ST скоба

Штапель ST представляет собой распространенный из четырех или пяти аминокислотных остатков мотив в белках и полипептидах с серином или треонином в качестве С-концевого остатка. ^{[ 1 ]}^{[ 2 ]} Он характеризуется одинарной водородной связью между гидроксильной группой серина или треонина ( у остатка i +3 или i группой основной цепи +4) и карбонильной остатка i . Мотивы бывают двух типов, в зависимости от того, имеет ли мотив 4 или 5 остатков. Большинство скобок ST встречаются в сочетании с альфа-спиралью и обычно связаны с небольшим изгибом спирали. Для поиска и изучения основных элементов ST в белках доступны два веб-сайта: Motivated Proteins. ^{[ 3 ]} и PDBeMotif . ^{[ 4 ]}

Ссылки

^ Грей, ТМ; Мэтьюз Б.В. (1984). «Внутриспиральные водородные связи остатков серина, треонина и цистеина внутри α-спиралей. Актуальность для мембраносвязанных белков». Журнал молекулярной биологии . 175 (1): 75–82. дои : 10.1016/0022-2836(84)90446-7 . ПМИД 6427470 .
^ Бальестерос, Дж.А.; Деупи Икс (2000). «Остатки серина и треонина изгибают альфа-спирали в конформации chi (1) 5 g (-)» . Биофизический журнал . 79 (5): 2754–2760. Бибкод : 2000BpJ....79.2754B . дои : 10.1016/S0006-3495(00)76514-3 . ПМК 1301156 . ПМИД 11053148 .
^ Руководитель, ДП; Милнер-Уайт, Э.Дж. (2009). «Мотивированные белки: веб-приложение для изучения небольших трехмерных белковых мотивов» . БМК Биоинформатика . 10 (1): 60. дои : 10.1186/1471-2105-10-60 . ПМЦ 2651126 . ПМИД 19210785 .
^ Головин А; Хенрик К. (2008). «MSDmotif: изучение белковых сайтов и мотивов» . БМК Биоинформатика . 9 (1): 312. дои : 10.1186/1471-2105-9-312 . ПМК 2491636 . ПМИД 18637174 .

[1] Грей, ТМ; Мэтьюз Б.В. (1984). «Внутриспиральные водородные связи остатков серина, треонина и цистеина внутри α-спиралей. Актуальность для мембраносвязанных белков». Журнал молекулярной биологии . 175 (1): 75–82. дои : 10.1016/0022-2836(84)90446-7 . ПМИД 6427470 .

[2] Бальестерос, Дж.А.; Деупи Икс (2000). «Остатки серина и треонина изгибают альфа-спирали в конформации chi (1) 5 g (-)» . Биофизический журнал . 79 (5): 2754–2760. Бибкод : 2000BpJ....79.2754B . дои : 10.1016/S0006-3495(00)76514-3 . ПМК 1301156 . ПМИД 11053148 .

[3] Руководитель, ДП; Милнер-Уайт, Э.Дж. (2009). «Мотивированные белки: веб-приложение для изучения небольших трехмерных белковых мотивов» . БМК Биоинформатика . 10 (1): 60. дои : 10.1186/1471-2105-10-60 . ПМЦ 2651126 . ПМИД 19210785 .

[4] Головин А; Хенрик К. (2008). «MSDmotif: изучение белковых сайтов и мотивов» . БМК Биоинформатика . 9 (1): 312. дои : 10.1186/1471-2105-9-312 . ПМК 2491636 . ПМИД 18637174 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]