ГенГИС

ГенГИС
	Биоразнообразие 19 морских метагеномов из Глобальной экспедиции по отбору проб океана .
Разработчик(и)	Донован Паркс, Майк Портер, Тимоти Манковски, Сувен Ван, Сильвия Черчер, Алекс Кедди, Кристиан Блуэн, Жаклин Уэлли, Стивен Брукс, Роб Бейко
Стабильная версия	2.5.3 / 22 апреля 2017 г .; 7 лет назад
Репозиторий	github .с /бейко-лаборатория / обменный курс ;
Операционная система	Windows, Mac OS X
Тип	Биоинформатика
Лицензия	Лицензия GPL v3
Веб-сайт	киви .cs .из .что /ГенГИС /Основной _Страница

ГенГИС ^[1] объединяет географические, экологические и филогенетические данные о биоразнообразии в единой интерактивной среде визуализации и анализа. Ключевой особенностью GenGIS является тестирование географических осей, которые могут соответствовать маршрутам миграции или градиентам, влияющим на сходство сообществ. ^[2] Данные также можно исследовать с помощью графических сводок данных по каждому сайту в виде 3D-геофилогении или пользовательских визуализаций, разработанных с использованием платформы плагинов. Предоставляются стандартные статистические тесты, такие как линейная регрессия и Mantel, а статистический язык R доступен непосредственно в GenGIS. С момента своего выпуска GenGIS используется для исследования филогеографии вирусов и бактериофагов, бактерий и эукариот.

См. также

Ссылки

^ Паркс, ДХ; Портер М; Черчер С; Ван С; Блуэн С; Уолли Дж; Брукс С; Бейко Р.Г. (2009). «GenGIS: геопространственная информационная система для геномных данных» . Геномные исследования . 19 (10): 1896–1904. дои : 10.1101/гр.095612.109 . ПМЦ 2765287 . ПМИД 19635847 .
^ Паркс, ДХ; Бейко Р.Г. (2009). «Количественная визуализация иерархически организованных данных в географическом контексте». 2009 17-я Международная конференция по геоинформатике . стр. 1–6. дои : 10.1109/ГЕОИНФОРМАТИКА.2009.5293552 . ISBN 978-1-4244-4562-2 . S2CID 22986133 . {{cite book}}: |journal= игнорируется ( помогите )

Внешние ссылки

Домашняя страница ГенГИС

[Parks2009-1] Паркс, ДХ; Портер М; Черчер С; Ван С; Блуэн С; Уолли Дж; Брукс С; Бейко Р.Г. (2009). «GenGIS: геопространственная информационная система для геномных данных» . Геномные исследования . 19 (10): 1896–1904. дои : 10.1101/гр.095612.109 . ПМЦ 2765287 . ПМИД 19635847 .

[ParksBeiko2009-2] Паркс, ДХ; Бейко Р.Г. (2009). «Количественная визуализация иерархически организованных данных в географическом контексте». 2009 17-я Международная конференция по геоинформатике . стр. 1–6. дои : 10.1109/ГЕОИНФОРМАТИКА.2009.5293552 . ISBN 978-1-4244-4562-2 . S2CID 22986133 . {{cite book}}: |journal= игнорируется ( помогите )

[1]

[2]