Преобразование в режиме реального времени, вызванное землетрясением

Конверсия, вызванная землетрясением в реальном времени ( RT-QuIC ) — это высокочувствительный анализ обнаружения прионов . ^{[ 1 ]}

Техника

Слово «трясение» в названии метода относится к тому факту, что образцы в анализе RT-QuIC буквально подвергаются встряхиванию. Это действие разрушает агрегаты прионного белка (PrP), которые затем инкубируются дальше, увеличивая количество неправильно свернутого PrP до обнаруживаемых уровней. ^{[ 2 ]}^{[ 3 ]}

Это «ранний, быстрый и специфичный анализ прионных заболеваний». Он может отбирать образцы нескольких типов, таких как спинномозговая жидкость (СМЖ), головной мозг , лимфатические узлы , кровь , мышцы и кожа , поэтому он применим для скрепи у овец, хронической истощающей болезни (ХИБ) у оленей, губчатой энцефалопатии крупного рогатого скота ( BSE) у коров и спорадическая болезнь Крейтцфельдта-Якоба у людей, среди других. ^{[ 4 ]}

В анализе RT-QuIC в избытке используются рекомбинантно полученные нормально свернутые прионы, часто усеченный белок сирийского хомячка, аминокислоты 90-231. Добавляют образцы, предположительно содержащие неправильно свернутые прионы, что приводит к неправильному сворачиванию и агрегации нормально свернутых прионов. Эти белковые агрегаты можно обнаружить с помощью тиофлавина Т в видимом спектре флуоресцентного обнаружения . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]} Центры по контролю и профилактике заболеваний включают положительный результат RT-QuIC в свои диагностические критерии вероятного диагноза сБКЯ. ^{[ 8 ]}

Анализы RT-QuIC также можно использовать для проверки на скрепи, BSE и CWD. Различные процедуры могут улучшить чувствительность и специфичность. Экстракция металла оксида железа (IOME) использует природное сродство прионного белка к металлу; образец инкубируется с магнитными шариками, которые связываются с прионным белком. Богатую прионами фракцию гранул впоследствии собирают и тестируют. ^{[ 9 ]}

Обычно тестируемыми тканями являются гомогенаты головного мозга и лимфатические ткани; однако прионы также были обнаружены в образцах кожи и крови. ^{[ 10 ]}^{[ 11 ]}^{[ 12 ]} Определенные ткани может быть трудно проверить на наличие прионов. Например, образцы крови, как правило, имеют низкий уровень циркулирующих внутриклеточных прионов и содержат ингибиторы анализа. ^{[ 13 ]}

См. также

Ссылки

^ Зерр, Инга; Крамм, Мария; да Силва Коррейя, Сусана Маргарида; Зафар, Сайма; Вильяр-Пике, Анна; Льоренс, Франк; Шмитц, Матиас (19 ноября 2020 г.). «Оптимизация конверсионного анализа, индуцированного землетрясением, в реальном времени для диагностики прионных заболеваний» . Границы биоинженерии и биотехнологии . 8 : 586890. дои : 10.3389/fbioe.2020.586890 . ISSN 2296-4185 . ПМЦ 7710546 . ПМИД 33330419 .
^ Левчук, Питер; Ридерер, Питер; О'Брайант, Сид Э.; Вербек, Марсель М.; Дюбуа, Брюно; Виссер, Питер Йелле; Еллингер, Курт А.; Энгельборгс, Себастьян; Рамирес, Альфредо; Парнетти, Лусилла; Джек, Клиффорд Р.; Теуниссен, Шарлотта Э.; Хампель, Харальд; Ллео, Альберто; Джессен, Фрэнк; Глодзик, Лидия; де Леон, Мони Дж.; Фэган, Энн М.; Молинуево, Хосе Луис; Янсен, Виллемейн Дж.; Винблад, Бенгт; Шоу, Лесли М.; Андреассон, Ульф; Отто, Марк; Молленхауэр, британец; Уилтфанг, Йенс; Тернер, Мартин Р.; Зерр, Инга; Гендельс, Рон; Томпсон, Александр Г.; Йоханссон, Гунилла; Эрманн, Наталья; Трояновский, Джон К.; Караджа, Илькер; Вагнер, Хольгер; Окл, Патрик; ван Валвейк ван Дорн, Линда; Бьерке, Мария; Капояннис, Димитриос; Куйперий, Х. Беа; Фаротти, Люсия; Ли, Йи; Гордон, Брайан А.; Эпельбаум, Стефан; Вос, Стефани Дж.Б.; Клин, Катарина Дж. М.; Ван Ностранд, Уильям Э.; Мингийон, Каролина; Шмитц, Матиас; Галло, Карла; Лопес Мато, Андреа; Тибо, Флоренция; Листа, Симона; Алколеа, Дэниел; Зеттерберг, Хенрик; Бленноу, Кай; Корнхубер, Йоханнес (27 октября 2017 г.). «Биомаркеры спинномозговой жидкости и крови при нейродегенеративной деменции: обновленная информация о консенсусе Целевой группы по биологическим маркерам в психиатрии Всемирной федерации обществ биологической психиатрии» . Всемирный журнал биологической психиатрии . 19 (4): 244–328. дои : 10.1080/15622975.2017.1375556 . ПМК 5916324 . ПМИД 29076399 .
^ Крамм, Мэри; Шмитц, Матиас; Карч, Эндрю; Митрова, Ева; Кун, Франциска; Шредер, Бой; Ребер, Алекс; Варгес, Даниэла; Ким, Ён-Сун; Сато, Кацуя; Коллинз, Стивен; Зерр, Инга (1 апреля 2015 г.). «Стабильность и воспроизводимость подчеркивают полезность RT-QuIC для диагностики болезни Крейтцфельдта-Якоба» . Молекулярная нейробиология . 53 (3): 1896–1904. дои : 10.1007/s12035-015-9133-2 . ПМЦ 4789202 . ПМИД 25823511 .
^ Атараши, Р.; Сано, К.; Сато, К.; Нисида, Н. (2011). «Преобразование, вызванное землетрясением, в реальном времени: высокочувствительный анализ обнаружения прионов» . Прион . 5 (3): 150–3. дои : 10.4161/при.5.3.16893 . ПМК 3226039 . ПМИД 21778820 .
^ Хейли, Нью-Джерси, Гувер Э.А. (2015). «Хроническая истощающая болезнь оленьих: современные знания и перспективы на будущее». Ежегодный обзор биологических наук о животных . 3 : 305–25. doi : 10.1146/annurev-animal-022114-111001 . ПМИД 25387112 .
^ Атараси Р , Сато К , Сано К , Фьюз Т , Ямагути Н , Исибаши Д , Мацубара Т , Накагаки Т , Яманака Х , Ширабе С , Ямада М , Мизусава Х , Китамото Т , Клуг Г , МакГлейд А , Коллинз С.Дж. , Нисида Н. (февраль 2011 г.). «Сверхчувствительное обнаружение прионов человека в спинномозговой жидкости путем преобразования, вызванного землетрясением, в реальном времени» (PDF) . Природная медицина . 17 (2): 175–78. дои : 10.1038/нм.2294 . hdl : 10069/25642 . ПМИД 21278748 . S2CID 11381303 .
^ Орру К.Д., Бонджани М., Тоноли Дж., Феррари С., Хьюсон А.Г., Гроувман Б.Р., Фиорини М., Поккьяри М., Монако С., Коги Б., Зануссо Дж. (август 2014 г.). «Тест на болезнь Крейтцфельдта-Якоба с использованием чистки носа » Медицинский журнал Новой Англии . 371 (6): 519–29. дои : 10.1056/NEJMoa1315200 . ПМЦ 4186748 . ПМИД 25099576 .
^ «Диагностические критерии CDC для болезни Крейцфельдта-Якоба (CJD), 2018» . Центры по контролю и профилактике заболеваний. 17 сентября 2018 года . Проверено 22 ноября 2018 г. Адаптировано из:
а) Глобальный надзор, диагностика и терапия трансмиссивных губчатых энцефалопатий человека: отчет консультации ВОЗ, февраль 1998 г., Женева, Швейцария;
б) Зерр и др. 2009 год
в) Национальное подразделение исследований и надзора за CJD. Протокол: наблюдение за CJD в Великобритании. Доступ к пункту c осуществлен 15 августа 2018 г.
Церр И, Калленберг К, Саммерс ДМ, Ромеро С, Таратуто А, Хайнеманн У, Брайтаупт М, Варгес Д, Мейснер Б, Ладогана А, Шуур М, Хайк С, Коллинз С.Дж., Янсен Г.Х., Стокин ГБ, Пиментел Дж, Хевер Э. , Колли Д. , Смит П. , Робертс Х , Брандел Дж. П. , ван Дуйн С , Поккиари М , Бег С., Крас П., Уилл Р.Г., Санчес-Джон П. (октябрь 2009 г.). «Обновленные клинические диагностические критерии спорадической болезни Крейцфельдта-Якоба» . Мозг 132 (Часть 10): 2659–68. дои : 10.1093/brain/awp191 . ПМЦ 2759336 . ПМИД 19773352 .
^ Денкерс Н.Д., Хендерсон Д.М., Матиасон К.К., Гувер Э.А. (август 2016 г.). «Улучшенное обнаружение прионов в биологических образцах путем экстракции магнитных частиц и преобразования, вызванного землетрясением, в реальном времени» . Джей Ген Вирол . 97 (8): 2023–2029. дои : 10.1099/jgv.0.000515 . ПМК 5903251 . ПМИД 27233771 .
^ Маммана А., Байарди С., Росси М., Франческини А., Донадио В., Капеллари С., Коги Б., Парчи П. (апрель 2020 г.). «Обнаружение прионов в биоптатах кожи пациентов с болезнью Крейтцфельдта-Якоба» . Энн Клин Трансл Нейрол . 7 (4): 559–564. дои : 10.1002/acn3.51000 . ПМЦ 7187701 . ПМИД 32141717 .
^ Конча-Марамбио Л., Прицков С., Мода Ф., Тальявини Ф., Айронсайд Дж.В., Шульц П.Е., Сото К. (декабрь 2016 г.). «Обнаружение прионов в крови пациентов с вариантом болезни Крейтцфельдта-Якоба» . Научный перевод Мед . 8 (370): 370ра183. doi : 10.1126/scitranslmed.aaf6188 . ПМЦ 5538786 . ПМИД 28003548 .
^ Орру С.Д., Юань Дж., Эпплби Б.С., Ли Б., Ли Ю., Виннер Д., Ван З., Жан Я.А., Роджерс М., Рарик Дж., Вайза Р.Э., Джоши Т., Ван Г.К., Коэн М.Л., Чжан С., Гроувман Б.Р., Петерсен Р.Б. , Айронсайд Дж.В., Киньонес-Матеу М.Э., Сафар Дж.Г., Конг К., Коги Б., Цзоу В.К. (ноябрь 2017 г.). «Активность посева прионов и инфекционность в образцах кожи пациентов со спорадической болезнью Крейтцфельдта-Якоба» . Научный перевод Мед . 9 (417). doi : 10.1126/scitranslmed.aam7785 . ПМК 5744860 . ПМИД 29167394 .
^ Орру CD, Уилхэм Дж.М., Раймонд Л.Д., Кун Ф., Шредер Б., Рабер А.Дж., Коги Б. (2011). «Анализ крови на прионную болезнь с использованием иммунопреципитации и улучшенной конверсии, вызванной землетрясением» . мБио . 2 (3): e00078–11. дои : 10.1128/mBio.00078-11 . ПМК 3101782 . ПМИД 21558432 .

[1] Зерр, Инга; Крамм, Мария; да Силва Коррейя, Сусана Маргарида; Зафар, Сайма; Вильяр-Пике, Анна; Льоренс, Франк; Шмитц, Матиас (19 ноября 2020 г.). «Оптимизация конверсионного анализа, индуцированного землетрясением, в реальном времени для диагностики прионных заболеваний» . Границы биоинженерии и биотехнологии . 8 : 586890. дои : 10.3389/fbioe.2020.586890 . ISSN 2296-4185 . ПМЦ 7710546 . ПМИД 33330419 .

[2] Левчук, Питер; Ридерер, Питер; О'Брайант, Сид Э.; Вербек, Марсель М.; Дюбуа, Брюно; Виссер, Питер Йелле; Еллингер, Курт А.; Энгельборгс, Себастьян; Рамирес, Альфредо; Парнетти, Лусилла; Джек, Клиффорд Р.; Теуниссен, Шарлотта Э.; Хампель, Харальд; Ллео, Альберто; Джессен, Фрэнк; Глодзик, Лидия; де Леон, Мони Дж.; Фэган, Энн М.; Молинуево, Хосе Луис; Янсен, Виллемейн Дж.; Винблад, Бенгт; Шоу, Лесли М.; Андреассон, Ульф; Отто, Марк; Молленхауэр, британец; Уилтфанг, Йенс; Тернер, Мартин Р.; Зерр, Инга; Гендельс, Рон; Томпсон, Александр Г.; Йоханссон, Гунилла; Эрманн, Наталья; Трояновский, Джон К.; Караджа, Илькер; Вагнер, Хольгер; Окл, Патрик; ван Валвейк ван Дорн, Линда; Бьерке, Мария; Капояннис, Димитриос; Куйперий, Х. Беа; Фаротти, Люсия; Ли, Йи; Гордон, Брайан А.; Эпельбаум, Стефан; Вос, Стефани Дж.Б.; Клин, Катарина Дж. М.; Ван Ностранд, Уильям Э.; Мингийон, Каролина; Шмитц, Матиас; Галло, Карла; Лопес Мато, Андреа; Тибо, Флоренция; Листа, Симона; Алколеа, Дэниел; Зеттерберг, Хенрик; Бленноу, Кай; Корнхубер, Йоханнес (27 октября 2017 г.). «Биомаркеры спинномозговой жидкости и крови при нейродегенеративной деменции: обновленная информация о консенсусе Целевой группы по биологическим маркерам в психиатрии Всемирной федерации обществ биологической психиатрии» . Всемирный журнал биологической психиатрии . 19 (4): 244–328. дои : 10.1080/15622975.2017.1375556 . ПМК 5916324 . ПМИД 29076399 .

[3] Крамм, Мэри; Шмитц, Матиас; Карч, Эндрю; Митрова, Ева; Кун, Франциска; Шредер, Бой; Ребер, Алекс; Варгес, Даниэла; Ким, Ён-Сун; Сато, Кацуя; Коллинз, Стивен; Зерр, Инга (1 апреля 2015 г.). «Стабильность и воспроизводимость подчеркивают полезность RT-QuIC для диагностики болезни Крейтцфельдта-Якоба» . Молекулярная нейробиология . 53 (3): 1896–1904. дои : 10.1007/s12035-015-9133-2 . ПМЦ 4789202 . ПМИД 25823511 .

[quic-4] Атараши, Р.; Сано, К.; Сато, К.; Нисида, Н. (2011). «Преобразование, вызванное землетрясением, в реальном времени: высокочувствительный анализ обнаружения прионов» . Прион . 5 (3): 150–3. дои : 10.4161/при.5.3.16893 . ПМК 3226039 . ПМИД 21778820 .

[2015CWDrev-5] Хейли, Нью-Джерси, Гувер Э.А. (2015). «Хроническая истощающая болезнь оленьих: современные знания и перспективы на будущее». Ежегодный обзор биологических наук о животных . 3 : 305–25. doi : 10.1146/annurev-animal-022114-111001 . ПМИД 25387112 .

[6] Атараси Р , Сато К , Сано К , Фьюз Т , Ямагути Н , Исибаши Д , Мацубара Т , Накагаки Т , Яманака Х , Ширабе С , Ямада М , Мизусава Х , Китамото Т , Клуг Г , МакГлейд А , Коллинз С.Дж. , Нисида Н. (февраль 2011 г.). «Сверхчувствительное обнаружение прионов человека в спинномозговой жидкости путем преобразования, вызванного землетрясением, в реальном времени» (PDF) . Природная медицина . 17 (2): 175–78. дои : 10.1038/нм.2294 . hdl : 10069/25642 . ПМИД 21278748 . S2CID 11381303 .

[7] Орру К.Д., Бонджани М., Тоноли Дж., Феррари С., Хьюсон А.Г., Гроувман Б.Р., Фиорини М., Поккьяри М., Монако С., Коги Б., Зануссо Дж. (август 2014 г.). «Тест на болезнь Крейтцфельдта-Якоба с использованием чистки носа » Медицинский журнал Новой Англии . 371 (6): 519–29. дои : 10.1056/NEJMoa1315200 . ПМЦ 4186748 . ПМИД 25099576 .

[cdc-8] «Диагностические критерии CDC для болезни Крейцфельдта-Якоба (CJD), 2018» . Центры по контролю и профилактике заболеваний. 17 сентября 2018 года . Проверено 22 ноября 2018 г. Адаптировано из:
а) Глобальный надзор, диагностика и терапия трансмиссивных губчатых энцефалопатий человека: отчет консультации ВОЗ, февраль 1998 г., Женева, Швейцария;
б) Зерр и др. 2009 год
в) Национальное подразделение исследований и надзора за CJD. Протокол: наблюдение за CJD в Великобритании. Доступ к пункту c осуществлен 15 августа 2018 г.
Церр И, Калленберг К, Саммерс ДМ, Ромеро С, Таратуто А, Хайнеманн У, Брайтаупт М, Варгес Д, Мейснер Б, Ладогана А, Шуур М, Хайк С, Коллинз С.Дж., Янсен Г.Х., Стокин ГБ, Пиментел Дж, Хевер Э. , Колли Д. , Смит П. , Робертс Х , Брандел Дж. П. , ван Дуйн С , Поккиари М , Бег С., Крас П., Уилл Р.Г., Санчес-Джон П. (октябрь 2009 г.). «Обновленные клинические диагностические критерии спорадической болезни Крейцфельдта-Якоба» . Мозг 132 (Часть 10): 2659–68. дои : 10.1093/brain/awp191 . ПМЦ 2759336 . ПМИД 19773352 .

[IOME-9] Денкерс Н.Д., Хендерсон Д.М., Матиасон К.К., Гувер Э.А. (август 2016 г.). «Улучшенное обнаружение прионов в биологических образцах путем экстракции магнитных частиц и преобразования, вызванного землетрясением, в реальном времени» . Джей Ген Вирол . 97 (8): 2023–2029. дои : 10.1099/jgv.0.000515 . ПМК 5903251 . ПМИД 27233771 .

[Skin-10] Маммана А., Байарди С., Росси М., Франческини А., Донадио В., Капеллари С., Коги Б., Парчи П. (апрель 2020 г.). «Обнаружение прионов в биоптатах кожи пациентов с болезнью Крейтцфельдта-Якоба» . Энн Клин Трансл Нейрол . 7 (4): 559–564. дои : 10.1002/acn3.51000 . ПМЦ 7187701 . ПМИД 32141717 .

[skin2-11] Конча-Марамбио Л., Прицков С., Мода Ф., Тальявини Ф., Айронсайд Дж.В., Шульц П.Е., Сото К. (декабрь 2016 г.). «Обнаружение прионов в крови пациентов с вариантом болезни Крейтцфельдта-Якоба» . Научный перевод Мед . 8 (370): 370ра183. doi : 10.1126/scitranslmed.aaf6188 . ПМЦ 5538786 . ПМИД 28003548 .

[blood-12] Орру С.Д., Юань Дж., Эпплби Б.С., Ли Б., Ли Ю., Виннер Д., Ван З., Жан Я.А., Роджерс М., Рарик Дж., Вайза Р.Э., Джоши Т., Ван Г.К., Коэн М.Л., Чжан С., Гроувман Б.Р., Петерсен Р.Б. , Айронсайд Дж.В., Киньонес-Матеу М.Э., Сафар Дж.Г., Конг К., Коги Б., Цзоу В.К. (ноябрь 2017 г.). «Активность посева прионов и инфекционность в образцах кожи пациентов со спорадической болезнью Крейтцфельдта-Якоба» . Научный перевод Мед . 9 (417). doi : 10.1126/scitranslmed.aam7785 . ПМК 5744860 . ПМИД 29167394 .

[Bloodtesting-13] Орру CD, Уилхэм Дж.М., Раймонд Л.Д., Кун Ф., Шредер Б., Рабер А.Дж., Коги Б. (2011). «Анализ крови на прионную болезнь с использованием иммунопреципитации и улучшенной конверсии, вызванной землетрясением» . мБио . 2 (3): e00078–11. дои : 10.1128/mBio.00078-11 . ПМК 3101782 . ПМИД 21558432 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]