Металлом
В биохимии металлом — это распределение металлов ионов в клеточном компартменте. Термин был придуман по аналогии с протеомом как [1] металломика - это изучение металлома: «комплексный анализ всех видов металлов и металлоидов в пределах клетки или типа ткани». [2] Поэтому металломику можно считать разделом метаболомики . [ нужна ссылка ] хотя металлы обычно не считаются метаболитами .
Альтернативное определение «металломов» как металлопротеинов или любых других металлосодержащих биомолекул и «металломики» как исследования таких биомолекул. [3]
Металлоинтерактом
[ редактировать ]При изучении металломов транскриптом , протеом и метаболом составляют целый металлом. Исследование металлома проводится для получения металлоинтерактома .
Металлотранскриптом
[ редактировать ]Металлотранскриптом [4] может быть определен как карта всего транскриптома в присутствии биологически или экологически значимых концентраций незаменимого или токсичного металла соответственно. Металлометаболом представляет собой полный пул мелких метаболитов в клетке в любой момент времени. Это приводит к образованию целого металлоинтерактома, и знание этого важно для сравнительной металломики, занимающейся вопросами токсичности и открытия лекарств. [4]
См. также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]Источники
[ редактировать ]- Банки, Люсия; Бертини, Ивано (2013). «Глава 1. Металломика и электролизер: некоторые определения и общие комментарии». В Банки, Люсия (ред.). Металломика и клетка . Ионы металлов в науках о жизни. Том. 12. Спрингер. стр. 1–13. дои : 10.1007/978-94-007-5561-1_1 . ISBN 978-94-007-5560-4 . ПМИД 23595668 . электронная книга ISBN 978-94-007-5561-1 ISSN 1559-0836 электронный- ISSN 1868-0402
- Харагути, Х. (2004). «Металломика как интегрированная биометалловедение». Журнал аналитической атомной спектрометрии . 19 :5–14. дои : 10.1039/b308213j .
- Мунику, С.; Шпунар, Дж.; Лобински, Р. (2009). «Металломика: понятие и методология». Обзоры химического общества . 38 (4): 1119–1138. дои : 10.1039/b713633c . ПМИД 19421584 .
- Шанкер, АК; Джанагираман, М.; Венкатешварлу, Б. (2009). «Взаимодействие хрома в растениях: современное состояние и будущие стратегии» . Металломика . 1 (5): 375–383. дои : 10.1039/b904571f . ПМИД 21305140 .
- Шпунар, Дж. (2005). «Достижения в аналитической методологии анализа бионеорганических видов: металломика, металлопротеомика и протеомика и метаболомика с метками гетероатомов». Аналитик . 130 (4): 442–465. Бибкод : 2005Ана...130..442С . дои : 10.1039/b418265k . ПМИД 15776152 .
- Уокетт, LP; Додж, AG; Эллис, LBM (2004). «Микробная геномика и таблица Менделеева» . Прикладная и экологическая микробиология . 70 (2): 647–655. дои : 10.1128/АЕМ.70.2.647-655.2004 . ПМК 348800 . ПМИД 14766537 .
- Уильямс, RJP (2001). «Химический отбор элементов клетками». Обзоры координационной химии . 216–217: 583–595. дои : 10.1016/s0010-8545(00)00398-2 .