✖


Jump to content

Фармакомикробиомика

Диаграмма Венна, показывающая фармакомикробиомику как раздел геномики, микробиологии и фармакологии.

Фармакомикробиомика , предложенная профессором Марко Канделой для конкурса проекта ERC-2009-StG (предложение № 242860, озаглавленное «ФармакоМИКРОБИОМИКА, исследование микробиомных детерминант различных реакций на лекарства у людей») и впервые публично предложенная 2010, Ризкалла и др. (от исследовательской группы Рами К. Азиза) определяется как влияние вариаций микробиома на расположение, действие и токсичность лекарств. [1] Фармакомикробиомика занимается взаимодействием между ксенобиотиками или чужеродными соединениями и микробиомом кишечника . По оценкам, в кишечнике обитает более 100 триллионов прокариот, представляющих более 1000 видов. [2] [3] В кишечнике микробы помогают модулировать функции развития, иммунологии и питания хозяина. [4] Совокупный геном микробов расширяет метаболические возможности человека, позволяя ему захватывать питательные вещества из различных источников. [5] А именно, посредством секреции ферментов, которые способствуют метаболизму чужеродных для организма химических веществ, модификации ферментов печени и кишечника, а также модуляции экспрессии метаболических генов человека, микробы могут существенно влиять на прием ксенобиотиков. [6]

Попытки понять взаимодействие между конкретными ксенобиотиками и микробиомом традиционно включали использование моделей in vivo, а также in vitro . [7] Недавно секвенирование следующего поколения геномной ДНК, полученной из сообщества микробов, было использовано для идентификации организмов внутри микробных сообществ, что позволяет получить точные профили состава микробов в окружающей среде. Такие инициативы, как Проект «Микробиом человека» (HMP), были направлены на характеристику микробного состава полости рта, кишечника, влагалища, кожи и носа. [8] Этот и другие проекты по определению характеристик микробиома ускорили изучение фармакомикробиомики. Обширное понимание микробиома в организме человека может привести к разработке новых терапевтических средств и персонализированных медикаментозных методов лечения, которые не усиливаются и не активируются процессами, осуществляемыми микробиомом.

История

[ редактировать ]

В статье 1973 года Рональд Шелин заявил, что желудочно-кишечный микробиом обладает способностью действовать как орган с метаболическим потенциалом, по крайней мере, равным печени. [9] С тех пор была признана важность микробиома человека в обеспечении здоровья и болезней, а специфические взаимодействия между ксенобиотиками и микробами были охарактеризованы с использованием in vitro или in vivo методов . Однако лишь немногие исследования приняли во внимание полный метаболический профиль, что заставляет некоторых утверждать, что совокупная роль микробиома в метаболизме и токсикологии ксенобиотиков в значительной степени остается неисследованной. [10] Сообщается, что 84% самых продаваемых фармацевтических препаратов в США и Европе применяются перорально, что делает его наиболее распространенным способом введения лекарств. [11] Следствием этого является то, что значительная часть лекарств, особенно малорастворимых и проницаемых, сталкивается с микробиомом и подвергается восстановительным и гидролитическим реакциям. [7] Представление о микробиоме человека как об органе довольно распространено в научной литературе; [12] однако биологически правильнее рассматривать его как облако, [13] поскольку «облачная модель микробиома» [13] лучше отражает неопределенность, связанную с динамическим составом микробиома. Понимание изменчивости микробиома является ключом к пониманию и модулированию фармакомикробиомных взаимодействий. Один и тот же пациент может должным образом реагировать на лекарство в определенный день, тогда — поскольку микробиом пациента резко меняется после инфекции, антимикробной терапии или лучевой терапии (например), реакция на лекарство может неожиданно сильно отличаться.Технологии секвенирования, такие как метагеномное секвенирование 16S рРНК , способствовали быстрому расширению области фармакомикробиомики за счет выявления разнообразия организмов в микробных сообществах. Проект «Микробиом человека» и «МЕТАгеномика кишечного тракта человека» (MetaHIT), созданные в 2007 и 2008 годах соответственно, были направлены на характеристику изменений микробиомов человека. [14] Эти крупномасштабные проекты имеют основополагающее значение для фармакомикробиомических исследований, поскольку позволяют создавать статистические модели, которые могут учитывать различия в микробном составе у разных людей.

История термина

[ редактировать ]

Термин «фармакомикробиомика» впервые был предложен в литературе в 2010 году. [1] а впоследствии, в 2011 году, были освобождены домены «pharmacomicrobiomics.org» и «pharmacomicrobiomics.com». Команда недавно окончивших университет студентов-фармацевтов (Мариам Ризкалла и Рама Саад) создала и опубликовала первую общедоступную базу данных с таким названием «ФармакоМикробиомика». [15] (с большой буквы для брендинга). С тех пор этот термин начал появляться в PubMed год за годом и 11 лет спустя пересек отметку в 50 публикаций (поиск PubMed).

Методы выяснения состава микробиома

[ редактировать ]
В типичном процессе фармакомикробиомики ДНК из микробного образца выделяют, секвенируют и затем сопоставляют с базами данных микробных последовательностей. На основании состава образца можно определить соответствующие назначения ксенобиотиков на основе известных взаимодействий. [16]

Модели животных

[ редактировать ]

Взаимодействие между ксенобиотиками и микробиомом хозяина в первую очередь оценивалось с использованием моделей животных in vivo , поскольку моделировать естественный кишечник человека сложно. В целом характер бактериальной колонизации одинаков у разных животных, причем как pH, так и количество микроорганизмов постепенно увеличиваются от тонкой кишки к илео-слепо-кишечному соединению толстой кишки. [7] Безмикробные крысы, колонизированные человеческими фекалиями, обычно считаются золотым стандартом в моделировании микробной среды кишечника на животных. [7] Однако активность ферментов может сильно различаться у разных организмов.

in vitro Модели

[ редактировать ]

Микробы, обнаруженные в образцах фекалий человека, достаточно репрезентативны для микробиома кишечника и часто используются в in vitro культурах различные методы микробного моделирования in vitro . Также были разработаны . Статическое периодическое культивирование состоит из посева бактерий без регулярного пополнения среды. [17] Системы полунепрерывного культивирования позволяют добавлять среду, не нарушая роста бактерий, и включают возможности контроля pH. [18] Система непрерывного культивирования больше напоминает систему кишечника, поскольку она постоянно пополняет и удаляет питательную среду. [19] Симулятор микробной системы кишечника человека (SHIME) моделирует тонкую и толстую кишку с помощью пятиступенчатого реактора и включает в себя множество портов для непрерывного мониторинга pH и объема. [20] Совсем недавно исследователи усовершенствовали SHIME, включив перистальтическую волну, управляемую компьютером, для циркуляции химуса по всему аппарату. [21] Эти технологии дали исследователям полный контроль над средой культивирования, способствуя открытию взаимодействия между ксенобиотиками и микробами.

Высокопроизводительное секвенирование

[ редактировать ]

Секвенирование 16S рРНК

[ редактировать ]

Рибосомальная РНК 16S является наиболее распространенным генетическим маркером домашнего хозяйства для классификации и идентификации видов бактерий, поскольку она присутствует во всех видах бактерий, имеет идентичную функцию в большинстве организмов и достаточно велика (~ 1500 п.н.), чтобы уловить достаточные вариации для различения бактерий. . [22] Последовательность 16S рРНК состоит из высококонсервативных последовательностей, которые чередуются с девятью окнами «гипервариабельных участков». [23] Это позволяет использовать универсальные праймеры для секвенирования многих видов одновременно и дает возможность различать бактерии только по вариабельным областям. Многие статьи предполагают, что секвенирование гена 16S рРНК обеспечивает идентификацию рода в> 90% случаев, но идентификацию на уровне вида примерно в 65–83% случаев. [24] Проект рибосомальной базы данных (RDP) [25] Базы данных и SILVA содержат информацию о последовательностях рРНК у бактерий, эукарий и архей. [26]

Последовательность дробовика

[ редактировать ]

Достижения в области высокопроизводительного секвенирования облегчили метагеномное секвенирование (SMS) — технологию, которая обеспечивает более широкую характеристику образцов микробов путем секвенирования большего количества генов в каждом организме. SMS включает сбор образцов микробов из окружающей среды, выделение ДНК, разрезание ДНК на небольшие фрагменты, а затем выполнение полногеномного секвенирования (WGS). Риды могут быть собраны заново или с использованием эталонных геномов. [27] Однако SMS не без ограничений. Считывания могут перекрываться и препятствовать точному сопоставлению с эталонными геномами. Кроме того, считывания могут быть загрязнены последовательностями ДНК человека, что искажает результаты. При сборке на основе ссылок чтение также может быть смещено в сторону видов, которые имеют общедоступные эталонные геномы.

Состав микробиома

[ редактировать ]

Индивидуальные микробиомы

[ редактировать ]

кишка

[ редактировать ]

В кишечнике большинство микробов можно обнаружить в толстой кишке, где уровень pH выше и более благоприятен для выживания. Эти бактерии часто более эффективны, чем наши собственные пищеварительные ферменты, и переваривают белки и углеводы. [9] Результаты исследования более 690 микробиомов человека показали, что большинство бактерий микробиома кишечника принадлежит к четырем типам: Bacillota, Bacteroidota, Actinomycetota и Pseudomonadota. [8]

Вагина

[ редактировать ]

Влагалище обладает более чем 200 филотипами, наиболее преобладающие из которых принадлежат к типам Bacillota , Bacteroidota , Actinomycetota и Fusobacteriota . [28] Секреция молочной кислоты и перекиси водорода Lactobacillus sp. может снизить pH, увеличивая концентрацию бактерий, вызывающих бактериальный вагиноз.

Плацента

[ редактировать ]

Первый профиль микробов при здоровой доношенной беременности выявил непатогенную комменсальную микробиоту из типов Firmicutes, Tenericutes, Proteobacteria, Bacteroidetes и Fusobacteria. [29]

Полость рта

[ редактировать ]

С помощью HMP было исследовано девять внутриротовых участков, в которых обнаружено более 300 родов, принадлежащих более чем 20 бактериальным типам. [30]

Проект микробиома человека

[ редактировать ]

Проект «Микробиом человека» США (HMP) был основан в 2008 году Национальными институтами здравоохранения (NIH). Основная цель — дать комплексную характеристику микробиоты человека и ее роли в здоровье и заболевании человека, а также разработать наборы данных и инструменты, которые ученые могут использовать для изучения микробных популяций. [8] Конкретные инициативы заключаются в следующем:

  1. Разработайте эталонный набор последовательностей микробного генома для первоначальной характеристики микробиома человека.
  2. Выясните связь между заболеванием и изменениями в микробиоме человека.
  3. Разрабатывать технологии компьютерного анализа, а именно методы секвенирования отдельных микробов или всех членов сложных популяций одновременно.
  4. Создать Центр анализа и координации данных для предоставления общедоступной информации о проекте, его результатах и ​​необработанных данных.
  5. Создать исследовательские хранилища для хранения материалов и реагентов, используемых в HMP. Сюда входят культивируемые организмы и образцы метагеномной ДНК.
  6. Изучите этические, юридические и социальные последствия исследований HMP.

Основными способами характеристики являются секвенирование 16S рРНК и метагеномное секвенирование методом дробовика. Участки тела, из которых берутся пробы, включают кожу, полость рта, кишечник, влагалище и полость носа. [8] Веб-сайт HMP содержит данные о последовательности, метаболической реконструкции и профиле сообщества. Эти наборы данных использовались для связи определенных клинических переменных с составом микробиома. [31] [32]

Известные лекарственные взаимодействия

[ редактировать ]

Вмешательство микробиоты в активность ксенобиотиков

[ редактировать ]

Микробиом может существенно влиять на эффективность фармацевтического препарата. Несмотря на то, что большинство лекарств всасываются в верхней части толстого кишечника, препараты длительного действия, попадающие в богатую микробами область нижнего отдела кишечника, могут подвергаться воздействию микробного метаболизма. Например, хлорамфеникол может вызывать аплазию костного мозга после перорального приема из-за присутствия колиформ, которые превращают хлорамфеникол в его токсичную форму, известную как п-аминофенил-2-амин-1,2-пропандиол. [33] Кроме того, было обнаружено, что изменение численности Eggerthella lenta между популяциями влияет на метаболизм дигоксина, усиливая как его активность, так и токсичность. [34] Неисчерпывающий список препаратов и роль микробиоты в потенцировании/увеличении их эффекта представлены ниже.

Лекарство Фармакологическое действие Влияние микробиоты на клинический исход Ссылка
Ацетаминофен Анальгезирующее и жаропонижающее Увеличение клинического эффекта и токсичности. [35]
хлорамфеникол Антибиотик Увеличение токсичности [33]
Дигоксин Кардиотонический Снижение токсичности и активности [34]
Флуцитозин Противогрибковый Уменьшение эффекта [36]
Метронидазол Антибиотик Обеспечить устойчивость к противомикробному/противогрибковому эффекту. Также снижает эффект за счет стимуляции обмена веществ. [37]
Сульфинпиразон Антибиотик Активировать препарат [38]
Сулиндак Нестероидный противовоспалительный препарат Активировать препарат [38]

Ксенобиотическое вмешательство в состав микробиома

[ редактировать ]

Хотя фармакомикробиомику часто интерпретируют как влияние микробиома на метаболизм ксенобиотиков, этот термин также может охватывать влияние ксенобиотиков на микробиом и микробные гены. Влияние антибиотиков на микробиом человека хорошо изучено. Было показано, что антибиотикотерапия нацелена не только на конкретный патоген, но и на комменсальных обитателей хозяина. [39] Имеющиеся данные свидетельствуют о том, что уровни комменсальных бактерий в некоторых случаях не нормализуются после лечения антибиотиками и фактически могут подвергаться отрицательному воздействию в течение длительных периодов времени. [39] Исследование, в котором оценивали микробы полости рта и кишечника до, сразу после и в течение 12 месяцев после воздействия антибиотиков, показало, что микробиом может быть изменен в течение более 12 месяцев. [40] Поскольку состав микробиома может быть изменен антибиотиками, это предполагает положительный отбор устойчивых условно-патогенных микроорганизмов, которые могут вызвать острое заболевание. [41]

Веб-портал фармакомикробиомики

[ редактировать ]

Веб-портал фармакомикробиомики [15] это студенческая инициатива, направленная на изучение того, как микробы модулируют действие лекарств. [42] предназначено для биоинформатиков, микробных генетиков и разработчиков лекарств. Цель проекта — собрать литературные данные и извлечь информацию о взаимодействии микробов и лекарств, включая информацию о классах лекарств, семействах микробов и системах организма. Кроме того, портал включает реляционную базу данных с информацией о микробном составе в различных участках тела и их специфическом влиянии на фармакокинетику и фармакодинамические свойства лекарств.

Персонализированная медицина

[ редактировать ]

Персонализированная медицина в контексте фармакомикробиомики означает способность прогнозировать реакцию человека на ксенобиотик на основе состава его кишечного микробиома. Однако современные подходы к исследованию состава микробиома с использованием метагеномного секвенирования после лечения ксенобиотиками редки. Вместо этого исследовательские усилия были сосредоточены преимущественно на моделировании изменений микробного состава при различных болезненных состояниях. [43] Будущие исследования должны объединить знания о том, какие микробы преимущественно метаболизируют определенные соединения (полученные в ходе исследований in vitro ), с определением видового разнообразия для прогнозирования толерантности к лекарствам у пациентов. Однако моделирование взаимодействия микроба с конкретным ксенобиотиком не может стабильно предсказывать взаимодействия, поскольку геномы микробов постоянно перетасовываются посредством горизонтального переноса генов . Учитывая это, подходы, нацеленные на отдельные сигнатуры генов/транскриптов/белков, а не на отдельные микробы, вероятно, приведут к более широко применимым персонализированным подходам. [44]

Ограничения

[ редактировать ]

Ограничения фармакомикробиомики в первую очередь возникают из-за неопределенности, связанной с метагеномным профилированием. А именно, короткие считывания, полученные с помощью дробовика, может быть трудно сопоставить с эталонными геномами, поскольку многие организмы имеют гомологичные последовательности. Кроме того, секвенирование 16S рРНК не может последовательно определить видовую идентичность, что ставит под сомнение видовую идентичность в метагеномных образцах. Ограничения также возникают из-за различий в дизайне исследований, поскольку часто используются уникальные подходы к определению природы взаимодействий ксенобиотиков и микробиомов. Например, поскольку фармакомикробиомика в очень широком смысле обозначает связь между ксенобиотиками и микробиомом, степень, в которой исследования профилируют генетику микробиома, может значительно различаться. Исследования, направленные на характеристику идентичности организма, но не идентичности гена или количества копий, могут выбрать использование дробового секвенирования 16S вместо SMS. И наоборот, исследования, направленные на идентификацию генов и их продуктов, а не на идентичность организма, могут выбрать WMGS в сочетании с транскриптомным анализом. Первоначально эти различия могут означать, что исследователям, желающим изучить общедоступные данные, возможно, придется ставить свои исследовательские вопросы так, чтобы они соответствовали имеющимся данным.

Ссылки

[ редактировать ]
  1. ^ Перейти обратно: а б Ризкалла, MR; Саад, Р.; Азиз, РК (2010). «Проект микробиома человека, персонализированная медицина и рождение фармакомикробиомики». Современная фармакогеномика и персонализированная медицина . 8 (3): 12. дои : 10,2174/187569210792246326 .
  2. ^ Лей, Р; Тернбо, П; Кляйн, С; Гордон, Дж (2006). «Микробная экология: микробы кишечника человека, связанные с ожирением». Природа . 444 (7122): 1022–1023. Бибкод : 2006Natur.444.1022L . дои : 10.1038/4441022a . ПМИД   17183309 . S2CID   205034045 .
  3. ^ Арумугам, М; Раес, Дж; Пеллетье, Э; и др. (2013). «Энтеротипы микробиома кишечника человека» . Природа . 473 (7346): 174–180. дои : 10.1038/nature09944 . ПМЦ   3728647 . ПМИД   21508958 .
  4. ^ Эгерт, М; Де Грааф, А.А.; Смидт, Х; Де Вос, WM; Венема (2006). «Функциональная микробиомика толстой кишки человека». Тенденции Микробиол . 14 (2): 86–91. дои : 10.1016/j.tim.2005.12.007 . ПМИД   16406528 .
  5. ^ Хайзер, HJ; Тернбо, П.Дж. (2013). «Развитие метагеномного взгляда на метаболизм ксенобиотиков» . Фармакол. Рез . 69 (1): 21–31. дои : 10.1016/j.phrs.2012.07.009 . ПМЦ   3526672 . ПМИД   22902524 .
  6. ^ Саад, Р; Ризкалла, MR; Азиз, РК (2012). «Кишечная фармакомикробиомика: верхушка айсберга сложных взаимодействий между лекарствами и кишечными микробами» . Кишечный Патог . 4 (1): 16. дои : 10.1186/1757-4749-4-16 . ПМЦ   3529681 . ПМИД   23194438 .
  7. ^ Перейти обратно: а б с д Соуза, Т; Патерсон, Р; Мур, В.; Карлссон, А; Абрахамссон, Б; Басит, AW (2008). «Желтокишечная микробиота как место биотрансформации лекарственных средств». Инт Джей Фарм . 363 (1–2): 1–25. doi : 10.1016/j.ijpharm.2008.07.009 . ПМИД   18682282 .
  8. ^ Перейти обратно: а б с д Примечания, С (2012). «Основы исследования микробиома человека» . Природа . 486 (7402): 215–221. Бибкод : 2012Natur.486..215T . дои : 10.1038/nature11209 . ПМЦ   3377744 . ПМИД   22699610 .
  9. ^ Перейти обратно: а б Шелине, Р.Р. (1973). «Метаболизм чужеродных соединений желудочно-кишечными микроорганизмами». Фармакол Рев . 25 (4): 451–523. ПМИД   4587548 .
  10. ^ Уилсон, ID; Николсон, Дж. К. (2016). «Взаимодействие кишечного микробиома с метаболизмом, эффективностью и токсичностью лекарств» . Перевод Рез . 179 : 204–222. дои : 10.1016/j.trsl.2016.08.002 . ПМЦ   5718288 . ПМИД   27591027 .
  11. ^ Леннернес, Х; Абрахамссон, Б. (2005). «Использование биофармацевтической классификации лекарств при открытии и разработке лекарств: текущий статус и будущее расширение». Джей Фарм Фармакол . 57 (3): 273–285. дои : 10.1211/0022357055263 . ПМИД   15807982 . S2CID   45646857 .
  12. ^ Бакеро, Ф.; Номбела, К. (1 июля 2012 г.). «Микробиом как орган человека» . Клиническая микробиология и инфекции . 18 : 2–4. дои : 10.1111/j.1469-0691.2012.03916.x . ПМИД   22647038 .
  13. ^ Перейти обратно: а б Эль-Ракаиби, Марва; Дутил, Бас Э.; Ризкалла, Мариам Р.; Болей, Аннемари; Коул, Джейсон Н.; Азиз, Рами К. (июль 2014 г.). «Фармакомикробиомика: влияние изменений микробиома человека на системную фармакологию и персонализированную терапию» . OMICS: Журнал интегративной биологии . 18 (7): 402–414. дои : 10.1089/omi.2014.0018 . ПМК   4086029 . ПМИД   24785449 .
  14. ^ https://commonfund.nih.gov/hmp/overview. Архивировано 3 марта 2017 г. в Wayback Machine , http://www.gutmicrobiotaforhealth.com/en/metahit/. Архивировано 7 декабря 2019 г. в Wayback Machine.
  15. ^ Перейти обратно: а б Р. Ризкалла, Мариам; Гамаль-Элдин, Соха; Саад, Рама; Азиз, Рами К. (2012). «Портал фармакомикробиомики: база данных о взаимодействии лекарств и микробиома». Современная фармакогеномика и персонализированная медицина . 10 (3): 195–203. дои : 10.2174/187569212802510030 .
  16. ^ «Изображения рибосом» . Центр молекулярной биологии РНК . Архивировано из оригинала 8 июня 2023 г. Проверено 12 июля 2024 г.
  17. ^ Роуленд, И. (2 декабря 2012 г.). Роль кишечной флоры в токсичности и раке . ISBN  9780323147057 . Архивировано из оригинала 12 июля 2024 г. Проверено 15 июня 2021 г.
  18. ^ Рамни, CJ; Роуленд, ИК (1992). « Модели in vivo и in vitro флоры толстой кишки человека». Crit Rev Food Sci Nutr . 31 (4): 299–331. дои : 10.1080/10408399209527575 . ПМИД   1581008 .
  19. ^ Марш, П.Д. (1995). «Роль непрерывной культуры в моделировании микрофлоры человека». J Chem Technol Биотехнология . 64 (1): 1–9. дои : 10.1002/jctb.280640102 .
  20. ^ Молли К., Вустин М. Ванде, Смет И. Де, Верстраете В. Микробная экология в здоровье и болезнях. Проверка симулятора кишечной микробной экосистемы человека (SHIME). Реактор с использованием активности, связанной с микроорганизмами. Проверка симулятора кишечной микробной экосистемы человека. (SHIME) Р. 2009; 2235 (март 2017 г.).
  21. ^ Минекус М., Марто П., Хавенаар Р., Хьюис ин 'т Вельд JHJ. Многокамерная динамическая управляемая компьютером модель, имитирующая желудок и тонкую кишку. Альтернатива Lab Anim. 1995; 23 (август 2015 г.): 197–209.
  22. ^ Янда, Дж. М.; Эбботт, СЛ (2007). «Секвенирование гена 16S рРНК для идентификации бактерий в диагностической лаборатории: плюсы, опасности и подводные камни» . J Clin Микробиол . 45 (9): 2761–2764. дои : 10.1128/JCM.01228-07 . ПМК   2045242 . ПМИД   17626177 .
  23. ^ Чакраворти, С; Хелб, Д; Бердей, М; Коннелл, Н. (2007). «Детальный анализ сегментов гена 16S рибосомальной РНК для диагностики патогенных бактерий» . J Микробиологические методы . 69 (2): 330–339. дои : 10.1016/j.mimet.2007.02.005 . ПМК   2562909 . ПМИД   17391789 .
  24. ^ Дранкур, М; Болле, С; Карлиоз, А; Мартелин, Р; Гайрал, Япония; Рауль, Д. (2000). «Анализ последовательности рибосомальной ДНК 16S большой коллекции неидентифицируемых бактериальных изолятов из окружающей среды и клинических исследований» . J Clin Микробиол . 38 (10): 3623–3630. дои : 10.1128/JCM.38.10.3623-3630.2000 . ПМЦ   87447 . ПМИД   11015374 .
  25. ^ Коул, младший; Ван, Кью; Фиш, Дж.А.; и др. (2014). « Проект рибосомальной базы данных «Данные и инструменты для высокопроизводительного анализа рРНК» . Нуклеиновые кислоты Рез . 42 (Д1): Д633-42. дои : 10.1093/nar/gkt1244 . ПМК   3965039 . ПМИД   24288368 .
  26. ^ Кваст, С; Прюссе, Э; Йылмаз, П; и др. (2013). « Проект базы данных генов рибосомальных РНК SILVA «Улучшенная обработка данных и веб-инструменты» . Нуклеиновые кислоты Рез . 41 (Д1): Д590-6. дои : 10.1093/nar/gks1219 . ПМЦ   3531112 . ПМИД   23193283 .
  27. ^ Шарптон, Ти Джей (2014). «Введение в анализ метагеномных данных дробовика» . Фронт Завод Науч . 5 : 209. дои : 10.3389/fpls.2014.00209 . ПМК   4059276 . ПМИД   24982662 .
  28. ^ Равель, Дж; Гайер, П; Абдо, З; и др. (2011). «Вагинальный микробиом женщин репродуктивного возраста» . Proc Natl Acad Sci . 108 (Приложение 1): 4680–4687. Бибкод : 2011PNAS..108.4680R . дои : 10.1073/pnas.1002611107 . ПМК   3063603 . ПМИД   20534435 .
  29. ^ Огаард, К; Ма, Дж; Энтони, К.М.; Гану, Р; Петрозино, Дж; Версалович, Дж (2014). «Плацента содержит уникальный микробиом» . Научный перевод Мед . 6 (237): 237–65. doi : 10.1126/scitranslmed.3008599 . ПМЦ   4929217 . ПМИД   24848255 .
  30. ^ Чжоу, Ю; Гао, Х; Михиндукуласурия, К.А.; и др. (2013). «Биогеография экосистем здорового организма человека» . Геном Биол . 14 (1): Р1. дои : 10.1186/gb-2013-14-1-r1 . ПМК   4054670 . ПМИД   23316946 .
  31. ^ Роджерс ГБ, Наркевич MR, Хоффман LR. «Желудочно-кишечный микробиом CF: структура и клиническое влияние. Pediatr Pulmonol. 2016;51 (май): S35-S44. doi: 10.1002/ppul.23544.
  32. ^ Ллойд-Прайс, Дж; Абу-Али, Г; Хаттенхауэр, К. (2016). «Здоровый микробиом человека» . Геном Мед . 8 (1): 51. дои : 10.1186/s13073-016-0307-y . ПМЦ   4848870 . ПМИД   27122046 .
  33. ^ Перейти обратно: а б Грундманн, О; Юн, СЛ (2010). «Синдром раздраженного кишечника: эпидемиология, диагностика и лечение: обновленная информация для практикующих врачей» . J Гастроэнтерол Гепатол . 25 (4): 691–699. дои : 10.1111/j.1440-1746.2009.06120.x . ПМИД   20074154 .
  34. ^ Перейти обратно: а б Матан, VI; Видерман, Дж; Добкин, Дж. Ф.; Линденбаум, Дж (1989). «Географические различия в инактивации дигоксина, метаболической активности анаэробной кишечной флоры человека» . Гут . 30 (7): 971–977. дои : 10.1136/gut.30.7.971 . ПМЦ   1434295 . ПМИД   2759492 .
  35. ^ Клейтон, штат Техас; Бейкер, Д; Линдон, Джей Си; Эверетт-младший; Николсон, Дж. К. (2009). «Фармакометабономическая идентификация значимого метаболического взаимодействия хозяина и микробиома, влияющего на метаболизм лекарств у человека» . Proc Natl Acad Sci США . 106 (34): 14728–14733. дои : 10.1073/pnas.0904489106 . ПМК   2731842 . ПМИД   19667173 .
  36. ^ Вермес, А; Куйпер, Э.Дж.; Гучелаар, HJ; Данкерт, Дж (2003). «Исследование in vitro активного превращения флуцитозина во фторурацил микроорганизмами микрофлоры кишечника человека». Химиотерапия . 49 (1–2): 17–23. дои : 10.1159/000069784 . ПМИД   12714804 . S2CID   27515058 .
  37. ^ Стеффенс, Л.С.; Николсон, С; Пол, Л.В.; Норд, CE; Патрик, С; Абратт, ВР. (2010). «Сверхэкспрессия белка RecA Bacteroides fragilis вызывает устойчивость к метронидазолу» . Рес Микробиол . 161 (5): 346–354. дои : 10.1016/j.resmic.2010.04.003 . ПМК   3025348 . ПМИД   20435137 .
  38. ^ Перейти обратно: а б Стронг, ХА; Ренвик, AG; Джордж, CF; Лю, Ю.Ф.; Хилл, MJ (1987). «Восстановление сульфинпиразона и сулиндака кишечными бактериями». Ксенобиотика . 17 (6): 685–696. дои : 10.3109/00498258709043976 . ПМИД   3630204 .
  39. ^ Перейти обратно: а б Йернберг, К; Лёфмарк, С; Эдлунд, К; Янссон, Дж. К. (2010). «Долгосрочное воздействие антибиотиков на микробиоту кишечника человека» . Микробиология . 156 (11): 3216–3223. дои : 10.1099/mic.0.040618-0 . ПМИД   20705661 .
  40. ^ Заура, Э; Брандт, BW; Йост, М; и др. (2015). « Одно и то же воздействие, но две радикально разные реакции на антибиотики. Устойчивость микробиома слюны по сравнению с долгосрочными микробами» . мБио . 6 (6): 1–11. дои : 10.1128/mBio.01693-15 . ПМЦ   4659469 . ПМИД   26556275 .
  41. ^ Франсино, член парламента (2016). «Антибиотики и микробиом кишечника человека: дисбиозы и накопление резистентности» . Передний микробиол . 6 : 1543. дои : 10.3389/fmicb.2015.01543 . ПМЦ   4709861 . ПМИД   26793178 .
  42. ^ Азиз, РК; Саад, Р; Ризкалла, MR (2011). «Фармакомикробиомика, или как насекомые модулируют лекарства: образовательная инициатива по изучению влияния микробиома человека на лекарства» . БМК Биоинформатика . 12 (Приложение 7): А10. дои : 10.1186/1471-2105-12-S7-A10 . ПМК   3194200 .
  43. ^ Костич, А.Д.; Ксавье, Р.Дж.; Геверс, Д. (2014). «Микробиом при воспалительных заболеваниях кишечника: современное состояние и будущее» . Гастроэнтерология . 146 (6): 1489–1499. дои : 10.1053/j.gastro.2014.02.009 . ПМК   4034132 . ПМИД   24560869 .
  44. ^ Конг, Юго-Запад; Коллинз, CD; Симидзу-мотохаси, Ю; и др. (2012). «Характеристики и прогностическая ценность сигнатуры транскриптома крови у мужчин с расстройствами аутистического спектра» . ПЛОС ОДИН . 7 (12): e49475. Бибкод : 2012PLoSO...749475K . дои : 10.1371/journal.pone.0049475 . ПМЦ   3515554 . ПМИД   23227143 .
Retrieved from "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Pharmacomicrobiomics&oldid=1234091889"
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: 6164da35906baf1d4a483b9ffdb7c51d__1720785240
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/61/1d/6164da35906baf1d4a483b9ffdb7c51d.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
Pharmacomicrobiomics - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)