Триходерма атровирид

Триходерма атровирид
Научная классификация
Домен:	Эукариоты
Королевство:	Грибы
Разделение:	Аскомикота
Сорт:	Сордариомицеты
Заказ:	Гипокреалес
Семья:	Гипокреевые
Род:	Триходерма
Разновидность:	Т. атровирид
Биномиальное имя
	Триходерма атровирид ; Вклад Чувствовать. Плавник. Нат. Люди 51: 363. (1892)
Синонимы
	Триходерма парсерамозная Trichoderma todica

Trichoderma atroviride — вид нитчатых грибов , обычно встречающийся в почве. ^{[ 1 ]} Этот вид грибов представляет особый интерес для исследователей из-за множества образуемых им вторичных метаболитов, которые используются в промышленности. ^{[ 1 ]} Род Trichoderma известен своим повсеместным распространением практически во всех почвах и простотой выращивания. Многие триходермы также являются авирулентными симбионтами растений . ^{[ 2 ]}

Таксономия

ДНК этого организма секвенировали и загрузили в базу данных NCBI. Сокращенное таксономическое описание следующее: Эукариоты; Грибы; Дикарья; Аскомикота; Пезизомикотин; Сордариомицеты; Гипокреомицеты; Гипокреалес; гипокреевые; Триходерма. Полный таксономический порядок можно найти на сайте NCBI. ^{[ 3 ]} Первое описание рода Trichoderma датируется 1794 годом, но отдельные виды не были указаны, и только в 1969 году была создана основа для идентификации видов Trichoderma . ^{[ 4 ]} Trichoderma atroviride также имеет несколько синонимов и старых названий, которые можно найти в таблице видов. ^{[ 5 ]}

Описание

На изображениях T. atroviride , растущих на чашках, видны зеленые плодовые тела и светочувствительные конидиации. На этих фотографиях также можно увидеть, как они растут в виде концентрических кругов на поверхности агара (см. изображение в рамке с видами). ^{[ 6 ]}^{[ 4 ]} Виды Trichoderma повсеместно описываются как имеющие длинные нитчатые гифы и способность прорастать на многих различных субстратах. Когда гриб растет, он сначала белый, но затем приобретает различные оттенки зеленого. Конидиеносцы обычно имеют неправильную форму и количество высвобождаемых конидий, а также светочувствительны и выделяются при воздействии света. ^{[ 7 ]} Наконец, триходерма известна своей быстрой скоростью роста и способностью колонизировать большинство субстратов. ^{[ 7 ]}

Среда обитания и экология

Trichoderma atroviride — довольно распространенные организмы, они встречаются в почвах как тропических, так и умеренных регионов по всему миру. ^{[ 8 ]} Этот гриб встречается на всех континентах, обычно в Европе, Северной и Южной Америке и Австралии (см. карту ареала). ^{[ 9 ]} T. atroviride является сапрофитом микопаразита, то есть он паразитирует на других грибах и получает пищу, поглощая растворенные органические вещества. ^{[ 10 ]} Т. атровирид обнаружен во многих субстратах, включая гниющую древесину и плодовые тела грибов. ^{[ 11 ]} и известно, что они могут использовать широкий спектр субстратов в качестве источников углерода и азота. Наконец, T. atroviride имеет широкий температурный диапазон выживаемости от -1 до 35°C. ^{[ 12 ]}

Актуальность для людей

Триходерма атровирид имеет множество применений, которые делают его полезным для человека. Они используются в качестве естественных средств биологической борьбы как с насекомыми, так и с другими грибами. ^{[ 13 ]} они могут поглощать загрязняющие вещества тяжелых металлов, ^{[ 14 ]} и их используют в качестве модельных организмов, чтобы лучше понять генетический контроль светозависимых механизмов. ^{[ 15 ]}

Фунгицид

Насекомые и патогенные грибы представляют собой серьезную угрозу сельскому хозяйству во всем мире. ^{[ 16 ]} К сожалению, синтетические пестициды и фунгициды могут быть вредными для окружающей среды и часто не очень эффективны в долгосрочной перспективе из-за эволюции. ^{[ 17 ]} Т. атровирид является микопаразитом и, следовательно, эффективным организмом, помогающим бороться с грибковыми патогенами растений. В частности, T. atroviride может конкурировать за питательные вещества и вырабатывать ферменты, разрушающие клеточную стенку гриба, чтобы убить грибок-хозяин. Кроме того, исследователи экспериментировали с геномом T. atroviride , чтобы заставить его экспрессировать еще более агрессивные фунгицидные агенты. ^{[ 18 ]} Кроме того, T. atroviride в настоящее время исследуется как метод защиты сельскохозяйственных культур от насекомых благодаря их способности производить натуральные инсектициды, с помощью которых они защищаются, поэтому их нельзя употреблять в пищу. ^{[ 13 ]}

Биоремедиация

Загрязнения, образующиеся в результате деятельности промышленности, представляют собой огромную экологическую проблему, решение которой обходится очень дорого. Недавно было обнаружено, что атровирид Т. способен поглощать некоторые из этих тяжелых металлов. Это наблюдалось in vitro на очистных сооружениях и в ходе исследований на чашках Петри. Этот тип биоремедиации может сыграть важную роль в решении кризисов, связанных с загрязнением тяжелыми металлами. ^{[ 14 ]}

Генетическая модель

Понимание биологических циркадных часов всегда было важно для изучения того, как организмы реагируют на раздражители. Хорошим модельным организмом для этого исследования является тот, который имеет четкую связь с абиотическими стимулами, легко воспроизводится и имеет геном, которым легко манипулировать. Т. атровирид отвечает обоим этим требованиям, поскольку он выпускает споры в ответ на свет и имеет консервативный геном, который можно редактировать с помощью известных генетических инструментов. Это позволило T. atroviride стать инструментальной моделью организма в исследованиях, направленных на понимание того, как организмы реагируют на раздражители. ^{[ 11 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б «Триходерма Атровирид — обзор | Темы ScienceDirect» . www.sciencedirect.com . Проверено 5 мая 2023 г.
^ Харман, Гэри Э.; Хауэлл, Чарльз Р.; Витербо, Ада; Чет, Илан; Лорито, Маттео (2004). «Виды Trichoderma — условно-патогенные, авирулентные растительные симбионты» . Обзоры природы Микробиология . 2 (1): 43–56. дои : 10.1038/nrmicro797 . ISSN 1740-1526 . ПМИД 15035008 . S2CID 17404703 .
^ Шох, Конрад Л; Чуфо, Стейси; Домрачев Михаил; Хоттон, Кэрол Л.; Каннан, Сивакумар; Хованская, Рогнеда; Лейпе, Детлеф; Маквей, Ричард; О'Нил, Кэтлин; Робберце, Барбара; Шарма, Шобха; Сусов Владимир; Салливан, Джон П; Сунь, Лу; Тернер, Шон (01 января 2020 г.). «Таксономия NCBI: комплексная обновленная информация о курировании, ресурсах и инструментах» . База данных . 2020 : baaa062. дои : 10.1093/база данных/baaa062 . ISSN 1758-0463 . ПМК 7408187 . ПМИД 32761142 .
^ Jump up to: ^а ^б Шустер, Андре; Шмолл, Моника (2010). «Биология и биотехнология триходермы» . Прикладная микробиология и биотехнология . 87 (3): 787–799. дои : 10.1007/s00253-010-2632-1 . ISSN 0175-7598 . ПМК 2886115 . ПМИД 20461510 .
^ «Виды грибов – синонимика видов» . www.speciesfungorum.org . Проверено 6 мая 2023 г.
^ Шустер, Андре; Шмолл, Моника (01 июля 2010 г.). «Биология и биотехнология триходермы» . Прикладная микробиология и биотехнология . 87 (3): 787–799. дои : 10.1007/s00253-010-2632-1 . ISSN 1432-0614 . ПМК 2886115 . ПМИД 20461510 .
^ Jump up to: ^а ^б «Триходерма» . Микология | Университет Аделаиды . Проверено 5 мая 2023 г.
^ Кубичек, Кристиан П; Эррера-Эстрелла, Альфредо; Зайдл-Зейбот, Верена; Мартинес, Диего А; Дружинина Ирина С; Тон, Майкл; Цайлингер, Сюзанна; Касас-Флорес, Серджио; Хорвиц, Бенджамин А; Мукерджи, Прасун К; Мукерджи, Мала; Кредич, Ласло; Алькарас, Луис Д; Аэртс, Андреа; Антал, Жужанна (2011). «Сравнительный анализ последовательности генома подчеркивает микопаразитизм как образ жизни предков триходермы» . Геномная биология . 12 (4): 40 рандов. дои : 10.1186/gb-2011-12-4-r40 . ISSN 1474-760X . ПМК 3218866 . ПМИД 21501500 .
^ Триходерма атровирид П.Карст. в Секретариате GBIF (2022 г.). Таксономия магистральной сети GBIF. Набор данных контрольного списка doi : 10.15468/39omei , доступ через GBIF.org 6 мая 2023 г.
^ Кубичек, Кристиан П; Эррера-Эстрелла, Альфредо; Зайдл-Зейбот, Верена; Мартинес, Диего А; Дружинина Ирина С; Тон, Майкл; Цайлингер, Сюзанна; Касас-Флорес, Серджио; Хорвиц, Бенджамин А; Мукерджи, Прасун К; Мукерджи, Мала; Кредич, Ласло; Алькарас, Луис Д; Аэртс, Андреа; Антал, Жужанна (2011). «Сравнительный анализ последовательности генома подчеркивает микопаразитизм как образ жизни предков триходермы» . Геномная биология . 12 (4): 40 рандов. дои : 10.1186/gb-2011-12-4-r40 . ISSN 1474-760X . ПМК 3218866 . ПМИД 21501500 .
^ Jump up to: ^а ^б Энрикес-Уррутиа, Марлен; Спаннер, Ребекка; Оливарес-Янес, Консуэло; Сегель-Авелло, Альдо; Перес-Лара, Родриго; Гильен-Алонсо, Эктор; Винклер, Роберт; Эррера-Эстрелла, Альфредо; Канесса, Пауло; Ларрондо, Луис Ф (11 августа 2022 г.). «Циркадные колебания атровирида Trichoderma и роль компонентов основных часов во вторичном метаболизме, развитии и микопаразитизме против фитопатогена Botrytis cinerea» . электронная жизнь . 11 : е71358. дои : 10.7554/eLife.71358 . ISSN 2050-084X . ПМЦ 9427114 . ПМИД 35950750 . S2CID 251493975 .
^ «Домой — Триходерма атровирид SC1 v1.0» . mycocosm.jgi.doe.gov . Проверено 6 мая 2023 г.
^ Jump up to: ^а ^б Поведа, Хорхе (2021). «Триходерма как средство биологической борьбы с вредителями: новые способы использования микопаразита» . Биологический контроль . 159 : 104634. doi : 10.1016/j.biocontrol.2021.104634 . hdl : 2454/41807 . S2CID 235522351 .
^ Jump up to: ^а ^б Лопес Эрраскин, Э; Васкес, К. (2003). «Толерантность и поглощение тяжелых металлов атровиридом Trichoderma, выделенным из ила» . Хемосфера . 50 (1): 137–143. Бибкод : 2003Chmsp..50..137L . дои : 10.1016/S0045-6535(02)00485-X . ПМИД 12656239 .
^ Рокас, Антонис (14 июля 2021 г.). Оценка редактора: Циркадные колебания атровирида Trichoderma и роль компонентов основных часов во вторичном метаболизме, развитии и микопаразитизме против фитопатогена Botrytis cinerea . дои : 10.7554/elife.71358.sa0 .
^ Новые направления биологических исследований в сельском хозяйстве . 1 января 1985 г. дои : 10.17226/13 . ISBN 978-0-309-07850-4 . ПМИД 25032394 .
^ Дэвис, Кэтрин Р.; Вольгемут, Франциска; Янг, Таран; Вайолет, Джозеф; Дикинсон, Мэтью; Сандерс, Ян-Виллем; Вальер, Синди; Эйвери, Саймон В. (2021). «Развивающиеся проблемы и стратегии борьбы с грибками в цепочке поставок продуктов питания» . Обзоры грибковой биологии . 36 : 15–26. дои : 10.1016/j.fbr.2021.01.003 . ПМЦ 8127832 . ПМИД 34084209 .
^ Бруннер, Курт; Цайлингер, Сюзанна; Силиенто, Розалия; Ву, Шеридиан Л.; Лорито, Маттео; Кубичек, Кристиан П.; Мах, Роберт Л. (2005). «Усовершенствование средства биоконтроля грибков атровирида триходерма для усиления как антагонизма, так и индукции устойчивости растений к системным заболеваниям» . Прикладная и экологическая микробиология . 71 (7): 3959–3965. Бибкод : 2005ApEnM..71.3959B . дои : 10.1128/АЕМ.71.7.3959-3965.2005 . ISSN 0099-2240 . ПМК 1168994 . ПМИД 16000810 .

[:0-1] Jump up to: ^а ^б «Триходерма Атровирид — обзор | Темы ScienceDirect» . www.sciencedirect.com . Проверено 5 мая 2023 г.

[2] Харман, Гэри Э.; Хауэлл, Чарльз Р.; Витербо, Ада; Чет, Илан; Лорито, Маттео (2004). «Виды Trichoderma — условно-патогенные, авирулентные растительные симбионты» . Обзоры природы Микробиология . 2 (1): 43–56. дои : 10.1038/nrmicro797 . ISSN 1740-1526 . ПМИД 15035008 . S2CID 17404703 .

[3] Шох, Конрад Л; Чуфо, Стейси; Домрачев Михаил; Хоттон, Кэрол Л.; Каннан, Сивакумар; Хованская, Рогнеда; Лейпе, Детлеф; Маквей, Ричард; О'Нил, Кэтлин; Робберце, Барбара; Шарма, Шобха; Сусов Владимир; Салливан, Джон П; Сунь, Лу; Тернер, Шон (01 января 2020 г.). «Таксономия NCBI: комплексная обновленная информация о курировании, ресурсах и инструментах» . База данных . 2020 : baaa062. дои : 10.1093/база данных/baaa062 . ISSN 1758-0463 . ПМК 7408187 . ПМИД 32761142 .

[:1-4] Jump up to: ^а ^б Шустер, Андре; Шмолл, Моника (2010). «Биология и биотехнология триходермы» . Прикладная микробиология и биотехнология . 87 (3): 787–799. дои : 10.1007/s00253-010-2632-1 . ISSN 0175-7598 . ПМК 2886115 . ПМИД 20461510 .

[5] «Виды грибов – синонимика видов» . www.speciesfungorum.org . Проверено 6 мая 2023 г.

[6] Шустер, Андре; Шмолл, Моника (01 июля 2010 г.). «Биология и биотехнология триходермы» . Прикладная микробиология и биотехнология . 87 (3): 787–799. дои : 10.1007/s00253-010-2632-1 . ISSN 1432-0614 . ПМК 2886115 . ПМИД 20461510 .

[:2-7] Jump up to: ^а ^б «Триходерма» . Микология | Университет Аделаиды . Проверено 5 мая 2023 г.

[8] Кубичек, Кристиан П; Эррера-Эстрелла, Альфредо; Зайдл-Зейбот, Верена; Мартинес, Диего А; Дружинина Ирина С; Тон, Майкл; Цайлингер, Сюзанна; Касас-Флорес, Серджио; Хорвиц, Бенджамин А; Мукерджи, Прасун К; Мукерджи, Мала; Кредич, Ласло; Алькарас, Луис Д; Аэртс, Андреа; Антал, Жужанна (2011). «Сравнительный анализ последовательности генома подчеркивает микопаразитизм как образ жизни предков триходермы» . Геномная биология . 12 (4): 40 рандов. дои : 10.1186/gb-2011-12-4-r40 . ISSN 1474-760X . ПМК 3218866 . ПМИД 21501500 .

[9] Триходерма атровирид П.Карст. в Секретариате GBIF (2022 г.). Таксономия магистральной сети GBIF. Набор данных контрольного списка doi : 10.15468/39omei , доступ через GBIF.org 6 мая 2023 г.

[10] Кубичек, Кристиан П; Эррера-Эстрелла, Альфредо; Зайдл-Зейбот, Верена; Мартинес, Диего А; Дружинина Ирина С; Тон, Майкл; Цайлингер, Сюзанна; Касас-Флорес, Серджио; Хорвиц, Бенджамин А; Мукерджи, Прасун К; Мукерджи, Мала; Кредич, Ласло; Алькарас, Луис Д; Аэртс, Андреа; Антал, Жужанна (2011). «Сравнительный анализ последовательности генома подчеркивает микопаразитизм как образ жизни предков триходермы» . Геномная биология . 12 (4): 40 рандов. дои : 10.1186/gb-2011-12-4-r40 . ISSN 1474-760X . ПМК 3218866 . ПМИД 21501500 .

[:3-11] Jump up to: ^а ^б Энрикес-Уррутиа, Марлен; Спаннер, Ребекка; Оливарес-Янес, Консуэло; Сегель-Авелло, Альдо; Перес-Лара, Родриго; Гильен-Алонсо, Эктор; Винклер, Роберт; Эррера-Эстрелла, Альфредо; Канесса, Пауло; Ларрондо, Луис Ф (11 августа 2022 г.). «Циркадные колебания атровирида Trichoderma и роль компонентов основных часов во вторичном метаболизме, развитии и микопаразитизме против фитопатогена Botrytis cinerea» . электронная жизнь . 11 : е71358. дои : 10.7554/eLife.71358 . ISSN 2050-084X . ПМЦ 9427114 . ПМИД 35950750 . S2CID 251493975 .

[12] «Домой — Триходерма атровирид SC1 v1.0» . mycocosm.jgi.doe.gov . Проверено 6 мая 2023 г.

[:4-13] Jump up to: ^а ^б Поведа, Хорхе (2021). «Триходерма как средство биологической борьбы с вредителями: новые способы использования микопаразита» . Биологический контроль . 159 : 104634. doi : 10.1016/j.biocontrol.2021.104634 . hdl : 2454/41807 . S2CID 235522351 .

[:5-14] Jump up to: ^а ^б Лопес Эрраскин, Э; Васкес, К. (2003). «Толерантность и поглощение тяжелых металлов атровиридом Trichoderma, выделенным из ила» . Хемосфера . 50 (1): 137–143. Бибкод : 2003Chmsp..50..137L . дои : 10.1016/S0045-6535(02)00485-X . ПМИД 12656239 .

[15] Рокас, Антонис (14 июля 2021 г.). Оценка редактора: Циркадные колебания атровирида Trichoderma и роль компонентов основных часов во вторичном метаболизме, развитии и микопаразитизме против фитопатогена Botrytis cinerea . дои : 10.7554/elife.71358.sa0 .

[16] Новые направления биологических исследований в сельском хозяйстве . 1 января 1985 г. дои : 10.17226/13 . ISBN 978-0-309-07850-4 . ПМИД 25032394 .

[17] Дэвис, Кэтрин Р.; Вольгемут, Франциска; Янг, Таран; Вайолет, Джозеф; Дикинсон, Мэтью; Сандерс, Ян-Виллем; Вальер, Синди; Эйвери, Саймон В. (2021). «Развивающиеся проблемы и стратегии борьбы с грибками в цепочке поставок продуктов питания» . Обзоры грибковой биологии . 36 : 15–26. дои : 10.1016/j.fbr.2021.01.003 . ПМЦ 8127832 . ПМИД 34084209 .

[18] Бруннер, Курт; Цайлингер, Сюзанна; Силиенто, Розалия; Ву, Шеридиан Л.; Лорито, Маттео; Кубичек, Кристиан П.; Мах, Роберт Л. (2005). «Усовершенствование средства биоконтроля грибков атровирида триходерма для усиления как антагонизма, так и индукции устойчивости растений к системным заболеваниям» . Прикладная и экологическая микробиология . 71 (7): 3959–3965. Бибкод : 2005ApEnM..71.3959B . дои : 10.1128/АЕМ.71.7.3959-3965.2005 . ISSN 0099-2240 . ПМК 1168994 . ПМИД 16000810 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

[ 15 ]

[ 16 ]

[ 17 ]

[ 18 ]