoralis, облигатный галофильный краситель». Немецкий ветеринарный еженедельник . 43 :817-820.

Научные книги

Гиббонс, штат Невада (1974). «Семейство V. Halobacteriaceae, сем. Ноябрь». В Р.Е. Бьюкенен; Н. Е. Гиббонс (ред.). Руководство Берджи по детерминативной бактериологии (8-е изд.). компании Williams & Wilkins Co. Балтимор: ISBN 0-683-01117-0 .

Эта археям статья, посвященная , незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[LPSN-1] Jump up to: ^а ^б Ж. П. Эзеби. «Халококк» . Список названий прокариот, имеющих номенклатуру (LPSN) . Проверено 17 ноября 2021 г.

[NCBI-2] Jump up to: ^а ^б Сэйерс; и др. «Халококк» . База данных таксономии Национального центра биотехнологической информации (NCBI) . Проверено 5 июня 2022 г.

[3] «Полные геномы: Halococcus» .

[4] «ЛТП» . Проверено 10 мая 2023 г.

[5] «Дерево LTP_all в формате Ньюика» . Проверено 10 мая 2023 г.

[6] «Примечания к выпуску LTP_06_2022» (PDF) . Проверено 10 мая 2023 г.

[about-7] «Выпуск GTDB 08-RS214» . База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.

[tree-8] "ar53_r214.sp_label" . База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.

[taxon_history-9] «История таксонов» . База данных таксономии генома . Проверено 10 мая 2023 г.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]