Омикс
 | Вы можете помочь дополнить эту статью текстом, переведенным из соответствующей статьи на французском языке . (Май 2022 г.) Нажмите [показать], чтобы просмотреть важные инструкции по переводу. |
Отрасли науки, неофициально известные как омика, представляют собой различные дисциплины биологии , названия которых заканчиваются суффиксом -омика , такие как геномика , протеомика , метаболомика , метагеномика , феномика и транскриптомика . Омика направлена на коллективную характеристику и количественную оценку пулов биологических молекул, которые отражаются на структуре, функциях и динамике организма или организмов. [ 1 ]
Родственный суффикс -оме используется для обращения к объектам изучения таких областей, как геном , протеом или метаболом соответственно. Суффикс -оме , используемый в молекулярной биологии, относится к совокупности некоторой ; это пример «неосуффикса», образованного путем абстракции от различных греческих терминов в -ωμα , последовательности, которая не образует идентифицируемого суффикса в греческом языке.
Функциональная геномика направлена на выявление функций как можно большего числа генов данного организма. Он сочетает в себе различные методы -омики, такие как транскриптомика и протеомика с насыщенными коллекциями мутантов. [ 2 ]
Источник
[ редактировать ]
Оксфордский словарь английского языка ( OED ) выделяет три различные области применения суффикса -ome :
- в медицине образует существительные со значением «опухоль, опухоль».
- в ботанике или зоологии, образуя существительные в значении «часть животного или растения с определенным строением».
- в клеточной и молекулярной биологии образует существительные со смыслом «все составляющие, рассматриваемые вместе».
Суффикс -ome возник как вариант -oma и стал продуктивным в последней четверти XIX века. Первоначально он появился в таких терминах, как склером [ 3 ] или корневище . [ 4 ] Все эти термины происходят от греческих слов в -ωμα , [ 5 ] последовательность, которая не является одним суффиксом, но анализируется как -ω-μα , где -ω- принадлежит основе слова (обычно глагола), а -μα является настоящим греческим суффиксом, образующим абстрактные существительные.
OED предполагает, что его третье определение возникло как ответвление от митома , [ 6 ] Ранние свидетельства включают биом (1916 г.). [ 7 ] и геном (впервые названный немецким геномом в 1920 г.) [ 8 ] ). [ 9 ]
Ассоциация с хромосомой в молекулярной биологии обусловлена ложной этимологией . Слово хромосома происходит от греческих основ χρωμ(ατ) — «цвет» и σωμ(ατ) — «тело». [ 9 ] Хотя σωμα «тело» действительно содержит суффикс -μα , предшествующий -ω- слова не является суффиксом, образующим основу, а является частью корня . Поскольку геном относится к полной генетической структуре организма, нео-суффикс -оме предложил себя как относящийся к «целостности» или «завершенности». [ 10 ]
Биоинформатики и молекулярные биологи были одними из первых учёных, широко применивших суффикс «-оме». [ нужна ссылка ] Среди первых сторонников были биоинформатики из Кембриджа , Великобритания, где было много ранних лабораторий биоинформатики, таких как центр MRC , центр Сэнгера и EBI ( Европейский институт биоинформатики ); например, центр MRC осуществил первые проекты по геному и протеому. [ 11 ]
Текущее использование
[ редактировать ]Многие «омы», выходящие за рамки исходного « генома », стали полезными и получили широкое распространение учёных-исследователей. « Протеомика » прочно утвердилась как термин для изучения белков в больших масштабах. «Омес» может служить простым сокращением для инкапсуляции поля; например, исследование интерактомики явно связано с крупномасштабным анализом взаимодействий ген-ген, белок-белок или белок-лиганд. Исследователи быстро изучают омы и омики, о чем свидетельствует резкий рост использования этих терминов в PubMed с середины 1990-х годов. [ 12 ]
Виды омических исследований
[ редактировать ] | Этот раздел нуждается в дополнительных цитатах для проверки . ( Март 2022 г. ) |
Геномика
[ редактировать ]- Геномика : изучение геномов организмов .
- Когнитивная геномика : исследование изменений когнитивных процессов, связанных с генетическими профилями.
- Сравнительная геномика : изучение взаимосвязи структуры и функции генома различных биологических видов или штаммов.
- Функциональная геномика : описывает функции и взаимодействия генов и белков (часто использует транскриптомику).
- Метагеномика : исследование метагеномов , то есть генетического материала, полученного непосредственно из образцов окружающей среды.
- Нейрогеномика : изучение генетических влияний на развитие и функцию нервной системы.
- Пангеномика : исследование всей коллекции генов или геномов, обнаруженных у данного вида. [ 13 ]
- Персональная геномика : раздел геномики, занимающийся секвенированием и анализом генома человека. Как только генотипы станут известны, генотип человека можно сравнить с опубликованными в литературе, чтобы определить вероятность проявления признаков и риск заболевания. Помогает в персонализированной медицине
- Электромика: раздел геномики, изучающий роль экзогенных электрических полей в усилении профилей экспрессии генов в клетках, тканях и органоидах. [ 14 ]
Эпигеномика
[ редактировать ]Эпигеном — это поддерживающая структура генома, включающая связывающие белки и РНК, альтернативные структуры ДНК и химические модификации ДНК.
- Эпигеномика : современные технологии включают конформацию хромосом с помощью Hi-C , различные ChIP-секвенирование и другие методы секвенирования в сочетании с протеомным фракционированием, а также методы секвенирования, которые обнаруживают химическую модификацию цитозинов, такие как бисульфитное секвенирование.
- Нуклеомика: изучение полного набора геномных компонентов, которые образуют «ядро клетки как сложную динамическую биологическую систему, называемую нуклеомом». [ 15 ] [ 16 ] Консорциум 4D Nucleome официально присоединился к IHEC ( Международному консорциуму эпигенома человека ) в 2017 году.
Микробиомика
[ редактировать ]- Микробиом . определяется как характерное микробное сообщество, занимающее достаточно четко определенную среду обитания и имеющее отчетливые физико-химические свойства Микробиом относится не только к вовлеченным микроорганизмам, но и к сфере их деятельности, что приводит к образованию специфических экологических ниш . Микробиом, который образует динамичную и интерактивную микроэкосистему, склонную к изменениям во времени и масштабе, интегрирован в макроэкосистемы, включая эукариотических хозяев, и в этом случае имеет решающее значение для их функционирования и здоровья. [ 17 ]
- Культуромика (микробиология) — это высокопроизводительная культура клеток бактерий , целью которой является всесторонняя идентификация штаммов или видов в образцах, полученных из таких тканей, как кишечник человека , или из окружающей среды . [ 18 ] [ 19 ] [ 20 ]
Липидомика
[ редактировать ]Липидом — это полный набор клеточных липидов , включая модификации, внесенные в определенный набор липидов, вырабатываемых организмом или системой.
- Липидомика : крупномасштабное исследование путей и сетей липидов. Используются методы масс-спектрометрии.
Протеомика
[ редактировать ]Протеом , включая модификации , — это полный набор белков внесенные в определенный набор белков, вырабатываемых организмом или системой.
- Протеомика : крупномасштабное изучение белков, особенно их структуры и функций. Используются методы масс-спектрометрии.
- Хемопротеомика : набор методов, используемых для изучения взаимодействий белка и малых молекул.
- Иммунопротеомика : изучение больших наборов белков (протеомика), участвующих в иммунном ответе.
- Нутрипротеомика: определение молекулярных мишеней питательных и непитательных компонентов рациона. Использует данные протеомной масс-спектрометрии для исследований экспрессии белков.
- Протеогеномика : новая область биологических исследований на стыке протеомики и геномики. Данные протеомики, используемые для аннотаций генов.
- Структурная геномика : исследование трехмерной структуры каждого белка, кодируемого данным геномом, с использованием сочетания экспериментальных и модельных подходов.
гликомика
[ редактировать ]Гликомика – это комплексное изучение гликома, то есть сахаров и углеводов.
Фудомика
[ редактировать ]Фудомика была определена Алехандро Сифуэнтесом в 2009 году как «дисциплина, которая изучает области продуктов питания и питания посредством применения и интеграции передовых технологий омики для улучшения благосостояния, здоровья и знаний потребителей». [ 21 ] [ 22 ]
Транскриптомика
[ редактировать ]Транскриптом — совокупность всех молекул РНК , включая мРНК, рРНК, тРНК и другие некодирующие РНК, образующиеся в одной или в популяции клеток.
- Транскриптомика : изучение транскриптомов, их структуры и функций.
Метаболомика
[ редактировать ]Метаболом . — это ансамбль небольших молекул, находящихся в биологическом матриксе
- Метаболомика : Научное изучение химических процессов с участием метаболитов. Это «систематическое исследование уникальных химических отпечатков пальцев, которые оставляют после себя определенные клеточные процессы», изучение профилей их низкомолекулярных метаболитов.
- Метабономика : количественное измерение динамического многопараметрического метаболического ответа живых систем на патофизиологические стимулы или генетическую модификацию.
Питание, фармакология и токсикология
[ редактировать ]- Пищевая геномика : наука, изучающая взаимосвязь между геномом человека, питанием и здоровьем.
- Нутригенетика изучает влияние генетических вариаций на взаимодействие между диетой и здоровьем с последствиями для восприимчивых подгрупп.
- Нутригеномика : изучение влияния продуктов питания и их компонентов на экспрессию генов. Изучает влияние питательных веществ на геном, протеом и метаболом.
- Фармакогеномика исследует влияние суммы вариаций в геноме человека на лекарства;
- Фармакомикробиомика исследует влияние изменений микробиома человека на лекарства и наоборот.
- Токсикогеномика : область науки, которая занимается сбором, интерпретацией и хранением информации об активности генов и белков в конкретной клетке или ткани организма в ответ на токсичные вещества.
Культура
[ редактировать ]Вдохновленная фундаментальными вопросами эволюционной биологии, группа из Гарварда во главе с Жаном-Батистом Мишелем и Эрезом Либерманом Эйденом создала американский неологизм «культуромика» для применения сбора и анализа больших данных в культурных исследованиях . [ 23 ]
Разнообразный
[ редактировать ]
- Митоинтерактом
- Психогеномика : процесс применения мощных инструментов геномики и протеомики для лучшего понимания биологических основ нормального поведения и заболеваний головного мозга, которые проявляются как поведенческие отклонения. Конечная цель применения психогеномики к изучению наркозависимости — разработать более эффективные методы лечения этих расстройств, а также объективные диагностические инструменты, профилактические меры и, в конечном итоге, методы лечения.
- Геномика стволовых клеток : помогает в биологии стволовых клеток. Цель состоит в том, чтобы сделать стволовые клетки ведущей модельной системой для понимания биологии человека и болезненных состояний и, в конечном итоге, ускорить прогресс в области клинического применения.
- Коннектомика : изучение коннектома, совокупности нейронных связей в мозге.
- Микробиомика : изучение геномов сообществ микроорганизмов, обитающих в определенной экологической нише.
- Целломика : количественный анализ и исследование клеток с использованием методов биовизуализации и биоинформатики.
- Томомика: комбинация методов томографии и омики для понимания биохимии тканей или клеток с высоким пространственным разрешением, обычно с использованием данных масс-спектрометрии визуализации. [ 24 ]
- Вирусная метагеномика : использование методов омики в почве, океанской воде и людях для изучения вирома и вирома человека .
- Этомика: высокопроизводительное машинное измерение поведения животных. [ 25 ]
- Видеомика (или видеомика): парадигма видеоанализа, вдохновленная принципами геномики, где непрерывную последовательность изображений (или видео) можно интерпретировать как захват одного изображения, развивающегося во времени посредством мутаций, раскрывающих «сцену».
- Мультиомика : интеграция различных омик в одном конвейере исследования или анализа. [ 26 ]
1. Геномика: изучение генома, полного набора генов организма.
2. Протеомика: изучение протеома, всей совокупности белков в клетках организма.
3. Метаболомика : изучение метаболизма, а также функций и взаимодействий продуктов метаболического распада или метаболитов.
4. Транскриптомика: Исследование полного набора РНК в клетках организма.
5. Липидомика: изучение липидов и путей, участвующих в передаче сигналов липидов.
6. Эпигеномика: изучение химических модификаций ДНК и белков-гистонов, которые регулируют экспрессию генов без изменения последовательности ДНК.
7. Гликомика: изучение гликома, полного набора сахаров или гликанов в организме.
8. Феномика: Изучение явлений, физических и биохимических свойств организмов.
9. Гармакогеномика: Исследование того, как гены влияют на реакцию человека на лекарства.
10. Токсигеномика: Изучение влияния токсичных химических веществ на геном и экспрессию генов.
11. Нутригеномика: изучение взаимодействия между питанием и генами.
12. Микробиомика: Изучение микробных сообществ (микробиоты) и их коллективных геномов (микробиома).
13. Виромика: изучение вирусного сообщества и их взаимодействия внутри организма-хозяина.
14. Экскосомика: изучение совокупности воздействий окружающей среды на человека и их влияния на здоровье.
15. Коннектомика: Исследование нейронных связей в головном мозге.
16. Иммуномика: Изучение иммунной системы в омическом масштабе.
17. Интерактомика: Исследование взаимоотношений и взаимодействий между белками и другими молекулами.
18. Флюксомика: Исследование скорости метаболических реакций в биологической системе.
19. *Фосфопротеомика: изучение фосфорилированных белков и их роли в передаче сигналов и функционировании клеток.
20. Спликомика: изучение сплайсинга РНК и его вариаций в разных тканях и условиях.
21. Секретомика: изучение секретома, всего набора белков, секретируемых клеткой, тканью или организмом.
22. Деградомика: Изучение протеолитических ферментов (протеаз) и их субстратов.
23. Убихитиномика: изучение убиквитина и убиквитиноподобных белковых модификаций других белков.
24. Металломика: Исследование роли ионов металлов в биологических системах.
25. Редоксомика**: Изучение окислительно-восстановительных состояний и роли активных форм кислорода в клеточных процессах.
26. Летучимика**: Исследование летучих органических соединений, вырабатываемых живыми организмами.
27. Тераностика**: сочетание терапии и диагностики, часто изучаемое на уровне омики.
28. Цитомика**: Изучение клетки и ее функций на молекулярном уровне.
29. Сенсомика**: исследование сенсорного восприятия и связанных с ним молекул и путей.
30. Фудомика**: Применение технологий омики в исследованиях продуктов питания и питания.
31. Хрономика**: Изучение биологических ритмов и их молекулярных механизмов.
32. Пептидомика**: Изучение пептидов, их структуры, функций и роли в биологии.
33. Экогеномика**: Изучение генетического состава экологических сообществ и их взаимодействия с окружающей средой.
34. Патогеномика**: Изучение геномов возбудителей с целью понимания их биологии и взаимодействия с хозяевами.
35. Нуклеомика**: Изучение ядерных компонентов клеток, включая хроматин и ядерные тельца.
36. Одноклеточные омики**: изучение данных омиков на уровне отдельных клеток для понимания клеточной гетерогенности.
37. Онкомика**: изучение генов, белков и путей, связанных с раком.
38. Биомеханика омика**: Исследование механических свойств биологических молекул и структур.
39. Симбиомика**: Исследование симбиотических отношений на молекулярном уровне.
40. Интерактомика**: Исследование молекулярных взаимодействий в биологических системах, включая белок-белковые, белок-ДНК и белок-РНК взаимодействия.
41. Палеомика**: Исследование древних биологических материалов с помощью омических технологий.
42. Метиломика**: изучение закономерностей метилирования ДНК по всему геному.
43. Токсикоэпигеномика**: Изучение влияния токсинов окружающей среды на эпигенетические модификации.
44. Нейрогеномика**: Изучение генетических основ строения и функций нервной системы.
45. Иммунопептидомика**: изучение пептидов, представленных иммунной системой, особенно тех, которые связаны с молекулами MHC.
46. Фитомика**: Изучение геномов растений и их взаимодействия с окружающей средой.
47. Аутоиммуномика**: изучение молекулярных механизмов, лежащих в основе аутоиммунных заболеваний.
48. Агригеномика**: Применение геномики в сельском хозяйстве для улучшения производства сельскохозяйственных культур и животноводства.
49. Термогеномика**: Изучение генетических основ терморегуляции и теплопродукции в организмах.
50. Биомная омика**: Изучение генетического и молекулярного состава целых биомов (крупных экологических территорий).
51. Метагеномика**: изучение генетического материала, полученного непосредственно из образцов окружающей среды, минуя необходимость выделения и культивирования отдельных видов.
52. Астробиомика**: Исследование потенциальной жизни и биологических молекул в космической среде.
53. Коннектомика**: Исследование комплексных карт нейронных связей в мозге.
54. Киномика**: Исследование киназ и их роли в клеточной передаче сигналов.
55. Феномика**: изучение фенотипов по шкале омикс, отражающее физические и биохимические характеристики организмов.
56. Гликопротеомика**: изучение гликопротеинов, представляющих собой белки с присоединенными углеводными группами.
57. Нутрипротеомика**: Изучение влияния питательных веществ на протеом.
58. Эпитранскриптомика**: изучение химических модификаций молекул РНК и их влияния на экспрессию и функцию генов.
59. Гликолипидомика**: Изучение гликолипидов, сложных молекул, состоящих из углеводов и липидов.
60. Эндокриномика**: Исследование эндокринной системы и данные омики, связанные с гормонами.
61. Психомика**: Исследование молекулярной основы психологических и психиатрических состояний.
62. Интерактомика**: Комплексное изучение всех молекулярных взаимодействий в клетке.
63. Дистрибутомика**: изучение закономерностей распределения молекул внутри клеток или организмов.
64. Пангеномика**: изучение полного набора генов внутри вида, включая основные и дополнительные гены.
65. Адаптомика**: Изучение адаптивных изменений организмов на молекулярном уровне.
66. Серомика**: Исследование сывороточных белков и метаболитов.
67. Нейропротеомика**: Исследование протеома нервной системы.
68. Фитохимомика**: Изучение сложных химических соединений в растениях.
69. Агингомика**: изучение молекулярных и генетических факторов, участвующих в старении.
70. Радиогеномика**: Исследование взаимосвязи между генетическими вариациями и реакцией на лучевую терапию.
71. Иммуногеномика**: Изучение генетических основ функционирования и разнообразия иммунной системы.
72. Биогеомика**: Исследование геномной основы биоразнообразия и функционирования экосистем.
73. Вирогеномика**: Исследование вирусных геномов и их взаимодействия с организмами-хозяевами.
74. Дермомика**: Изучение молекулярных и генетических аспектов биологии кожи.
75. Аллергомика**: Изучение молекулярно-генетических основ аллергических реакций.
76. Плантомика**: Комплексное изучение биологии растений с использованием омических подходов.
77. Океаномика**: Исследование морских организмов и экосистем с использованием омических технологий.
78. Геномика паразитов**: Изучение геномов паразитических организмов.
79. Омика в аквакультуре**: Применение технологий омики для улучшения практики аквакультуры.
80. Эпигеномика**: Изучение полного набора эпигенетических модификаций генетического материала клетки.
81. Патофизиомика**: Изучение молекулярных и клеточных механизмов болезненных процессов.
82. Квантовая омика**: Исследование квантово-механических свойств биологических молекул и их влияния на биологические функции.
83. Термогеномика**: Исследование генетических основ терморегуляции в организмах.
84. Хрономика**: Изучение биологических ритмов и их молекулярных основ.
85. Синтеомика**: изучение подходов синтетической биологии с использованием данных омики для проектирования и создания новых биологических частей, устройств и систем.
86. Холобионтная омика**: Изучение данных омики хозяина и связанной с ним микробиоты как единой экологической единицы.
87. Экофизиомика**: Изучение взаимодействий между физиологическими функциями организмов и окружающей их средой на омическом уровне.
88. Резистомика**: Изучение генов устойчивости к антибиотикам и их механизмов.
89. Аптамеромика**: исследование аптамеров, коротких молекул ДНК или РНК, которые связываются со специфическими мишенями, и их применение.
90. Вируломика**: Изучение факторов вирулентности и механизмов патогенности микробов.
91. Микомика**: Изучение геномов грибов и их биологических функций.
92. Фотомика**: Исследование взаимодействия света и биологических систем.
93. Наноника**: Исследование наноматериалов и их взаимодействия с биологическими системами с использованием омических подходов.
94. Аллергеномика**: Изучение аллергенов и молекулярных основ аллергических реакций.
95. Ксенобиомика**: Изучение воздействия чужеродных веществ (ксенобиотиков) на биологические системы.
96. Физиомика**: Исследование физиологических аспектов биологических систем в масштабе омика.
97. Психогеномика**: Исследование генетических и молекулярных основ психологических особенностей и расстройств.
98. Метиломика**: изучение закономерностей метилирования ДНК и их влияния на экспрессию генов.
99. Кардиомика**: Изучение молекулярно-генетических основ сердечно-сосудистой функции и заболеваний.
100. Деградомика**: Изучение протеолитических процессов и путей деградации белков.
101. Астробиомика**: Исследование потенциала жизни и биологических процессов во внеземной среде.
102. Геономика**: Исследование генетических основ геологических и геобиологических процессов.
103. Радиомика**: изучение количественных характеристик медицинских изображений и их связи с клиническими результатами.
104. Биомная омика**: изучение генетических, молекулярных и экологических взаимодействий внутри биомов.
105. Аллостеромика**: Изучение аллостерических сайтов и их регуляторной роли в функции белков.
106. Биотермодинамика**: Исследование термодинамических свойств биологических молекул и систем с использованием омических подходов.
107. Антропомика**: Исследование человеческого разнообразия и эволюции с использованием данных омики.
108. Коннектомика**: Исследование нейронных связей в мозге и нервной системе.
109. Аутофагомика**: изучение процесса аутофагии на уровне омики.
110. Фотогеномика**: Исследование влияния света на экспрессию генов и клеточные функции.
111. Аэромика**: Исследование переносимых по воздуху биологических частиц и их воздействия на здоровье и окружающую среду.
112. Эпитранскриптомика**: изучение химических модификаций молекул РНК и их влияния на экспрессию и функцию генов.
113. Радиогеномика**: Исследование взаимосвязи между геномными особенностями и ответом на лучевую терапию.
114. Нефромика**: Изучение почек и их функций на молекулярном уровне.
115. Дерматомика**: Изучение кожи, ее молекулярного состава и функций.
116. Ксеномика**: Изучение эффектов и взаимодействий чужеродного генетического материала, введенного в организм.
117. МикроРНКомика**: Исследование микроРНК и их роли в регуляции экспрессии генов.
118. Синтетическая омика**: Исследование и проектирование синтетических биологических систем с использованием данных омики.
119. Энвирономика**: Исследование взаимодействий организмов со средой их обитания с использованием омических технологий.
120. Палеомика**: Исследование древних биологических материалов и их молекулярной информации.
121. Регуломика**: Исследование регуляторных сетей и их роли в экспрессии генов.
122. Патобиомика**: изучение путей и механизмов заболеваний по шкале омикс.
123. Эволвомика**: Исследование эволюционных процессов и закономерностей с использованием данных омики.
124. Термобиомика**: Исследование влияния температуры на биологические молекулы и системы.
125. Циркадиомика**: изучение циркадных ритмов и их молекулярных основ.
126. Наномика**: Исследование наномасштабных биологических процессов и материалов.
127. Метапротеомика**: Исследование коллективного содержания белков в пробах окружающей среды.
128. Биомеханика омика**: Исследование механических свойств биологических молекул и систем.
129. Омика рака**: Исследование молекулярной основы рака, включая онкогеномику и протеомику рака.
130. Омика синтетической биологии**: Применение технологий омики для проектирования и создания новых биологических частей, устройств и систем.
131. Гутомика**: изучение микробиома кишечника и его взаимодействия с хозяином.
132. Нутригеномика**: Исследование связи между питанием и геномом.
133. Омика растений**: Комплексное исследование биологии растений с использованием подходов омики.
134. Инфектомика**: Изучение молекулярных механизмов инфекционных болезней.
135. Микробиомика**: Изучение микробных сообществ и их функций.
136. Сексомика**: Исследование молекулярных основ половых различий в биологии.
137. Биомеханомика**: Исследование взаимодействия механических сил и биологических систем.
138. Нейрогеномика**: Изучение генетических основ неврологических функций и нарушений.
139. Омеомика**: Изучение связей и взаимодействий между различными омами (геномом, протеомом и т. д.).
140. Иммунотранскриптомика**: Исследование транскриптома иммунных клеток.
141. Нервомика**: Изучение нервной системы и ее молекулярных компонентов.
142. Эмбриомика**: Изучение молекулярно-генетических процессов эмбрионального развития.
143. Агингомика**: Исследование молекулярных основ старения.
144. Фотопротеомика**: исследование белков, участвующих в светочувствительности и реакции.
145. Гематомика**: Изучение молекулярного состава и функции крови.
146. Биофотоника омика**: Исследование взаимодействия света с биологическими материалами на уровне омики.
147. Анатомия**: Изучение молекулярных основ анатомических структур.
148. Микобиомика**: изучение грибковых сообществ и их взаимодействия с хозяином или окружающей средой.
149. Патогеномика**: Изучение геномов возбудителей.
150. Симбиомика**: Изучение симбиотических отношений на молекулярном уровне.
151. Аквомика**: Изучение водных организмов и их молекулярная биология.
152. Бактериомика**: Изучение бактерий и их геномов.
153. Биомаркеромика**: Исследование биомаркеров с использованием омических технологий для выявления и мониторинга заболеваний.
154. Кардиомика**: Исследование сердечно-сосудистой системы на молекулярном уровне.
155. Целломика**: изучение структуры, функций и поведения клеток с использованием высокопроизводительных методов.
156. Хемогеномика**: Изучение реакции генома на химические соединения.
157. Криомика**: Исследование биологических молекул и систем в условиях низких температур.
158. Дистрибутомика**: Исследование пространственного распределения молекул внутри клеток и тканей.
159. Экосистемная омика**: исследование целых экосистем с использованием омических подходов.
160. Энергетика омика**: Исследование потоков энергии и обмена веществ в биологических системах.
161. Гастромика**: Изучение желудочно-кишечной системы и ее микробиоты.
162. Генная омика**: Исследование подходов к генной терапии и их эффектов на уровне омики.
163. Гормономика**: Изучение гормонов и их молекулярных путей.
164. Гидратомика**: Исследование гидратного состояния биологических молекул и систем.
165. Инфламомика**: Изучение воспаления и его молекулярных путей.
166. Металлопротеомика**: Изучение металлопротеинов и их роли в биологии.
167. Морфомика**: Изучение формы и строения организмов и их молекулярной основы.
168. Нервомика**: Изучение нервной системы и ее молекулярного состава.
169. Нейрохимомика**: Изучение химических процессов в нервной системе.
170. Нутриомика**: Исследование взаимодействия питательных веществ и генома.
171. Окуляромика**: Исследование глаза и его молекулярная биология.
172. Оптогеномика**: Исследование генетических основ восприятия и реакции света.
173. Органомика**: Изучение конкретных органов на молекулярном уровне.
174. Паразитомика**: Изучение паразитов и их взаимодействия с хозяевами.
175. Патофеномика**: Изучение фенотипов заболеваний и их молекулярной основы.
176. Фармакомика**: Изучение лекарственных средств и их влияния на геном и протеом.
177. Полиомика**: изучение сложных взаимодействий между множеством омов (генома, протеома и т. д.).
178. Психомика**: Изучение молекулярной основы психологических черт и расстройств.
179. Пульмономика**: Исследование легких и дыхательной системы на молекулярном уровне.
180. Репродуктомика**: Исследование репродуктивных систем и их молекулярной биологии.
181. Респиромика**: Изучение дыхательной системы и ее молекулярных функций.
182. Селеномика**: Исследование роли селена в биологии.
183. Сексомика**: Исследование молекулярных основ половых различий и полового развития.
184. Пространственная наука**: Исследование пространственного распределения молекул внутри биологических систем.
185. Спортомика**: Исследование молекулярных основ спортивных результатов и физической активности.
186. Стемцелломика**: Исследование стволовых клеток и их молекулярных свойств.
187. Стромомика**: Изучение стромы, поддерживающей ткани органов и ее молекулярных компонентов.
188. Субцелломика**: Исследование молекулярного состава субклеточных компартментов.
189. Синаптомика**: Изучение синапсов и их молекулярных компонентов.
190. Токсиномика**: Изучение токсинов и их влияния на геном и протеом.
191. Травомика**: Исследование молекулярной основы травмы и повреждения.
192. Васкуляромика**: Исследование сосудистой системы и ее молекулярной биологии.
193. Виросомомика**: Изучение структуры и функций вирусных частиц.
194. Зоономика**: Изучение зоонозных болезней и их молекулярной основы.
Неродственные слова в -омике
[ редактировать ]В слове «комикс» не используется суффикс «омикс»; оно происходит от греческого «κωμ(ο)-» ( веселье ) + «-ικ(ο)-» (суффикс прилагательного), а не представляет собой усечение «σωμ(ατ)-».
Точно так же слово «экономика» состоит из греческого «οικ(ο)-» ( домохозяйство ) + «νομ(ο)-» ( закон или обычай ) и «экономика(ы)» от «οικ(ο)-». + "νομ(ο)-" + "-ικ(ο)-". Суффикс -omics иногда используется для создания названий экономических школ , таких как Рейганомика .
См. также
[ редактировать ]Примечания
[ редактировать ]- ^ Субеди, Прабал; Мортль, Симона; Азимзаде, Омид (2022). «Омики в радиационной биологии: удивлены, но не разочарованы» . Радиация . 2 : 124–129. дои : 10.3390/radiation2010009 .
- ^ Холторф, Хауке; Гиттон, Мари Кристина; Рески, Ральф (2002). «Функциональная геномика растений». естественные науки . 89 (6): 235–249. Бибкод : 2002NW.....89..235H . дои : 10.1007/s00114-002-0321-3 . ПМИД 12146788 . S2CID 7768096 .
- ^ «Склерома, n: Оксфордский словарь английского языка» . Проверено 25 апреля 2011 г.
- ^ «ризома, n: Оксфордский словарь английского языка» . Проверено 25 апреля 2011 г.
- ^ «-ома, гребенчатая форма: Оксфордский словарь английского языка» . Проверено 25 апреля 2011 г.
- ^ «Домашняя страница: Оксфордский словарь английского языка» . Проверено 25 апреля 2011 г.
- ^ «биом, сущ.: Оксфордский словарь английского языка» . Проверено 25 апреля 2011 г.
- ^ Ганс Винклер (1920). Распространение и причины партеногенеза в растительном и животном царстве . Издательство Фишер, Йена. п. 165.
Предлагаю использовать выражение: геном для гаплоидного хромосомного набора, который вместе с связанной с ним протоплазмой представляет собой материальную основу систематического единства... » По-английски: «Предлагаю выражение геном для гаплоидной хромосомы набор, который вместе с соответствующей протоплазмой определяет материальные основы вида...
- ^ Jump up to: а б Кольридж, Х.; и др . Оксфордский словарь английского языка
- ^ Лидделл, ХГ; Скотт, Р.; и др . Греко-английский лексикон [1996]. ( Поиск в проекте «Персей». )
- ^ Грив, IC; Диккенс, Нью-Джерси; Правенец, М; Крен, В; Хюбнер, Н.; Кук, ЮАР; Эйтман, Ти Джей; Петретто, Э; Мангион, Дж (2008). «Полногеномный анализ коэкспрессии во многих тканях» . ПЛОС ОДИН . 3 (12): е4033. Бибкод : 2008PLoSO...3.4033G . дои : 10.1371/journal.pone.0004033 . ISSN 1932-6203 . ПМК 2603584 . ПМИД 19112506 .
- ^ «Таблица ОМЕС» . Герштейнская лаборатория . Йель. 2002. Архивировано из оригинала 15 апреля 2023 года.
- ^ О'Коннелл, Мэри Дж.; МакНелли, Алан; Макинерни, Джеймс О. (28 марта 2017 г.). «Почему у прокариот есть пангеномы» (PDF) . Природная микробиология . 2 (4): 17040. doi : 10.1038/nmicrobiol.2017.40 . ISSN 2058-5276 . ПМИД 28350002 . S2CID 19612970 .
- ^ Абаси, Сара; Джайн, Абхишек; Кук, Джон П.; Джузеппи-Эли, Энтони (04 мая 2023 г.). «Электрически стимулированная экспрессия генов под действием экзогенно приложенных электрических полей» . Границы молекулярной биологии . 10 . дои : 10.3389/fmolb.2023.1161191 . ПМЦ 10192815 . ПМИД 37214334 .
- ^ Таширо, Сатоши; Ланкто, Кристиан (4 марта 2015 г.). «Международный нуклеомный консорциум» . Ядро . 6 (2): 89–92. дои : 10.1080/19491034.2015.1022703 . ПМЦ 4615172 . ПМИД 25738524 .
- ^ Кремер, Томас; Кремер, Мэрион; Хюбнер, Барбара; Стрикфаден, Хилмар; Смитс, Дэниел; Попкен, Йенс; Стерр, Майкл; Маркаки, Иоланда; Риппе, Карстен (07 октября 2015 г.). «4D-нуклеом: свидетельства динамического ядерного ландшафта, основанного на совмещенных активных и неактивных ядерных отсеках» . Письма ФЭБС . 589 (20ЧастьА): 2931–2943. дои : 10.1016/j.febslet.2015.05.037 . ISSN 1873-3468 . ПМИД 26028501 . S2CID 10254118 .
- ^ Берг, Габриэле ; Рыбакова Дарья; Фишер, Дорин; Чернава, Томислав; Верже, Мари-Кристин Шампомье; Чарльз, Тревор; Чен, Сяоюлун; Коколин, Лука; Эверсол, Келли; Коррал, Хема Эрреро; Казу, Мэри; Кинкель, Линда; Ланге, Лене; Пять, Нельсон; Лой, Александр; МакКлин, Джеймс А.; Маген, Эммануэль; Моклин, Тим; МакКлюр, Райан; Миттер, Биргит; Райан, Мэтью; Саранд, Инга; Смидт, Хауке; Шелкле, Беттина; Рим, Гюго; Киран, Г. Сегал; Селвин, Джозеф; Соуза, Рафаэль Соарес Корреа де; Ван Овербек, Лео; и др. (2020). «Повторное рассмотрение определения микробиома: старые концепции и новые проблемы» . Микробиом . 8 (1): 103. дои : 10.1186/s40168-020-00875-0 . ПМЦ 7329523 . ПМИД 32605663 .
Материал был скопирован из этого источника, который доступен по международной лицензии Creative Commons Attribution 4.0 .
- ^ Лагье Дж., Армугом Ф., Миллион М. и др. (декабрь 2012 г.). «Микробная культуромика: смена парадигмы в изучении микробиома кишечника человека» . Клиническая микробиология и инфекции . 18 (12): 1185–1193. дои : 10.1111/1469-0691.12023 .
- ^ Лагье Дж., Хелаифия С., Алоу М. и др. (декабрь 2016 г.). «Культурирование ранее некультивируемых представителей микробиоты кишечника человека с помощью культуромики» . Природная микробиология . 1 (12): 16203. doi : 10.1038/nmicrobiol.2016.203 .
- ^ Греуб, Г. (декабрь 2012 г.). «Культуромика: новый подход к изучению микробиома человека» . Клиническая микробиология и инфекции . 18 (12): 1157–1159. дои : 10.1111/1469-0691.12032 .
- ^ Ганн, Шэрон (27 ноября 2020 г.). «Фудомика: наука о еде» . Передовая геномика . Проверено 2 июня 2022 г.
- ^ Сифуэнтес, Алехандро (октябрь 2009 г.). «Анализ пищевых продуктов и фудомика» . Журнал хроматографии А. 1216 (43): 7109. doi : 10.1016/j.chroma.2009.09.018 . hdl : 10261/154212 . ПМИД 19765718 . Проверено 2 июня 2022 г.
- ^ Мишель, Дж.Б.; Шен, ЮК; Эйден, AP; Верес, А; Грей, МК; команда Google Книги; Пикетт, JP; Хойберг, Д; Клэнси, Д; Норвиг, П; Орвант, Дж (2011). «Количественный анализ культуры с использованием миллионов оцифрованных книг» . Наука . 331 (6014): 176–182. Бибкод : 2011Sci...331..176M . дои : 10.1126/science.1199644 . ISSN 1095-9203 . ПМЦ 3279742 . ПМИД 21163965 .
- ^ Кампсон, Питер; Флетчер, Ян; Сано, Наоко; Барлоу, Андерс (2016). «Быстрый многомерный анализ данных 3D ToF-SIMS: графические процессоры (GPU) и подвыборка с низким расхождением для крупномасштабного анализа главных компонентов» . Анализ поверхности и интерфейса . 48 (12): 1328. дои : 10.1002/sia.6042 .
- ^ Райзер, Майкл (2009). «Эпоха этомики?». Природные методы . 6 (6): 413–414. дои : 10.1038/nmeth0609-413 . ПМИД 19478800 . S2CID 5151763 .
- ^ Чу, Су Х.; Хуанг, Менгна; Келли, Рэйчел С.; Бенедетти, Элиза; Сиддики, Джалал К.; Железник, Оана А.; Перейра, Александр; Херрингтон, Дэвид; Уилок, Крейг Э.; Крумсик, Ян; Макгичи, Майкл (18 июня 2019 г.). «Интеграция метаболомических и других омических данных в дизайне популяционных исследований: эпидемиологическая перспектива» . Метаболиты . 9 (6): Е117. дои : 10.3390/metabo9060117 . ISSN 2218-1989 . ПМК 6630728 . ПМИД 31216675 .
Дальнейшее чтение
[ редактировать ]- Ледерберг, Джошуа ; Маккрей, Алекса Т. (2 апреля 2001 г.). «Комментарий: «Ome Sweet» Omics — генеалогическая сокровищница слов» . Ученый . 15 (7): 8 . Проверено 1 июня 2014 г.
- Хотц, Роберт Ли (13 августа 2012 г.). «Вот омическая история: ученые обнаружили распространяющийся суффикс» . Уолл Стрит Джорнал .
Внешние ссылки
[ редактировать ]
- Omics.org Домашняя страница терминов и концепций . Вероятно, первая созданная веб-страница omics.
- Список омиков , включая ссылки/происхождение. Поддерживается (CHI) Кембриджским институтом здравоохранения.
