Хетомиум термофилум
| Хетомиум термофилум | |
|---|---|
Научная классификация 
| |
| Домен: | Эукариоты |
| Королевство: | Грибы |
| Разделение: | Аскомикота |
| Сорт: | Сордариомицеты |
| Заказ: | Сордариалес |
| Семья: | Четомиевые |
| Род: | Хетомий |
| Разновидность: | С. термофилум
|
| Биномиальное имя | |
| Хетомиум термофилум Прикосновение (1950)
| |
Chaetomium thermophilum — термофильный нитчатый гриб . Он растет на навозе или компосте (гнилой органике). Он примечателен тем, что является эукариотом и устойчив к высоким температурам (60 ° C). Оптимальная температура роста 50–55 °С. [ 1 ]
Исследовать
[ редактировать ]Поскольку грибы являются эукариотами и не далеки от животных, они являются хорошими моделями для сравнительных и простых в использовании исследований, а в случае C. thermophilum это имеет особое значение. Во-первых, учитывая тот факт, что он термофильный, белки, полученные из этого гриба, термостабильны и, следовательно, с ними легче работать. Белки C. thermophilum термофильны и поэтому лучше подходят для исследований (структурных и биохимических), чем сопоставимые мезофильные грибы. При изучении белков комплекса ядерных пор установлено, что выделение белков происходит более обильно и более растворимо, чем у дрожжей (белки дрожжей осаждаются при более низкой температуре). [ 2 ]
Геном и протеом
[ редактировать ]Геном C. thermophilum полностью секвенирован. Он занимает 28,3 МБ и кодирует 7227 предсказанных генов, кодирующих белки. [ 1 ] [ 3 ] Saccharomyces cerevisiae Модельные дрожжи имеют 73% гомологию белка с этим грибом.
Протеом C. thermophilum был изучен и идентифицировано 27 различных белковых сообществ, включая 108 взаимосвязанных комплексов. [ 4 ]
Модельная система для идентификации белковых взаимодействий высшего порядка
[ редактировать ]
Первое наблюдение метаболона в метаболизме жирных кислот с высоким разрешением произошло в результате криоэлектронного микроскопического анализа клеточных гомогенатов C. thermophilum . Другие белковые комплексы и взаимодействия более высокого порядка были предсказаны и подтверждены с использованием новой интеграции экспериментальных и вычислительных методов, которые включают протеомику, масс-спектрометрию сшивки, вычислительную структурную биологию и электронную микроскопию. На клеточных гомогенатах C. thermophilum получены структуры белковых комплексов с высоким разрешением, чистота нативного белкового комплекса < 40%. [ 4 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б Бок, Томас; Чен, Вэй-Хуа; Ори, Алессандро; Малик, Наяб; Сильва-Мартин, Ноэлла; Уэрта-Сепас, Хайме; Пауэлл, Шон Т.; Кастритис, Панайотис Л.; Смышляев, Георгий (16 декабря 2014 г.). «Комплексный подход к аннотации генома эукариотического термофила Chaetomium thermophilum» . Исследования нуклеиновых кислот . 42 (22): 13525–13533. дои : 10.1093/nar/gku1147 . ISSN 0305-1048 . ПМК 4267624 . ПМИД 25398899 .
- ^ Понимание структуры и сборки комплекса ядерных пор путем использования генома эукариотического термофила
- ^ «Генозимы, публичные геномы» . Genome.fungalgenomics.ca . Проверено 17 мая 2014 г.
- ^ Jump up to: а б Кастритис, Панайотис Л.; О'Рейли, Фрэнсис Дж.; Бок, Томас; Ли, Юаньюэ; Рогон, Мэтт З.; Бучак, Катажина; Романова, Наталья; Беттс, Мэтью Дж.; Буй, Кхань Хай (01 июля 2017 г.). «Захват белковых сообществ с помощью структурной протеомики у термофильных эукариот» . Молекулярная системная биология . 13 (7): 936. doi : 10.15252/msb.20167412 . ISSN 1744-4292 . ПМЦ 5527848 . ПМИД 28743795 .