Йоханнес Краузе

Йоханнес Краузе (родился 17 июля 1980 года в Лайнефельде ) — немецкий биохимик, специализирующийся на исследованиях исторических инфекционных заболеваний и эволюции человека. С 2010 года — профессор археологии и палеогенетики Тюбингенского университета . В 2014 году Краузе был назначен содиректором-основателем нового Института истории человечества Макса Планка в Йене .
Карьера
[ редактировать ]С 2000 по 2005 год Краузе изучал биохимию в Лейпциге и Университетском колледже Корка в Ирландии. В 2005 году он получил диплом с публикацией «Митохондриальный геном шерстистого мамонта» в Институте эволюционной антропологии Макса Планка , за которым в 2008 году защитил докторскую диссертацию под руководством Сванте Паабо под названием « От генов к геномам: применение мультиплексной ПЦР в исследованиях древней ДНК в отношении генетические исследования неандертальцев и пещерных медведей . [1]
В 2010 году за докторскую диссертацию он был удостоен Тюбингенской премии в области ранней предыстории и четвертичной экологии . В том же году за соавторство научной статьи «Проект последовательности и предварительный анализ генома неандертальца» он получил премию Ньюкомба Кливленда Американской ассоциации содействия развитию науки — приз за лучшую статью года. В октябре 2010 года он стал младшим профессором Института научной археологии в Тюбингене. С тех пор он возглавляет рабочую группу по палеогенетике в институте.
Летом 2014 года было объявлено, что Экономический институт Макса Планка в Йене получит другой мандат. Вместе с Расселом Греем Краузе был назначен содиректором нового Института истории и наук Макса Планка , начиная с 1 февраля 2014 года. [2] При этом Краузе остается почетным профессором Тюбингенского университета.
Исследовать
[ редактировать ]В центре внимания Краузе — генетический анализ древней ДНК с использованием секвенирования ДНК. Его исследовательские интересы включают эволюцию человека, исторические патогены и эпидемии. [3]
В 2010 году Краузе и другие успешно реконструировали митохондриальную ДНК денисовца . из 30 миллиграммов порошкообразного материала из кости пальца Это позволило ему продемонстрировать, что денисовцы представляли собой независимую ветвь рода Homo , которая отделилась от линии неандертальцев 640 000 лет назад. [4] [5] Он также внес свой вклад в исследование генетического наследия неандертальцев, которое продемонстрировало, что неандертальцы и современные люди имеют один и тот же «языковой ген» ( FOXP2 ), что позволяет предположить, что неандертальцы также обладали способностью говорить. [6] [7]
Краузе входил в международную исследовательскую группу, которая в 2011 году реконструировала геном бактерии Yersinia pestis XIV века из образцов ДНК, извлеченных с чумного кладбища Ист-Смитфилд в Лондоне, установив окончательные доказательства того, что средневековая эпидемия Черной смерти была вызвана Yersinia pestis . [8] [9]
В июне 2013 года группа Краузе в сотрудничестве с Технологическим институтом Лозанны опубликовала исследование, показывающее, что бактерия проказы не изменилась генетически со времен Средневековья, и все бактерии проказы во всем мире можно отнести к общему предку, датируемому 4000 годом до нашей эры. [10]
В 2017 году команда под руководством Краузе провела первое надежное секвенирование геномов мумифицированных людей из Древнего Египта. Однако, по собственному признанию команды в рукописи, образцы, возможно, не были репрезентативными для большинства египтян. Другие результаты гаплотипов и ДНК ПЦР указывают на происхождение современного населения Египта из стран Африки к югу от Сахары. В их исследовании приняли участие 90 человек, и выяснилось, что они «очень напоминали древние и современные популяции Ближнего Востока, особенно те, что жили в Леванте, и почти не имели ДНК из стран Африки к югу от Сахары. Более того, генетика мумий оставалась удивительно последовательной, даже когда разные державы, в том числе нубийцы, греки и римляне, завоевали империю. [11] [12]
В 2019 году Краузе и другие опубликовали анализ распространения Y. pestis во время эпидемии Черной смерти, начавшейся в Европе в 1347 году. Среди полученных результатов было обнаружено, что штамм XIV века из Самарской области в России является предком Черной смерти. Смерть. Другие геномы со всей Европы в тот период были идентичны, что указывает на скорость распространения чумы. [13] Позже по крайней мере две отдельные клады в Европе, по-видимому, возникли . Один из них связан со вспышками болезней в Германии и Швейцарии в 15–17 веках нашей эры. Другой связан со вспышками в Лондоне в 17 веке и Марселе в 18 веке. Это говорит о том, что болезнь могла оставаться в дремлющем состоянии более чем в одном резервуаре болезни в Европе. Случаи чумы в Лондоне и Марселе также могут быть связаны с морскими путешествиями. [14] Современные штаммы Y. pestis , например, обнаруженные на Мадагаскаре в 2017 году, очень похожи на предковый штамм «Черной смерти». Улучшение гигиены человека, сокращение популяций черных крыс и блох, а также уменьшение контактов людей с ними, вероятно, в большей степени ограничили передачу болезни, чем генетические изменения. [13]
Публикации
[ редактировать ]- Ламнидис ТЦ; и др. (2018). «Древние геномы Фенноскандинавии раскрывают происхождение и распространение сибирского происхождения в Европе» . Природные коммуникации . 9 (5018): 5018. Бибкод : 2018NatCo...9.5018L . дои : 10.1038/s41467-018-07483-5 . ПМК 6258758 . ПМИД 30479341 .
- Краузе Дж.; и др. (2007). «Неандертальцы в Центральной Азии и Сибири» (PDF) . Природа . 449 (7164): 902–904. Бибкод : 2007Natur.449..902K . дои : 10.1038/nature06193 . ПМИД 17914357 . S2CID 2084412 .
- Краузе Дж.; и др. (2008). «Митохондриальные геномы обнаруживают взрывную радиацию вымерших и современных медведей вблизи границы миоцена и плиоцена» . Эволюционная биология BMC . 8 (1): 220. дои : 10.1186/1471-2148-8-220 . ПМК 2518930 . ПМИД 18662376 .
- Краузе Дж. и др. (2010). «Полный геном митохондриальной ДНК неизвестного гоминина из южной Сибири» . Природа . 464 (7290): 894–897. Бибкод : 2010Natur.464..894K . дои : 10.1038/nature08976 . ПМЦ 10152974 . ПМИД 20336068 .
- Грин Р.Э., Краузе Дж.; и др. (2010). «Проект секвенирования и предварительный анализ генома неандертальца» . Наука . 328 (5979): 710–722. Бибкод : 2010Sci...328..710G . дои : 10.1126/science.1188021 . ПМК 5100745 . ПМИД 20448178 .
- Дж. Краузе и Томас Траппе: Путешествие наших генов: история о нас и наших предках. Propyäen Verlag, февраль 2019 г., ISBN 978-3549100028
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Майкл Болус: Похвала: Dr. Йоханнес Краузе, лауреат двенадцатой Тюбингенской премии в области древней предыстории и четвертичной экологии. Архивировано 21 октября 2013 г. в Wayback Machine (pdf; 155 КБ), В: Сообщения Общества доисторических времен , том 19, 2010 г., стр. 7. –10.
- ^ Грей, Рассел. «Рассел Грей» . Институт эволюционной антропологии Макса Планка . Проверено 3 декабря 2021 г.
- ^ «Йоханнес Краузе» . Институт эволюционной антропологии Макса Планка . Проверено 13 июля 2022 г.
- ^ Гош, Паллаб (22 декабря 2010 г.). «Древние люди, получившие название «денисовцы», скрестились с нами» . Новости Би-би-си . Проверено 17 июля 2014 г.
- ^ Й. Краузе; В. Фу; Дж. М. Гуд; Б. Виола; М.В. Шунков; А.П. Деревянко; С. Паабо (2010). «Полный геном митохондриальной ДНК неизвестного гоминина из южной Сибири» . Природа . 464 (7290): 894–897. Бибкод : 2010Natur.464..894K . дои : 10.1038/nature08976 . ПМЦ 10152974 . ПМИД 20336068 .
- ^ Й. Краузе; К. Лалуэса-Фокс; Л. Орландо; В. Энард; РЭ Зеленый; ХА Бурбано; Ж.-Ж. Хаблин; К. Ханни; Дж. Фортеа; г-н де ла Расилья; Ж. Бертранпети; А. Росас; С. Паабо (2007). «Производный вариант FOXP2 современных людей был использован неандертальцами» . Современная биология . 17 (21): 1908–1912. дои : 10.1016/j.cub.2007.10.008 . hdl : 11858/00-001M-0000-000F-FED3-1 . ПМИД 17949978 . S2CID 9518208 .
- ^ М. Инман (18 октября 2007 г.). «У неандертальцев был тот же «языковой ген», что и у современных людей» . Национальные географические новости. Архивировано из оригинала 20 октября 2007 года.
- ^ Кирстен И. Бос ; Верена Дж. Шунеманн; Дж. Брайан Голдинг; Эрнан А. Бурбано; Николас Ваглехнер; Брайан К. Кумбс; Джозеф Б. Макфи; Шэрон Н. ДеВитт; Маттиас Мейер; Сара Шмедес; Джеймс Вуд; Дэвид Джей Ди Эрн; Д. Энн Херринг; Питер Бауэр; Хендрик Н. Пойнар ; Йоханнес Краузе (2011). «Проект генома Yersinia pestis жертв Черной смерти» . Природа . 478 (7370): 506–510. Бибкод : 2011Natur.478..506B . дои : 10.1038/nature10549 . ПМК 3690193 . ПМИД 21993626 .
- ^ В.Дж. Шунеманн; К. Бос; С. ДеВитт; С. Шмедес; Дж. Джеймисон; А. Миттник; С. Форрест; БК Кумбс; Дж. Вуд; DJD Заработок; В. Уайт; Й. Краузе; Х. Н. Пойнар (2011). «Целевое обогащение древних патогенов с получением плазмиды pPCP1 Yersinia pestis жертв Черной смерти» . ПНАС . 108 (38): Е746–Е752. Бибкод : 2011PNAS..108E.746S . дои : 10.1073/pnas.1105107108 . ПМК 3179067 . ПМИД 21876176 .
- ^ В.Дж. Шунеманн; П. Сингх; ТА Мендум; Б. Краузе-Кёра; Г. Ягер; КИ Бос; А. Хербиг; К. Эконому; А. Бенджак; П. Буссо; А. Небель; Дж. Л. Болдсен; А. Кьельстрём; Х. Ву; Г. Р. Стюарт; ГМ Тейлор; П. Бауэр; ОЙ-С. Ли; ХХТ Ву; Д.Е. Минникин; Г.С. Бесра; К. Такер; С. Роффи; ТАК Соу; С.Т. Коул; К. Низельт; Дж. Краузе (2013). «Полногеномное сравнение средневековых и современных Mycobacterium leprae». Наука . 341 (6142): 179–183. Бибкод : 2013Sci...341..179S . дои : 10.1126/science.1238286 . ПМИД 23765279 . S2CID 22760148 .
- ^ Уэйд, Л. (2017). «Наконец-то ДНК египетской мумии» . Наука . 356 (6341): 894. Бибкод : 2017Sci...356..894W . дои : 10.1126/science.356.6341.894 . ПМИД 28572344 .
- ^ В.Дж. Шунеманн; А. Пельтцер; Б. Вельте; В.П. ван Пелт; М. Молак; А. Фуртвенглер; К. Урбан; Э. Рейтер; К. Низельт; Б. Тессманн; М. Франкен; К. Харвати; В. Хаак; С. Шиффельс; Дж. Краузе (2017). «Геномы древнеегипетских мумий предполагают увеличение африканского происхождения к югу от Сахары в постримские периоды» . Природные коммуникации . 15694 : 15694. Бибкод : 2017NatCo...815694S . дои : 10.1038/ncomms15694 . ПМЦ 5459999 . ПМИД 28556824 .
- ^ Jump up to: а б Верниммен, Тим (30 октября 2019 г.). «Профилирование виновников прошлых эпидемий» . Знающий журнал . Ежегодные обзоры. doi : 10.1146/knowable-102919-1 . Проверено 13 июля 2022 г.
- ^ Спиру, Мария А.; Келлер, Марсель; Тухбатова Резеда И.; Шейб, Кристиана Л.; Нельсон, Элизабет А.; Андрадес Валтуэнья, Аида; Нойманн, Гуннар У.; Уокер, Дон; Альтерауж, Амели; Карти, Ниам; Сессфорд, Крейг; Фец, Герман; Гурвеннек, Микаэль; Хартл, Роберт; Хендерсон, Майкл; фон Хейкинг, Кристин; Инскип, Сара А.; Качки, Саша; Ки, Феликс М.; Нокс, Элизабет Л.; Позже Кристиан; Махешвари-Аплин, Пришита; Петерс, Йорис; Робб, Джон Э.; Шрайбер, Юрген; Кивисилд, Тоомас; Кастекс, Доминик; Лёш, Сандра; Харбек, Микаэла; Хербиг, Александр; Бос, Кирстен И.; Краузе, Йоханнес (2 октября 2019 г.). «Филогеография второй пандемии чумы, выявленная на основе анализа исторических геномов Yersinia pestis» . Природные коммуникации . 10 (1): 4470. Бибкод : 2019NatCo..10.4470S . дои : 10.1038/s41467-019-12154-0 . ISSN 2041-1723 . ПМК 6775055 . ПМИД 31578321 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]- Профиль Краузе, организованный Институтом Макса Планка