Аниндья Дутта
![]() | В этой статье есть несколько проблем. Пожалуйста, помогите улучшить его или обсудите эти проблемы на странице обсуждения . ( Узнайте, как и когда удалять эти шаблонные сообщения )
|
Аниндья Дутта | |
---|---|
Альма-матер |
|
Награды |
|
Научная карьера | |
Поля | Биохимия, биология рака |
Учреждения | Бригам и женская больница, Гарвардская медицинская школа, Медицинский факультет Университета Вирджинии, Университет Алабамы |
Аниндья Дутта — американский биохимик и исследователь рака индийского происхождения, с 2021 года заведующая кафедрой генетики Медицинской школы Бирмингемского университета Алабамы , а также заведующая кафедрой биохимии и молекулярной генетики в Университете Медицинская школа Вирджинии в 2011–2021 годах. Исследования Датты были сосредоточены на клеточном цикле млекопитающих с упором на репликацию и репарацию ДНК, а также на некодирующие РНК. Его особенно интересует, как дерегуляция этих процессов способствует прогрессированию рака. За свои достижения он был избран членом Американской ассоциации содействия развитию науки . [ 1 ] получил премию Ранбакси в области биомедицинских наук, премию «Выдающийся исследователь» от Американского общества исследований патологии , премию «Выдающийся ученый» от Университета Вирджинии и премию Марка Бразерса от Медицинской школы Университета Индианы .
Биография
[ редактировать ]Дутта родился в Калькутте, Индия. Он учился в Высшей средней школе Святого Патрика в Асансоле (1966–1974) и получил степень MBBS в Христианском медицинском колледже и больнице в Веллоре , получив диплом лучшего поступающего студента в 1982 году. После года работы научным сотрудником в Индийском институте медицины Химическая биология , Калькутта, он поступил в Университет Рокфеллера в Нью-Йорке на докторантуру у Хидесабуро Ханафуса , чтобы работать над вирусной онкологией. Он получил докторскую степень. в 1989 году.
Он присоединился к лаборатории Брюса Стиллмана в лаборатории Колд-Спринг-Харбор, чтобы провести постдокторское исследование регуляции клеточного цикла репликации ДНК. В 1992 году он начал ординатуру по анатомической патологии в Женской больнице Бригама Гарвардской медицинской школы , где впоследствии стал ассистентом, а затем доцентом кафедры патологии. В 2003 году он был назначен профессором биохимии и молекулярной генетики Гарри Ф. Берда на медицинском факультете Университета Вирджинии. В 2021 году он стал заведующим кафедрой генетики Медицинской школы Бирмингемского университета Алабамы .
Дутта обнаружил, как фактор клеточного цикла p21 взаимодействует и ингибирует циклин-зависимые киназы и PCNA, идентифицировав циклин-связывающий мотив Cy или RXL, который также используется cdk для идентификации субстратов для фосфорилирования. [ 2 ] [ 3 ] [ 4 ] Он обнаружил, как взаимодействие p21, Cdt1, Set8 и других важных регуляторов клеточного цикла с PCNA запускает их убиквитилирование с помощью CRL4-Cdt2 и последующую протеасомную деградацию. [ 5 ] [ 6 ] [ 7 ] [ 8 ] В его лаборатории клонированы кДНК многих факторов инициации репликации ДНК человека и их регуляторов (Orc3, Orc4, Orc5, Orc6, Cdc6, Cdt1, Cdc45, Mcm10, геминин). [ 9 ] [ 10 ] и определили, насколько важен баланс геминина-Cdt1 для предотвращения чрезмерной репликации в клетках человека. [ 11 ] [ 12 ] [ 13 ] [ 14 ] Эти открытия объяснили, как новый экспериментальный противораковый препарат MLN4924 ( Певонедистат ) вызывает чрезмерную репликацию ДНК и повреждение ДНК, приводящее к гибели раковых клеток. Лаборатория обнаружила E2 в пути анемии Фанкони, UBE2T, который, как теперь известно, вызывает анемию Фанкони (FANCT). [ 15 ] В ходе раннего внедрения геномных технологий в рамках пилотного проекта ENCODE лаборатория Датты молекулярно идентифицировала домены человеческих хромосом, которые реплицируются рано или поздно в S-фазе, и показала, что они соответствуют хромосомным доменам с активными или репрессивными эпигенетическими метками соответственно. [ 16 ] Он подтвердил, что большинство источников репликации в клетках человека представляют собой зоны с несколькими сайтами инициации, каждый из которых используется неэффективно в данной клетке в популяции клеток. [ 17 ] Лаборатория обнаружила десятки тысяч внехромосомных кругов ДНК (микроДНК) в нормальных и раковых клетках и тканях человека, мышей и кур, а также соматически мозаичные хромосомные микроделеции в некоторых «горячих точках» производства микроДНК. [ 18 ] МикроДНК высвобождается в кровоток и пополнит репертуар бесклеточной циркулирующей ДНК, которая используется для жидкой биопсии при раке и в пренатальной неинвазивной генетической диагностике. [ 19 ] Наконец, лаборатория обнаружила, как удаление генов MCM9 и ASF1a при некоторых видах рака человека делает раковые клетки восприимчивыми к терапии, вызывающей повреждение ДНК. [ 20 ] и что деубиквитиназа USP46 должна быть нацелена на терапию рака, вызванного вирусом папилломы человека. [ 21 ]
В области некодирующих РНК Датта обнаружил роль микроРНК, таких как miR-206, и длинных некодирующих РНК (lncRNA), таких как H19 и MUNC, в стимулировании дифференцировки и регенерации скелетных мышц после травмы. [ 22 ] [ 23 ] [ 24 ] Группа определила роль нескольких микроРНК в онкогенезе. [ 25 ] и множество длинных некодирующих РНК, уровни экспрессии которых предсказывают исход глиомы (например, DRAIC, LINC00152 или APTR), и позволяет предположить, что паттерны экспрессии днРНК могут использоваться в прогностических целях. [ 26 ] Дутта идентифицировал новое семейство коротких РНК, полученных в результате процессинга тРНК, называемое tRF. tRF становятся универсальными регуляторами клеточных функций, причем некоторые из них регулируют экспрессию клеточных генов с помощью микроРНК-подобных путей, хотя они не генерируются ферментами, которые обычно генерируют микроРНК. [ 27 ] [ 28 ] [ 29 ]
Почести и награды
[ редактировать ]- Национальный стипендиат, национальный стипендиат научных талантов, Индия (1975).
- Лучший поступающий студент, Христианский медицинский колледж, Веллор, Индия (1981).
- Постдокторская стипендия (1990 г.), премия младшего факультета (1993 г.) и премия научного сотрудника (2001 г.), Американское онкологическое общество.
- Премия за развитие исследовательской карьеры, Программа исследования рака молочной железы армии США (1994).
- Сотрудник Американской ассоциации развития науки (2007 г.)
- Премия Ранбакси за исследования в области фундаментальной биомедицинской науки (2009 г.)
- Профессор Гарри Ф. Берда (2003–2018 гг.), Заслуженный профессор Харрисона (2018 г.), Премия Millipub за статьи с > 1000 цитирований (2012 г.), Премия Team Science (2012 г.), Премия выдающегося ученого (2015 г.), Университет Вирджинии
- Премия выдающемуся исследователю Американского общества исследований патологии (2015 г.)
- Премия Марка Бразерса, Медицинский факультет Университета Индианы (2016)
Профессиональная деятельность
[ редактировать ]Через лабораторию Датты прошло более 75 стажеров (докторантов, докторантов и студентов, а также студентов), из которых более 30 в настоящее время занимают независимые должности, проводя исследования в научных кругах или промышленности. В качестве заведующего кафедрой биохимии и молекулярной генетики он нанял девять преподавателей и разработал направление исследований на кафедре — эпигенетику и геномику рака. Дутта работал редактором журнала биологической химии и старшим редактором отдела исследований рака. Он работал рецензентом в Национальных институтах здравоохранения, Программе исследования рака Вооруженных сил США, Cancer Research UK, Wellcome Trust UK, CNRS/INSERM во Франции, Австрийском научном фонде, программе Европейского Союза FP7, DBT-Wellcome Trust India Alliance , Institute. по фундаментальной науке (Корея), а также в комитете по внешнему обзору Фонда медицинских исследований Оклахомы и Университета Томаса Джефферсона . Датта был избран организатором двух Гордонских исследовательских конференций по пролиферации клеток и стабильности генома, а также организовал три собрания лаборатории Колд-Спринг-Харбор по репликации эукариотической ДНК и поддержанию генома. Он входил в программные комитеты ежегодных собраний Американское общество исследований патологии и Американское общество биохимии и молекулярной биологии .
Ссылки
[ редактировать ]- ^ «Годовой отчет AAAS за 2007 год» (PDF) . Американская ассоциация содействия развитию науки. п. 22.
- ^ Чен, Дж; Джексон, ПК; Киршнер, М.В.; Дутта, А. (23 марта 1995 г.). «Отдельные домены p21, участвующие в ингибировании киназы Cdk и PCNA». Природа . 374 (6520): 386–8. Бибкод : 1995Natur.374..386C . дои : 10.1038/374386a0 . ПМИД 7885482 . S2CID 4335260 .
- ^ Такеда, Д.Ю.; Вольшлегель, Дж. А.; Дутта, А. (19 января 2001 г.). «Двудольный мотив распознавания субстрата циклин-зависимых киназ» . Журнал биологической химии . 276 (3): 1993–7. дои : 10.1074/jbc.M005719200 . PMID 11067844 .
- ^ Чен, Дж; Саха, П; Корнблут, С; Динлахт, Б.Д.; Дутта, А. (сентябрь 1996 г.). «Мотивы, связывающие циклин, необходимы для функции p21CIP1» . Молекулярная и клеточная биология . 16 (9): 4673–82. дои : 10.1128/MCB.16.9.4673 . ПМК 231467 . ПМИД 8756624 .
- ^ Аббас, Т; Сибата, Э; Парк, Дж; Джа, С; Карнани, Н; Дутта, А. (8 октября 2010 г.). «CRL4(Cdt2) регулирует пролиферацию клеток и экспрессию генов гистонов, нацеливаясь на деградацию PR-Set7/Set8» . Молекулярная клетка . 40 (1): 9–21. doi : 10.1016/j.molcel.2010.09.014 . ПМЦ 2966975 . ПМИД 20932471 .
- ^ Аббас, Т; Дутта, А. (июнь 2009 г.). «p21 при раке: сложные сети и многочисленные действия» . Обзоры природы. Рак . 9 (6): 400–14. дои : 10.1038/nrc2657 . ПМЦ 2722839 . ПМИД 19440234 .
- ^ Аббас, Т; Шивапрасад, У; Тераи, К; Амадор, В; Пагано, М; Дутта, А. (15 сентября 2008 г.). «PCNA-зависимая регуляция убиквитилирования и деградации p21 через комплекс убиквитинлигазы CRL4Cdt2» . Гены и развитие . 22 (18): 2496–506. дои : 10.1101/gad.1676108 . ПМК 2546691 . ПМИД 18794347 .
- ^ Сенга, Т; Шивапрасад, У; Чжу, В; Парк, Дж. Х.; Ариас, Э.Э.; Уолтер, Джей Си; Дутта, А. (10 марта 2006 г.). «PCNA является кофактором деградации Cdt1 путем CUL4/DDB1-опосредованного N-концевого убиквитинирования» . Журнал биологической химии . 281 (10): 6246–52. дои : 10.1074/jbc.M512705200 . ПМИД 16407252 .
- ^ Белл, СП; Дутта, А (2002). «Репликация ДНК в эукариотических клетках». Ежегодный обзор биохимии . 71 : 333–74. doi : 10.1146/annurev.biochem.71.110601.135425 . ПМИД 12045100 .
- ^ Дхар, СК; Ёсида, К; Мачида, Ю; Хайра, П; Чаудхури, Б; Вольшлегель, Дж. А.; Леффак, М; Йейтс, Дж; Дутта, А. (10 августа 2001 г.). «Репликация oriP вируса Эпштейна-Барр требует человеческого ORC и ингибируется геминином» . Клетка . 106 (3): 287–96. дои : 10.1016/S0092-8674(01)00458-5 . ПМИД 11509178 .
- ^ Мачида, YJ; Дутта, А. (15 января 2007 г.). «Ингибитор APC/C, Emi1, необходим для предотвращения повторной репликации» . Гены и развитие . 21 (2): 184–94. дои : 10.1101/gad.1495007 . ПМК 1770901 . ПМИД 17234884 .
- ^ Мачида, YJ; Хэмлин, Дж.Л.; Дутта, А. (7 октября 2005 г.). «В нужном месте, в нужное время и только один раз: инициация репликации у многоклеточных животных» . Клетка . 123 (1): 13–24. дои : 10.1016/j.cell.2005.09.019 . ПМИД 16213209 .
- ^ Вазири, К; Саксена, С; Чон, Ю; Ли, С; Мурата, К; Мачида, Ю; Вагл, Н.; Хван, Д.С.; Датта, А. (апрель 2003 г.). «Р53-зависимый путь контрольной точки предотвращает повторную репликацию» . Молекулярная клетка . 11 (4): 997–1008. дои : 10.1016/S1097-2765(03)00099-6 . ПМИД 12718885 .
- ^ Вольшлегель, Дж. А.; Дуайер, Британская Колумбия; Дхар, СК; Цветич, К; Уолтер, Джей Си; Дутта, А. (22 декабря 2000 г.). «Ингибирование репликации эукариотической ДНК путем связывания геминина с Cdt1». Наука . 290 (5500): 2309–12. Бибкод : 2000Sci...290.2309W . дои : 10.1126/science.290.5500.2309 . ПМИД 11125146 .
- ^ Мачида, YJ; Дутта, А. (15 января 2007 г.). «Ингибитор APC/C, Emi1, необходим для предотвращения повторной репликации» . Гены и развитие . 21 (2): 184–94. дои : 10.1101/gad.1495007 . ПМК 1770901 . ПМИД 17234884 .
- ^ Проект ENCODE, Консорциум; Бирни, Э ; Стаматояннопулос, JA ; Дутта, А ; Гиго, Р; Гингерас, ТР; Маргулис, Э.Х.; Венг, З; Снайдер, М; Дермицакис, ET; Турман, Р.Э.; Кюн, М.С.; Тейлор, CM; Неф, С; Кох, СМ; Астана, С; Малхотра, А; Аджубей, И; Гринбаум, Дж.А.; Эндрюс, РМ; Фличек, П; Бойл, ПиДжей; Цао, Х; Картер, Северная Каролина; Клелланд, ГК; Дэвис, С; День, Н; Дхами, П; Диллон, Южная Каролина; и др. (14 июня 2007 г.). «Идентификация и анализ функциональных элементов в 1% генома человека в рамках пилотного проекта ENCODE» . Природа . 447 (7146): 799–816. Бибкод : 2007Natur.447..799B . дои : 10.1038/nature05874 . ПМК 2212820 . ПМИД 17571346 .
- ^ Карнани, Н; Тейлор, CM; Малхотра, А; Дутта, А. (1 февраля 2010 г.). «Геномное исследование инициации репликации в хромосомах человека выявило влияние регуляции транскрипции и структуры хроматина на выбор источника» . Молекулярная биология клетки . 21 (3): 393–404. дои : 10.1091/mbc.e09-08-0707 . ПМК 2814785 . ПМИД 19955211 .
- ^ Сибата, Ю; Кумар, П; Слой, Р; Уиллкокс, С; Гаган-младший; Гриффит, доктор медицинских наук; Дутта, А. (6 апреля 2012 г.). «Внехромосомные микроДНК и хромосомные микроделеции в нормальных тканях» . Наука . 336 (6077): 82–6. Бибкод : 2012Sci...336...82S . дои : 10.1126/science.1213307 . ПМК 3703515 . ПМИД 22403181 .
- ^ Кумар, П; Диллон, LW; Сибата, Ю; Джазаери, А.А.; Джонс, ДР; Дутта, А. (сентябрь 2017 г.). «Нормальные и раковые ткани выделяют в кровообращение внехромосомную кольцевую ДНК (вкДНК)» . Молекулярные исследования рака . 15 (9): 1197–1205. дои : 10.1158/1541-7786.MCR-17-0095 . ПМЦ 5581709 . ПМИД 28550083 .
- ^ Ли, Кентукки; Я, Дж.С.; Сибата, Э; Дутта, А. (5 октября 2017 г.). «ASF1a способствует восстановлению негомологичного соединения концов, способствуя фосфорилированию MDC1 с помощью ATM при двухцепочечных разрывах» . Молекулярная клетка . 68 (1): 61–75.e5. doi : 10.1016/j.molcel.2017.08.021 . ПМК 5743198 . ПМИД 28943310 .
- ^ Киран, С; Дар, А; Сингх, СК; Ли, Кентукки; Дутта, А. (6 декабря 2018 г.). «Дебиквитиназа USP46 необходима для пролиферации и роста опухолей при раке, трансформированном ВПЧ» . Молекулярная клетка . 72 (5): 823–835.e5. doi : 10.1016/j.molcel.2018.09.019 . ПМК 6294304 . ПМИД 30415951 .
- ^ Мюллер, AC; Цихевич, Массачусетс; Дей, БК; Слой, Р; Реон, Би Джей; Гаган-младший; Дутта, А. (февраль 2015 г.). «MUNC, длинная некодирующая РНК, которая облегчает функцию MyoD в скелетном миогенезе» . Молекулярная и клеточная биология . 35 (3): 498–513. дои : 10.1128/MCB.01079-14 . ПМЦ 4285423 . ПМИД 25403490 .
- ^ Дей, БК; Пфайфер, К; Дутта, А. (1 марта 2014 г.). «Длинная некодирующая РНК H19 дает начало микроРНК miR-675-3p и miR-675-5p, которые способствуют дифференцировке и регенерации скелетных мышц» . Гены и развитие . 28 (5): 491–501. дои : 10.1101/gad.234419.113 . ПМЦ 3950346 . ПМИД 24532688 .
- ^ Ким, Гонконг; Ли, Ю.С.; Шивапрасад, У; Малхотра, А; Дутта, А. (28 августа 2006 г.). «Мышечно-специфичная микроРНК миР-206 способствует дифференцировке мышц» . Журнал клеточной биологии . 174 (5): 677–87. дои : 10.1083/jcb.200603008 . ПМК 2064311 . ПМИД 16923828 .
- ^ Ли, Ю.С.; Дутта, А. (1 мая 2007 г.). «МикроРНК-супрессор опухоли let-7 подавляет онкоген HMGA2» . Гены и развитие . 21 (9): 1025–30. дои : 10.1101/gad.1540407 . ПМЦ 1855228 . ПМИД 17437991 .
- ^ Реон, Би Джей; Анайя, Дж; Чжан, Ю; Манделл, Дж; Пуроу, Б; Абунадер, Р; Дутта, А. (декабрь 2016 г.). «Экспрессия днРНК в глиомах низкой степени злокачественности и мультиформной глиобластоме: анализ in silico» . ПЛОС Медицина . 13 (12): e1002192. дои : 10.1371/journal.pmed.1002192 . ПМК 5140055 . ПМИД 27923049 .
- ^ Ли, Ю.С.; Сибата, Ю; Малхотра, А; Дутта, А. (15 ноября 2009 г.). «Новый класс малых РНК: фрагменты РНК, полученные из тРНК (tRF)» . Гены и развитие . 23 (22): 2639–49. дои : 10.1101/gad.1837609 . ПМЦ 2779758 . ПМИД 19933153 .
- ^ Кумар, П; Кушку, К; Дутта, А. (август 2016 г.). «Биогенез и функция фрагментов транспортной РНК (tRF)» . Тенденции биохимических наук . 41 (8): 679–689. дои : 10.1016/j.tibs.2016.05.004 . ПМЦ 5173347 . ПМИД 27263052 .
- ^ Кумар, П; Анайя, Дж; Мудунури, СБ; Дутта, А. (1 октября 2014 г.). «Метаанализ фрагментов РНК, полученных из тРНК, показывает, что они эволюционно консервативны и связаны с белками AGO для распознавания конкретных мишеней РНК» . БМК Биология . 12:78 . дои : 10.1186/s12915-014-0078-0 . ПМК 4203973 . ПМИД 25270025 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]- Сайт ДуттаЛаб
- Веб-сайт ЗАО «Генетика»
- сайт БМГ
- Публикации Датты в NCBI
- The New York Times о eccDNA с Аниндией Даттой (20 ноября 2019 г.)
- Текущее интервью Датты по биологии (7 декабря 2015 г.)
- Подкаст Шарлоттсвилля с Аниндией Даттой (30 ноября 2010 г.)
- Ежедневная научная газета о проекте «Происхождение репликации искусственных млекопитающих», возглавляемом Аниндья Датта (1 декабря 2005 г.)
- Живые люди
- Американские биологи XXI века
- Члены Американской ассоциации содействия развитию науки
- Факультет Университета Вирджинии
- Преподаватели Гарвардской медицинской школы
- Выпускники Рокфеллеровского университета
- Индийские эмигранты в США
- Американские биологи XX века
- Индийские биологи XX века
- Индийские биологи XXI века
- Американские биохимики XXI века
- Ученые из Калькутты