Эсшерихия вирус Т5
| Эсшерихия вирус Т5 | |
|---|---|
| |
| Структурная модель бактериофага T5 в атомном разрешении [ 1 ] | |
Классификация вирусов 
| |
| (не вмешательство): | Вирус |
| Область : | Дуплоднавирия |
| Королевство: | Heunggongvirae |
| Филум: | Уровириката |
| Сорт: | Caudoviricetes |
| Заказ: | Каудовиралс |
| Семья: | Demerecviridae |
| Род: | Теквинтавирус |
| Разновидность: | Эсшерихия вирус Т5
|
| Синонимы [ 2 ] | |
| |
Вирус Escherichia T5 , иногда называемый бактериофагом T5, является каудальным вирусом в семействе Demerecviridae . Этот бактериофаг специфически заражает бактериальные клетки E. coli и следует литическому жизненному циклу .
Структура и геном
[ редактировать ]
T5 Вирион включает в себя 90 нанометрового икосаэдрического капсида (голова) и 250 нанометровый гибкий, не сокращающий хвост. [ 3 ]
Капсид содержит 1,750 пары оснований фага, двухцепочечный ДНК геном , который кодирует около 168 белков (теперь снижена до 162). [ 4 ] Геном имеет уникальную последовательность 111 613 п.н. с двумя идентичными большими прямыми терминальными повторениями 10 139 п.н. Когда последовательность генома была опубликована в 2005 году, только 61 (36,3%) из 168 кодированных белков были назначены функциями на основе гомологии для известных последовательностей. Более половины всех генов (92 или 54,7%) были предсказаны ORF, не имеющими сходства с любыми известными белками. [ 5 ] Количество нехарактерных белков остается высоким примерно на 50% генома (на основе последней аннотации эталонного протеома в Uniprot, 2021 ). [ 4 ]
Инфекция
[ редактировать ]Было показано, что бактериофаг T5 заражает E. coli внешней мембраны клетки хозяина после того, как его рецепторный связывающий белок PB5 связывается с транспортером , FHUA. Связывание запускает структурные изменения в PB5 и в конечном итоге приводит к высвобождению ДНК из фагового капсида. [ 6 ] [ 7 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Падилла-Санчес, Виктор (2024-01-06), структурная модель бактериофага T5 в атомном разрешении , DOI : 10.5281/Zenodo.5090191 , извлеченные 2024-01-06
- ^ Крупович, Март; и др. (Май 2015). «Чтобы переименовать все (522) существующий бактериальный вирус и 2 вида архаальных вирусов» (PDF) . Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV) . Получено 27 февраля 2020 года .
- ^ Эффантин Г. и др.: Структура бактериофага T5 выявляет сходство с HK97 и T4, предполагающие эволюционные отношения. J Mol Biol. (2006) 361, 993–1002, doi: 10.1016/j.jmb.2006.06.081
- ^ Jump up to: а беременный «Escherichia Phage T5 (Enterobacteria Phage T5)» . www.uniprot.org . Получено 2021-04-02 .
- ^ ; Ван, Цзян T5 " . Virology . 332 (1): 45–65. DOI : 10.1016/j.virol.2004.10.049 . ISSN 0042-6822 . PMID 15661140 .
- ^ Флайхан, а; Wien, F; Paternostre, M; Boulanger, P; Брейтон, C (сентябрь 2012 г.). «Новое понимание PB5, рецептор -связывающий белок бактериофага T5 и его взаимодействие с его рецептором Escherichia coli» . Биохими . 94 (9): 1982–9. doi : 10.1016/j.biochi.2012.05.021 . PMID 22659573 . S2CID 20354844 .
- ^ BASIT, H; Шиваджи Шарма, К; Van der Heyden, a; Гондран, C; Брейтон, C; Думи, P; Винник, FM; Labbé, P (11 мая 2012 г.). «Амфипол опосредованная поверхностная иммобилизация FHUA: платформа для обнаружения белка бактериофага PB5». Химическая связь . 48 (48): 6037–9. doi : 10.1039/c2cc31107k . PMID 22576748 . S2CID 19703515 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]
 | Эта статья, связанная с вирусом , является заглушкой . Вы можете помочь Википедии, расширив ее . |