Трансформатор белок
Белок трансформатора (TFP), также известный как метаморфический белок, представляет собой белок , который может взаимосвязан между двумя или более фигур (также известных как складки ), каждый из которых имеет различную функцию. [ 1 ] [ 2 ]
Складка белка определяется тем, как складывается двумерный линейный белковый полипептид в трехмерную структуру . Большинство белков принимают единую стабильную складку. Но некоторые белки обладают предельной структурной стабильностью и могут быстро взаимосвязаться между двумя или более сгибами. [ 2 ] Считалось, что белковые структуры в данной среде полностью определяются их аминокислотной последовательности. [ 3 ] Эти белковые структуры обычно связаны с одной физиологической активностью белка. Эта гипотеза, однако, была оспорена наблюдениями о том, что белки могут складываться в двух альтернативных конформациях, таких как прионные белки, которые существуют в физиологически активной клеточной форме и нерастворимой форме. [ 4 ]
Было подсчитано, что до четырех процентов белков могут иметь это свойство складной цепочки. [ 2 ] Примеры метаморфических белков включают XCL1 , RFAH и KAIB . [ 2 ]
Rfah
[ редактировать ]Расширение концепции белка, который существует в растворимой и нерастворимой форме, для бактериального транскрипционного фактора RFAH было наблюдалось две совершенно разные структуры в растворе. [ 5 ] RFAH является белком с двумя доменами, C-концевой домен (CTD), из которого может быть складывается в альфа-спиральную и, альтернативно, в бета-сборрел. Эти две взаимосвязанные структуры имеют две разные функции, в альфа-спиральной форме CTD ингибирует связывание N-концевого домена с РНК-полимеразой, тогда как форма бета-обработки рекрутирует рибосомы. Таким образом, RFAH является первым членом класса белка трансформатора, который, очевидно, нарушает исходное предложение «одна последовательность - одна структура - одна функция», которое управляло исследование белка на протяжении десятилетий. [ 6 ] [ 7 ] [ 8 ]
Смотрите также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Caldwell E (19 июля 2012 г.). «Как трансформатор? Белок разворачивается и разбирается в новой функции» . ResearchNews.osu.edu. Архивировано из оригинала 26 июля 2012 года . Получено 14 сентября 2012 года .
- ^ Jump up to: а беременный в дюймовый Dishman AF, Volkman BF (июнь 2022 г.). «Дизайн и открытие метаморфических белков» . Современное мнение в структурной биологии . 74 : 102380. DOI : 10.1016/j.sbi.2022.102380 . PMC 9664977 . PMID 35561475 .
- ^ Anfinsen CB, Redfield RR, Choate WL, Page J, Carroll WR (март 1954 г.). «Исследования по грубой структуре, сшиванию и терминальных последовательностям в рибонуклеазе» . Журнал биологической химии . 207 (1): 201–210. doi : 10.1016/s0021-9258 (18) 71260-x . PMID 13152095 .
- ^ Prusiner SB, Scott MR, Dearmond SJ, Cohen Fe (май 1998). «Прионная биология белка» . Клетка . 93 (3): 337–348. doi : 10.1016/s0092-8674 (00) 81163-0 . PMID 9590169 .
- ^ Burmann BM, Knauer SH, Sevostyanova A, Schweimer K, Mooney RA, Landick R, et al. (Июль 2012 г.). «Переключатель α -спирали в β -ствол преобразует RFAH транскрипционного фактора в коэффициент трансляции» . Клетка . 150 (2): 291–303. doi : 10.1016/j.cell.2012.05.042 . PMC 3430373 . PMID 22817892 .
- ^ Knauer SH, Artsimovitch I, Rösch P (декабрь 2012 г.). «Трансформерный белок» . Клеточный цикл . 11 (23): 4289–4290. Doi : 10.4161/cc.22468 . PMC 3552902 . PMID 23095672 .
- ^ Knauer SH, Rösch P, Artsimovitch I (декабрь 2012 г.). «Преобразование: следующий уровень регулирования» . РНК -биология . 9 (12): 1418–1423. doi : 10.4161/rna.22724 . PMC 3679274 . PMID 23131843 .
- ^ «Трансформеры: наука, а не художественная литература‹ Крайли ‹pdbe‹ embl-ebi » . Белковый банк в Европе . Европейский институт молекулярной биологии. Архивировано с оригинала 15 сентября 2015 года . Получено 14 января 2022 года .