актино -ugpB Мотив РНК
![]() | В этой статье есть несколько проблем. Пожалуйста, помогите улучшить его или обсудите эти проблемы на странице обсуждения . ( Узнайте, как и когда удалять эти шаблонные сообщения )
|
Актино-угпБ | |
---|---|
![]() Консенсусная вторичная структура и консервативность последовательности РНК Actino-ugpB | |
Идентификаторы | |
Символ | Актино-угпБ |
Рфам | RF02927 |
Другие данные | |
РНК Тип | Джин ; мРНК |
ТАК | ТАК: 0001263 |
PDB Структуры | ПДБе |
Мотив Actino- ugpB РНК представляет собой консервативную структуру РНК , открытую биоинформатикой . [ 1 ]
Мотивы Actino- ugpB обнаружены у штаммов вида Gardnerella vaginalis , относящихся к типу Actinomycetota .
Неясно, функционируют ли РНК Actino- ugpB как цис-регуляторные элементы или они действуют в транс . Многие из РНК расположены выше гена «ugpB», который кодирует белок, предположительно участвующий в сахара транспорте . Однако некоторые РНК не расположены выше гена, кодирующего белок . Структурно мотив состоит из двух шпилек с консервативными нуклеотидами, расположенными в стеблях и снаружи шпилек, но не в их концевых петлях.
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Вайнберг З., Люнсе К.Э., Корбино К.А., Эймс Т.Д., Нельсон Дж.В., Рот А., Перкинс К.Р., Шерлок М.Е., Брейкер Р.Р. (октябрь 2017 г.). «Обнаружение 224 структурированных РНК-кандидатов путем сравнительного анализа конкретных подмножеств межгенных областей» . Нуклеиновые кислоты Рез . 45 (18): 10811–10823. дои : 10.1093/nar/gkx699 . ПМЦ 5737381 . ПМИД 28977401 .